More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swol_1258 on replicon NC_008346
Organism: Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008346  Swol_1258  vesicle-fusing ATPase  100 
 
 
493 aa  996    Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.3081  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1923  vesicle-fusing ATPase  55.83 
 
 
494 aa  554  1e-156  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.385338  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0078  microtubule-severing ATPase  56.88 
 
 
490 aa  547  1e-154  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.000000378681  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0841  vesicle-fusing ATPase  55.83 
 
 
491 aa  544  1e-153  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.362889  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3106  Adenosinetriphosphatase  55.11 
 
 
493 aa  540  9.999999999999999e-153  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00000310536  normal  0.727853 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1077  vesicle-fusing ATPase  54.36 
 
 
494 aa  541  9.999999999999999e-153  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0625  Vesicle-fusing ATPase  53.66 
 
 
500 aa  531  1e-150  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11930  Microtubule-severing ATPase  53.58 
 
 
490 aa  528  1e-148  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000271723  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1639  Vesicle-fusing ATPase  53.77 
 
 
503 aa  514  1e-144  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3121  Microtubule-severing ATPase  53.27 
 
 
493 aa  507  9.999999999999999e-143  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1470  AAA ATPase central domain protein  48.77 
 
 
494 aa  470  1.0000000000000001e-131  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.043509  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1034  ATP-dependent metalloprotease FtsH  41.53 
 
 
510 aa  345  8e-94  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2059  ATP-dependent metalloprotease FtsH  42.19 
 
 
639 aa  345  1e-93  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0200  ATP-dependent metalloprotease FtsH  41.11 
 
 
602 aa  338  1.9999999999999998e-91  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0400462  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0546  ATP-dependent metalloprotease FtsH  42.25 
 
 
697 aa  335  1e-90  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0150  cell division protein FtsH, putative  42.37 
 
 
700 aa  335  1e-90  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0533  ATP-dependent metalloprotease FtsH  42.25 
 
 
697 aa  335  1e-90  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.37995  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0338  ATP-dependent metalloprotease FtsH  40.51 
 
 
610 aa  332  6e-90  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0356  ATP-dependent metalloprotease FtsH  40.32 
 
 
610 aa  332  1e-89  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0072  cell division protein FtsH  42.21 
 
 
633 aa  331  2e-89  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.12055  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1890  FtsH peptidase  41.3 
 
 
608 aa  331  2e-89  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  unclonable  0.00000000000186964  hitchhiker  0.0000000000919555 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0064  cell division protein FtsH  42.21 
 
 
633 aa  330  3e-89  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.651636  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0060  cell division protein  42.21 
 
 
633 aa  330  3e-89  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0060  cell division protein  42.21 
 
 
633 aa  330  3e-89  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.527958  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0064  cell division protein FtsH  42.21 
 
 
633 aa  330  3e-89  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.550597  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0073  cell division protein FtsH  42.21 
 
 
633 aa  330  3e-89  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.755624 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0076  cell division protein FtsH  42.21 
 
 
633 aa  330  3e-89  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0454651  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0060  ATP-dependent metalloprotease FtsH  42.79 
 
 
633 aa  330  4e-89  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5244  cell division protein FtsH  42.42 
 
 
633 aa  330  4e-89  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.293032 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0060  ATP-dependent metalloprotease FtsH  42.79 
 
 
639 aa  330  4e-89  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0063  cell division protein FtsH  42.21 
 
 
633 aa  330  5.0000000000000004e-89  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1052  ATP-dependent metalloprotease FtsH  40.24 
 
 
643 aa  330  5.0000000000000004e-89  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0062  ATP-dependent metalloprotease FtsH  43.17 
 
 
632 aa  329  8e-89  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0551  ATP-dependent metalloprotease FtsH  42.32 
 
 
652 aa  328  1.0000000000000001e-88  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.66681 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1229  cell division protein  39.07 
 
 
646 aa  327  2.0000000000000001e-88  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000000211886  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0868  ATP-dependent metalloprotease FtsH  43.51 
 
 
607 aa  327  2.0000000000000001e-88  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00580  ATP-dependent metalloprotease FtsH  41.72 
 
 
630 aa  328  2.0000000000000001e-88  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000000119838  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0081  FtsH-2 peptidase. Metallo peptidase. MEROPS family M41, membrane protease FtsH catalytic subunit  40.59 
 
 
693 aa  327  3e-88  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  decreased coverage  0.00746794  normal  0.780653 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0391  peptidase M41, FtsH  39.69 
 
 
662 aa  326  5e-88  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.0150338  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0793  ATP-dependent metalloprotease FtsH  40.74 
 
 
611 aa  326  8.000000000000001e-88  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.0000170708  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1180  cell division protein FtsH  40.04 
 
 
617 aa  325  1e-87  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.334987  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2393  FtsH peptidase  39.84 
 
 
619 aa  324  2e-87  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00023499  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0064  ATP-dependent metalloprotease FtsH  42.73 
 
 
635 aa  325  2e-87  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000000323168  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1809  cell division protein FtsH  41.09 
 
 
614 aa  324  3e-87  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0346889  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0172  ATP-dependent metalloprotease FtsH  42.38 
 
 
646 aa  323  4e-87  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0055  ATP-dependent metalloprotease FtsH  42.09 
 
 
671 aa  321  1.9999999999999998e-86  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0085  ATP-dependent metalloprotease FtsH  40.04 
 
 
619 aa  321  1.9999999999999998e-86  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0128077  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0848  ATP-dependent metalloprotease FtsH  40.97 
 
 
630 aa  320  1.9999999999999998e-86  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.810549  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1717  ATP-dependent metalloprotease FtsH  40.72 
 
 
676 aa  320  3e-86  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_01240  membrane protease FtsH catalytic subunit  39.84 
 
 
696 aa  320  3e-86  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2043  ATP-dependent metalloprotease FtsH  42.98 
 
 
687 aa  320  3e-86  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000823852 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0087  ATP-dependent metalloprotease FtsH  42.01 
 
 
620 aa  320  3.9999999999999996e-86  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1774  FtsH-2 peptidase  43.56 
 
 
702 aa  319  6e-86  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.517267  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2185  FtsH-2 peptidase  42.22 
 
 
627 aa  319  7e-86  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0723  FtsH-2 peptidase  41.65 
 
 
609 aa  318  2e-85  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0513277  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3252  ATP-dependent metalloprotease FtsH  41.25 
 
 
617 aa  317  2e-85  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00193369  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1806  ATP-dependent metalloprotease FtsH  42.22 
 
 
651 aa  318  2e-85  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.266956  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0126  ATP-dependent metalloprotease FtsH  39.3 
 
 
615 aa  318  2e-85  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0860215  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2639  ATP-dependent metalloprotease FtsH  41.48 
 
 
612 aa  317  2e-85  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.117969  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3438  ATP-dependent metalloprotease FtsH  42 
 
 
607 aa  317  2e-85  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.588898  hitchhiker  0.000161563 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0463  ATP-dependent metalloprotease FtsH  39.33 
 
 
662 aa  317  3e-85  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2158  ATP-dependent metalloprotease FtsH  43.56 
 
 
706 aa  317  3e-85  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1722  peptidase M41, FtsH  39.48 
 
 
631 aa  317  4e-85  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.139159 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2338  ATP-dependent metalloprotease FtsH  43.89 
 
 
634 aa  316  5e-85  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1076  ATP-dependent metalloprotease FtsH  39.69 
 
 
701 aa  316  5e-85  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2066  ATP-dependent metalloprotease FtsH  43.33 
 
 
705 aa  316  6e-85  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1595  ATP-dependent metalloprotease FtsH  41.27 
 
 
612 aa  316  6e-85  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_002936  DET0391  ATP-dependent metalloprotease FtsH  40.08 
 
 
608 aa  315  9e-85  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  unclonable  0.000322193  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0159  ATP-dependent metalloprotease FtsH  39.92 
 
 
614 aa  314  1.9999999999999998e-84  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.794037  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_333  ATP-dependent metalloprotease, cell division protein  40.08 
 
 
499 aa  314  1.9999999999999998e-84  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  unclonable  0.00000000228185  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2252  ATP-dependent metalloprotease FtsH  40.33 
 
 
621 aa  314  1.9999999999999998e-84  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  unclonable  0.000000390574  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1770  ATP-dependent metalloprotease FtsH  41.23 
 
 
651 aa  314  1.9999999999999998e-84  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.292571  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2372  ATP-dependent metalloprotease FtsH  43.44 
 
 
635 aa  314  2.9999999999999996e-84  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0392  ATP-dependent metalloprotease FtsH  41.3 
 
 
618 aa  313  2.9999999999999996e-84  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.297627 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1495  FtsH peptidase  43.44 
 
 
635 aa  314  2.9999999999999996e-84  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.629279  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7802  cell division protein  39.76 
 
 
630 aa  313  2.9999999999999996e-84  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.120789  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3548  ATP-dependent metalloprotease FtsH  41.76 
 
 
682 aa  313  3.9999999999999997e-84  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0555196  normal  0.0513542 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0014  cell division protein  39.35 
 
 
655 aa  313  3.9999999999999997e-84  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_02030  membrane protease FtsH catalytic subunit  38.83 
 
 
783 aa  313  4.999999999999999e-84  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  unclonable  0.0000829689  normal 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0370  ATP-dependent metalloprotease FtsH  40.33 
 
 
604 aa  313  4.999999999999999e-84  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  unclonable  0.000000686263  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0783  membrane protease FtsH catalytic subunit  38.49 
 
 
631 aa  313  4.999999999999999e-84  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  unclonable  0.0000000394436  unclonable  0.000000272669 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0438  membrane protease FtsH catalytic subunit  39.84 
 
 
673 aa  313  4.999999999999999e-84  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000747191  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0627  ATP-dependent metalloprotease FtsH  39.36 
 
 
682 aa  313  4.999999999999999e-84  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0250398  normal  0.798069 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4390  ATP-dependent metalloprotease FtsH  43.79 
 
 
623 aa  313  5.999999999999999e-84  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.489169  normal  0.114321 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2460  ATP-dependent metalloprotease FtsH  43.21 
 
 
635 aa  313  5.999999999999999e-84  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5357  cell division protein ftsH (ATP-dependent zinc-metallo protease)  43.27 
 
 
615 aa  312  9e-84  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.0232294 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4361  ATP-dependent metalloprotease FtsH  40.67 
 
 
640 aa  311  1e-83  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.193811 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6194  FtsH-2 peptidase  39.48 
 
 
646 aa  311  1e-83  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4465  ATP-dependent metalloprotease FtsH  41.7 
 
 
610 aa  311  1e-83  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1098  membrane protease FtsH catalytic subunit  42.32 
 
 
640 aa  311  1e-83  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.13074  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2418  ATP-dependent metalloprotease FtsH  41.09 
 
 
616 aa  311  1e-83  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0276  ATP-dependent Zn protease  41.65 
 
 
708 aa  311  1e-83  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00629107  normal  0.162688 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2884  ATP-dependent metalloprotease FtsH  40.76 
 
 
623 aa  312  1e-83  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.402765  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0518  ATP-dependent metalloprotease FtsH  37.7 
 
 
636 aa  311  2e-83  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.000475149  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1168  FtsH-2 peptidase  40.52 
 
 
605 aa  311  2e-83  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.747317  normal  0.986179 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0064  FtsH peptidase  39.8 
 
 
637 aa  311  2e-83  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3391  ATP-dependent metalloprotease FtsH  40.79 
 
 
624 aa  311  2e-83  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.565531  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0997  ATP-dependent zinc protease/ cell division protein  40.74 
 
 
616 aa  310  2.9999999999999997e-83  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000353226  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1513  FtsH peptidase  40.67 
 
 
665 aa  310  2.9999999999999997e-83  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  unclonable  0.000000097295  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2472  ATP-dependent metalloprotease FtsH  38.26 
 
 
601 aa  310  2.9999999999999997e-83  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>