More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swit_4729 on replicon NC_009511
Organism: Sphingomonas wittichii RW1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009511  Swit_4729  DNA repair protein RecN  100 
 
 		 553 aa  1052    Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.574204  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1736  DNA repair protein RecN  65.34 
 
 		 554 aa  610  1e-173  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0149698  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0546  DNA repair protein RecN  69.37 
 
 		 556 aa  563  1.0000000000000001e-159  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.419857 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3295  DNA repair protein RecN  52.76 
 
 		 561 aa  474  1e-132  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1377  DNA repair protein RecN  53.12 
 
 		 559 aa  469  1.0000000000000001e-131  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.183083  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1421  DNA repair protein RecN  52.94 
 
 		 559 aa  467  9.999999999999999e-131  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.564129  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2431  DNA repair protein RecN  55.83 
 
 		 557 aa  465  1e-129  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.320289  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1753  DNA repair protein RecN  52.94 
 
 		 554 aa  462  1e-129  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1998  DNA repair protein RecN  52.07 
 
 		 558 aa  459  9.999999999999999e-129  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1061  DNA repair protein RecN  52.22 
 
 		 561 aa  457  1e-127  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.73431 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1289  DNA repair protein RecN  51.51 
 
 		 561 aa  457  1e-127  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2007  DNA repair protein RecN  52.12 
 
 		 561 aa  452  1.0000000000000001e-126  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.518502 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6694  DNA repair protein RecN  54.03 
 
 		 557 aa  453  1.0000000000000001e-126  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.478556  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4037  DNA repair protein RecN  52.31 
 
 		 562 aa  451  1e-125  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.531713  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6163  DNA repair protein RecN (recombination protein N)  53.05 
 
 		 557 aa  448  1.0000000000000001e-124  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0430688 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2347  DNA repair protein RecN  53.3 
 
 		 557 aa  447  1.0000000000000001e-124  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.724371 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0331  DNA repair protein RecN  51.23 
 
 		 565 aa  448  1.0000000000000001e-124  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.398153  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0938  DNA repair protein RecN  46.67 
 
 		 555 aa  444  1e-123  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  hitchhiker  0.0000961269  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2071  DNA repair protein RecN  49.54 
 
 		 557 aa  439  9.999999999999999e-123  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.240609  hitchhiker  0.00158855 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3497  DNA repair protein RecN  50.62 
 
 		 553 aa  441  9.999999999999999e-123  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.185224 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2842  DNA repair protein RecN  49.27 
 
 		 557 aa  435  1e-121  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.049374  hitchhiker  0.0050611 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2879  DNA repair protein RecN  48.54 
 
 		 557 aa  437  1e-121  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3383  DNA repair protein RecN  52.04 
 
 		 561 aa  436  1e-121  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.342411  normal  0.0146677 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3099  DNA repair protein RecN  52.72 
 
 		 564 aa  437  1e-121  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.545519  normal  0.794323 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2583  DNA repair protein RecN  48.82 
 
 		 557 aa  437  1e-121  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  hitchhiker  0.0083659  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0692  DNA repair protein RecN  51.1 
 
 		 549 aa  434  1e-120  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0261152  decreased coverage  0.000301908 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4484  DNA repair protein RecN  55.52 
 
 		 547 aa  433  1e-120  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0940  DNA repair protein RecN  52.12 
 
 		 577 aa  429  1e-119  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.693692  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7433  DNA repair protein RecN  54.64 
 
 		 557 aa  429  1e-119  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.146948  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0793  DNA repair protein RecN  50.74 
 
 		 546 aa  426  1e-118  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.628008 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2118  DNA repair protein RecN  50.93 
 
 		 546 aa  424  1e-117  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.513575  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2067  DNA repair protein RecN  52.04 
 
 		 565 aa  423  1e-117  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.614381 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3161  DNA repair protein RecN  50.09 
 
 		 570 aa  421  1e-116  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.957491  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2747  DNA repair protein RecN  49.73 
 
 		 549 aa  421  1e-116  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2954  DNA repair protein RecN  51.35 
 
 		 566 aa  421  1e-116  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.0217727 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3180  DNA repair protein RecN  51.35 
 
 		 566 aa  416  9.999999999999999e-116  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3137  DNA repair protein RecN  51.44 
 
 		 565 aa  415  1e-114  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.103261 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0700  DNA repair protein RecN  48.92 
 
 		 554 aa  393  1e-108  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.415077 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0703  DNA repair protein RecN  50.64 
 
 		 546 aa  395  1e-108  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2413  DNA repair protein  51.75 
 
 		 553 aa  379  1e-104  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  hitchhiker  0.00688711  normal  0.675409 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1763  DNA repair protein RecN  41.09 
 
 		 560 aa  357  2.9999999999999997e-97  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.137867  normal  0.0495571 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01182  DNA repair protein RecN  40.43 
 
 		 554 aa  350  5e-95  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.239665  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0756  DNA repair protein RecN  49.56 
 
 		 559 aa  348  2e-94  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2333  DNA repair protein RecN  42.99 
 
 		 549 aa  346  6e-94  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0492  DNA repair protein RecN  42.99 
 
 		 549 aa  346  6e-94  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2214  DNA repair protein RecN  42.99 
 
 		 549 aa  346  6e-94  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.725261  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3319  DNA repair protein RecN  42.99 
 
 		 549 aa  346  6e-94  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.303665  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3286  DNA repair protein RecN  42.99 
 
 		 549 aa  346  6e-94  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0539815  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1107  DNA repair protein RecN  42.99 
 
 		 549 aa  346  6e-94  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0249547  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3329  DNA repair protein RecN  42.81 
 
 		 549 aa  345  1e-93  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3364  DNA repair protein RecN  38.17 
 
 		 559 aa  344  2.9999999999999997e-93  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.276138  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1191  DNA repair protein RecN  40.29 
 
 		 559 aa  340  5.9999999999999996e-92  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1300  DNA repair protein RecN  42.81 
 
 		 549 aa  337  2.9999999999999997e-91  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  decreased coverage  0.00383913  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0998  DNA repair protein RecN  40.46 
 
 		 589 aa  337  5e-91  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.553113 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3831  DNA repair protein RecN  41.83 
 
 		 549 aa  332  1e-89  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0713  DNA repair protein RecN  42.29 
 
 		 549 aa  332  1e-89  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.685992  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0259  DNA repair protein RecN  42.11 
 
 		 549 aa  330  4e-89  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.255628  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0743  DNA repair protein RecN  42.11 
 
 		 549 aa  330  4e-89  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.259434  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0456  DNA repair protein RecN  40.39 
 
 		 553 aa  329  8e-89  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0661  DNA repair protein RecN  41.73 
 
 		 549 aa  328  2.0000000000000001e-88  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0637  DNA repair protein RecN  41.73 
 
 		 549 aa  327  2.0000000000000001e-88  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1597  DNA repair protein RecN  39.39 
 
 		 553 aa  326  6e-88  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1774  DNA repair protein RecN  39.5 
 
 		 556 aa  325  9e-88  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2641  DNA repair protein RecN  41.58 
 
 		 549 aa  325  2e-87  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.227143  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1515  recombination protein N  37.3 
 
 		 557 aa  324  3e-87  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1026  recombination and repair protein  37.23 
 
 		 554 aa  323  6e-87  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0968  DNA repair protein RecN  39.54 
 
 		 567 aa  322  9.999999999999999e-87  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.858596  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0775  DNA repair protein RecN  39.5 
 
 		 552 aa  321  1.9999999999999998e-86  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000179189 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1458  DNA repair protein RecN  37.12 
 
 		 557 aa  321  3e-86  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.0380589  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1480  DNA repair protein RecN  40.93 
 
 		 556 aa  320  5e-86  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.269893  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2889  recombination and repair protein  36.14 
 
 		 553 aa  319  7e-86  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000988342  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3462  recombination and repair protein  35.48 
 
 		 552 aa  319  7.999999999999999e-86  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1385  DNA repair protein  34.71 
 
 		 608 aa  318  1e-85  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.0276871  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1034  DNA repair protein RecN  40.29 
 
 		 576 aa  318  1e-85  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1446  DNA repair protein RecN  34.71 
 
 		 556 aa  318  1e-85  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.000211173  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2475  recombination and repair protein  32.92 
 
 		 565 aa  318  2e-85  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3359  recombination and repair protein  36.25 
 
 		 553 aa  318  2e-85  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.0341558 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1281  recombination and repair protein  34.64 
 
 		 553 aa  317  3e-85  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  unclonable  0.000000000117137 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1376  recombination and repair protein  35.96 
 
 		 553 aa  317  3e-85  Yersinia pestis Angola  Bacteria  decreased coverage  0.0000000100313  normal  0.0248594 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2976  recombination and repair protein  35.96 
 
 		 553 aa  317  3e-85  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0819489  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4197  DNA repair protein RecN  36.8 
 
 		 557 aa  317  4e-85  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.312426  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0866  DNA repair protein RecN  35.32 
 
 		 555 aa  317  4e-85  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1170  recombination and repair protein  35.14 
 
 		 552 aa  317  5e-85  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.0260908 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2316  DNA repair protein RecN  34.09 
 
 		 573 aa  316  6e-85  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1104  recombination and repair protein  34.95 
 
 		 552 aa  316  8e-85  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.239344  normal  0.154382 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1104  recombination and repair protein  34.95 
 
 		 552 aa  316  9e-85  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.562592 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2879  recombination and repair protein  35.55 
 
 		 553 aa  314  1.9999999999999998e-84  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.158329 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4507  DNA repair protein RecN  36.8 
 
 		 557 aa  315  1.9999999999999998e-84  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2897  recombination and repair protein  35.55 
 
 		 553 aa  314  1.9999999999999998e-84  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5483  DNA repair protein RecN  38.28 
 
 		 558 aa  315  1.9999999999999998e-84  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.582199  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2899  recombination and repair protein  35.55 
 
 		 553 aa  314  1.9999999999999998e-84  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1169  recombination and repair protein  34.59 
 
 		 553 aa  313  5.999999999999999e-84  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2829  recombination and repair protein  35.37 
 
 		 553 aa  313  5.999999999999999e-84  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00407233  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1860  DNA repair protein RecN  40.11 
 
 		 558 aa  312  1e-83  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.457848  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2735  alkylhydroperoxidase AhpD core  37.1 
 
 		 557 aa  312  1e-83  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0271976  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3011  recombination and repair protein  35.37 
 
 		 553 aa  312  1e-83  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0254  DNA repair protein RecN  35.43 
 
 		 573 aa  311  2e-83  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2505  DNA repair protein RecN  41.77 
 
 		 555 aa  311  2e-83  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2771  recombination and repair protein  34.76 
 
 		 552 aa  311  2.9999999999999997e-83  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.170925  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2774  recombination and repair protein  35.06 
 
 		 553 aa  310  5.9999999999999995e-83  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00000000103072  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>