More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TK90_1464 on replicon NC_013889
Organism: Thioalkalivibrio sp. K90mix



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013889  TK90_1464  Pirin domain protein  100 
 
 
282 aa  573  1.0000000000000001e-163  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1025  Pirin domain protein  52.71 
 
 
283 aa  283  3.0000000000000004e-75  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1135  Pirin-like protein  50.54 
 
 
282 aa  269  4e-71  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.120417  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0700  pirin domain-containing protein  45.71 
 
 
286 aa  236  2e-61  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0271  pirin family protein  46.3 
 
 
282 aa  237  2e-61  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2950  Pirin-like protein  45.68 
 
 
288 aa  236  3e-61  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000589  pirin-related protein  43.98 
 
 
282 aa  236  3e-61  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0425395  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3771  pirin domain-containing protein  45.8 
 
 
293 aa  231  9e-60  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1885  hypothetical protein  44.64 
 
 
285 aa  226  2e-58  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06417  hypoxanthine phosphoribosyltransferase  44.57 
 
 
282 aa  226  5.0000000000000005e-58  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2994  pirin family protein  46.35 
 
 
284 aa  223  2e-57  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1771  pirin family protein  44.28 
 
 
277 aa  222  4.9999999999999996e-57  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3297  Pirin domain protein  45.32 
 
 
294 aa  222  7e-57  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.414004  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0892  Pirin domain protein  44.09 
 
 
285 aa  221  7e-57  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0867  pirin domain-containing protein  43.73 
 
 
285 aa  221  8e-57  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0902  pirin domain-containing protein  43.86 
 
 
290 aa  221  9e-57  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3859  hypothetical protein  41.94 
 
 
284 aa  221  9e-57  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0744  pirin domain-containing protein  43.32 
 
 
285 aa  221  9.999999999999999e-57  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3469  pirin domain-containing protein  43.97 
 
 
285 aa  221  9.999999999999999e-57  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3385  hypoxanthine phosphoribosyltransferase  43.93 
 
 
285 aa  220  1.9999999999999999e-56  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3276  pirin domain-containing protein  43.32 
 
 
285 aa  220  1.9999999999999999e-56  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0895  pirin family protein  43.64 
 
 
285 aa  219  5e-56  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3111  pirin domain-containing protein  43.25 
 
 
295 aa  219  5e-56  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1238  pirin domain-containing protein  43.17 
 
 
284 aa  219  5e-56  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.464073  normal  0.563177 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2497  Pirin, N-terminal:Pirin, C-terminal  42.16 
 
 
310 aa  216  4e-55  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01867  Pirin-like protein  41.26 
 
 
287 aa  216  4e-55  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.282676  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0487  pirin domain-containing protein  42.7 
 
 
284 aa  213  1.9999999999999998e-54  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.974974  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1626  Pirin, N-terminal:Pirin, C-terminal  41.58 
 
 
284 aa  213  2.9999999999999995e-54  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0798  Pirin-like protein  41.96 
 
 
307 aa  211  1e-53  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.58528 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3553  pirin domain-containing protein  42.6 
 
 
284 aa  209  3e-53  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3217  pirin domain-containing protein  41.37 
 
 
288 aa  209  3e-53  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0805  Pirin-like  42.86 
 
 
293 aa  208  7e-53  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0305  pirin domain-containing protein  41.67 
 
 
299 aa  205  6e-52  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1390  Pirin, N-terminal:Pirin, C-terminal  40.74 
 
 
304 aa  205  6e-52  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.0000265912  normal  0.285485 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3743  pirin  42.24 
 
 
289 aa  203  2e-51  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0436  Pirin domain protein  39.58 
 
 
298 aa  202  3e-51  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0129  pirin domain-containing protein  40.59 
 
 
294 aa  201  8e-51  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0459235  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0422  Pirin domain protein  39.24 
 
 
298 aa  200  3e-50  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0605401  hitchhiker  0.000103661 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02027  pirin  42.36 
 
 
285 aa  199  3.9999999999999996e-50  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.223829  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2793  Pirin domain protein  38.8 
 
 
312 aa  198  9e-50  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1064  hypothetical protein  42.81 
 
 
286 aa  197  1.0000000000000001e-49  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.435244  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0775  pirin domain-containing protein  42.5 
 
 
274 aa  197  1.0000000000000001e-49  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.000168068  normal  0.408223 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1676  Pirin domain protein  37.72 
 
 
290 aa  196  3e-49  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.105924  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1200  putative pirin  41.11 
 
 
283 aa  196  4.0000000000000005e-49  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0541  pirin-like protein  39.58 
 
 
298 aa  196  5.000000000000001e-49  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0687971  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4590  Pirin-like  37.09 
 
 
301 aa  195  8.000000000000001e-49  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  hitchhiker  0.00966452  normal  0.667256 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0017  Pirin domain protein  38.54 
 
 
299 aa  194  1e-48  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  hitchhiker  0.00905247  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3224  pirin family protein  40.29 
 
 
290 aa  191  8e-48  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2828  Pirin domain protein  40.29 
 
 
290 aa  191  8e-48  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2003  Pirin-like  38.93 
 
 
280 aa  191  9e-48  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.000755932  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1118  hypothetical protein  40.14 
 
 
285 aa  191  2e-47  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1798  Pirin domain protein  35.97 
 
 
301 aa  190  2e-47  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.940307  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0443  pirin domain-containing protein  41.42 
 
 
283 aa  189  4e-47  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.401256  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0825  pirin family protein  37.62 
 
 
302 aa  189  5.999999999999999e-47  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1669  Pirin domain protein  39.24 
 
 
286 aa  188  9e-47  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0781406  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2143  pirin like protein  36.96 
 
 
303 aa  187  1e-46  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.390987 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3438  Pirin-like  35.64 
 
 
303 aa  187  1e-46  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1742  Pirin domain protein  38.54 
 
 
286 aa  188  1e-46  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.700387  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4622  Pirin domain protein  36.63 
 
 
303 aa  187  2e-46  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.07821 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2205  Pirin-like  38.19 
 
 
286 aa  187  2e-46  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0972044  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2986  Pirin domain protein  40.77 
 
 
283 aa  187  2e-46  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.532155  normal  0.0758996 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0013  hypothetical protein  38.72 
 
 
277 aa  186  5e-46  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0645  Pirin domain protein  39.72 
 
 
283 aa  186  5e-46  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1191  pirin domain-containing protein  39.24 
 
 
299 aa  185  7e-46  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.343867  normal  0.264863 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0955  Pirin domain protein  38.46 
 
 
285 aa  184  1.0000000000000001e-45  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1279  Pirin-like  37.86 
 
 
282 aa  183  3e-45  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.639009 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0013  hypothetical protein  39.1 
 
 
279 aa  182  4.0000000000000006e-45  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1112  hypothetical protein  38.95 
 
 
285 aa  182  4.0000000000000006e-45  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.663913  normal  0.850043 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0377  pirin protein  35.62 
 
 
303 aa  182  6e-45  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.107819  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0684  pirin domain-containing protein  37.29 
 
 
302 aa  181  8.000000000000001e-45  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.00758399  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2160  Pirin-like  35.74 
 
 
303 aa  180  2e-44  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.194706 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4604  Pirin domain protein  39.6 
 
 
331 aa  180  2.9999999999999997e-44  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0130352  hitchhiker  0.0000248585 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3449  pirin domain-containing protein  37.29 
 
 
302 aa  179  4e-44  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0455  pirin domain-containing protein  38.63 
 
 
296 aa  179  4e-44  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.131978 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1092  pirin domain-containing protein  38.25 
 
 
288 aa  178  8e-44  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3135  pirin domain-containing protein  39.85 
 
 
279 aa  178  8e-44  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3239  Pirin domain protein  36.33 
 
 
309 aa  177  2e-43  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1247  pirin domain-containing protein  35.84 
 
 
306 aa  177  2e-43  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.466295  hitchhiker  0.00358039 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0101  Pirin domain protein  36.84 
 
 
300 aa  177  2e-43  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1007  Pirin domain protein  39.49 
 
 
286 aa  174  9.999999999999999e-43  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1469  pirin domain-containing protein  36.93 
 
 
298 aa  174  9.999999999999999e-43  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1021  Pirin domain protein  36 
 
 
309 aa  174  1.9999999999999998e-42  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.58625  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4404  Pirin domain-containing protein  38.31 
 
 
320 aa  174  1.9999999999999998e-42  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.355425  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0339  pirin domain-containing protein  36.43 
 
 
289 aa  173  2.9999999999999996e-42  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4026  Pirin domain protein  37.04 
 
 
278 aa  171  1e-41  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0555  Pirin domain protein  37.5 
 
 
302 aa  171  2e-41  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1948  pirin domain-containing protein  39.46 
 
 
346 aa  170  3e-41  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1949  pirin domain-containing protein  39.86 
 
 
290 aa  169  4e-41  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.199065  normal 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1234  Pirin domain protein  41.13 
 
 
318 aa  167  2e-40  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.816582  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1404  Pirin domain protein  38.1 
 
 
292 aa  166  5.9999999999999996e-40  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.160916  normal  0.121608 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7689  pirin domain-containing protein  37.86 
 
 
328 aa  164  1.0000000000000001e-39  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.684027 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2191  Pirin domain protein  35.86 
 
 
292 aa  162  7e-39  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0614  pirin domain-containing protein  36.93 
 
 
290 aa  161  9e-39  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0516  pirin domain-containing protein  36.93 
 
 
290 aa  161  9e-39  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1928  pirin family protein  36.93 
 
 
290 aa  161  9e-39  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1509  pirin family protein  37.28 
 
 
290 aa  160  2e-38  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.589692  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0780  pirin domain-containing protein  37.28 
 
 
290 aa  160  2e-38  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1074  pirin domain-containing protein  39.02 
 
 
290 aa  160  2e-38  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.326014  normal 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_2096  pirin family protein  37.28 
 
 
290 aa  160  2e-38  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0093  pirin domain-containing protein  35.2 
 
 
328 aa  160  3e-38  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.28108  normal  0.0211992 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>