More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swit_3933 on replicon NC_009511
Organism: Sphingomonas wittichii RW1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009511  Swit_3933  Beta-N-acetylhexosaminidase  100 
 
 		 337 aa  658    Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1140  Beta-N-acetylhexosaminidase  61.79 
 
 		 335 aa  392  1e-108  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.777331 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1091  Beta-N-acetylhexosaminidase  59.05 
 
 		 355 aa  355  7.999999999999999e-97  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3122  Beta-N-acetylhexosaminidase  56.54 
 
 		 341 aa  335  5e-91  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.435185  normal  0.194122 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4420  putative sugar hydrolase/Beta-N-acetylhexosaminidase  53.05 
 
 		 342 aa  316  3e-85  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.821767 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2793  Beta-N-acetylhexosaminidase  52.23 
 
 		 341 aa  312  6.999999999999999e-84  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0138787  normal  0.035915 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3192  Beta-N-acetylhexosaminidase  54.86 
 
 		 341 aa  306  4.0000000000000004e-82  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0603472  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2510  Beta-N-acetylhexosaminidase  50.45 
 
 		 342 aa  305  9.000000000000001e-82  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.327504 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3398  Beta-N-acetylhexosaminidase  52.25 
 
 		 343 aa  305  9.000000000000001e-82  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.383857  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2765  Beta-N-acetylhexosaminidase  57.39 
 
 		 334 aa  303  2.0000000000000002e-81  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.313459  normal  0.158158 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3707  Beta-N-acetylhexosaminidase  51.95 
 
 		 343 aa  303  3.0000000000000004e-81  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  decreased coverage  0.00367643  normal  0.692515 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3589  Beta-N-acetylhexosaminidase  56.16 
 
 		 351 aa  302  6.000000000000001e-81  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.806874 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1912  Beta-N-acetylhexosaminidase  52.98 
 
 		 338 aa  301  9e-81  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1760  Beta-N-acetylhexosaminidase  49.23 
 
 		 341 aa  301  2e-80  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2748  Beta-N-acetylhexosaminidase  50.15 
 
 		 341 aa  296  4e-79  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.429307  normal  0.273595 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1805  glycoside hydrolase family protein  52.94 
 
 		 338 aa  293  4e-78  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.174272  normal  0.317979 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1777  Beta-N-acetylhexosaminidase  57.04 
 
 		 339 aa  293  4e-78  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.120997  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2180  glycoside hydrolase family 3 domain protein  54.11 
 
 		 339 aa  291  1e-77  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.259276  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3024  Beta-N-acetylhexosaminidase  53.33 
 
 		 337 aa  284  1.0000000000000001e-75  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.363862  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2482  Beta-N-acetylhexosaminidase  56.43 
 
 		 341 aa  282  6.000000000000001e-75  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.474909  normal  0.012309 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1810  glycoside hydrolase family protein  50.16 
 
 		 343 aa  281  8.000000000000001e-75  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4411  Beta-N-acetylhexosaminidase  53.44 
 
 		 337 aa  276  3e-73  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.666506  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2348  Beta-N-acetylhexosaminidase  46.97 
 
 		 339 aa  275  6e-73  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0870  glycosy hydrolase family protein  47.09 
 
 		 339 aa  271  1e-71  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0879  glycosy hydrolase family protein  49.17 
 
 		 337 aa  270  2e-71  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3725  Beta-N-acetylhexosaminidase  45.33 
 
 		 308 aa  268  1e-70  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.646228  normal  0.35117 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1484  Beta-N-acetylhexosaminidase  47.35 
 
 		 337 aa  266  4e-70  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.760181  normal  0.558112 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1682  Beta-N-acetylhexosaminidase  45.35 
 
 		 337 aa  261  2e-68  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1726  beta-hexosamidase  47.88 
 
 		 328 aa  258  7e-68  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.336412  normal  0.406336 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1160  Beta-N-acetylhexosaminidase  46.79 
 
 		 344 aa  245  9e-64  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0839942  normal  0.394325 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2673  glycosyl hydrolase  49.48 
 
 		 338 aa  238  6.999999999999999e-62  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0951  Beta-N-acetylhexosaminidase  48.98 
 
 		 308 aa  232  7.000000000000001e-60  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0904  Beta-N-acetylhexosaminidase  48.84 
 
 		 338 aa  230  2e-59  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.14342  normal  0.0636434 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6683  Beta-N-acetylhexosaminidase  43 
 
 		 340 aa  228  1e-58  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.613122 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5779  Beta-N-acetylhexosaminidase  41.91 
 
 		 340 aa  222  6e-57  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.028314  normal  0.0213376 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1868  Beta-N-acetylhexosaminidase  47.3 
 
 		 328 aa  215  7e-55  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0376084  normal  0.8886 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1509  Beta-N-acetylhexosaminidase  42.17 
 
 		 338 aa  210  3e-53  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.371203 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1586  Beta-N-acetylhexosaminidase  47.93 
 
 		 337 aa  206  4e-52  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.245014 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2941  putative glycoside hydrolase  47.59 
 
 		 337 aa  203  3e-51  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1631  Beta-N-acetylhexosaminidase  40.26 
 
 		 364 aa  202  7e-51  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.154433  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0905  Beta-N-acetylhexosaminidase  41.74 
 
 		 353 aa  187  2e-46  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1261  Beta-N-acetylhexosaminidase  41.08 
 
 		 346 aa  173  3.9999999999999995e-42  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1179  beta-hexosaminidase  37.01 
 
 		 313 aa  166  6.9999999999999995e-40  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  hitchhiker  0.00210954  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0853  beta-hexosaminidase  37.01 
 
 		 313 aa  164  2.0000000000000002e-39  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.0000000457661  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1327  Beta-N-acetylhexosaminidase  39.16 
 
 		 348 aa  162  5.0000000000000005e-39  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0497854  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0727  beta-hexosaminidase  38.8 
 
 		 359 aa  161  1e-38  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4847  glycoside hydrolase family protein  34.33 
 
 		 361 aa  160  2e-38  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.139059  normal  0.0302245 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1845  beta-hexosaminidase  35.9 
 
 		 349 aa  160  4e-38  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0159028  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1468  beta-hexosaminidase  40.13 
 
 		 335 aa  157  2e-37  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.0176842  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1089  glycoside hydrolase family 3 domain protein  29.75 
 
 		 426 aa  157  2e-37  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000284177  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2876  family 3 glycoside hydrolase domain-containing protein  33.8 
 
 		 363 aa  156  4e-37  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.259757  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1525  beta-hexosaminidase  39.8 
 
 		 335 aa  155  8e-37  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.276065  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1790  glycosyl hydrolase  32.54 
 
 		 344 aa  155  1e-36  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0298414  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_2109  Beta-N-acetylhexosaminidase  35.5 
 
 		 353 aa  153  2.9999999999999998e-36  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.302973 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0282  Beta-N-acetylhexosaminidase  34.94 
 
 		 511 aa  153  4e-36  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3178  glycoside hydrolase family 3 domain protein  42.16 
 
 		 387 aa  152  5.9999999999999996e-36  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.752007 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1398  glycoside hydrolase family 3 domain protein  38.75 
 
 		 362 aa  152  1e-35  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1097  beta-hexosaminidase  35.82 
 
 		 342 aa  149  6e-35  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2034  beta-hexosaminidase  37.1 
 
 		 339 aa  149  8e-35  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.362016  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1761  beta-hexosaminidase  35.4 
 
 		 349 aa  149  8e-35  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0223  beta-hexosaminidase  35.94 
 
 		 330 aa  149  8e-35  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1019  beta-hexosaminidase  35.22 
 
 		 342 aa  149  9e-35  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0659  beta-hexosaminidase  35.82 
 
 		 342 aa  149  9e-35  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1139  beta-hexosaminidase  35.82 
 
 		 342 aa  149  9e-35  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3056  glycoside hydrolase family 3 protein  35.27 
 
 		 352 aa  149  9e-35  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0575  beta-hexosaminidase  35.79 
 
 		 331 aa  148  1.0000000000000001e-34  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4251  beta-hexosaminidase  35.22 
 
 		 342 aa  148  1.0000000000000001e-34  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2614  Beta-N-acetylhexosaminidase  35.53 
 
 		 369 aa  147  2.0000000000000003e-34  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0420  glycoside hydrolase family 3 domain-containing protein  32.29 
 
 		 511 aa  148  2.0000000000000003e-34  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.500128  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3261  Beta-N-acetylhexosaminidase  35.53 
 
 		 369 aa  147  2.0000000000000003e-34  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.0432032 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2165  beta-hexosaminidase  38.52 
 
 		 342 aa  147  2.0000000000000003e-34  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.424583 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01728  beta-hexosaminidase  38.51 
 
 		 361 aa  147  2.0000000000000003e-34  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1068  beta-hexosaminidase  36.23 
 
 		 350 aa  147  3e-34  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  decreased coverage  0.0051556  normal  0.100642 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004407  beta N-acetyl-glucosaminidase  36.24 
 
 		 327 aa  147  3e-34  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1015  beta-hexosaminidase  36.22 
 
 		 342 aa  147  3e-34  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.791894  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00991  beta-hexosaminidase  37.25 
 
 		 327 aa  146  4.0000000000000006e-34  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1606  beta-hexosaminidase  38.25 
 
 		 348 aa  146  5e-34  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.632419  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1987  glycoside hydrolase family 3 protein  34.49 
 
 		 337 aa  146  5e-34  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.564603  normal  0.428635 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1296  glycoside hydrolase family protein  33.65 
 
 		 357 aa  145  7.0000000000000006e-34  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1090  beta-hexosaminidase  35.69 
 
 		 342 aa  145  1e-33  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3507  beta-hexosaminidase  37.54 
 
 		 336 aa  144  2e-33  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0548  beta-hexosaminidase  37.46 
 
 		 342 aa  144  2e-33  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2968  beta-hexosaminidase  37.46 
 
 		 335 aa  144  2e-33  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0265184  hitchhiker  0.0000639415 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2820  beta-hexosaminidase  37.46 
 
 		 342 aa  144  2e-33  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.24602  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2889  beta-hexosaminidase  37.46 
 
 		 342 aa  144  2e-33  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2461  beta-hexosaminidase  37.46 
 
 		 342 aa  144  2e-33  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1784  beta-hexosaminidase  37.46 
 
 		 342 aa  144  2e-33  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.131771  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_3174  glycoside hydrolase family 3 domain protein  32.61 
 
 		 528 aa  144  2e-33  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.108856  normal  0.164805 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1754  Beta-N-acetylhexosaminidase  33.52 
 
 		 364 aa  144  2e-33  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3630  glycoside hydrolase family protein  35.54 
 
 		 352 aa  144  2e-33  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2835  beta-hexosaminidase  37.46 
 
 		 342 aa  144  2e-33  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.261076  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_25195  beta-hexosaminidase  37.19 
 
 		 332 aa  144  2e-33  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2293  beta-hexosaminidase  33.99 
 
 		 342 aa  144  2e-33  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.610564  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2774  beta-hexosaminidase  37.46 
 
 		 342 aa  144  2e-33  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3281  beta-hexosaminidase  36.86 
 
 		 336 aa  144  3e-33  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2307  beta-hexosaminidase  36.81 
 
 		 381 aa  144  3e-33  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0826435  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2183  glycoside hydrolase family protein  36.71 
 
 		 341 aa  143  4e-33  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1754  beta-N-acetylhexosaminidase  36.14 
 
 		 347 aa  143  4e-33  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1662  beta-hexosaminidase  35.82 
 
 		 336 aa  142  6e-33  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.370939  normal  0.723702 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3597  beta-hexosaminidase  35.31 
 
 		 336 aa  142  6e-33  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.656661  normal  0.548595 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>