237 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swoo_0540 on replicon NC_010506
Organism: Shewanella woodyi ATCC 51908



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010506  Swoo_0540  di-haem cytochrome c peroxidase  100 
 
 		 499 aa  1034    Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0114  di-haem cytochrome c peroxidase  35.46 
 
 		 483 aa  196  7e-49  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3672  di-haem cytochrome c peroxidase  32.89 
 
 		 498 aa  171  3e-41  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2005  putative cytochrome c peroxidase  32.38 
 
 		 451 aa  166  5.9999999999999996e-40  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.0792169 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0031  methylamine utilization protein MauG, putative  33.09 
 
 		 435 aa  156  8e-37  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0868971  normal  0.24254 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2749  putative cytochrome c peroxidase  30.16 
 
 		 437 aa  136  9e-31  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.0452779 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3354  di-haem cytochrome c peroxidase  28.47 
 
 		 449 aa  132  1.0000000000000001e-29  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.475738  normal  0.135039 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2247  putative methylamine utilization protein MauG precursor  29.43 
 
 		 419 aa  117  3.9999999999999997e-25  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.666839 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4685  Cytochrome-c peroxidase  26.6 
 
 		 328 aa  115  2.0000000000000002e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0810  Cytochrome-c peroxidase  29.45 
 
 		 336 aa  114  3e-24  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0559  Cytochrome-c peroxidase  25.96 
 
 		 353 aa  114  3e-24  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0900  Cytochrome-c peroxidase  26.32 
 
 		 337 aa  112  1.0000000000000001e-23  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.897307 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1600  Cytochrome-c peroxidase  28.6 
 
 		 357 aa  112  2.0000000000000002e-23  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.282012 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1545  Cytochrome-c peroxidase  27.27 
 
 		 384 aa  110  6e-23  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.16368  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0552  cytochrome-c peroxidase  25.61 
 
 		 333 aa  109  1e-22  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0019  Cytochrome-c peroxidase  28.83 
 
 		 345 aa  108  2e-22  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2378  cytochrome-c peroxidase  24.53 
 
 		 346 aa  106  1e-21  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0541294  normal  0.454259 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0020  Di-haem cytochrome c peroxidase  29.22 
 
 		 345 aa  102  1e-20  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7510  putative di-haem cytochrome c peroxidase  25.63 
 
 		 358 aa  102  2e-20  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.733811  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0350  Cytochrome-c peroxidase  26 
 
 		 311 aa  102  2e-20  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4658  Cytochrome-c peroxidase  25.88 
 
 		 768 aa  101  4e-20  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.264501  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1968  cytochrome-c peroxidase  24.37 
 
 		 463 aa  100  5e-20  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0786511  normal  0.0102191 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0766  cytochrome-c peroxidase  24.34 
 
 		 379 aa  100  7e-20  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3340  cytochrome-c peroxidase  25.87 
 
 		 369 aa  98.2  3e-19  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0101  Cytochrome-c peroxidase  26.67 
 
 		 348 aa  98.6  3e-19  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0466  cytochrome c551 peroxidase  27.49 
 
 		 346 aa  97.1  7e-19  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.656943  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3135  cytochrome-c peroxidase  26.49 
 
 		 302 aa  97.1  7e-19  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0020  cytochrome c551 peroxidase  27.49 
 
 		 304 aa  95.9  1e-18  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5340  Cytochrome-c peroxidase  25.11 
 
 		 377 aa  96.3  1e-18  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0812  Cytochrome-c peroxidase  26.15 
 
 		 334 aa  95.5  2e-18  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2697  cytochrome c peroxidase  28.66 
 
 		 357 aa  94.4  4e-18  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.521922  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2854  cytochrome-c peroxidase  26.17 
 
 		 335 aa  94.4  5e-18  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0047  cytochrome c551 peroxidase  26.28 
 
 		 304 aa  93.6  8e-18  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5227  cytochrome c551 peroxidase precursor  27.38 
 
 		 346 aa  92.8  1e-17  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0372  cytochrome-c peroxidase  28 
 
 		 349 aa  92.8  1e-17  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.393962  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03366  predicted cytochrome C peroxidase  26.28 
 
 		 465 aa  92  2e-17  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.157341  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0195  Cytochrome-c peroxidase  26.28 
 
 		 465 aa  92  2e-17  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3821  di-haem cytochrome c peroxidase family protein  26.28 
 
 		 465 aa  92  2e-17  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.057161 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_60700  cytochrome c551 peroxidase precursor  27.08 
 
 		 346 aa  92  2e-17  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03319  hypothetical protein  26.28 
 
 		 465 aa  92  2e-17  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.08517  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3278  cytochrome c peroxidase  25.07 
 
 		 459 aa  91.7  3e-17  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3721  di-haem cytochrome c peroxidase family protein  26.28 
 
 		 465 aa  91.7  3e-17  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3411  cytochrome-c peroxidase  25.07 
 
 		 459 aa  91.7  3e-17  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.267851  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1263  cytochrome c peroxidase  28.31 
 
 		 358 aa  91.7  3e-17  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4046  Cytochrome-c peroxidase  25.43 
 
 		 360 aa  91.7  3e-17  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.399285  normal  0.0466935 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0940  cytochrome c peroxidase  25.07 
 
 		 459 aa  91.7  3e-17  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0216007  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0409  cytochrome-c peroxidase  26.34 
 
 		 369 aa  91.7  3e-17  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0199  cytochrome-c peroxidase  26.28 
 
 		 465 aa  91.7  3e-17  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.910181 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4880  di-haem cytochrome c peroxidase family protein  26.28 
 
 		 465 aa  91.7  3e-17  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1488  cytochrome-c peroxidase  26.77 
 
 		 322 aa  90.9  5e-17  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.39743  normal  0.0300205 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2684  cytochrome-c peroxidase  27.71 
 
 		 330 aa  90.9  5e-17  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.831831 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0394  cytochrome c551 peroxidase  27.2 
 
 		 351 aa  90.1  9e-17  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.194468  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0203  cytochrome-c peroxidase  26.94 
 
 		 346 aa  89  2e-16  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.908377  normal  0.102484 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_10230  Di-heme cytochrome c peroxidase, CCP_MauG family  26.13 
 
 		 464 aa  89  2e-16  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1058  cytochrome-c peroxidase  26.33 
 
 		 347 aa  89  2e-16  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0622508  normal  0.212255 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0505  cytochrome-c peroxidase  25.87 
 
 		 365 aa  88.6  2e-16  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0442639  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1091  Cytochrome-c peroxidase  26.46 
 
 		 459 aa  88.2  3e-16  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  hitchhiker  0.00000159552  hitchhiker  0.0000000000000391154 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2772  cytochrome-c peroxidase  27.38 
 
 		 352 aa  87.4  5e-16  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.474498  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2648  cytochrome-c peroxidase  26.97 
 
 		 344 aa  87.4  5e-16  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0545437  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1818  Cytochrome-c peroxidase  26.97 
 
 		 344 aa  87.4  5e-16  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.680331  normal  0.132089 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1353  cytochrome-c peroxidase  25.93 
 
 		 351 aa  87.4  5e-16  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0523  cytochrome C peroxidase  24.43 
 
 		 343 aa  87  6e-16  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00240388 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1877  cytochrome-c peroxidase  27.27 
 
 		 330 aa  87  7e-16  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.54832  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06375  cytochrome c peroxidase  25.53 
 
 		 437 aa  87  7e-16  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2526  cytochrome-c peroxidase  26.06 
 
 		 344 aa  86.7  8e-16  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4031  cytoChrome-c peroxidase  24.39 
 
 		 466 aa  86.3  0.000000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4048  cytoChrome-c peroxidase  24.39 
 
 		 466 aa  86.3  0.000000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2827  cytochrome-c peroxidase  26.87 
 
 		 377 aa  86.3  0.000000000000001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2395  BCCP, cytochrome c peroxidase  26.04 
 
 		 347 aa  86.3  0.000000000000001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2527  cytochrome-c peroxidase  26.15 
 
 		 359 aa  86.3  0.000000000000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.730316  normal  0.0763035 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2947  cytochrome-c peroxidase  26.07 
 
 		 317 aa  86.3  0.000000000000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0431502  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4103  cytochrome-c peroxidase  24.39 
 
 		 466 aa  86.3  0.000000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4152  cytoChrome-c peroxidase  24.39 
 
 		 466 aa  86.3  0.000000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.418537  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4328  Cytochrome-c peroxidase  24.04 
 
 		 398 aa  85.9  0.000000000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.314374  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4210  cytochrome-c peroxidase  24.39 
 
 		 466 aa  85.1  0.000000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2533  cytochrome-c peroxidase  26.67 
 
 		 344 aa  85.9  0.000000000000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2655  cytochrome-c peroxidase  25.77 
 
 		 350 aa  85.9  0.000000000000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.872358  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4821  cytochrome-c peroxidase  27.78 
 
 		 328 aa  84.7  0.000000000000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2573  cytochrome-c peroxidase  25.73 
 
 		 346 aa  85.1  0.000000000000003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1316  cytochrome-c peroxidase  26.97 
 
 		 346 aa  85.1  0.000000000000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000633381  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1107  cytochrome-c peroxidase  23.42 
 
 		 417 aa  84.7  0.000000000000004  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.63501  normal  0.861161 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0893  cytochrome-c peroxidase  25.23 
 
 		 340 aa  84.3  0.000000000000005  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.849776  normal  0.50285 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1860  di-haem cytochrome c peroxidase  28.21 
 
 		 358 aa  84  0.000000000000006  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.39839  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2813  cytochrome c551 peroxidase  25.19 
 
 		 345 aa  83.6  0.000000000000007  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.259536  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0777  Cytochrome-c peroxidase  25.43 
 
 		 352 aa  83.6  0.000000000000007  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  unclonable  0.0000000000000325432  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3124  cytochrome-c peroxidase  25.99 
 
 		 331 aa  83.2  0.000000000000009  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1935  cytochrome-c peroxidase  26.51 
 
 		 330 aa  82.4  0.00000000000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.28817  normal  0.0197442 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3388  Cytochrome-c peroxidase  25.3 
 
 		 373 aa  82.4  0.00000000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.109099  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1187  cytochrome c551 peroxidase  25 
 
 		 352 aa  82.4  0.00000000000002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.0823128  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3091  di-haem cytochrome c peroxidase  26.1 
 
 		 346 aa  82.4  0.00000000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6837  Cytochrome-c peroxidase  30.58 
 
 		 365 aa  82  0.00000000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2895  Cytochrome-c peroxidase  25.52 
 
 		 352 aa  82  0.00000000000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.370282 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0098  Cytochrome-c peroxidase  28.71 
 
 		 365 aa  81.6  0.00000000000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0145  di-haem cytochrome c peroxidase  25.18 
 
 		 383 aa  81.3  0.00000000000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2999  Cytochrome-c peroxidase  26.19 
 
 		 352 aa  81.3  0.00000000000004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.0979676 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1377  cytochrome-c peroxidase  25.66 
 
 		 347 aa  81.3  0.00000000000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.189071 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4460  Cytochrome-c peroxidase  24.32 
 
 		 345 aa  81.3  0.00000000000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0825354 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3631  cytochrome-c peroxidase  25.28 
 
 		 390 aa  80.5  0.00000000000006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1789  cytochrome-c peroxidase  26.39 
 
 		 348 aa  80.1  0.00000000000008  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4161  Cytochrome-c peroxidase  24.63 
 
 		 598 aa  80.1  0.00000000000009  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0171649  normal  0.0843454 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>