237 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swit_1780 on replicon NC_009511
Organism: Sphingomonas wittichii RW1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009511  Swit_1780  hypothetical protein  100 
 
 		 291 aa  584  1e-166  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0176081  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0359  hypothetical protein  67.24 
 
 		 292 aa  416  9.999999999999999e-116  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.639489 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0128  protein of unknown function DUF849  65.97 
 
 		 296 aa  386  1e-106  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5853  3-keto-5-aminohexanoate cleavage enzyme  69.07 
 
 		 294 aa  386  1e-106  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.493531  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1910  hypothetical protein  66.32 
 
 		 311 aa  378  1e-104  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.476578  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4741  hypothetical protein  65.51 
 
 		 304 aa  375  1e-103  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.88722 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3176  hypothetical protein  57.04 
 
 		 311 aa  308  8e-83  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.151565  hitchhiker  0.00732826 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0229  protein of unknown function DUF849  54.48 
 
 		 293 aa  303  2.0000000000000002e-81  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.747002  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1937  hypothetical protein  54.83 
 
 		 295 aa  295  8e-79  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.642383  normal  0.0127736 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0771  hypothetical protein  49.31 
 
 		 297 aa  288  8e-77  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0383  hypothetical protein  47.59 
 
 		 297 aa  286  2e-76  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0344  protein of unknown function DUF849  46.55 
 
 		 290 aa  257  2e-67  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3174  hypothetical protein  47.08 
 
 		 293 aa  254  1.0000000000000001e-66  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1017  protein of unknown function DUF849  45.86 
 
 		 293 aa  254  1.0000000000000001e-66  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  decreased coverage  0.0000125138  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2361  hypothetical protein  43.45 
 
 		 298 aa  246  3e-64  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.479394  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4905  hypothetical protein  47.78 
 
 		 294 aa  246  3e-64  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.0922631 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0323  hypothetical protein  46.42 
 
 		 294 aa  245  4.9999999999999997e-64  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.198912 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6226  hypothetical protein  44.9 
 
 		 297 aa  245  6e-64  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  hitchhiker  0.00955667  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0303  hypothetical protein  46.42 
 
 		 294 aa  244  9.999999999999999e-64  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00075505 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0327  hypothetical protein  46.42 
 
 		 294 aa  243  3e-63  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1340  protein of unknown function DUF849  48.29 
 
 		 299 aa  242  6e-63  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2917  hypothetical protein  48.46 
 
 		 295 aa  242  7e-63  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.041062  normal  0.0930195 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5231  hypothetical protein  48.46 
 
 		 295 aa  239  4e-62  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.225304  normal  0.0225177 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5233  hypothetical protein  49.83 
 
 		 309 aa  239  4e-62  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.782218 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3316  hypothetical protein  49.83 
 
 		 309 aa  239  4e-62  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0677839  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5051  hypothetical protein  49.83 
 
 		 309 aa  239  4e-62  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.5247  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0612  hypothetical protein  49.49 
 
 		 309 aa  239  5e-62  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0827  hypothetical protein  49.83 
 
 		 309 aa  238  5.999999999999999e-62  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.519946 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2128  hypothetical protein  48.81 
 
 		 309 aa  238  9e-62  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0851  hypothetical protein  48.81 
 
 		 309 aa  238  9e-62  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0491  hypothetical protein  48.46 
 
 		 309 aa  237  1e-61  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4979  hypothetical protein  50.17 
 
 		 309 aa  238  1e-61  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.483188  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4509  protein of unknown function DUF849  49.83 
 
 		 309 aa  238  1e-61  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4459  hypothetical protein  50.17 
 
 		 309 aa  237  1e-61  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0689248  normal  1 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0690  hypothetical protein  48.46 
 
 		 309 aa  237  1e-61  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6173  hypothetical protein  49.49 
 
 		 294 aa  237  2e-61  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1848  hypothetical protein  49.15 
 
 		 309 aa  237  2e-61  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3285  hypothetical protein  49.15 
 
 		 309 aa  236  2e-61  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.113084  normal  1 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1958  hypothetical protein  48.46 
 
 		 309 aa  237  2e-61  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3589  hypothetical protein  49.15 
 
 		 309 aa  237  2e-61  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.72078  normal  0.726481 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3968  hypothetical protein  49.15 
 
 		 312 aa  237  2e-61  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.274195 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0986  hypothetical protein  48.46 
 
 		 309 aa  237  2e-61  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0500  hypothetical protein  49.15 
 
 		 294 aa  236  3e-61  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0761  hypothetical protein  48.46 
 
 		 309 aa  236  4e-61  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.470234  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_71150  hypothetical protein  49.15 
 
 		 294 aa  234  1.0000000000000001e-60  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.185944  normal  1 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_5071  hypothetical protein  47.44 
 
 		 295 aa  232  5e-60  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.674247 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_16260  hypothetical protein  45.21 
 
 		 295 aa  221  9.999999999999999e-57  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2922  hypothetical protein  44.33 
 
 		 301 aa  218  7.999999999999999e-56  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.565171  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3825  hypothetical protein  44.22 
 
 		 303 aa  218  1e-55  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2173  hypothetical protein  43.2 
 
 		 300 aa  213  3.9999999999999995e-54  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.414156  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2188  hypothetical protein  45.58 
 
 		 305 aa  210  2e-53  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.390095  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4492  protein of unknown function DUF849  43.2 
 
 		 300 aa  207  1e-52  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6431  protein of unknown function DUF849  42.86 
 
 		 300 aa  207  2e-52  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0132289 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3295  hypothetical protein  42.86 
 
 		 305 aa  203  3e-51  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3885  hypothetical protein  39.72 
 
 		 273 aa  190  2.9999999999999997e-47  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0209  hypothetical protein  39.3 
 
 		 275 aa  188  1e-46  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1487  3-keto-5-aminohexanoate cleavage enzyme  40 
 
 		 272 aa  183  4.0000000000000006e-45  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2380  protein of unknown function DUF849  38.97 
 
 		 272 aa  179  5.999999999999999e-44  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.625502  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1078  hypothetical protein  38.68 
 
 		 273 aa  176  4e-43  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1884  3-keto-5-aminohexanoate cleavage enzyme  37.63 
 
 		 289 aa  176  5e-43  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.0818534 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2468  protein of unknown function DUF849  38.62 
 
 		 272 aa  175  7e-43  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.437162  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2345  hypothetical protein  39.65 
 
 		 272 aa  173  2.9999999999999996e-42  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.117765  normal  0.494816 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0635  hypothetical protein  37.98 
 
 		 281 aa  172  5e-42  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG1068  hypothetical protein  36.46 
 
 		 273 aa  167  2e-40  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.567235 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2623  protein of unknown function DUF849  37.23 
 
 		 287 aa  164  1.0000000000000001e-39  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1594  protein of unknown function DUF849  34.45 
 
 		 296 aa  164  1.0000000000000001e-39  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2423  hypothetical protein  37.28 
 
 		 272 aa  162  6e-39  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.216636 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1372  protein of unknown function DUF849  35.05 
 
 		 282 aa  160  2e-38  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0190  hypothetical protein  37.06 
 
 		 272 aa  159  7e-38  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.881715  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5229  protein of unknown function DUF849  38.83 
 
 		 274 aa  157  2e-37  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.850912  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1903  3-keto-5-aminohexanoate cleavage enzyme  37.28 
 
 		 271 aa  155  7e-37  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5151  protein of unknown function DUF849  37.8 
 
 		 274 aa  154  1e-36  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.373427  normal  0.110468 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2907  hypothetical protein  35.05 
 
 		 293 aa  154  2e-36  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4391  protein of unknown function DUF849  35.5 
 
 		 321 aa  153  2.9999999999999998e-36  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4686  hypothetical protein  37.59 
 
 		 274 aa  152  5.9999999999999996e-36  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.547717  normal  0.972452 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6352  protein of unknown function DUF849  35.49 
 
 		 274 aa  150  2e-35  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2185  hypothetical protein  34.39 
 
 		 310 aa  150  4e-35  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007488  RSP_3969  hypothetical protein  33.12 
 
 		 310 aa  149  8e-35  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3015  3-keto-5-aminohexanoate cleavage enzyme  35.58 
 
 		 306 aa  148  9e-35  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4531  hypothetical protein  32.28 
 
 		 312 aa  148  9e-35  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3741  hypothetical protein  35.58 
 
 		 306 aa  148  1.0000000000000001e-34  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0921  3-keto-5-aminohexanoate cleavage enzyme  36.91 
 
 		 305 aa  147  3e-34  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0368988 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11733  hypothetical protein  35.89 
 
 		 272 aa  146  3e-34  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1700  hypothetical protein  36.16 
 
 		 308 aa  146  4.0000000000000006e-34  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009508  Swit_5054  hypothetical protein  34.18 
 
 		 313 aa  146  4.0000000000000006e-34  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.486178  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2137  hypothetical protein  31.72 
 
 		 293 aa  145  5e-34  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  decreased coverage  0.0000000999013  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1631  hypothetical protein  34.81 
 
 		 274 aa  145  6e-34  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0966  hypothetical protein  32.38 
 
 		 310 aa  145  8.000000000000001e-34  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4256  hypothetical protein  34.92 
 
 		 310 aa  145  1e-33  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.011054  normal  0.0603426 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3694  protein of unknown function DUF849  36.19 
 
 		 309 aa  143  4e-33  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2170  hypothetical protein  35.53 
 
 		 290 aa  143  4e-33  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4641  hypothetical protein  35.56 
 
 		 309 aa  142  7e-33  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.719101  normal  0.130782 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0471  hypothetical protein  36.68 
 
 		 309 aa  142  7e-33  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3905  hypothetical protein  33.33 
 
 		 310 aa  142  8e-33  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.251797 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2322  hypothetical protein  30.28 
 
 		 310 aa  142  9e-33  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00000925474  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6069  hypothetical protein  33.54 
 
 		 307 aa  141  9.999999999999999e-33  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0271  hypothetical protein  34.77 
 
 		 310 aa  141  9.999999999999999e-33  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.0058593  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0074  protein of unknown function DUF849  35.57 
 
 		 308 aa  141  1.9999999999999998e-32  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.860524  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2376  protein of unknown function DUF849  36.08 
 
 		 280 aa  141  1.9999999999999998e-32  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.515693  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2085  protein of unknown function DUF849  36.08 
 
 		 281 aa  141  1.9999999999999998e-32  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.359333  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>