117 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TBFG_11248 on replicon NC_009565
Organism: Mycobacterium tuberculosis F11



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009565  TBFG_11248  sec-independent translocase  100 
 
 
131 aa  263  8e-70  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0984178  hitchhiker  0.00266671 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3991  sec-independent translocase  66.19 
 
 
137 aa  175  2e-43  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.344864  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4065  sec-independent translocase  66.19 
 
 
137 aa  175  2e-43  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4005  sec-independent translocase  66.19 
 
 
137 aa  175  2e-43  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.13737  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4493  sec-independent translocase  63.38 
 
 
142 aa  174  5e-43  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.152495  normal  0.0793539 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2203  sec-independent translocase  63.83 
 
 
141 aa  172  1.9999999999999998e-42  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.873436  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1860  twin-arginine translocation protein, TatB subunit  62.37 
 
 
160 aa  132  1.9999999999999998e-30  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.263306  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1070  twin-arginine translocation protein, TatB subunit  58.06 
 
 
159 aa  122  1e-27  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.684223  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0798  sec-independent translocase  41.43 
 
 
129 aa  100  8e-21  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.612385  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_06460  sec-independent translocase  40.88 
 
 
137 aa  99.4  2e-20  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0887  sec-independent translocase  43.62 
 
 
194 aa  77  0.00000000000008  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0281514  normal  0.284391 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3829  sec-independent translocase  41.3 
 
 
179 aa  75.1  0.0000000000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.565106  normal  0.0266894 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2159  twin-arginine translocation protein, TatB subunit  42.25 
 
 
231 aa  74.7  0.0000000000004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0902166  hitchhiker  0.00343469 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1126  sec-independent translocation protein mttA/Hcf106  36.67 
 
 
120 aa  62  0.000000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0776102  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4416  putative sec-independent protein secretion pathway component TatB  30.65 
 
 
180 aa  57.4  0.00000006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.918064 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0164  Sec-independent protein translocase protein TatB  36.84 
 
 
157 aa  56.6  0.0000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3012  twin-arginine translocation protein, TatB subunit  34.88 
 
 
120 aa  56.2  0.0000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.706608 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3225  peptidyl-tRNA hydrolase  29.9 
 
 
169 aa  55.1  0.0000003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8412  Sec-independent protein secretion pathway components-like protein  29.69 
 
 
123 aa  54.3  0.0000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.298591  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1444  sec-independent translocase  31.5 
 
 
112 aa  54.3  0.0000006  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.608572  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0706  sec-independent translocation protein mttA/Hcf106  27.78 
 
 
146 aa  54.3  0.0000006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I3000  sec-independent translocase  36.99 
 
 
125 aa  54.3  0.0000006  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0319  twin-arginine translocation protein, TatB subunit  46.43 
 
 
136 aa  53.5  0.000001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1154  twin-arginine translocation protein, TatB subunit  34.19 
 
 
128 aa  53.5  0.000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.184367  hitchhiker  0.00921719 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3911  twin-arginine translocation protein, TatB subunit  36.71 
 
 
190 aa  53.5  0.000001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4052  twin-arginine translocation protein, TatB subunit  30.28 
 
 
197 aa  53.1  0.000001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0381  sec-independent translocase  34.07 
 
 
105 aa  52  0.000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1187  sec-independent translocation protein mttA/Hcf106  36.64 
 
 
118 aa  52.4  0.000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.444668  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3891  hypothetical protein  35.8 
 
 
113 aa  52.4  0.000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000131978  normal  0.0356458 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3206  twin-arginine translocation protein TatB  29.57 
 
 
125 aa  51.6  0.000003  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0131  twin-arginine translocation protein, TatB subunit  35.9 
 
 
234 aa  52  0.000003  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2918  twin-arginine translocation protein, TatB subunit  35.48 
 
 
127 aa  51.6  0.000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0437928  normal  0.0202972 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4243  twin-arginine translocation protein, TatB subunit  35 
 
 
203 aa  52  0.000003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.828314  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2428  sec-independent translocase  32.71 
 
 
133 aa  51.6  0.000004  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03730  sec-independent translocase  33.75 
 
 
171 aa  51.2  0.000005  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4142  twin-arginine translocation protein, TatB subunit  33.75 
 
 
171 aa  51.2  0.000005  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4061  sec-independent translocase  33.75 
 
 
171 aa  51.2  0.000005  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4358  sec-independent translocase  33.75 
 
 
171 aa  51.2  0.000005  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001923  twin-arginine translocation protein TatB  32.77 
 
 
132 aa  51.2  0.000005  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4171  sec-independent translocase  33.75 
 
 
171 aa  51.2  0.000005  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00147266 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4220  sec-independent translocase  33.75 
 
 
171 aa  51.2  0.000005  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000636785 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5278  sec-independent translocase  33.75 
 
 
171 aa  51.2  0.000005  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.47844  normal  0.252522 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03679  hypothetical protein  33.75 
 
 
171 aa  51.2  0.000005  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00566  sec-independent translocase  36.11 
 
 
132 aa  50.8  0.000006  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4254  sec-independent translocase  32.5 
 
 
182 aa  50.4  0.000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4301  sec-independent translocase  32.5 
 
 
182 aa  50.4  0.000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.275024  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4182  sec-independent translocase  32.5 
 
 
182 aa  50.4  0.000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.595249  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4205  sec-independent translocase  32.5 
 
 
182 aa  50.4  0.000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4361  sec-independent translocase  32.5 
 
 
182 aa  50.4  0.000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4214  twin-arginine translocation protein, TatB subunit  38.27 
 
 
99 aa  50.4  0.000009  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4309  sec-independent translocase  33.75 
 
 
171 aa  50.1  0.00001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1789  twin-arginine translocation protein TatB  29.17 
 
 
178 aa  48.9  0.00002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2514  twin-arginine translocation protein TatB  32.14 
 
 
172 aa  48.5  0.00003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.641034  normal  0.463559 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2513  hypothetical protein  31.33 
 
 
137 aa  48.9  0.00003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000100868 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1778  twin-arginine translocation protein TatB  36.62 
 
 
180 aa  47.8  0.00005  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0260824  normal  0.022069 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0070  twin-arginine translocation protein, TatB subunit  28.15 
 
 
134 aa  47.8  0.00005  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0546  Sec-independent protein translocase TatB  40 
 
 
184 aa  47.4  0.00006  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0338554  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0601  sec-independent translocase  34.19 
 
 
119 aa  47.8  0.00006  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.836249  normal  0.0805568 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1849  twin-arginine translocation protein, TatA/E family subunit  39.58 
 
 
69 aa  47.4  0.00006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.194429 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7939  sec-independent translocase  33.33 
 
 
143 aa  47.4  0.00006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1667  twin-arginine translocation protein, TatB subunit  56.1 
 
 
138 aa  47  0.00008  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2744  twin-arginine translocation protein TatB  34.12 
 
 
188 aa  47  0.00009  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.640923  normal  0.254094 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4186  twin-arginine translocation protein, TatB subunit  43.55 
 
 
96 aa  47  0.00009  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3044  Sec-independent protein translocase protein TatB  29.17 
 
 
102 aa  46.6  0.0001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3374  Sec-independent protein translocase TatB  41.1 
 
 
120 aa  46.6  0.0001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0666  sec-independent translocation protein mttA/Hcf106  45.1 
 
 
214 aa  46.2  0.0001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0753  twin-arginine translocation protein, TatB subunit  25.22 
 
 
156 aa  46.6  0.0001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0367695  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4078  twin-arginine translocation protein, TatB subunit  30.77 
 
 
102 aa  47  0.0001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.792853 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1487  Sec-independent protein translocase protein TatB  35.62 
 
 
104 aa  45.8  0.0002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1703  twin-arginine translocation protein TatB  28.91 
 
 
149 aa  45.4  0.0002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2789  twin-arginine translocation protein TatB  32.94 
 
 
200 aa  46.2  0.0002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.180162  normal  0.187511 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3956  sec-independent translocase  37.1 
 
 
179 aa  45.8  0.0002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.0760029 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3421  twin-arginine translocation protein, TatB subunit  35.71 
 
 
151 aa  45.1  0.0003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.746627  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_15360  twin arginine-targeting protein translocase TatB  37.1 
 
 
202 aa  45.4  0.0003  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1739  SEC-independent protein translocase  53.66 
 
 
110 aa  44.7  0.0004  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0118  twin-arginine translocation protein, TatB subunit  27.4 
 
 
208 aa  44.7  0.0004  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.650798  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0543  twin-arginine translocation protein TatB  32.39 
 
 
104 aa  44.7  0.0005  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.69735  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0809  twin-arginine translocation protein TatB  38.1 
 
 
147 aa  43.9  0.0008  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3548  sec-independent translocase  28.8 
 
 
172 aa  43.9  0.0008  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0868381  hitchhiker  0.000446597 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0410  sec-independent translocase  30.7 
 
 
175 aa  43.5  0.0009  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1040  twin-arginine translocation protein, TatB subunit  40.32 
 
 
96 aa  43.5  0.001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0259  Sec-independent protein translocase TatB  36.51 
 
 
118 aa  42.7  0.001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0757626  hitchhiker  0.00426413 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1081  twin-arginine translocation protein, TatB subunit  40.32 
 
 
96 aa  43.5  0.001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.678073  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2747  sec-independent translocase  30.7 
 
 
182 aa  43.1  0.001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.990271  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0914  twin-arginine translocation protein, TatB subunit  35.62 
 
 
163 aa  42.7  0.001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1469  twin-arginine translocation protein TatB  30.89 
 
 
126 aa  42.7  0.002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0327243  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0592  Sec-independent protein translocase TatB  33.8 
 
 
139 aa  42.7  0.002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.067468  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1618  twin-arginine translocation protein, TatB subunit  40.43 
 
 
152 aa  42.4  0.002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0925556  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2321  twin-arginine translocation protein, TatB subunit  29.89 
 
 
254 aa  42.7  0.002  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.00445114  normal  0.211432 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0983  sec-independent translocation protein MttA/Hcf106  29.21 
 
 
128 aa  42.7  0.002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1443  Sec-independent protein secretion pathway components-like protein  30.19 
 
 
110 aa  42  0.003  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.115776  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0355  sec-independent translocase  40 
 
 
176 aa  42  0.003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.843267  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_25870  hypothetical protein  30.65 
 
 
167 aa  42  0.003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.537825  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3218  sec-independent translocase  30.43 
 
 
170 aa  42  0.003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2871  sec-independent translocase  27.36 
 
 
170 aa  42  0.003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.0579485 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1973  twin-arginine translocation protein TatB  24 
 
 
162 aa  41.2  0.004  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.268413  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2670  sec-independent translocase  38.33 
 
 
179 aa  41.2  0.004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.410256  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0437  sec-independent translocase  38.33 
 
 
179 aa  41.2  0.004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.496787  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1088  twin-arginine translocation protein, TatB subunit  32.89 
 
 
117 aa  41.2  0.004  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0416  sec-independent translocase  38.33 
 
 
179 aa  41.2  0.004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00584011 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>