More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swit_0764 on replicon NC_009511
Organism: Sphingomonas wittichii RW1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009511  Swit_0764  AsnC family transcriptional regulator  100 
 
 		 156 aa  318  1.9999999999999998e-86  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.267919  normal  0.248385 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4109  AsnC family transcriptional regulator  60 
 
 		 155 aa  199  9.999999999999999e-51  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0783  AsnC family transcriptional regulator  42 
 
 		 150 aa  133  9e-31  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.514102  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2877  AsnC family transcriptional regulator  39.74 
 
 		 159 aa  124  6e-28  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.49085  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4595  AsnC family transcriptional regulator  41.33 
 
 		 164 aa  122  1e-27  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2996  AsnC family transcriptional regulator  39.47 
 
 		 156 aa  122  2e-27  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0252668  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1293  AsnC family transcriptional regulator  41.33 
 
 		 164 aa  122  2e-27  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4155  AsnC family transcriptional regulator  37.82 
 
 		 159 aa  119  9.999999999999999e-27  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3040  transcriptional regulator, AsnC family  40.62 
 
 		 162 aa  119  1.9999999999999998e-26  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1659  transcriptional regulator, AsnC family  42.11 
 
 		 161 aa  118  1.9999999999999998e-26  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.31019  normal  0.273663 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3387  transcriptional regulator, AsnC family  40.62 
 
 		 162 aa  119  1.9999999999999998e-26  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1990  transcriptional regulator, AsnC family  42.11 
 
 		 161 aa  118  1.9999999999999998e-26  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.141708  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3156  transcriptional regulator, AsnC family  38.56 
 
 		 155 aa  118  3e-26  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  unclonable  0.000000033258  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3022  regulatory proteins, AsnC/Lrp  39.74 
 
 		 155 aa  118  3e-26  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  unclonable  0.00000000242064  normal  0.0404205 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4125  AsnC family transcriptional regulator  40 
 
 		 153 aa  117  4.9999999999999996e-26  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3904  AsnC family transcriptional regulator  40 
 
 		 153 aa  117  4.9999999999999996e-26  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.674127 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3102  transcription regulator protein  40.62 
 
 		 162 aa  117  6e-26  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.327288  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4561  AsnC family transcriptional regulator  40.26 
 
 		 156 aa  117  7e-26  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00127893  normal  0.163186 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5614  AsnC family transcriptional regulator  40 
 
 		 162 aa  117  7.999999999999999e-26  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.41474  normal  0.0388981 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1192  AsnC family transcriptional regulator  40.79 
 
 		 163 aa  117  9e-26  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0301  AsnC family transcriptional regulator  39.1 
 
 		 166 aa  115  1.9999999999999998e-25  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7861  putative transcriptional regulator, AsnC family  40.27 
 
 		 150 aa  115  3e-25  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0789573  normal  0.974187 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0461  AsnC family transcriptional regulator  37.18 
 
 		 161 aa  114  3.9999999999999997e-25  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1733  AsnC family transcriptional regulator  37.91 
 
 		 165 aa  114  6e-25  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.017814  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0505  AsnC family transcriptional regulator  40.67 
 
 		 181 aa  112  1.0000000000000001e-24  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.287922  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0772  AsnC family transcriptional regulator  38.61 
 
 		 156 aa  113  1.0000000000000001e-24  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.148197  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00399  predicted DNA-binding transcriptional regulator  38.67 
 
 		 152 aa  112  2.0000000000000002e-24  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3162  transcriptional regulator, AsnC family  38.67 
 
 		 152 aa  112  2.0000000000000002e-24  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5229  AsnC family transcriptional regulator  38 
 
 		 152 aa  112  2.0000000000000002e-24  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.104749  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0490  AsnC family transcriptional regulator  38.67 
 
 		 152 aa  112  2.0000000000000002e-24  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.918354  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00403  hypothetical protein  38.67 
 
 		 152 aa  112  2.0000000000000002e-24  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1064  AsnC family transcriptional regulator  39.07 
 
 		 175 aa  112  2.0000000000000002e-24  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0353  AsnC family transcriptional regulator  37.82 
 
 		 162 aa  112  2.0000000000000002e-24  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0535  transcriptional regulator, AsnC family  38.67 
 
 		 152 aa  112  2.0000000000000002e-24  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1883  AsnC family transcriptional regulator  36.67 
 
 		 150 aa  112  2.0000000000000002e-24  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0524  AsnC family transcriptional regulator  38.67 
 
 		 152 aa  112  2.0000000000000002e-24  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3168  AsnC family transcriptional regulator  38.67 
 
 		 152 aa  112  2.0000000000000002e-24  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.634105  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0370  transcriptional regulator, AsnC family  38.67 
 
 		 152 aa  112  2.0000000000000002e-24  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0483  AsnC family transcriptional regulator  38.67 
 
 		 152 aa  112  2.0000000000000002e-24  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS02081  transcription regulator protein  37.5 
 
 		 152 aa  111  3e-24  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1736  bkd operon transcriptional regulator  39.74 
 
 		 175 aa  111  3e-24  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  hitchhiker  0.00397839  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0251  regulatory proteins, AsnC/Lrp  35.95 
 
 		 156 aa  111  3e-24  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2899  AsnC family transcriptional regulator  38 
 
 		 154 aa  111  3e-24  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4188  AsnC family transcriptional regulator  40.26 
 
 		 188 aa  112  3e-24  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1843  bkd operon transcriptional regulator  39.74 
 
 		 175 aa  111  3e-24  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.00082559  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0513  bkd operon transcriptional regulator  39.74 
 
 		 175 aa  111  3e-24  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  hitchhiker  0.000000170709  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4159  AsnC family transcriptional regulator  38 
 
 		 152 aa  111  3e-24  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.409138  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3278  AsnC family transcriptional regulator  38 
 
 		 152 aa  111  3e-24  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.882377 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1635  bkd operon transcriptional regulator  39.74 
 
 		 175 aa  111  3e-24  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.00000232797  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4810  AsnC family transcriptional regulator  38 
 
 		 152 aa  111  3e-24  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.402994  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5136  AsnC family transcriptional regulator  38.67 
 
 		 177 aa  112  3e-24  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.944237 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3357  AsnC family transcriptional regulator  38 
 
 		 152 aa  111  3e-24  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.773724  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4765  transcriptional regulator, AsnC family  39.61 
 
 		 157 aa  111  4.0000000000000004e-24  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.261527  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4212  AsnC family transcriptional regulator  39.61 
 
 		 157 aa  111  4.0000000000000004e-24  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.642978  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4242  AsnC family transcriptional regulator  38.67 
 
 		 176 aa  111  5e-24  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5248  AsnC family transcriptional regulator  37.09 
 
 		 156 aa  110  5e-24  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.58536  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0671  bkd operon transcriptional regulator  39.74 
 
 		 229 aa  110  5e-24  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.0000013017  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2323  AsnC family transcriptional regulator  39.74 
 
 		 202 aa  110  6e-24  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3971  transcriptional regulator, AsnC family  38.41 
 
 		 175 aa  110  6e-24  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0808  AsnC family transcriptional regulator  40 
 
 		 159 aa  110  6e-24  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0915  AsnC family transcriptional regulator  38.67 
 
 		 152 aa  110  6e-24  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.72349  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3258  AsnC family transcriptional regulator  38.96 
 
 		 157 aa  110  6e-24  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000650696  decreased coverage  0.000218809 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0782  bkd operon transcriptional regulator  39.74 
 
 		 229 aa  110  8.000000000000001e-24  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.00000164018  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0518  glutamate uptake regulatory protein  38 
 
 		 152 aa  110  9e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0562  glutamate uptake regulatory protein  38 
 
 		 152 aa  110  9e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.426244  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0499  glutamate uptake regulatory protein  38 
 
 		 152 aa  110  9e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0508  glutamate uptake regulatory protein  38 
 
 		 152 aa  110  9e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.892509 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2309  AsnC family transcriptional regulator  38.82 
 
 		 157 aa  110  9e-24  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00293447 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0502  glutamate uptake regulatory protein  38 
 
 		 152 aa  110  9e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2461  AsnC family transcriptional regulator  39.74 
 
 		 202 aa  110  9e-24  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.00000130465  n/a   
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7497  AsnC family transcriptional regulator  40.4 
 
 		 169 aa  109  1.0000000000000001e-23  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.000799666  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3954  AsnC family transcriptional regulator  38.67 
 
 		 152 aa  109  1.0000000000000001e-23  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3830  AsnC family transcriptional regulator  38.82 
 
 		 158 aa  109  1.0000000000000001e-23  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.676178  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5188  transcriptional regulator BkdR, putative  36.42 
 
 		 156 aa  109  2.0000000000000002e-23  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.354058  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3216  AsnC family transcriptional regulator  40 
 
 		 163 aa  109  2.0000000000000002e-23  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0928  AsnC family transcriptional regulator  33.77 
 
 		 158 aa  108  2.0000000000000002e-23  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5095  AsnC family transcriptional regulator  36.42 
 
 		 156 aa  109  2.0000000000000002e-23  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0521  AsnC family transcriptional regulator  39.61 
 
 		 161 aa  109  2.0000000000000002e-23  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.0209927 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0537  transcriptional regulator, AsnC family  39.61 
 
 		 161 aa  109  2.0000000000000002e-23  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.863753  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4115  AsnC family transcriptional regulator  38.82 
 
 		 166 aa  108  3e-23  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2581  leucine-responsive regulatory protein, putative  35.29 
 
 		 171 aa  108  3e-23  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3783  putative leucine-responsive regulatory protein  35.29 
 
 		 171 aa  108  3e-23  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.615551  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3922  transcriptional regulator, AsnC family  38.82 
 
 		 166 aa  108  3e-23  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4022  AsnC family transcriptional regulator  38.82 
 
 		 166 aa  108  3e-23  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0015  transcriptional regulator  35.29 
 
 		 171 aa  108  3e-23  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03485  regulatory protein, AsnC/Lrp  36 
 
 		 160 aa  108  3e-23  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0873  AsnC family transcriptional regulator  38.93 
 
 		 156 aa  108  3e-23  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.286103  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3105  AsnC family transcriptional regulator  35.29 
 
 		 171 aa  108  3e-23  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3999  AsnC family transcriptional regulator  38.82 
 
 		 166 aa  108  3e-23  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2497  AsnC family transcriptional regulator  38.82 
 
 		 156 aa  108  3e-23  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.38008  normal  0.590435 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3311  AsnC family transcriptional regulator  39.07 
 
 		 175 aa  108  3e-23  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.944983  normal  0.0543443 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3844  putative leucine-responsive regulatory protein  35.29 
 
 		 171 aa  108  3e-23  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4337  AsnC family transcriptional regulator  38.82 
 
 		 166 aa  108  4.0000000000000004e-23  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0345  AsnC family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 160 aa  108  4.0000000000000004e-23  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0877618  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2055  transcriptional regulator AsnC family  37.33 
 
 		 162 aa  107  4.0000000000000004e-23  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.381037  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0273  transcriptional regulator, AsnC family  35.14 
 
 		 156 aa  107  5e-23  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3119  putative leucine-responsive regulatory protein  35.29 
 
 		 222 aa  107  5e-23  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.533929  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0004  AsnC family transcriptional regulator  35.29 
 
 		 222 aa  107  5e-23  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.211943  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5150  transcriptional regulator, AsnC family  38.16 
 
 		 154 aa  107  5e-23  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1553  AsnC family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 154 aa  107  6e-23  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.0410589  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>