More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TK90_2855 on replicon NC_013930
Organism: Thioalkalivibrio sp. K90mix



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013930  TK90_2855  type II secretion system protein E  100 
 
 		 490 aa  991    Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.370108  normal  0.352738 
 
 
-
 
NC_013930  TK90_2860  type II secretion system protein E  45.85 
 
 		 491 aa  419  1e-116  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.898794  normal  0.474728 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0972  type II secretion system protein E  38.54 
 
 		 528 aa  335  1e-90  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0752  pilus assembly pathway ATPase PilB  35.59 
 
 		 577 aa  263  4e-69  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.440841  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0301  type II secretion system protein E  33.94 
 
 		 554 aa  258  2e-67  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1554  type II secretion system protein E  36.94 
 
 		 553 aa  257  3e-67  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.185461 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0879  type II secretion system protein E  31.96 
 
 		 569 aa  255  1.0000000000000001e-66  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.13472 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1276  type II secretion system protein E  31.46 
 
 		 563 aa  254  2.0000000000000002e-66  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001891  general secretion pathway protein E  40 
 
 		 500 aa  253  5.000000000000001e-66  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3618  general secretory pathway protein E  40.16 
 
 		 523 aa  253  5.000000000000001e-66  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.394925  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1168  type II secretion system protein E  33.87 
 
 		 561 aa  253  6e-66  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00602  general secretory pathway protein E  39.51 
 
 		 501 aa  252  9.000000000000001e-66  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0145  general secretory pathway protein E  39.84 
 
 		 523 aa  252  1e-65  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0170  general secretion pathway protein E  40.27 
 
 		 520 aa  251  2e-65  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3566  general secretion pathway protein E  39.79 
 
 		 521 aa  250  4e-65  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.294519  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2305  general secretion pathway protein E  37.97 
 
 		 503 aa  250  4e-65  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0122  type II secretion system protein E  40.16 
 
 		 514 aa  250  5e-65  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.766789  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0154  general secretory pathway protein E  39.52 
 
 		 521 aa  249  6e-65  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0150  general secretory pathway protein E  39.52 
 
 		 521 aa  249  7e-65  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4205  general secretory pathway protein E  39.52 
 
 		 521 aa  249  7e-65  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.381078  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0154  general secretory pathway protein E  39.52 
 
 		 521 aa  249  7e-65  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.11492 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0098  general secretory pathway protein E  39.89 
 
 		 511 aa  249  1e-64  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0106  general secretory pathway protein E  39.1 
 
 		 514 aa  248  2e-64  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4357  general secretory pathway protein E  39.73 
 
 		 524 aa  247  4e-64  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.555593  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1725  general secretory pathway protein E  34.25 
 
 		 553 aa  246  6e-64  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0138  type II secretion system protein E  31.13 
 
 		 569 aa  246  9e-64  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0152  type II secretion system protein E (GspE)  39.1 
 
 		 521 aa  246  9e-64  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.203719  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4733  general secretory pathway protein E  39.3 
 
 		 523 aa  245  9.999999999999999e-64  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0457665  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0157  type II secretion system protein E (GspE)  39.1 
 
 		 521 aa  245  9.999999999999999e-64  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0152  type II secretion system protein E (GspE)  39.1 
 
 		 521 aa  245  9.999999999999999e-64  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1138  type II secretory pathway, ATPase  32.81 
 
 		 582 aa  245  1.9999999999999999e-63  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_29490  putative type II secretion protein  32.44 
 
 		 575 aa  244  3e-63  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_17740  type II secretion system protein E (GspE)  34.58 
 
 		 557 aa  244  3.9999999999999997e-63  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.898246 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0167  general secretion pathway protein E  39.1 
 
 		 521 aa  243  6e-63  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1072  general secretory pathway protein E  43.96 
 
 		 463 aa  243  6e-63  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.538099  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0426  type II secretion system protein E  31.64 
 
 		 577 aa  243  6e-63  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0285266  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_3071  general secretory pathway protein E  42.77 
 
 		 515 aa  242  1e-62  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000785682 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2923  general secretion pathway protein E  37.47 
 
 		 499 aa  241  1e-62  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2780  type II secretion system protein E  46.13 
 
 		 548 aa  242  1e-62  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2785  general secretion pathway protein E  42.11 
 
 		 497 aa  241  2e-62  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.254947  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3426  general secretory pathway protein E  37.7 
 
 		 497 aa  241  2e-62  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0221  general secretory pathway protein E  42.11 
 
 		 497 aa  241  2e-62  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2663  general secretion pathway protein E  42.11 
 
 		 497 aa  241  2e-62  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1889  general secretion pathway protein E  42.11 
 
 		 497 aa  241  2e-62  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.902732  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0008  general secretory pathway protein E  42.11 
 
 		 497 aa  241  2e-62  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3517  general secretion pathway protein E  42.11 
 
 		 497 aa  241  2e-62  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.385541  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0008  general secretory pathway protein E  42.11 
 
 		 497 aa  241  2e-62  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3246  general secretory pathway protein GspE  39.73 
 
 		 497 aa  241  2.9999999999999997e-62  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.827332 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3137  general secretory pathway protein E  39.73 
 
 		 497 aa  240  2.9999999999999997e-62  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0117  type IV-A pilus assembly ATPase PilB  31.75 
 
 		 571 aa  240  2.9999999999999997e-62  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.00247138  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02837  hypothetical type II secretion protein GspE  39.73 
 
 		 497 aa  240  5e-62  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  unclonable  0.00000237275  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02787  hypothetical protein  39.73 
 
 		 497 aa  240  5e-62  Escherichia coli BL21  Bacteria  unclonable  0.0000039107  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0051  general secretory pathway protein E  42.11 
 
 		 499 aa  239  5.999999999999999e-62  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.582006  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1392  type II secretion system protein E  30.37 
 
 		 571 aa  239  9e-62  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.025124 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0009  Type II secretion system gspE  42.11 
 
 		 499 aa  239  9e-62  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0061  general secretory pathway protein E  42.11 
 
 		 499 aa  239  9e-62  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.212522  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0080  general secretory pathway protein E  42.11 
 
 		 499 aa  239  1e-61  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0061  general secretory pathway protein E  42.11 
 
 		 499 aa  239  1e-61  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3271  type II secretion system protein E  33.14 
 
 		 574 aa  238  2e-61  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3360  type II secretion system protein E  32.51 
 
 		 585 aa  238  2e-61  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2744  type II secretion system protein E  37.95 
 
 		 527 aa  238  2e-61  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.804654  normal  0.322952 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1010  type II secretion system protein E  33.63 
 
 		 598 aa  238  3e-61  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0008  general secretion pathway protein E  41.49 
 
 		 497 aa  237  3e-61  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0543  type II secretion system protein E  43.96 
 
 		 462 aa  237  3e-61  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0062  general secretory pathway protein E  39.63 
 
 		 498 aa  237  3e-61  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1347  type II secretion system protein E  32.14 
 
 		 556 aa  237  4e-61  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3243  type II secretion system protein E  42.27 
 
 		 499 aa  237  4e-61  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.286765 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2530  general secretory pathway protein E  39.78 
 
 		 477 aa  237  4e-61  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.247366  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_16170  type II secretion system protein E, GspE  32.24 
 
 		 569 aa  237  4e-61  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00254  putative Mannose-sensitive agglutinin (MSHA) biogenesis protein MshE (pilus type IV)  34.39 
 
 		 570 aa  236  5.0000000000000005e-61  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4590  general secretion pathway protein E  38.89 
 
 		 509 aa  236  6e-61  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3937  general secretory pathway protein E  42.28 
 
 		 495 aa  236  6e-61  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.279584 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1964  general secretion pathway protein E  34 
 
 		 583 aa  236  7e-61  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4500  putative general secretion pathway protein E  42.28 
 
 		 522 aa  236  7e-61  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.155561 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0232  general secretory pathway protein E  38.1 
 
 		 525 aa  236  7e-61  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03957  Type II secretory pathway, ATPase PulE-like protein  39.48 
 
 		 519 aa  235  1.0000000000000001e-60  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0888  type II secretion system protein E  32.49 
 
 		 553 aa  236  1.0000000000000001e-60  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0226  general secretory pathway protein E  37.09 
 
 		 518 aa  235  1.0000000000000001e-60  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1755  general secretory pathway protein E  42.18 
 
 		 462 aa  234  2.0000000000000002e-60  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.571927  normal  0.572296 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1231  L(+)-tartrate dehydratase subunit beta (L-TTD beta)  34.29 
 
 		 583 aa  234  2.0000000000000002e-60  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0968  type II secretion system protein E  33.03 
 
 		 561 aa  234  2.0000000000000002e-60  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.197479  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1322  type II secretion system protein E  30.97 
 
 		 553 aa  234  2.0000000000000002e-60  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.0787535 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0755  general secretory pathway protein E  42.62 
 
 		 469 aa  234  3e-60  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.179891 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1300  general secretory pathway protein E  38.86 
 
 		 498 aa  233  4.0000000000000004e-60  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1653  type IV-A pilus assembly ATPase PilB  31.44 
 
 		 568 aa  234  4.0000000000000004e-60  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0387  general secretory pathway protein E  36.39 
 
 		 493 aa  233  5e-60  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002620  TC0860  general secretion pathway protein E  38.05 
 
 		 500 aa  233  5e-60  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0387  general secretory pathway protein E  36.39 
 
 		 493 aa  233  5e-60  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.0402565 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3314  type II secretion system protein E  38.99 
 
 		 491 aa  233  5e-60  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3520  general secretory pathway protein E  36.39 
 
 		 493 aa  233  5e-60  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.189411  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3528  type II secretion system protein E  40.83 
 
 		 586 aa  233  5e-60  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.305202  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3137  pili biogenesis ATPase  41.56 
 
 		 474 aa  233  6e-60  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.629616  hitchhiker  0.0029573 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1884  type II secretion system protein E  32.94 
 
 		 570 aa  233  8.000000000000001e-60  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.000000626903  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1273  type II protein secretion ATPase LspE  36.68 
 
 		 494 aa  233  8.000000000000001e-60  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0641  type II secretion system protein E  29.82 
 
 		 560 aa  233  8.000000000000001e-60  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0536  type II secretion system protein E  36.27 
 
 		 605 aa  233  8.000000000000001e-60  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.466146  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2399  general secretory pathway protein E  39.1 
 
 		 515 aa  233  8.000000000000001e-60  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000178866 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2859  general secretory pathway protein E  38.03 
 
 		 498 aa  232  1e-59  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2652  type II secretion system protein E  39.2 
 
 		 505 aa  232  1e-59  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1349  general secretory pathway protein E  37.8 
 
 		 520 aa  232  1e-59  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>