More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TDE0104 on replicon NC_002967
Organism: Treponema denticola ATCC 35405



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002967  TDE0104  3-dehydroquinate synthase  100 
 
 		 343 aa  702    Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02181  3-dehydroquinate synthase  35.42 
 
 		 370 aa  197  3e-49  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2358  3-dehydroquinate synthase  38.85 
 
 		 367 aa  193  3e-48  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0216034  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0287  3-dehydroquinate synthase  37.82 
 
 		 359 aa  191  2e-47  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1423  3-dehydroquinate synthase  36.48 
 
 		 356 aa  191  2e-47  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000905299  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0248  3-dehydroquinate synthase  36.03 
 
 		 359 aa  189  8e-47  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.000249526  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3697  3-dehydroquinate synthase  36.03 
 
 		 359 aa  188  1e-46  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0194599  normal  0.984962 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_07351  3-dehydroquinate synthase  35.09 
 
 		 363 aa  187  2e-46  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.374407  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3893  3-dehydroquinate synthase  35.66 
 
 		 359 aa  187  2e-46  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00000115633  normal  0.386529 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0778  3-dehydroquinate synthase  37 
 
 		 363 aa  187  3e-46  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.173055  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5301  3-dehydroquinate synthase  38.14 
 
 		 367 aa  186  5e-46  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_07551  3-dehydroquinate synthase  37.02 
 
 		 363 aa  186  5e-46  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0881  3-dehydroquinate synthase  34.59 
 
 		 364 aa  186  7e-46  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.100912  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0733  3-dehydroquinate synthase  34.59 
 
 		 364 aa  186  7e-46  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009359  OSTLU_38791  predicted protein  36.79 
 
 		 368 aa  186  7e-46  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0409062  normal  1 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_07371  3-dehydroquinate synthase  35.09 
 
 		 363 aa  186  7e-46  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3705  3-dehydroquinate synthase  34.47 
 
 		 359 aa  184  2.0000000000000003e-45  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.0000820021  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0682  3-dehydroquinate synthase  34.15 
 
 		 363 aa  184  2.0000000000000003e-45  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.833789  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0703  3-dehydroquinate synthase  35.28 
 
 		 366 aa  184  2.0000000000000003e-45  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0239  3-dehydroquinate synthase  31.63 
 
 		 359 aa  184  2.0000000000000003e-45  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  unclonable  0.00000000355339  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4386  3-dehydroquinate synthase  36.55 
 
 		 363 aa  182  7e-45  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00709401 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1056  3-dehydroquinate synthase  36.77 
 
 		 355 aa  182  7e-45  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.859657  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3367  3-dehydroquinate synthase  32.7 
 
 		 359 aa  182  8.000000000000001e-45  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0475831  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4222  3-dehydroquinate synthase  35.31 
 
 		 366 aa  182  9.000000000000001e-45  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.950152 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4183  3-dehydroquinate synthase  35.31 
 
 		 366 aa  182  9.000000000000001e-45  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_07421  3-dehydroquinate synthase  35.91 
 
 		 368 aa  181  1e-44  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00250573 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2969  3-dehydroquinate synthase  32.23 
 
 		 368 aa  181  1e-44  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.351532  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4112  3-dehydroquinate synthase  35.15 
 
 		 358 aa  181  1e-44  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0000335612  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0214  3-dehydroquinate synthase  34.14 
 
 		 358 aa  181  2e-44  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.0019522  hitchhiker  0.0093174 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4201  3-dehydroquinate synthase  35.15 
 
 		 358 aa  181  2e-44  Shewanella baltica OS195  Bacteria  decreased coverage  0.0000411195  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4002  3-dehydroquinate synthase  35.15 
 
 		 358 aa  181  2e-44  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.00000746069  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4083  3-dehydroquinate synthase  35.15 
 
 		 358 aa  181  2e-44  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000010907  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3247  3-dehydroquinate synthase  32.52 
 
 		 368 aa  180  2.9999999999999997e-44  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4264  3-dehydroquinate synthase  33.13 
 
 		 358 aa  180  2.9999999999999997e-44  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00482631  normal  0.106006 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2136  3-dehydroquinate synthase  31.31 
 
 		 358 aa  179  5.999999999999999e-44  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.122395  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2132  3-dehydroquinate synthase  38.25 
 
 		 362 aa  179  8e-44  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1240  3-dehydroquinate synthase  34.21 
 
 		 369 aa  179  9e-44  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0331  3-dehydroquinate synthase  35.44 
 
 		 359 aa  178  1e-43  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.274632  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1146  3-dehydroquinate synthase  34.6 
 
 		 370 aa  177  2e-43  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0704  3-dehydroquinate synthase  33.96 
 
 		 367 aa  177  2e-43  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0116  3-dehydroquinate synthase  34.9 
 
 		 368 aa  177  2e-43  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_5179  3-dehydroquinate synthase  35.86 
 
 		 364 aa  177  2e-43  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.981519  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0610  3-dehydroquinate synthase  33.74 
 
 		 370 aa  177  3e-43  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0735  3-dehydroquinate synthase  33.96 
 
 		 367 aa  177  3e-43  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.116609  normal  1 
 
 
-
 
NC_011678  PHATRDRAFT_20809  3-dehydroquinate synthase  34.91 
 
 		 431 aa  177  3e-43  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0341  3-dehydroquinate synthase  33.45 
 
 		 358 aa  177  3e-43  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3030  3-dehydroquinate synthase  32.22 
 
 		 361 aa  177  3e-43  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.213133  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_5008  3-dehydroquinate synthase  36.08 
 
 		 363 aa  176  4e-43  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1441  3-dehydroquinate synthase  37.29 
 
 		 361 aa  176  5e-43  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2685  3-dehydroquinate synthase  35.21 
 
 		 362 aa  176  6e-43  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.0391774 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0691  3-dehydroquinate synthase  33.44 
 
 		 370 aa  176  7e-43  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0787  3-dehydroquinate synthase  34.09 
 
 		 388 aa  176  7e-43  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2900  3-dehydroquinate synthase  32.22 
 
 		 368 aa  175  8e-43  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.146748 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0688  3-dehydroquinate synthase  35.06 
 
 		 350 aa  175  8e-43  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0376  3-dehydroquinate synthase  32.99 
 
 		 358 aa  176  8e-43  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  decreased coverage  0.00801427  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0164  3-dehydroquinate synthase  36.33 
 
 		 356 aa  175  8e-43  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.300731  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5128  3-dehydroquinate synthase  35.15 
 
 		 376 aa  175  9e-43  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1820  3-dehydroquinate synthase  34.33 
 
 		 360 aa  175  9.999999999999999e-43  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.774122  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0995  3-dehydroquinate synthase  34.71 
 
 		 369 aa  175  9.999999999999999e-43  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0964  3-dehydroquinate synthase  34.71 
 
 		 369 aa  175  9.999999999999999e-43  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0525  3-dehydroquinate synthase  35.03 
 
 		 368 aa  175  9.999999999999999e-43  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0679  3-dehydroquinate synthase  31.82 
 
 		 372 aa  174  9.999999999999999e-43  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.241981 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4951  3-dehydroquinate synthase  35.15 
 
 		 365 aa  175  9.999999999999999e-43  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5078  3-dehydroquinate synthase  35.15 
 
 		 365 aa  174  1.9999999999999998e-42  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0806  3-dehydroquinate synthase  38.57 
 
 		 350 aa  174  1.9999999999999998e-42  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.117722  normal  0.388542 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0388  3-dehydroquinate synthase  34.81 
 
 		 365 aa  174  1.9999999999999998e-42  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2455  3-dehydroquinate synthase  34.63 
 
 		 361 aa  174  1.9999999999999998e-42  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0307726  normal  0.543805 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1283  3-dehydroquinate synthase  36.36 
 
 		 367 aa  174  2.9999999999999996e-42  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.637861  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0689  3-dehydroquinate synthase  34.74 
 
 		 350 aa  173  3.9999999999999995e-42  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3037  3-dehydroquinate synthase  33.44 
 
 		 370 aa  173  3.9999999999999995e-42  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5126  3-dehydroquinate synthase  35.05 
 
 		 367 aa  173  5e-42  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3266  3-dehydroquinate synthase  36.3 
 
 		 368 aa  173  5e-42  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.966202  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5574  3-dehydroquinate synthase  34.24 
 
 		 372 aa  172  5e-42  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.751857  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3597  3-dehydroquinate synthase  34.24 
 
 		 361 aa  172  5.999999999999999e-42  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00180341  hitchhiker  0.0000000386379 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_15571  3-dehydroquinate synthase  36.7 
 
 		 372 aa  172  6.999999999999999e-42  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.341963 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1528  3-dehydroquinate synthase  35.93 
 
 		 370 aa  172  7.999999999999999e-42  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0261057  normal  0.35523 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2793  3-dehydroquinate synthase  34.34 
 
 		 363 aa  172  7.999999999999999e-42  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2145  3-dehydroquinate synthase  38.63 
 
 		 375 aa  172  9e-42  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000281313  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1854  3-dehydroquinate synthase  34.91 
 
 		 359 aa  172  1e-41  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0869188  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0253  3-dehydroquinate synthase  32.92 
 
 		 359 aa  171  1e-41  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1573  3-dehydroquinate synthase  34.69 
 
 		 361 aa  172  1e-41  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1003  3-dehydroquinate synthase  33.33 
 
 		 376 aa  172  1e-41  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1478  3-dehydroquinate synthase  35.57 
 
 		 370 aa  171  2e-41  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.389848  normal  0.464781 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3129  3-dehydroquinate synthase  34.95 
 
 		 368 aa  171  2e-41  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2818  3-dehydroquinate synthase  35.57 
 
 		 370 aa  171  2e-41  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0978  3-dehydroquinate synthase  34.77 
 
 		 360 aa  171  2e-41  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.105687  normal  0.163627 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0665  3-dehydroquinate synthase  32.87 
 
 		 355 aa  171  2e-41  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  decreased coverage  0.0000291417  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2205  3-dehydroquinate synthase  35.06 
 
 		 366 aa  171  2e-41  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000150156  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1427  3-dehydroquinate synthase  36.03 
 
 		 363 aa  170  3e-41  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2318  3-dehydroquinate synthase  34.92 
 
 		 615 aa  170  3e-41  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0070259 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1538  3-dehydroquinate synthase  36.03 
 
 		 363 aa  170  3e-41  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0444  3-dehydroquinate synthase  35.1 
 
 		 359 aa  170  3e-41  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.0095589  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1114  3-dehydroquinate synthase  34.62 
 
 		 362 aa  170  3e-41  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0407056  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2564  3-dehydroquinate synthase  34.5 
 
 		 380 aa  170  4e-41  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.443147 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3772  3-dehydroquinate synthase  35.29 
 
 		 361 aa  170  4e-41  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002328  3-dehydroquinate synthase  33.11 
 
 		 366 aa  169  5e-41  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  decreased coverage  0.00000221553  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2746  3-dehydroquinate synthase  34.67 
 
 		 359 aa  169  6e-41  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3757  3-dehydroquinate synthase  34.67 
 
 		 359 aa  169  6e-41  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1758  3-dehydroquinate synthase  34.67 
 
 		 359 aa  169  6e-41  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3699  3-dehydroquinate synthase  34.67 
 
 		 359 aa  169  6e-41  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  decreased coverage  0.00532697  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>