More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Syncc9605_2635 on replicon NC_007516
Organism: Synechococcus sp. CC9605



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007513  Syncc9902_2263  sodium/solute transporter family urea transporter  86.97 
 
 
474 aa  767    Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2635  sodium/solute transporter family urea transporter  100 
 
 
476 aa  931    Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal  0.451328 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0779  Na+/solute symporter  48 
 
 
482 aa  431  1e-119  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0182  Na+/solute symporter  48.71 
 
 
478 aa  410  1e-113  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0029  Na+/solute symporter  47.92 
 
 
488 aa  397  1e-109  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.080483 
 
 
-
 
NC_009356  OSTLU_119678  predicted protein  24.8 
 
 
709 aa  129  1.0000000000000001e-28  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_30460  Na+/proline symporter  27.48 
 
 
554 aa  123  8e-27  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0720305  normal  0.147602 
 
 
-
 
NC_011677  PHATRDRAFT_20424  urea transporter  23.42 
 
 
704 aa  122  9.999999999999999e-27  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.333459  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_01880  Na+/proline symporter  26.53 
 
 
587 aa  122  9.999999999999999e-27  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02598  urea active transporter, putative (AFU_orthologue; AFUA_1G17570)  24.73 
 
 
680 aa  122  1.9999999999999998e-26  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.811341 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1604  Na+/solute symporter  26.29 
 
 
556 aa  122  1.9999999999999998e-26  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.0772243 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_52351  urea active transport protein  28.34 
 
 
724 aa  117  5e-25  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.0516586  normal  0.828998 
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07373  solute symporter family transporter (AFU_orthologue; AFUA_6G03200)  23.77 
 
 
699 aa  116  7.999999999999999e-25  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006686  CND00530  urea transporter, putative  25 
 
 
674 aa  116  7.999999999999999e-25  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.45321  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2753  Na+/solute symporter  27.13 
 
 
472 aa  116  7.999999999999999e-25  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00418  urea transporter (Dur3), putative (AFU_orthologue; AFUA_1G04870)  26.78 
 
 
693 aa  114  3e-24  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.798545 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2308  sodium/proline symporter  26.76 
 
 
492 aa  114  3e-24  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.591948  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2435  sodium/proline symporter  27.4 
 
 
483 aa  114  4.0000000000000004e-24  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.015008  hitchhiker  0.00456377 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2686  sodium/proline symporter  28.07 
 
 
486 aa  112  1.0000000000000001e-23  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0529769  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1564  sodium/proline symporter family protein  26.47 
 
 
492 aa  112  2.0000000000000002e-23  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.286578 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3673  sodium/proline symporter family protein  26.35 
 
 
492 aa  111  3e-23  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.257529  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3331  sodium/proline symporter  26.3 
 
 
487 aa  111  3e-23  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.825412  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2177  sodium/proline symporter  27.63 
 
 
482 aa  111  3e-23  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.000107736  normal  0.0804917 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3677  sodium/proline symporter family protein  26 
 
 
492 aa  110  6e-23  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.289137  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3435  sodium/proline symporter family protein  26.12 
 
 
493 aa  109  8.000000000000001e-23  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3396  sodium/proline symporter  26.12 
 
 
493 aa  109  8.000000000000001e-23  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.435875  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3347  sodium/proline symporter  26.12 
 
 
493 aa  109  8.000000000000001e-23  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3655  sodium/proline symporter family protein  26.12 
 
 
492 aa  109  9.000000000000001e-23  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3705  sodium/proline symporter family protein  26.12 
 
 
492 aa  109  1e-22  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.338299  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2770  sodium/proline symporter  28.57 
 
 
483 aa  108  2e-22  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0000703765  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2790  sodium/proline symporter  28.57 
 
 
483 aa  108  2e-22  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00276408  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2865  sodium/proline symporter  28.57 
 
 
483 aa  108  2e-22  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.468907 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1588  sodium/proline symporter  28.57 
 
 
483 aa  108  2e-22  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.0000493204  unclonable  0.00000000000453194 
 
 
-
 
NC_009046  PICST_32520  Urea active transport protein  25.62 
 
 
658 aa  108  2e-22  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07557  conserved hypothetical protein  24.27 
 
 
692 aa  108  3e-22  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.314115  hitchhiker  0.00246133 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1398  sodium/proline symporter  27.49 
 
 
483 aa  107  3e-22  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0934266  unclonable  0.0000000000241033 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1463  sodium/proline symporter  27.49 
 
 
483 aa  107  3e-22  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.169082  unclonable  0.0000343135 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1451  sodium/proline symporter  27.73 
 
 
483 aa  107  3e-22  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0423407  unclonable  0.000000000084673 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2469  sodium/proline symporter  27.75 
 
 
497 aa  108  3e-22  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00121427  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1520  Sodium/proline symporter  26.89 
 
 
483 aa  107  4e-22  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009042  PICST_55023  urea permease  24.71 
 
 
659 aa  107  4e-22  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.410596  normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1440  proline permease  24.77 
 
 
511 aa  106  8e-22  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.0406998  n/a   
 
 
-
 
NC_011677  PHATRDRAFT_768  predicted protein  22.83 
 
 
643 aa  105  2e-21  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.530084  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3406  Na+/solute symporter  24.94 
 
 
461 aa  104  3e-21  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.183888  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3516  sodium/proline symporter  26.77 
 
 
485 aa  104  4e-21  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3036  sodium/proline symporter  27.63 
 
 
488 aa  103  5e-21  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.0000692388  normal  0.0245093 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3752  sodium/proline symporter family protein  26.02 
 
 
492 aa  103  5e-21  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3386  sodium/proline symporter  27.59 
 
 
484 aa  103  6e-21  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2608  sodium/proline symporter  26.26 
 
 
483 aa  103  7e-21  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0498264  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3463  proline/sodium symporter  26.43 
 
 
495 aa  103  1e-20  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0686  Na+/solute symporter  25.06 
 
 
507 aa  102  1e-20  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.663287  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1142  sodium/proline symporter  26.15 
 
 
492 aa  101  2e-20  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.00000269484  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2541  sodium/pantothenate symporter  25.47 
 
 
487 aa  102  2e-20  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  unclonable  0.00000000222476  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0375  Na+/solute symporter  29.13 
 
 
478 aa  101  3e-20  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.197469 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0436  Na+/solute symporter  29.55 
 
 
478 aa  99.8  9e-20  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5457  Na+/solute symporter  28.16 
 
 
482 aa  98.6  2e-19  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.692749  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1619  sodium/proline symporter  26.14 
 
 
483 aa  97.8  4e-19  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.000146301  decreased coverage  0.00000122936 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0552  sodium/pantothenate symporter  23.14 
 
 
482 aa  97.4  5e-19  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1957  high affinity proline permease  25.69 
 
 
512 aa  96.7  7e-19  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1991  high affinity proline permease  25.69 
 
 
512 aa  96.7  7e-19  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1289  sodium/proline symporter family protein  25.91 
 
 
492 aa  96.7  8e-19  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000753427  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0949  sodium/proline symporter  25.3 
 
 
488 aa  96.3  1e-18  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.000000419009  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0364  sodium/proline symporter  26.83 
 
 
493 aa  95.9  1e-18  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1796  Na+/solute symporter  25.35 
 
 
483 aa  95.5  2e-18  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  unclonable  0.00000000417622  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1314  sodium/proline symporter family protein  25.42 
 
 
492 aa  94.4  4e-18  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  7.01893e-22 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2570  Na+/solute symporter  28.06 
 
 
464 aa  94.4  4e-18  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00000435173  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1154  sodium/proline symporter family protein  25.42 
 
 
492 aa  94.4  4e-18  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  unclonable  0.000000094389  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1134  sodium/proline symporter; osmoregulated proline transporter  25.42 
 
 
492 aa  94.4  4e-18  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000000164333  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1246  sodium/proline symporter family protein  25.42 
 
 
492 aa  94.4  4e-18  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  unclonable  0.000000000709794  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1391  sodium/proline symporter family protein  25.42 
 
 
492 aa  94.4  4e-18  Bacillus cereus AH187  Bacteria  decreased coverage  0.000000288563  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5240  Na+/solute symporter  25.51 
 
 
460 aa  94.4  5e-18  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4125  Na+/solute symporter  27.11 
 
 
479 aa  94  5e-18  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0765871  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1353  sodium/proline symporter family protein  25.42 
 
 
492 aa  94  6e-18  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.0000000718577  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1128  sodium/proline symporter; osmoregulated proline transporter  25.18 
 
 
492 aa  92.8  1e-17  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000000418657  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4055  sodium/proline symporter family protein  25.48 
 
 
492 aa  92.8  1e-17  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000025968  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0463  sodium/solute symporter transmembrane protein  27.42 
 
 
479 aa  91.7  2e-17  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1396  Na+/proline symporter  25.84 
 
 
553 aa  92  2e-17  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0718  Na+/solute symporter  27.19 
 
 
486 aa  90.9  4e-17  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1250  sodium/proline symporter  26.61 
 
 
496 aa  90.5  7e-17  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.654808  normal  0.469552 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4147  sodium/proline symporter  25.23 
 
 
497 aa  89.7  1e-16  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0309  Na+/solute symporter  24.55 
 
 
510 aa  89.7  1e-16  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0864  hypothetical protein  25.21 
 
 
524 aa  89  2e-16  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.983965  normal  0.0488094 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0122  Na+/solute symporter  23.99 
 
 
449 aa  88.2  3e-16  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00309864  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0871  Na+/solute symporter  27.45 
 
 
482 aa  87.8  3e-16  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.857902  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0800  Na+/solute symporter  27.45 
 
 
483 aa  87.8  4e-16  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1379  sodium/panthothenate symporter  26.6 
 
 
492 aa  87.4  5e-16  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0385274  normal  0.372154 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06350  hypothetical protein  23.36 
 
 
506 aa  87.4  6e-16  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009043  PICST_57505  urea transport protein  22.47 
 
 
668 aa  87  7e-16  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.20443  normal  0.667471 
 
 
-
 
NC_003912  CJE1675  sodium/proline permease  25.45 
 
 
489 aa  86.7  8e-16  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0353  Na+/solute symporter  26.82 
 
 
479 aa  86.7  8e-16  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.606466  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_03760  putative sodium:solute symporter  26.27 
 
 
461 aa  85.9  0.000000000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.188515  normal  0.0159939 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1494  sodium/proline permease  25.45 
 
 
489 aa  86.3  0.000000000000001  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.858456  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1156  sodium/proline symporter  25.46 
 
 
486 aa  85.5  0.000000000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.307204  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0338  Na+/solute symporter  25.98 
 
 
479 aa  85.5  0.000000000000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3686  sodium/panthothenate symporter  27.02 
 
 
483 aa  85.1  0.000000000000002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.925299  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3645  sodium/panthothenate symporter  26.23 
 
 
483 aa  85.1  0.000000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00060524 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3574  sodium/panthothenate symporter  26.23 
 
 
483 aa  84.7  0.000000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0378  sodium:solute symporter  26.95 
 
 
461 aa  85.1  0.000000000000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3573  sodium/panthothenate symporter  26.23 
 
 
483 aa  84.7  0.000000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0131777  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3680  sodium/panthothenate symporter  26 
 
 
483 aa  84.3  0.000000000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.433126 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>