More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tbd_0983 on replicon NC_007404
Organism: Thiobacillus denitrificans ATCC 25259



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007404  Tbd_0983  adenylyl cyclase class-3/4/guanylyl cyclase  100 
 
 		 737 aa  1471    Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2129  adenylate/guanylate cyclase  44.88 
 
 		 741 aa  571  1e-161  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1858  adenylate/guanylate cyclase  44.37 
 
 		 734 aa  572  1e-161  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.88873  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5187  adenylate/guanylate cyclase with Chase sensor  38.51 
 
 		 758 aa  484  1e-135  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1703  hypothetical protein  36.01 
 
 		 758 aa  429  1e-119  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1704  hypothetical protein  36.01 
 
 		 758 aa  428  1e-118  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0302  putative Chase2 sensor protein  41.58 
 
 		 670 aa  420  1e-116  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2346  CHASE2 domain-containing protein  35.91 
 
 		 760 aa  367  1e-100  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.285183  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7152  adenylate/guanylate cyclase  34.42 
 
 		 744 aa  365  1e-99  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2534  adenylate/guanylate cyclase with Chase sensor  35.84 
 
 		 764 aa  363  8e-99  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.263424  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1344  adenylate/guanylate cyclase  34.67 
 
 		 794 aa  355  2e-96  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1969  adenylate/guanylate cyclase with Chase sensor  32.92 
 
 		 696 aa  350  6e-95  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0397866  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3153  adenylate/guanylate cyclase  35.95 
 
 		 759 aa  347  3e-94  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1674  adenylate/guanylate cyclase  33.79 
 
 		 731 aa  342  1e-92  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.285397  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0034  TPR repeat-containing adenylate/guanylate cyclase  31.54 
 
 		 758 aa  335  2e-90  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.00000015313  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1553  adenylate/guanylate cyclase with Chase sensor  34.83 
 
 		 754 aa  329  1.0000000000000001e-88  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.333757 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_4085  adenylate/guanylate cyclase  33.29 
 
 		 746 aa  325  2e-87  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.104935 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2169  adenylate/guanylate cyclase  32.91 
 
 		 756 aa  323  8e-87  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0505849  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0280  adenylate/guanylate cyclase with Chase sensor  35.7 
 
 		 656 aa  320  7e-86  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1894  putative Chase2 sensor protein  35.56 
 
 		 729 aa  317  3e-85  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0276882  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0296  adenylate/guanylate cyclase with Chase sensor  35.97 
 
 		 672 aa  316  9.999999999999999e-85  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3360  adenylate/guanylate cyclase with Chase sensor  34.65 
 
 		 723 aa  314  3.9999999999999997e-84  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3663  adenylate/guanylate cyclase with Chase sensor  33.76 
 
 		 723 aa  312  1e-83  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.93824  normal  0.384107 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1740  adenylyl cyclase class-3/4/guanylyl cyclase  33.64 
 
 		 753 aa  311  2e-83  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.21931 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0929  adenylate/guanylate cyclase  30.4 
 
 		 738 aa  310  5.9999999999999995e-83  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.144822  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1763  putative Chase2 sensor protein  32.71 
 
 		 725 aa  296  1e-78  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.544846  normal  0.0880592 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0721  adenylate/guanylate cyclase  31.37 
 
 		 729 aa  285  2.0000000000000002e-75  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.164553  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2619  adenylate/guanylate cyclase with Chase sensor  33.18 
 
 		 658 aa  280  9e-74  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.103266  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1112  adenylate/guanylate cyclase  28.07 
 
 		 721 aa  263  6.999999999999999e-69  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3090  putative Chase2 sensor protein  29.65 
 
 		 614 aa  261  3e-68  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1889  putative adenylate/guanylate cyclase  33.58 
 
 		 645 aa  244  3.9999999999999997e-63  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0331  putative adenylate/guanylate cyclase  27.43 
 
 		 641 aa  243  1e-62  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3697  adenylate/guanylate cyclase  35.03 
 
 		 696 aa  242  2e-62  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.61471  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0343  transmembrane sensor-like domain-containing protein  29.35 
 
 		 638 aa  232  2e-59  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0411  adenylate/guanylate cyclase catalytic domain-containing protein  25.78 
 
 		 694 aa  230  8e-59  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0173822  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4565  adenylate/guanylate cyclase with Chase sensor  29.69 
 
 		 761 aa  225  2e-57  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.593943  normal  0.183616 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0668  putative adenylate/guanylate cyclase  27.11 
 
 		 701 aa  224  6e-57  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00673986  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0932  adenylate/guanylate cyclase catalytic domain-containing protein  31.9 
 
 		 936 aa  221  5e-56  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2510  putative Chase2 sensor protein  29.38 
 
 		 753 aa  219  1e-55  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0278578 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2382  adenylate/guanylate cyclase  36.13 
 
 		 752 aa  219  2e-55  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2371  adenylate/guanylate cyclase with Chase sensor  37.43 
 
 		 657 aa  218  4e-55  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.0177701 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3884  adenylate/guanylate cyclase  30.45 
 
 		 667 aa  215  2.9999999999999995e-54  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1218  adenylate/guanylate cyclase with Chase sensor  26.46 
 
 		 611 aa  212  2e-53  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2702  adenylate/guanylate cyclase with Chase sensor  36.57 
 
 		 656 aa  212  2e-53  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  hitchhiker  0.00394792  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1277  hypothetical protein  41.28 
 
 		 701 aa  208  3e-52  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0671  putative adenylate/guanylate cyclase  40.79 
 
 		 593 aa  207  5e-52  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.810132 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1477  putative adenylate/guanylate cyclase  40.86 
 
 		 903 aa  206  9e-52  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.861008  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1276  hypothetical protein  40.57 
 
 		 701 aa  206  1e-51  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3755  adenylate/guanylate cyclase with Chase sensor  33.58 
 
 		 678 aa  200  9e-50  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3744  GAF/PAS/PAC sensor-containing adenylate/guanylate cyclase  36.12 
 
 		 858 aa  200  1.0000000000000001e-49  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1046  adenylate/guanylate cyclase  37.14 
 
 		 726 aa  199  1.0000000000000001e-49  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000197957  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0400  adenylate/guanylate cyclase  37.04 
 
 		 864 aa  199  2.0000000000000003e-49  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3621  putative adenylate/guanylate cyclase  29.06 
 
 		 607 aa  197  5.000000000000001e-49  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0091  adenylate/guanylate cyclase  35.91 
 
 		 859 aa  196  2e-48  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.101175 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4017  adenylyl cyclase class-3/4/guanylyl cyclase  34.71 
 
 		 701 aa  194  7e-48  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.556421 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3163  adenylate/guanylate cyclase with Chase sensor  29.73 
 
 		 643 aa  192  2e-47  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1406  adenylate/guanylate cyclase with Chase sensor  31.92 
 
 		 757 aa  192  2e-47  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.9726 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3049  adenylate/guanylate cyclase  38.75 
 
 		 713 aa  190  7e-47  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3501  adenylate/guanylate cyclase with Chase sensor  29.65 
 
 		 652 aa  189  2e-46  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.703236  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0231  putative adenylate/guanylate cyclase  32.55 
 
 		 675 aa  189  2e-46  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0742762  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2802  adenylate/guanylate cyclase  36.65 
 
 		 702 aa  187  8e-46  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.523853  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2413  GAF/PAS/PAC sensor-containing adenylate/guanylate cyclase  37.37 
 
 		 861 aa  187  9e-46  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4585  adenylate/guanylate cyclase  25.42 
 
 		 744 aa  186  2.0000000000000003e-45  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0862409  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0558  adenylate/guanylate cyclase  29.04 
 
 		 665 aa  186  2.0000000000000003e-45  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.132478  normal  0.264577 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0057  putative Chase2 sensor protein  35.9 
 
 		 650 aa  185  3e-45  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00712657 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0991  adenylate/guanylate cyclase with Chase sensor  34.4 
 
 		 703 aa  184  7e-45  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.358146  normal  0.0115754 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5176  adenylate/guanylyl cyclase  34.89 
 
 		 717 aa  182  2e-44  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.263029  normal  0.588904 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1205  adenylate/guanylate cyclase  35.84 
 
 		 724 aa  179  1e-43  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  decreased coverage  0.000104961  normal  0.0234559 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3735  adenylate/guanylate cyclase  35.86 
 
 		 860 aa  179  2e-43  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0169064  normal  0.419577 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4698  adenylate/guanylate cyclase  30.65 
 
 		 735 aa  176  9.999999999999999e-43  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2543  adenylate/guanylate cyclase  33.56 
 
 		 712 aa  175  2.9999999999999996e-42  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  unclonable  0.00000118563  normal  0.086844 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1986  adenylate/guanylate cyclase  25.3 
 
 		 643 aa  174  6.999999999999999e-42  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0647  adenylate/guanylate cyclase  34.07 
 
 		 911 aa  171  3e-41  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.707555  normal  0.864231 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_03401  hypothetical protein  31.04 
 
 		 645 aa  170  7e-41  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.689704 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0401  adenylate/guanylate cyclase catalytic domain-containing protein  32.95 
 
 		 797 aa  164  5.0000000000000005e-39  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.173302  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18180  putative Chase2 sensor protein  25.91 
 
 		 582 aa  162  2e-38  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000385352  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0940  adenylate/guanylate cyclase with Chase sensor  31.32 
 
 		 597 aa  162  3e-38  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.326683  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0097  putative Chase2 sensor protein  29.22 
 
 		 635 aa  159  1e-37  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2386  adenylate/guanylate cyclase  31.39 
 
 		 681 aa  158  3e-37  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0015  putative adenylate/guanylate cyclase  37.73 
 
 		 284 aa  156  1e-36  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.391867  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0078  adenylate/guanylate cyclase with integral membrane sensor  43.62 
 
 		 585 aa  154  5e-36  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0981996 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1986  adenylate cyclase, putative  39.81 
 
 		 636 aa  154  5.9999999999999996e-36  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  unclonable  0.00000955851  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2729  adenylate/guanylate cyclase  34.3 
 
 		 1119 aa  153  8.999999999999999e-36  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.0163544 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0663  putative adenylate/guanylate cyclase  34.48 
 
 		 632 aa  153  1e-35  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.389437  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_28331  guanylate cyclase  32.54 
 
 		 632 aa  151  5e-35  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.345698 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0831  adenylate/guanylate cyclase  35.9 
 
 		 643 aa  151  5e-35  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0353  adenylate/guanylate cyclase  30.55 
 
 		 699 aa  150  7e-35  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.213992 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2515  adenylyl cyclase class-3/4/guanylyl cyclase  28.39 
 
 		 650 aa  148  4.0000000000000006e-34  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.764918 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2857  adenylate/guanylate cyclase  43.78 
 
 		 1805 aa  147  6e-34  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1538  hypothetical protein  34.09 
 
 		 431 aa  146  1e-33  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2575  adenylate/guanylate cyclase  30.72 
 
 		 740 aa  146  2e-33  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0521558  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0714  adenylate/guanylate cyclase with integral membrane sensor  35.65 
 
 		 637 aa  145  2e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.17996  normal  0.926966 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3029  adenylate/guanylate cyclase  39.73 
 
 		 482 aa  146  2e-33  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00483  adenylate cyclase  32.56 
 
 		 358 aa  145  2e-33  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0108  adenylate/guanylate cyclase with integral membrane sensor  35.38 
 
 		 648 aa  145  2e-33  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0450692  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1610  adenylate/guanylate cyclase with GAF sensor(s)  41.05 
 
 		 528 aa  145  3e-33  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0559  adenylate/guanylate cyclase  35.55 
 
 		 523 aa  144  6e-33  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.855978  normal  0.139536 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1446  hypothetical protein  33.93 
 
 		 441 aa  143  9.999999999999999e-33  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1077  adenylate cyclase  37.93 
 
 		 513 aa  143  9.999999999999999e-33  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3412  adenylate/guanylate cyclase  33.2 
 
 		 1207 aa  143  9.999999999999999e-33  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.210507 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>