218 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TM1040_0478 on replicon NC_008044
Organism: Ruegeria sp. TM1040



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008044  TM1040_0478  glycosyl transferase, group 1  100 
 
 		 430 aa  870    Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.521551  normal  0.581976 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1010  glycosyl transferase group 1  24.2 
 
 		 391 aa  74.7  0.000000000003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.513267  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1822  glycosyl transferase, group 1  22.97 
 
 		 389 aa  68.9  0.0000000002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.173501  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2019  glycosyl transferase, group 1  28.31 
 
 		 363 aa  66.2  0.000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.891192  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3362  glycosyl transferase, group 1  29.44 
 
 		 433 aa  65.9  0.000000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.0581443 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0496  glycosyl transferase group 1  27.81 
 
 		 409 aa  65.5  0.000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1843  glycosyl transferase group 1  22.26 
 
 		 396 aa  65.5  0.000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01950  predicted glycosyl transferase  31.71 
 
 		 406 aa  63.2  0.000000009  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.144977  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01939  hypothetical protein  31.71 
 
 		 406 aa  63.2  0.000000009  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.156433  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5286  glycosyl transferase group 1  28.47 
 
 		 409 aa  61.6  0.00000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2333  putative colanic acid biosynthesis glycosyltransferase WcaL  28.72 
 
 		 406 aa  60.8  0.00000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.68197 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2739  glycosyl transferase group 1  25.54 
 
 		 377 aa  59.7  0.0000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.363262  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3964  glycosyl transferase group 1  26.03 
 
 		 1264 aa  58.5  0.0000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2440  putative colanic acid biosynthesis glycosyltransferase WcaL  29.34 
 
 		 406 aa  58.5  0.0000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000788378 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2225  putative colanic acid biosynthesis glycosyltransferase WcaL  28.88 
 
 		 406 aa  58.5  0.0000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.044252  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2326  putative colanic acid biosynthesis glycosyltransferase WcaL  28.74 
 
 		 406 aa  58.2  0.0000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.45919  normal  0.147649 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0172  glycosyl transferase, group 1  30.52 
 
 		 374 aa  57.8  0.0000004  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.0363337  normal  0.131519 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1613  glycosyl transferase group 1  31.88 
 
 		 406 aa  57.4  0.0000005  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0151504  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2978  colanic acid biosynthesis glycosyl transferase WcaL  31.88 
 
 		 406 aa  57.4  0.0000005  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0458092  hitchhiker  0.000111113 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0826  glycosyl transferase group 1  34.72 
 
 		 350 aa  57.4  0.0000005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1018  colanic acid biosynthesis glycosyl transferase WcaL  31.88 
 
 		 406 aa  57  0.0000006  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2336  colanic acid biosynthesis glycosyl transferase WcaL  31.88 
 
 		 406 aa  57  0.0000006  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000162166  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1597  glycosyl transferase group 1  31.88 
 
 		 406 aa  57  0.0000006  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.308201  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2261  glycosyl transferase, group 1  31.17 
 
 		 410 aa  57  0.0000006  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1188  colanic acid biosynthesis glycosyl transferase WcaL  31.88 
 
 		 406 aa  56.6  0.0000008  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0291  glycosyl transferase group 1  30.28 
 
 		 360 aa  55.8  0.000001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.832234  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0359  glycosyl transferase group 1  29.17 
 
 		 410 aa  56.2  0.000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3212  glycosyl transferase group 1  27.01 
 
 		 374 aa  56.2  0.000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.283031  normal  0.707738 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2282  putative colanic acid biosynthesis glycosyltransferase WcaL  28 
 
 		 406 aa  55.8  0.000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000100013 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3204  glycosyl transferase, group 1  32.9 
 
 		 408 aa  55.8  0.000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3285  glycosyl transferase group 1  26.91 
 
 		 395 aa  55.8  0.000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2807  glycosyl transferase group 1  30.22 
 
 		 412 aa  55.5  0.000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3099  glycosyl transferase group 1  24.48 
 
 		 358 aa  55.1  0.000002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2826  glycosyl transferase group 1  30.29 
 
 		 426 aa  55.5  0.000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.342836 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1197  glycosyl transferase, group 1  25.29 
 
 		 374 aa  55.1  0.000003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3114  glycosyl transferase group 1  25.1 
 
 		 369 aa  54.7  0.000003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.0000000000549793  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1926  glycosyl transferase group 1  26.02 
 
 		 395 aa  54.7  0.000003  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  hitchhiker  0.00887755  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3642  glycosyl transferase, group 1  26.29 
 
 		 411 aa  55.1  0.000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0158  glycosyl transferase, group 1  29.5 
 
 		 398 aa  54.3  0.000004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2547  glycosyl transferase group 1  25.17 
 
 		 414 aa  54.7  0.000004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.148819 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0355  glycosyl transferase group 1  28.18 
 
 		 364 aa  54.3  0.000005  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.984651 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4417  glycosyl transferase group 1  27.06 
 
 		 406 aa  53.9  0.000006  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_05360  Glycosyl transferase, group 1  26.71 
 
 		 370 aa  53.5  0.000007  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.012164  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1934  glycosyl transferase, group 1  28.34 
 
 		 367 aa  53.5  0.000008  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.142623 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2519  putative lipopolysaccharide core biosynthesis glycosyl transferase  29.63 
 
 		 384 aa  53.1  0.000009  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.050684 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0282  glycosyl transferase group 1  28.46 
 
 		 364 aa  53.1  0.000009  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2467  glycosyl transferase group 1  31.9 
 
 		 412 aa  53.1  0.00001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2773  glycosyl transferase, group 1  28.85 
 
 		 430 aa  53.1  0.00001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3084  glycosyl transferase group 1  29.61 
 
 		 379 aa  52.8  0.00001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1780  glycosyl transferase group 1  32.89 
 
 		 412 aa  52.8  0.00001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2457  glycosyl transferase, group 1  25.99 
 
 		 386 aa  52.4  0.00001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2658  glycosyl transferase, group 1  30.66 
 
 		 406 aa  52.8  0.00001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2685  glycosyl transferase group 1  28.78 
 
 		 412 aa  52.4  0.00001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.481855  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5117  glycosyltransferase group 1 family protein  28.36 
 
 		 366 aa  52  0.00002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000816463  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2912  glycosyl transferase group 1  28.78 
 
 		 412 aa  52.4  0.00002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.341746  normal  0.205284 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0675  glycosyl transferase, group 1  27.97 
 
 		 376 aa  52  0.00002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.102281  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_14750  glycosyltransferase  27.48 
 
 		 743 aa  52  0.00002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00041718 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4446  glycosyl transferase, group 1  24.58 
 
 		 426 aa  51.6  0.00002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.342615  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6301  glycosyl transferase group 1  28.1 
 
 		 428 aa  52  0.00002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.322189 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3085  glycosyl transferase group 1  25.66 
 
 		 409 aa  51.6  0.00003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1476  glycosyl transferase  22.62 
 
 		 346 aa  51.6  0.00003  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.621422  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1999  glycosyl transferase group 1  25.93 
 
 		 403 aa  51.2  0.00003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0461  lipopolysaccharide biosynthesis-related protein  22.28 
 
 		 383 aa  51.2  0.00004  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  hitchhiker  0.00755363  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1357  glycosyl transferase, group 1  23.72 
 
 		 364 aa  50.8  0.00004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2285  glycosyl transferase group 1  29.3 
 
 		 410 aa  50.8  0.00004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0267673  normal  0.0567423 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4606  putative glycosyl transferase, group 1  26.09 
 
 		 377 aa  50.8  0.00004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0423402  normal  0.43747 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5100  glycosyltransferase group 1 family protein  28.36 
 
 		 366 aa  50.8  0.00005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000151173  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1151  glycosyl transferase group 1  21.84 
 
 		 395 aa  50.8  0.00005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5516  glycosyl transferase, group 1 family protein  28.36 
 
 		 366 aa  50.8  0.00005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3643  glycosyl transferase, group 1  33.66 
 
 		 387 aa  50.8  0.00005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.590189  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS5273  glycosyl transferase, group 1 family protein  28.36 
 
 		 366 aa  50.4  0.00006  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0104828  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5670  group 1 family glycosyl transferase  28.36 
 
 		 366 aa  50.4  0.00006  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00270519  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3395  glycosyl transferase, group 1  28.11 
 
 		 321 aa  50.4  0.00006  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4707  glycosyl transferase group 1  25.71 
 
 		 386 aa  50.4  0.00006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.817147  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3111  group 1 glycosyl transferase  26.17 
 
 		 383 aa  50.1  0.00007  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1045  group 1 glycosyl transferase  26.47 
 
 		 353 aa  50.1  0.00008  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  unclonable  0.00000151909  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2976  glycosyl transferase group 1  28.93 
 
 		 417 aa  50.1  0.00008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.82983  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0341  glycosyl transferase, group 1  23.88 
 
 		 344 aa  50.1  0.00008  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  decreased coverage  0.000281472  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1746  glycosyl transferase, group 1  27.62 
 
 		 421 aa  49.3  0.0001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2465  glycosyl transferase, group 1  24.24 
 
 		 377 aa  49.7  0.0001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.356534  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4007  glycosyl transferase, group 1  24.16 
 
 		 390 aa  49.3  0.0001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.308231  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1530  glycosyltransferase  25.32 
 
 		 366 aa  49.7  0.0001  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.0000442427  normal  0.18466 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3906  glycosyl transferase, group 1  28.29 
 
 		 416 aa  49.7  0.0001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.0901376 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2615  glycosyl transferase, group 1  26.56 
 
 		 395 aa  49.3  0.0001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0615  glycosyl transferase, group 1  30.87 
 
 		 420 aa  49.3  0.0001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.0722468  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0587  Poly(glycerol-phosphate) alpha-glucosyltransferase  23.13 
 
 		 490 aa  49.3  0.0001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0766  glycosyl transferase group 1  30.87 
 
 		 420 aa  49.3  0.0001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.676437  normal  1 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0601  Poly(glycerol-phosphate) alpha-glucosyltransferase  23.13 
 
 		 490 aa  49.3  0.0001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.86353  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0245  glycosyl transferase group 1  26.28 
 
 		 396 aa  49.7  0.0001  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.0172332  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2743  glycosyl transferase group 1  26.67 
 
 		 367 aa  49.3  0.0001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0154  glycosyl transferase, group 1 family protein  28.67 
 
 		 360 aa  48.9  0.0002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3547  1,2-diacylglycerol 3-glucosyltransferase  27.78 
 
 		 393 aa  48.9  0.0002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.220663 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2433  glycosyl transferase, group 1  23.93 
 
 		 417 aa  48.9  0.0002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.287149 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2889  glycosyl transferase group 1  27.94 
 
 		 353 aa  48.9  0.0002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1772  glycosyl transferase, group 1  29.01 
 
 		 359 aa  48.9  0.0002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0387  glycosyl transferase group 1  26.8 
 
 		 364 aa  48.5  0.0002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3442  glycosyl transferase group 1  27.78 
 
 		 385 aa  48.9  0.0002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0688  glycosyl transferase, group 1  25.16 
 
 		 348 aa  48.5  0.0002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0342377  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3107  glycosyl transferase group 1  28.65 
 
 		 426 aa  48.9  0.0002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2020  glycosyl transferase group 1  25.81 
 
 		 376 aa  48.9  0.0002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>