More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swol_1995 on replicon NC_008346
Organism: Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008346  Swol_1995  hypothetical protein  100 
 
 		 133 aa  280  4.0000000000000003e-75  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1521  protein of unknown function UPF0047  63.08 
 
 		 133 aa  189  1e-47  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2645  protein of unknown function UPF0047  60 
 
 		 133 aa  179  1e-44  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2595  protein of unknown function UPF0047  58.91 
 
 		 132 aa  166  9e-41  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0242418  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0103  hypothetical protein  58.78 
 
 		 130 aa  165  2e-40  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3472  protein of unknown function UPF0047  57.69 
 
 		 133 aa  162  9e-40  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00822222  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1211  protein of unknown function UPF0047  55.56 
 
 		 133 aa  159  1e-38  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_03800  conserved hypothetical protein TIGR00149  63.48 
 
 		 132 aa  158  2e-38  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1261  protein of unknown function UPF0047  51.15 
 
 		 143 aa  157  6e-38  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.285021  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0008  hypothetical protein  51.54 
 
 		 132 aa  154  3e-37  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.000191173  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0947  hypothetical protein  55.38 
 
 		 132 aa  154  4e-37  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.12412  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0452  hypothetical protein  53.08 
 
 		 132 aa  154  6e-37  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.430845  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0925  hypothetical protein  53.85 
 
 		 132 aa  151  2e-36  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000978518  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1494  hypothetical protein  56.92 
 
 		 131 aa  150  5e-36  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0551  hypothetical protein  50.81 
 
 		 135 aa  148  2e-35  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0534  hypothetical protein  50.81 
 
 		 135 aa  149  2e-35  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0826  hypothetical protein  51.15 
 
 		 133 aa  147  4e-35  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1967  hypothetical protein  53.08 
 
 		 132 aa  147  4e-35  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.990431  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0262  hypothetical protein  51.54 
 
 		 132 aa  147  5e-35  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.016516  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0454  hypothetical protein  48.46 
 
 		 132 aa  145  1.0000000000000001e-34  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1000  protein of unknown function UPF0047  48.46 
 
 		 133 aa  145  2.0000000000000003e-34  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.606508  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1537  hypothetical protein  48.46 
 
 		 132 aa  145  2.0000000000000003e-34  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00760  hypothetical protein  48.46 
 
 		 132 aa  145  2.0000000000000003e-34  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000404598  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1526  hypothetical protein  55.81 
 
 		 133 aa  144  4.0000000000000006e-34  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.183474 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0382  hypothetical protein  48.46 
 
 		 132 aa  144  4.0000000000000006e-34  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.279914 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1517  protein of unknown function UPF0047  48.46 
 
 		 130 aa  144  5e-34  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3175  hypothetical protein  49.22 
 
 		 132 aa  143  1e-33  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0951  hypothetical protein  52 
 
 		 129 aa  142  2e-33  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.672358  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0431  hypothetical protein  49.24 
 
 		 132 aa  141  3e-33  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.0277947  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0129  hypothetical protein  49.61 
 
 		 138 aa  140  4e-33  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0620  protein of unknown function UPF0047  50.77 
 
 		 132 aa  139  9.999999999999999e-33  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    unclonable  1.17685e-35 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3648  hypothetical protein  49.61 
 
 		 134 aa  139  9.999999999999999e-33  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2637  protein of unknown function UPF0047  51.56 
 
 		 131 aa  138  1.9999999999999998e-32  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00164321  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0621  hypothetical protein  53.85 
 
 		 131 aa  139  1.9999999999999998e-32  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.688874  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2505  protein of unknown function UPF0047  47.66 
 
 		 131 aa  139  1.9999999999999998e-32  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2442  hypothetical protein  48.44 
 
 		 131 aa  138  3e-32  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.823465 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0783  protein of unknown function UPF0047  49.23 
 
 		 132 aa  137  4.999999999999999e-32  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0242  hypothetical protein  47.29 
 
 		 138 aa  137  6e-32  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0606  protein of unknown function UPF0047  50 
 
 		 132 aa  137  7e-32  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0023  protein of unknown function UPF0047  49.21 
 
 		 131 aa  135  1e-31  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2112  hypothetical protein  48.82 
 
 		 132 aa  134  5e-31  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000735836  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3000  protein of unknown function UPF0047  48.46 
 
 		 130 aa  133  7.000000000000001e-31  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0313  hypothetical protein  49.61 
 
 		 152 aa  133  9e-31  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0927  hypothetical protein  50.75 
 
 		 136 aa  132  9.999999999999999e-31  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0986  protein of unknown function UPF0047  50 
 
 		 139 aa  131  3e-30  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0759646  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_136  hypothetical protein  48.06 
 
 		 138 aa  131  3.9999999999999996e-30  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0970  hypothetical protein  50 
 
 		 136 aa  130  5e-30  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.135191  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0693  hypothetical protein  46.21 
 
 		 133 aa  129  1.0000000000000001e-29  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000221984  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0727  hypothetical protein  47.69 
 
 		 143 aa  128  2.0000000000000002e-29  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0718399  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0983  protein of unknown function UPF0047  50 
 
 		 139 aa  129  2.0000000000000002e-29  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0126  protein of unknown function UPF0047  40.77 
 
 		 134 aa  127  4.0000000000000003e-29  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.885152  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1056  hypothetical protein  48.46 
 
 		 133 aa  127  5.0000000000000004e-29  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.858147  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0349  protein of unknown function UPF0047  44.19 
 
 		 131 aa  124  3e-28  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.0772026  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2260  protein of unknown function UPF0047  47.5 
 
 		 130 aa  119  9.999999999999999e-27  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.0000782775  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2316  protein of unknown function UPF0047  45.11 
 
 		 138 aa  117  3.9999999999999996e-26  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1216  hypothetical protein  42.75 
 
 		 134 aa  117  3.9999999999999996e-26  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.372222  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0603  hypothetical protein  43.18 
 
 		 143 aa  112  2.0000000000000002e-24  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0831  hypothetical protein  42.75 
 
 		 137 aa  106  1e-22  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0943  hypothetical protein  46.03 
 
 		 130 aa  103  7e-22  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0655  hypothetical protein  41.98 
 
 		 139 aa  103  9e-22  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1222  protein of unknown function UPF0047  40.94 
 
 		 128 aa  102  1e-21  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00545275 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0183  hypothetical protein  40.46 
 
 		 132 aa  102  1e-21  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.7709 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0167  hypothetical protein  40.48 
 
 		 136 aa  102  2e-21  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1612  hypothetical protein  38.71 
 
 		 137 aa  100  5e-21  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2077  hypothetical protein  40.62 
 
 		 137 aa  99.8  1e-20  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  hitchhiker  0.00188003  hitchhiker  0.000638573 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0408  protein of unknown function UPF0047  41.22 
 
 		 128 aa  99.4  1e-20  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.170864  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1262  protein of unknown function UPF0047  52.04 
 
 		 140 aa  97.8  4e-20  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.46172 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1204  hypothetical protein  40.98 
 
 		 136 aa  97.8  5e-20  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3510  hypothetical protein  49.55 
 
 		 139 aa  96.7  8e-20  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1450  protein of unknown function UPF0047  37.98 
 
 		 137 aa  94.4  4e-19  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.713066  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0339  protein of unknown function UPF0047  37.5 
 
 		 137 aa  94  5e-19  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5528  protein of unknown function UPF0047  47.12 
 
 		 140 aa  94  7e-19  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.652918  normal  1 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3771  protein of unknown function UPF0047  39.23 
 
 		 134 aa  93.6  8e-19  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3660  protein of unknown function UPF0047  47.75 
 
 		 139 aa  93.6  8e-19  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.180865  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0725  protein of unknown function UPF0047  45.95 
 
 		 141 aa  92  2e-18  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3562  protein of unknown function UPF0047  48.08 
 
 		 160 aa  91.3  4e-18  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.140371 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0301  hypothetical protein  39.84 
 
 		 160 aa  90.9  5e-18  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.157186 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0264  protein of unknown function UPF0047  38.28 
 
 		 140 aa  90.9  5e-18  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.846801  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1394  hypothetical protein  35.94 
 
 		 137 aa  90.5  7e-18  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.722362  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0528  protein of unknown function UPF0047  35.71 
 
 		 146 aa  90.1  8e-18  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3238  hypothetical protein  47.12 
 
 		 160 aa  89.4  1e-17  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.143896 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0463  hypothetical protein  39.06 
 
 		 142 aa  89.7  1e-17  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.822173  normal  0.159097 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4149  hypothetical protein  41.51 
 
 		 139 aa  89  2e-17  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.183368  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4801  hypothetical protein  41.51 
 
 		 139 aa  89  2e-17  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.639835  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3690  hypothetical protein  41.88 
 
 		 160 aa  89.4  2e-17  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3367  hypothetical protein  41.51 
 
 		 139 aa  89  2e-17  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.00750068  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5223  hypothetical protein  40.57 
 
 		 139 aa  88.6  2e-17  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3433  protein of unknown function UPF0047  46.15 
 
 		 160 aa  88.6  3e-17  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3301  hypothetical protein  40.57 
 
 		 139 aa  87.8  4e-17  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.0121064 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1703  protein of unknown function UPF0047  47.12 
 
 		 140 aa  88.2  4e-17  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2784  hypothetical protein  50.57 
 
 		 139 aa  87.4  5e-17  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00159172  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2650  hypothetical protein  44.44 
 
 		 139 aa  87.8  5e-17  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006670  CNA03880  conserved hypothetical protein  45.83 
 
 		 140 aa  87.4  6e-17  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2911  hypothetical protein  34.53 
 
 		 145 aa  87.4  6e-17  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.735439  normal  0.0500199 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1880  hypothetical protein  41.9 
 
 		 137 aa  87  7e-17  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002339  hypothetical protein  46.88 
 
 		 148 aa  87  7e-17  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.195625  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1273  protein of unknown function UPF0047  47.57 
 
 		 138 aa  87  8e-17  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2217  hypothetical protein  45.19 
 
 		 139 aa  87  8e-17  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.851507  hitchhiker  0.001424 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1685  hypothetical protein  37.4 
 
 		 139 aa  86.7  9e-17  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2631  hypothetical protein  36.92 
 
 		 138 aa  86.3  1e-16  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>