More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Syncc9902_1973 on replicon NC_007513
Organism: Synechococcus sp. CC9902



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009091  P9301_17311  preprotein translocase subunit SecY  81.55 
 
 		 439 aa  672    Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_17221  preprotein translocase subunit SecY  83.14 
 
 		 439 aa  678    Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_23211  preprotein translocase subunit SecY  87.7 
 
 		 439 aa  743    Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1111  preprotein translocase subunit SecY  84.28 
 
 		 439 aa  705    Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1973  preprotein translocase subunit SecY  100 
 
 		 439 aa  853    Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.962751  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0358  preprotein translocase subunit SecY  94.99 
 
 		 439 aa  766    Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.932904 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1632  preprotein translocase subunit SecY  82 
 
 		 439 aa  674    Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_19851  preprotein translocase subunit SecY  84.05 
 
 		 439 aa  704    Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.517194  normal  1 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_17471  preprotein translocase subunit SecY  81.78 
 
 		 439 aa  672    Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.77971  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_16601  preprotein translocase subunit SecY  85.42 
 
 		 439 aa  715    Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2214  preprotein translocase subunit SecY  66.52 
 
 		 439 aa  572  1.0000000000000001e-162  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.180024  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0709  preprotein translocase subunit SecY  61.82 
 
 		 437 aa  524  1e-147  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.0000000243192  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1310  preprotein translocase subunit SecY  62.73 
 
 		 436 aa  522  1e-147  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.206198  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2577  preprotein translocase subunit SecY  61.14 
 
 		 437 aa  524  1e-147  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.477892  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0231  preprotein translocase subunit SecY  62.92 
 
 		 438 aa  507  9.999999999999999e-143  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.832784  normal  0.264762 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0234  preprotein translocase subunit SecY  62.92 
 
 		 438 aa  507  9.999999999999999e-143  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2994  preprotein translocase subunit SecY  61.02 
 
 		 446 aa  494  9.999999999999999e-139  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.389258  normal  0.0673077 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3721  preprotein translocase subunit SecY  62.11 
 
 		 439 aa  491  1e-137  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009358  OSTLU_15058  IISP family transporter: preprotein translocase SecY subunit  44.42 
 
 		 423 aa  338  9.999999999999999e-92  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0295736  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0867  protein translocase subunit secY/sec61 alpha  42.99 
 
 		 442 aa  328  2.0000000000000001e-88  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  decreased coverage  0.000000152006  hitchhiker  0.00837403 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3985  preprotein translocase, SecY subunit  41.42 
 
 		 448 aa  316  4e-85  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  decreased coverage  0.00342615  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1745  preprotein translocase subunit SecY  41.61 
 
 		 437 aa  315  7e-85  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.261464  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0646  preprotein translocase subunit SecY  40.37 
 
 		 435 aa  313  4.999999999999999e-84  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00379524  hitchhiker  0.000000811889 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2158  preprotein translocase, SecY subunit  41.65 
 
 		 426 aa  313  4.999999999999999e-84  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.00470545  normal  0.460281 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2352  preprotein translocase subunit SecY  43.9 
 
 		 441 aa  312  5.999999999999999e-84  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.299181  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1931  preprotein translocase subunit SecY  42.62 
 
 		 445 aa  312  7.999999999999999e-84  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.776856  normal  0.537809 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1953  preprotein translocase subunit SecY  41.9 
 
 		 447 aa  310  2.9999999999999997e-83  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2038  preprotein translocase subunit SecY  41.9 
 
 		 447 aa  309  8e-83  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0347  preprotein translocase, SecY subunit  41.08 
 
 		 443 aa  307  2.0000000000000002e-82  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.742267  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0517  preprotein translocase, SecY subunit  41.08 
 
 		 443 aa  307  2.0000000000000002e-82  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.120445  unclonable  0.0000000000266535 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0862  preprotein translocase, SecY subunit  42.55 
 
 		 438 aa  306  4.0000000000000004e-82  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.148817  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0728  preprotein translocase, SecY subunit  40.71 
 
 		 429 aa  306  4.0000000000000004e-82  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00054251  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1086  preprotein translocase subunit SecY  39.86 
 
 		 435 aa  305  8.000000000000001e-82  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.135642  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0680  preprotein translocase subunit SecY  40.42 
 
 		 437 aa  305  1.0000000000000001e-81  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1366  preprotein translocase subunit SecY  40.18 
 
 		 437 aa  305  1.0000000000000001e-81  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000833152  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0721  preprotein translocase subunit SecY  41.16 
 
 		 435 aa  304  2.0000000000000002e-81  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2837  preprotein translocase subunit SecY  40.28 
 
 		 435 aa  303  6.000000000000001e-81  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1000  preprotein translocase, SecY subunit  39.57 
 
 		 419 aa  302  7.000000000000001e-81  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.00382146  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_09800  preprotein translocase, SecY subunit  40.38 
 
 		 427 aa  301  1e-80  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.141788  hitchhiker  0.0000395879 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0953  preprotein translocase subunit SecY  39.04 
 
 		 435 aa  301  2e-80  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0415377  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1926  preprotein translocase subunit SecY  41.9 
 
 		 447 aa  300  4e-80  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.228643  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0099  preprotein translocase subunit SecY  39.72 
 
 		 437 aa  300  5e-80  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0986849 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0700  preprotein translocase subunit SecY  40.09 
 
 		 435 aa  299  8e-80  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.418561  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1384  preprotein translocase subunit SecY  41.69 
 
 		 443 aa  298  1e-79  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.378018 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1575  preprotein translocase subunit SecY  40.24 
 
 		 435 aa  298  1e-79  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0569624  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5050  preprotein translocase subunit SecY  42.72 
 
 		 444 aa  298  2e-79  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.478224  normal  0.981585 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0080  preprotein translocase subunit SecY  41.72 
 
 		 441 aa  298  2e-79  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0404503  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3308  preprotein translocase subunit SecY  38.81 
 
 		 435 aa  297  2e-79  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000602472 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1006  preprotein translocase subunit SecY  41.98 
 
 		 446 aa  296  4e-79  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.38875  hitchhiker  0.00669682 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_23270  preprotein translocase, SecY subunit  41.23 
 
 		 426 aa  296  5e-79  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.704414  hitchhiker  0.00000750325 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2237  preprotein translocase subunit SecY  41.8 
 
 		 437 aa  296  5e-79  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.104557  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1565  preprotein translocase subunit SecY  41.59 
 
 		 443 aa  296  5e-79  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.112443  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1976  preprotein translocase subunit SecY  40.95 
 
 		 446 aa  296  7e-79  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.923807  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0739  preprotein translocase subunit SecY  41.61 
 
 		 440 aa  296  7e-79  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  hitchhiker  0.00521081  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2135  protein translocase subunit secY/sec61 alpha  40.09 
 
 		 428 aa  295  1e-78  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.233384  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1213  preprotein translocase subunit SecY  40.72 
 
 		 446 aa  293  3e-78  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0425  preprotein translocase subunit SecY  41.94 
 
 		 437 aa  293  3e-78  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.65116  normal  0.157207 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1863  preprotein translocase subunit SecY  41.81 
 
 		 446 aa  293  4e-78  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.271597  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2756  preprotein translocase, SecY subunit  40.98 
 
 		 443 aa  293  4e-78  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.373135  normal  0.477854 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1176  preprotein translocase subunit SecY  40.5 
 
 		 446 aa  292  9e-78  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0379017  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0343  preprotein translocase, SecY subunit  41.08 
 
 		 444 aa  291  1e-77  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  hitchhiker  0.000192463  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0339  preprotein translocase subunit SecY  41 
 
 		 440 aa  291  1e-77  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.000142446  unclonable  0.0000000706243 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0507  preprotein translocase subunit SecY  40.39 
 
 		 443 aa  291  2e-77  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0640452  normal  0.0135524 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0305  preprotein translocase subunit SecY  40.95 
 
 		 453 aa  291  2e-77  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.398461 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4729  preprotein translocase subunit SecY  40.39 
 
 		 443 aa  291  2e-77  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0376135  normal  0.430849 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2986  preprotein translocase subunit SecY  39.39 
 
 		 448 aa  290  4e-77  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.135734  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0504  preprotein translocase subunit SecY  40.39 
 
 		 443 aa  290  4e-77  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  hitchhiker  0.000390206  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4301  preprotein translocase, SecY subunit  38.99 
 
 		 432 aa  290  5.0000000000000004e-77  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0646  preprotein translocase, SecY subunit  39.66 
 
 		 444 aa  290  5.0000000000000004e-77  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.617938  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3318  preprotein translocase subunit SecY  41.47 
 
 		 441 aa  290  5.0000000000000004e-77  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.150394  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0235  preprotein translocase subunit SecY  41.98 
 
 		 419 aa  289  5.0000000000000004e-77  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00849669  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4528  preprotein translocase subunit SecY  39.66 
 
 		 444 aa  290  5.0000000000000004e-77  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.447133  normal  0.242735 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1360  preprotein translocase, SecY subunit  40.75 
 
 		 423 aa  289  5.0000000000000004e-77  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0474  preprotein translocase subunit SecY  40.15 
 
 		 443 aa  289  6e-77  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.733359  hitchhiker  0.00000433507 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0178  preprotein translocase subunit SecY  41.27 
 
 		 446 aa  289  6e-77  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.000000408952  hitchhiker  0.00214614 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4256  preprotein translocase subunit SecY  40.38 
 
 		 443 aa  289  8e-77  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.0000193642  unclonable  0.00000000000448849 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1118  preprotein translocase subunit SecY  39.76 
 
 		 428 aa  288  1e-76  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.348488  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4298  preprotein translocase subunit SecY  40.62 
 
 		 446 aa  288  1e-76  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.000000258427  unclonable  0.0000000000837901 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2181  preprotein translocase, SecY subunit  39.34 
 
 		 447 aa  288  1e-76  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.318083 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2459  preprotein translocase, SecY subunit  39.34 
 
 		 447 aa  288  1e-76  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0886  preprotein translocase subunit SecY  40.62 
 
 		 418 aa  288  1e-76  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.609907  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1009  preprotein translocase subunit SecY  39.95 
 
 		 439 aa  288  1e-76  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00114462  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4670  preprotein translocase subunit SecY  40.86 
 
 		 446 aa  288  1e-76  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.000000509869  unclonable  0.0000000121988 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0233  preprotein translocase subunit SecY  41.61 
 
 		 446 aa  288  1e-76  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  unclonable  0.000000181445  unclonable  0.0000105897 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5059  preprotein translocase subunit SecY  39.9 
 
 		 442 aa  288  2e-76  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000898122  normal  0.284155 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3428  preprotein translocase subunit SecY  43.03 
 
 		 443 aa  288  2e-76  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.452831  normal  0.23727 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2754  preprotein translocase, SecY subunit  38.12 
 
 		 437 aa  288  2e-76  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0857  preprotein translocase subunit SecY  39.42 
 
 		 442 aa  287  2.9999999999999996e-76  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4363  preprotein translocase subunit SecY  39.68 
 
 		 437 aa  287  2.9999999999999996e-76  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0120386  normal  0.169527 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0979  protein translocase subunit secY/sec61 alpha  39.24 
 
 		 447 aa  287  2.9999999999999996e-76  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.0000479753  hitchhiker  0.00549319 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_09050  preprotein translocase subunit SecY  39.42 
 
 		 442 aa  287  2.9999999999999996e-76  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.224184 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04500  preprotein translocase subunit SecY  39.07 
 
 		 454 aa  286  4e-76  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.705639  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0778  preprotein translocase, SecY subunit  39.9 
 
 		 430 aa  286  4e-76  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000100686  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0220  preprotein translocase subunit SecY  41.69 
 
 		 446 aa  286  5e-76  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00000798254  hitchhiker  0.00367272 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4150  preprotein translocase subunit SecY  41.69 
 
 		 446 aa  286  5e-76  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.0000000158721  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2045  preprotein translocase, SecY subunit  40.43 
 
 		 435 aa  286  5e-76  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.000027617  hitchhiker  0.00154147 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0216  preprotein translocase subunit SecY  41.69 
 
 		 446 aa  286  5e-76  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000000065492  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0168  preprotein translocase subunit SecY  41.31 
 
 		 446 aa  286  5e-76  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  unclonable  0.0000000114541  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4036  preprotein translocase subunit SecY  41.69 
 
 		 446 aa  286  5e-76  Shewanella baltica OS223  Bacteria  unclonable  0.0000000184742  unclonable  0.00000000000435138 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2144  preprotein translocase, SecY subunit  39.72 
 
 		 447 aa  286  5.999999999999999e-76  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>