290 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swit_1415 on replicon NC_009511
Organism: Sphingomonas wittichii RW1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009511  Swit_1415  SAM-dependent methyltransferase-like protein  100 
 
 		 288 aa  581  1.0000000000000001e-165  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.418397  normal  0.0960542 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0922  SAM-dependent methyltransferase  65.61 
 
 		 294 aa  371  1e-102  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.728224  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1397  SAM-dependent methyltransferase  69.44 
 
 		 252 aa  341  1e-92  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.404398  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3093  hypothetical protein  50 
 
 		 304 aa  267  2e-70  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3027  putative SAM-dependent methyltransferase  47.77 
 
 		 298 aa  266  4e-70  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00129145 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1373  putative SAM-dependent methyltransferase  45.36 
 
 		 314 aa  259  4e-68  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3676  hypothetical protein  47.7 
 
 		 334 aa  258  1e-67  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0146  putative SAM dependent methyltransferase  45.73 
 
 		 381 aa  254  2.0000000000000002e-66  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.440659  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0163  hypothetical protein  45.92 
 
 		 386 aa  252  6e-66  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0151  SAM dependent methyltransferase, putative  45.39 
 
 		 381 aa  252  6e-66  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3845  hypothetical protein  43.79 
 
 		 291 aa  247  2e-64  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0024  hypothetical protein  46.64 
 
 		 385 aa  244  9.999999999999999e-64  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000201715 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0413  SAM dependent methyltransferase  48.44 
 
 		 405 aa  243  3e-63  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0039  putative SAM-dependent methyltransferase protein  46.67 
 
 		 365 aa  238  1e-61  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.274671 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0054  putative SAM-dependent methyltransferase protein  46.83 
 
 		 365 aa  237  2e-61  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2432  hypothetical protein  38.03 
 
 		 287 aa  226  3e-58  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0277  hypothetical protein  38.33 
 
 		 291 aa  223  3e-57  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1019  putative SAM-dependent methyltransferase  34.48 
 
 		 290 aa  207  2e-52  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0841  hypothetical protein  38.57 
 
 		 311 aa  199  6e-50  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.359342 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3671  hypothetical protein  37.24 
 
 		 291 aa  196  4.0000000000000005e-49  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000000273453  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0743  oxidoreductase  36.15 
 
 		 293 aa  192  6e-48  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2221  SAM dependent methyltransferase  36.12 
 
 		 297 aa  189  4e-47  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.0816781 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3463  SAM dependent methyltransferase  32.99 
 
 		 293 aa  183  2.0000000000000003e-45  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.0898386 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1219  oxidoreductase  36.46 
 
 		 295 aa  178  1e-43  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.00837631  hitchhiker  0.00166496 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2887  hypothetical protein  37.37 
 
 		 287 aa  166  5e-40  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002620  TC0684  hypothetical protein  32.73 
 
 		 275 aa  155  1e-36  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  0.654148  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1462  hypothetical protein  32.47 
 
 		 318 aa  77.8  0.0000000000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.685404  normal  0.241812 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1977  hypothetical protein  30.28 
 
 		 297 aa  69.3  0.00000000008  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.257048  hitchhiker  0.000740302 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3492  pseudouridine synthase  37.96 
 
 		 560 aa  62  0.00000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1141  hypothetical protein  26.25 
 
 		 390 aa  60.5  0.00000003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.432078  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1163  hypothetical protein  26.25 
 
 		 390 aa  60.5  0.00000003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.809319  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2998  hypothetical protein  34.83 
 
 		 397 aa  59.7  0.00000005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0667  hypothetical protein  25.75 
 
 		 390 aa  59.3  0.00000006  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3385  putative RNA methylase  30.71 
 
 		 412 aa  59.7  0.00000006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.871032  normal  0.230972 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2072  23S rRNA m(2)G2445 methyltransferase  33.61 
 
 		 713 aa  59.3  0.00000007  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4405  hypothetical protein  33.9 
 
 		 299 aa  58.9  0.0000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.134753  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1161  hypothetical protein  26.35 
 
 		 320 aa  58.9  0.0000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00102959 
 
 
-
 
NC_011677  PHATRDRAFT_46093  predicted protein  25.93 
 
 		 839 aa  57.8  0.0000002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_26220  predicted SAM-dependent methyltransferase  36.44 
 
 		 657 aa  57.8  0.0000002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3540  hypothetical protein  34.12 
 
 		 409 aa  57.8  0.0000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1380  hypothetical protein  31.25 
 
 		 385 aa  57.4  0.0000003  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0930599  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0954  SAM-dependent methyltransferase  35.48 
 
 		 384 aa  57  0.0000003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.358949  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1214  hypothetical protein  30.19 
 
 		 309 aa  56.2  0.0000005  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1095  23S rRNA m(2)G2445 methyltransferase  33.04 
 
 		 708 aa  55.8  0.0000008  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0184189  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0341  protein of unknown function Met10  33.33 
 
 		 395 aa  55.5  0.000001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0223  SAM-dependent methyltransferase  42.53 
 
 		 397 aa  55.1  0.000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0650  putative SAM-dependent methyltransferase  34.09 
 
 		 400 aa  55.1  0.000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0592  PUA domain-containing protein  33.71 
 
 		 394 aa  54.3  0.000002  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_4037  PUA domain-containing protein  32.97 
 
 		 397 aa  54.3  0.000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.663766  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3134  PUA domain-containing protein  30.63 
 
 		 404 aa  54.3  0.000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.312464  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0282  SAM-dependent methyltransferase  41.38 
 
 		 398 aa  53.9  0.000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2965  putative SAM-dependent methyltransferase  34.07 
 
 		 396 aa  54.3  0.000003  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.545858 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2247  hypothetical protein  31.82 
 
 		 396 aa  53.5  0.000004  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3083  PUA domain-containing protein  29.63 
 
 		 404 aa  53.5  0.000004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0506746 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0687  hypothetical protein  27.4 
 
 		 384 aa  53.5  0.000004  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.46442  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0617  methyltransferase related protein  28.71 
 
 		 381 aa  53.5  0.000004  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2997  PUA domain-containing protein  30 
 
 		 404 aa  53.1  0.000005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.0717099 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02689  methyltransferase  28.46 
 
 		 310 aa  53.1  0.000005  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1149  SAM-dependent methyltransferase  32.95 
 
 		 396 aa  52.8  0.000006  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0973  SAM-dependent methyltransferase  29.31 
 
 		 396 aa  52.8  0.000006  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.510915 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1011  SAM-dependent methyltransferase  29.31 
 
 		 396 aa  52.8  0.000006  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.719099 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1865  hypothetical protein  41.38 
 
 		 389 aa  53.1  0.000006  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0977  SAM-dependent methyltransferase  29.31 
 
 		 396 aa  52.8  0.000007  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0805  SAM-dependent methyltransferase  36.59 
 
 		 395 aa  52.8  0.000007  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.969032 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003801  methyltransferase  28.46 
 
 		 310 aa  52.8  0.000007  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1491  putative RNA methylase  30.43 
 
 		 408 aa  52.4  0.000008  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.286756 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02010  23S rRNA m(2)G2445 methyltransferase  29.17 
 
 		 699 aa  52.8  0.000008  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.347097  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3155  SAM-dependent methyltransferase  32.95 
 
 		 411 aa  52.4  0.000008  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3105  PUA domain-containing protein  30 
 
 		 404 aa  52.4  0.000009  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.281212 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2474  PUA domain-containing protein  30 
 
 		 404 aa  52.4  0.000009  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.78499  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3088  PUA domain-containing protein  30 
 
 		 404 aa  52.4  0.000009  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00971  predicted methyltransferase  31.82 
 
 		 367 aa  52  0.00001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.406744  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2676  Protein of unknown function methylase putative  31.82 
 
 		 391 aa  52  0.00001  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00640456  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1076  hypothetical protein  31.82 
 
 		 396 aa  52  0.00001  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00716941  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2151  hypothetical protein  31.82 
 
 		 396 aa  52  0.00001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.111749  normal  0.201335 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3324  hypothetical protein  30.91 
 
 		 353 aa  51.6  0.00001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2629  hypothetical protein  31.82 
 
 		 396 aa  52  0.00001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.126778  hitchhiker  0.0000254452 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2348  hypothetical protein  31.82 
 
 		 396 aa  52  0.00001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.287324  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00978  hypothetical protein  31.82 
 
 		 367 aa  52  0.00001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.536136  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6438  SAM-dependent methyltransferase  31.06 
 
 		 404 aa  52  0.00001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.812224 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1082  hypothetical protein  31.82 
 
 		 396 aa  52  0.00001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000000305834  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1132  hypothetical protein  31.82 
 
 		 396 aa  52  0.00001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.250632 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003408  hypothetical protein  34.78 
 
 		 397 aa  52  0.00001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  decreased coverage  0.00000270562  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1409  protein of unknown function Met10  29.63 
 
 		 394 aa  52  0.00001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1121  SAM-dependent methyltransferase  25.95 
 
 		 403 aa  51.2  0.00002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  7.50041e-16 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2881  SAM-dependent methyltransferases  28.8 
 
 		 305 aa  51.2  0.00002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000986982  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2228  hypothetical protein  32.35 
 
 		 306 aa  51.2  0.00002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.581502  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2968  SAM-dependent methyltransferase  33.07 
 
 		 396 aa  50.8  0.00002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.343918  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2168  PUA domain-containing protein  31.63 
 
 		 395 aa  51.2  0.00002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0604  protein of unknown function Met10  29.52 
 
 		 394 aa  51.6  0.00002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.0000000000482493  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1488  PUA domain containing protein  28.03 
 
 		 400 aa  51.6  0.00002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0887  PUA domain-containing protein  37.21 
 
 		 396 aa  50.8  0.00002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.201837  unclonable  0.0000193307 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0259  SAM-dependent methyltransferase  24.31 
 
 		 389 aa  51.2  0.00002  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.966549  n/a   
 
 
-
 
NC_009371  OSTLU_41962  predicted protein  35.58 
 
 		 493 aa  51.6  0.00002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.0487312 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3432  PUA domain-containing protein  35.37 
 
 		 394 aa  51.2  0.00002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3236  PUA domain-containing protein  24.81 
 
 		 399 aa  50.4  0.00003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.553903  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2376  SAM-dependent methyltransferase  30.19 
 
 		 400 aa  50.4  0.00003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1062  SAM-dependent methyltransferase  38.3 
 
 		 422 aa  50.8  0.00003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.647422 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003438  23S rRNA (guanine-N-2-) -methyltransferase RlmL  37.23 
 
 		 706 aa  50.8  0.00003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1583  PUA domain containing protein  30.19 
 
 		 400 aa  50.4  0.00003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.303299  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>