150 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TRQ2_0817 on replicon NC_010483
Organism: Thermotoga sp. RQ2



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009486  Tpet_0794  major facilitator transporter  100 
 
 		 384 aa  758    Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0817  major facilitator transporter  100 
 
 		 384 aa  758    Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1554  major facilitator superfamily MFS_1  53.56 
 
 		 399 aa  394  1e-108  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0167  major facilitator transporter  47.79 
 
 		 393 aa  362  6e-99  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.0000162796  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0604  major facilitator superfamily MFS_1  52.23 
 
 		 393 aa  352  5.9999999999999994e-96  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0215  major facilitator transporter  51.6 
 
 		 382 aa  352  7e-96  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0732  major facilitator superfamily MFS_1  49.74 
 
 		 398 aa  346  4e-94  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3736  major facilitator superfamily MFS_1  46.65 
 
 		 389 aa  330  2e-89  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.414858  normal  0.0993496 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0244  major facilitator transporter  46.79 
 
 		 397 aa  316  5e-85  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1461  major facilitator superfamily MFS_1  46.49 
 
 		 395 aa  311  7.999999999999999e-84  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.182385  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0433  major facilitator transporter  43.01 
 
 		 389 aa  282  9e-75  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.174319  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0517  major facilitator transporter  46.98 
 
 		 391 aa  274  2.0000000000000002e-72  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0697  major facilitator superfamily MFS_1  36.48 
 
 		 379 aa  274  2.0000000000000002e-72  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.275752  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3105  major facilitator superfamily MFS_1  37.53 
 
 		 391 aa  265  8e-70  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2770  major facilitator superfamily MFS_1  45.19 
 
 		 388 aa  259  7e-68  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1092  major facilitator transporter  39.53 
 
 		 394 aa  252  6e-66  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0250  major facilitator transporter  39.23 
 
 		 404 aa  246  4e-64  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2321  major facilitator transporter  38.95 
 
 		 409 aa  214  1.9999999999999998e-54  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.359591  normal  0.15275 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12292  integral membrane protein  36.53 
 
 		 409 aa  213  2.9999999999999995e-54  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1549  major facilitator transporter  37.39 
 
 		 423 aa  207  2e-52  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0231798  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2778  major facilitator superfamily transporter  38.53 
 
 		 398 aa  193  5e-48  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.851658  normal  0.145835 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2350  major facilitator transporter  38.26 
 
 		 420 aa  190  4e-47  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.497178  normal  0.0402385 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0690  major facilitator transporter  36.23 
 
 		 415 aa  175  9.999999999999999e-43  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2495  major facilitator transporter  36.46 
 
 		 419 aa  168  1e-40  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.533626 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0594  major facilitator transporter  34.56 
 
 		 364 aa  154  4e-36  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  hitchhiker  0.00448971  hitchhiker  0.00000771738 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1522  major facilitator transporter  35.49 
 
 		 365 aa  147  2.0000000000000003e-34  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.884088  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4759  major facilitator transporter  32.29 
 
 		 402 aa  144  2e-33  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.245052  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3408  major facilitator transporter  32.29 
 
 		 402 aa  144  2e-33  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4108  major facilitator transporter  31.32 
 
 		 402 aa  142  9.999999999999999e-33  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.810639 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6535  major facilitator transporter  31.55 
 
 		 402 aa  141  1.9999999999999998e-32  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.386481 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1324  major facilitator superfamily MFS_1  31.18 
 
 		 403 aa  140  4.999999999999999e-32  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.654344  normal  0.651678 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1003  major facilitator transporter  38.34 
 
 		 370 aa  138  2e-31  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0827  major facilitator transporter  30.34 
 
 		 406 aa  135  1.9999999999999998e-30  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.0216762 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1388  major facilitator superfamily MFS_1  30.81 
 
 		 403 aa  135  1.9999999999999998e-30  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.012215  normal  0.408598 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1653  major facilitator transporter  31.62 
 
 		 388 aa  134  3e-30  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5351  transporter, major facilitator superfamily (MFS)  32.74 
 
 		 404 aa  134  3.9999999999999996e-30  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1766  major facilitator transporter  47.62 
 
 		 364 aa  134  3.9999999999999996e-30  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.000930556 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2281  major facilitator superfamily MFS_1  30 
 
 		 392 aa  132  7.999999999999999e-30  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.976851  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3497  major facilitator transporter  29.47 
 
 		 399 aa  129  9.000000000000001e-29  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.405337  normal  0.792508 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3461  major facilitator superfamily MFS_1  29.1 
 
 		 405 aa  127  2.0000000000000002e-28  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.270087  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1445  hypothetical protein  30.9 
 
 		 400 aa  127  3e-28  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6190  major facilitator transporter  30.14 
 
 		 398 aa  127  3e-28  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2080  major facilitator superfamily transporter  30.59 
 
 		 400 aa  127  4.0000000000000003e-28  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.592815 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1675  major facilitator superfamily MFS_1  30.59 
 
 		 400 aa  127  4.0000000000000003e-28  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3525  major facilitator superfamily MFS_1  28.81 
 
 		 404 aa  126  6e-28  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.63708  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2513  major facilitator transporter  31.15 
 
 		 393 aa  126  6e-28  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1865  major facilitator transporter  29.1 
 
 		 401 aa  124  3e-27  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.418414  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2382  hypothetical protein  28.29 
 
 		 387 aa  122  9.999999999999999e-27  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3000  major facilitator superfamily transporter  29.26 
 
 		 397 aa  122  9.999999999999999e-27  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2241  major facilitator family transporter  29.74 
 
 		 418 aa  121  1.9999999999999998e-26  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.113649  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2529  hypothetical protein  28.17 
 
 		 387 aa  121  1.9999999999999998e-26  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0601  major facilitator superfamily MFS_1  28.61 
 
 		 406 aa  119  6e-26  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3567  major facilitator transporter  30.9 
 
 		 402 aa  118  9.999999999999999e-26  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.468217 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1174  major facilitator superfamily MFS_1  28.69 
 
 		 409 aa  119  9.999999999999999e-26  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.148034  normal  0.0846365 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3378  major facilitator transporter  28.33 
 
 		 400 aa  118  1.9999999999999998e-25  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3368  major facilitator transporter  30.34 
 
 		 404 aa  117  3e-25  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5349  major facilitator superfamily MFS_1  30.59 
 
 		 394 aa  116  6.9999999999999995e-25  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.262681  normal  0.784079 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2454  major facilitator transporter  28.36 
 
 		 389 aa  113  4.0000000000000004e-24  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.117931  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1932  hypothetical protein  28.73 
 
 		 386 aa  113  7.000000000000001e-24  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.629328  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1271  major facilitator transporter  28.05 
 
 		 403 aa  112  8.000000000000001e-24  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.879022 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3944  major facilitator transporter  28.41 
 
 		 401 aa  111  2.0000000000000002e-23  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5059  major facilitator transporter  27.84 
 
 		 401 aa  110  4.0000000000000004e-23  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0787973  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3204  major facilitator transporter  28.12 
 
 		 401 aa  110  5e-23  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4939  major facilitator transporter  26.91 
 
 		 414 aa  110  5e-23  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2744  major facilitator family transporter  29.26 
 
 		 393 aa  108  2e-22  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3659  major facilitator transporter  29.32 
 
 		 406 aa  108  2e-22  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4572  major facilitator transporter  28.9 
 
 		 453 aa  106  6e-22  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.359582 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0729  major facilitator transporter  26.58 
 
 		 420 aa  105  1e-21  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.463384  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1765  major facilitator transporter  27.3 
 
 		 376 aa  105  1e-21  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0906  major facilitator transporter  38.04 
 
 		 386 aa  103  5e-21  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.0319355 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0972  major facilitator superfamily MFS_1  25 
 
 		 388 aa  102  1e-20  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.000000460218  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0805  major facilitator family transporter  26.61 
 
 		 417 aa  101  2e-20  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.03228  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_709  permease of the major facilitator superfamily  26.49 
 
 		 420 aa  99.8  8e-20  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.768296  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0984  major facilitator transporter  35.75 
 
 		 404 aa  97.4  4e-19  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0287  major facilitator superfamily MFS_1  25.67 
 
 		 455 aa  95.1  2e-18  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_07690  major facilitator family transporter  27.65 
 
 		 404 aa  92.8  1e-17  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.632803  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1563  major facilitator superfamily protein  28.98 
 
 		 402 aa  91.3  2e-17  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1461  major facilitator transporter  26.06 
 
 		 402 aa  92  2e-17  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.609311  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2064  major facilitator transporter  27.71 
 
 		 403 aa  92  2e-17  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0362  major facilitator transporter  26.9 
 
 		 407 aa  92  2e-17  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3382  major facilitator superfamily MFS_1  34.21 
 
 		 393 aa  90.5  5e-17  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0566  major facilitator transporter  27 
 
 		 415 aa  90.1  5e-17  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1056  major facilitator transporter  29.75 
 
 		 396 aa  90.1  6e-17  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.0999083  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1177  major facilitator transporter  28.05 
 
 		 399 aa  89.4  9e-17  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.670552 
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_6139  major facilitator superfamily permease  33.88 
 
 		 426 aa  88.6  2e-16  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2019  major facilitator superfamily MFS_1  28.81 
 
 		 386 aa  88.2  2e-16  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.135627  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0054  major facilitator transporter  28.57 
 
 		 403 aa  85.9  0.000000000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1824  major facilitator superfamily MFS_1  27.22 
 
 		 385 aa  84.3  0.000000000000003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  decreased coverage  0.00000433141  normal  0.0989924 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2894  multidrug-efflux transporter  32.34 
 
 		 406 aa  82.8  0.000000000000009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.595534  normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0712  major facilitator superfamily protein  30.11 
 
 		 402 aa  82.8  0.00000000000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0924904  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0750  major facilitator family transporter  30.11 
 
 		 402 aa  82.8  0.00000000000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0810937  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1238  major facilitator superfamily protein  30.11 
 
 		 402 aa  82.4  0.00000000000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1714  major facilitator family transporter  30.11 
 
 		 402 aa  82.8  0.00000000000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0616  major facilitator superfamily MFS_1  27.37 
 
 		 394 aa  82.4  0.00000000000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0455  hypothetical protein  27.37 
 
 		 394 aa  82.4  0.00000000000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2435  major facilitator superfamily protein  29.94 
 
 		 446 aa  81.3  0.00000000000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1163  major facilitator family transporter  29.94 
 
 		 446 aa  81.3  0.00000000000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.151971  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0026  major facilitator transporter  26.62 
 
 		 411 aa  81.3  0.00000000000003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5671  major facilitator superfamily MFS_1  24.75 
 
 		 420 aa  80.9  0.00000000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.507002  normal  0.329972 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1922  major facilitator transporter  30.73 
 
 		 422 aa  80.5  0.00000000000005  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.356092  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>