More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swit_0342 on replicon NC_009511
Organism: Sphingomonas wittichii RW1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009511  Swit_0342  thiolase  100 
 
 		 381 aa  764    Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.516645  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6845  thiolase  66.85 
 
 		 383 aa  510  1e-143  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2277  thiolase  64.17 
 
 		 383 aa  476  1e-133  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.573629 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3512  thiolase  59.15 
 
 		 390 aa  454  1e-127  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4368  thiolase  61.46 
 
 		 383 aa  457  1e-127  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.739547  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2581  thiolase  59.36 
 
 		 385 aa  451  1e-125  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.0313462 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_51190  thiolase  59.89 
 
 		 383 aa  451  1e-125  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000113364 
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5279  thiolase  58.76 
 
 		 385 aa  432  1e-120  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0177  thiolase  59.95 
 
 		 403 aa  421  1e-116  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.96187  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0129  thiolase  59.42 
 
 		 402 aa  417  9.999999999999999e-116  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0147  thiolase  59.15 
 
 		 402 aa  415  9.999999999999999e-116  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5111  thiolase  59.94 
 
 		 390 aa  412  1e-114  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.0000299159  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5776  thiolase  58.36 
 
 		 393 aa  411  1e-113  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.158542  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1074  thiolase  57.26 
 
 		 384 aa  393  1e-108  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4625  thiolase  53.32 
 
 		 390 aa  372  1e-102  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2336  Propanoyl-CoA C-acyltransferase  48.8 
 
 		 382 aa  343  2e-93  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5255  thiolase  49.05 
 
 		 389 aa  332  1e-89  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4062  putative thiolase  50.92 
 
 		 383 aa  330  3e-89  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6629  thiolase  51.2 
 
 		 381 aa  323  3e-87  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.023971  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4071  thiolase  48.67 
 
 		 382 aa  305  6e-82  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.197027  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0844  thiolase  50.13 
 
 		 384 aa  294  2e-78  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5499  acetyl-CoA acetyltransferase  43.7 
 
 		 391 aa  287  2e-76  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3829  acetyl-CoA acetyltransferase  44.73 
 
 		 388 aa  286  2.9999999999999996e-76  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.401188  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2009  hypothetical protein  40 
 
 		 380 aa  283  2.0000000000000002e-75  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.992719  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1978  hypothetical protein  40.84 
 
 		 379 aa  283  3.0000000000000004e-75  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0960116  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2931  hypothetical protein  40.84 
 
 		 379 aa  282  9e-75  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4413  acetyl-CoA acetyltransferase  44.04 
 
 		 389 aa  281  1e-74  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00900083  normal  0.500105 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3588  thiolase  40.58 
 
 		 379 aa  280  4e-74  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.446493 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1757  acetyl-CoA acetyltransferase  44.64 
 
 		 391 aa  275  8e-73  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.439431  normal  0.143058 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4565  acetyl-CoA acetyltransferase  44.04 
 
 		 388 aa  275  1.0000000000000001e-72  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.153409  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1879  putative lipid transfer protein  40.31 
 
 		 379 aa  274  2.0000000000000002e-72  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.0403443 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4152  acetyl-CoA acetyltransferase  43.78 
 
 		 389 aa  273  3e-72  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.500938  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2935  acetyl-CoA acetyltransferase-like protein  42.02 
 
 		 383 aa  269  7e-71  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.220087  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0233  putative thiolase  43.46 
 
 		 388 aa  268  2e-70  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3805  acetyl-CoA acetyltransferase  41.97 
 
 		 388 aa  266  5e-70  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1686  Acetyl-CoA acetyltransferase-like  40.79 
 
 		 379 aa  264  2e-69  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0569144  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3401  Acetyl-CoA acetyltransferase-like protein  42.27 
 
 		 380 aa  259  6e-68  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0771846 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5006  acetyl-CoA acetyltransferase  40.68 
 
 		 382 aa  258  1e-67  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.815912  normal  0.11432 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1502  acetyl-CoA acetyltransferase  42.16 
 
 		 390 aa  258  1e-67  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7411  acetyl-CoA acetyltransferase  44.33 
 
 		 383 aa  253  5.000000000000001e-66  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0860  putative thiolase  40.73 
 
 		 384 aa  244  9.999999999999999e-64  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.016172  normal  0.461503 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4787  acetyl-CoA acetyltransferase  42.34 
 
 		 387 aa  243  3e-63  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0607631  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3607  acetyl-CoA acetyltransferase  40.31 
 
 		 382 aa  244  3e-63  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.241671  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2839  hypothetical protein  40.58 
 
 		 388 aa  243  3.9999999999999997e-63  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00983373  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3115  acetyl-CoA acetyltransferase  40.98 
 
 		 382 aa  239  4e-62  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.119662  normal  0.439972 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2350  acetyl-CoA acetyltransferase  40.16 
 
 		 382 aa  237  2e-61  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.731467  normal  0.759568 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2663  acetyl-CoA acetyltransferase  42.11 
 
 		 385 aa  233  4.0000000000000004e-60  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5095  acetyl-CoA acetyltransferase  41.36 
 
 		 395 aa  224  3e-57  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.926475 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4266  hypothetical protein  37.67 
 
 		 381 aa  223  4.9999999999999996e-57  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.804759  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4311  hypothetical protein  39.11 
 
 		 389 aa  214  1.9999999999999998e-54  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.642503 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1484  hypothetical protein  39.79 
 
 		 389 aa  208  2e-52  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.185234  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2362  acetyl-CoA acetyltransferase  37.37 
 
 		 386 aa  204  2e-51  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1391  acetyl-CoA acetyltransferase  36.41 
 
 		 387 aa  202  7e-51  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5302  putative nonspecific lipid-transfer protein  38.99 
 
 		 388 aa  201  3e-50  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.739228 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1803  putative nonspecific lipid-transfer protein  37.67 
 
 		 389 aa  200  3e-50  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.851643 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2093  Propanoyl-CoA C-acyltransferase  40.05 
 
 		 385 aa  198  1.0000000000000001e-49  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.773617  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0156  acetyl-CoA acetyltransferase  34.18 
 
 		 388 aa  197  2.0000000000000003e-49  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1933  acetyl-CoA acetyltransferase  35.04 
 
 		 390 aa  195  1e-48  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  decreased coverage  0.00196536  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3567  putative thiolase  35.79 
 
 		 378 aa  195  1e-48  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8761  lipid-transfer protein  38.2 
 
 		 385 aa  195  1e-48  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.134204 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0352  hypothetical protein  35.71 
 
 		 386 aa  194  2e-48  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.0000477716  decreased coverage  0.0000013738 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0550  acetyl-CoA acetyltransferase  35.55 
 
 		 390 aa  194  3e-48  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3651  Acetyl-CoA acetyltransferase-like protein  36.29 
 
 		 387 aa  191  2e-47  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.48348  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2509  acetyl-CoA acetyltransferase  34.36 
 
 		 388 aa  187  2e-46  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.481347  normal  0.719039 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4716  DitF protein  38.85 
 
 		 453 aa  187  2e-46  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.300284 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0150  acetyl-CoA acetyltransferase  34.11 
 
 		 387 aa  186  6e-46  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.964414  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1626  acetyl-CoA acetyltransferase  33.93 
 
 		 387 aa  185  9e-46  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0581  hypothetical protein  34.25 
 
 		 395 aa  185  9e-46  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0835832  normal  0.505436 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3310  hypothetical protein  36.72 
 
 		 393 aa  183  4.0000000000000006e-45  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.408434 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0435  Propanoyl-CoA C-acyltransferase  32.14 
 
 		 387 aa  182  9.000000000000001e-45  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13573  lipid-transfer protein  35.58 
 
 		 386 aa  181  1e-44  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000077821 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1902  hypothetical protein  32.66 
 
 		 396 aa  180  2.9999999999999997e-44  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.986081  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3314  thiolase  34.56 
 
 		 404 aa  177  3e-43  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2361  lipid-transfer protein  36.94 
 
 		 394 aa  176  7e-43  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0692288 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2103  Acetyl-CoA acetyltransferase-like protein  36.81 
 
 		 384 aa  176  7e-43  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.655505  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4108  diterpenoid dioxygenase  33.42 
 
 		 397 aa  174  2.9999999999999996e-42  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.742638  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2744  putative thiolase/acetyl-CoA acetyltransferase, PaaJ-like  32.41 
 
 		 406 aa  173  5e-42  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0906041 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4055  putative nonspecific lipid-transfer protein  35.64 
 
 		 397 aa  173  5e-42  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0205444  normal  0.64672 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2105  thiolase  34.83 
 
 		 404 aa  172  9e-42  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0715913  normal  0.0186682 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3972  thiolase  36.91 
 
 		 383 aa  172  1e-41  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.330404 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3277  hypothetical protein  35.05 
 
 		 388 aa  171  2e-41  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3215  hypothetical protein  35.05 
 
 		 388 aa  171  2e-41  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.128121  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3226  hypothetical protein  35.05 
 
 		 388 aa  171  2e-41  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0339  acetyl-CoA acetyltransferase  32.56 
 
 		 388 aa  171  2e-41  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.00626565  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3322  thiolase  36.39 
 
 		 383 aa  169  6e-41  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  hitchhiker  0.00152041  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2786  lipid-transfer protein  34.08 
 
 		 394 aa  169  8e-41  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.143685  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1835  lipid-transfer protein  35 
 
 		 381 aa  169  9e-41  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.722448  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4021  putative nonspecific lipid-transfer protein  32.69 
 
 		 378 aa  169  9e-41  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4180  putative acetyl-CoA C-acetyltransferase  32.55 
 
 		 394 aa  167  2e-40  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.785914  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6832  DitF protein  34.84 
 
 		 396 aa  168  2e-40  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2151  nonspecific lipid-transfer protein  31.08 
 
 		 403 aa  166  5e-40  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4171  hypothetical protein  36.46 
 
 		 548 aa  166  5.9999999999999996e-40  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2483  hypothetical protein  34.9 
 
 		 548 aa  166  9e-40  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.207424 
 
 
-
 
NC_008147  Mmcs_5454  putative nonspecific lipid-transfer protein  38.92 
 
 		 388 aa  164  3e-39  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.839799  normal  1 
 
 
-
 
NC_008704  Mkms_5851  putative nonspecific lipid-transfer protein  38.92 
 
 		 388 aa  164  3e-39  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0314395  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3765  hypothetical protein  34.83 
 
 		 550 aa  163  4.0000000000000004e-39  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.981168 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3692  hypothetical protein  34.83 
 
 		 550 aa  163  4.0000000000000004e-39  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3705  hypothetical protein  35.01 
 
 		 550 aa  163  5.0000000000000005e-39  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.724372  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0511  lipid-transfer protein  32.43 
 
 		 389 aa  162  7e-39  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4421  Thiolase  37.07 
 
 		 394 aa  162  7e-39  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0806685  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>