223 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Svir_39570 on replicon NC_013159
Organism: Saccharomonospora viridis DSM 43017



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013159  Svir_39570  hypothetical protein  100 
 
 		 198 aa  391  1e-108  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.336935 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_7076  hypothetical protein  71.35 
 
 		 193 aa  274  8e-73  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10037  hypothetical protein  56.38 
 
 		 202 aa  220  9e-57  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.739012 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5392  hypothetical protein  55.85 
 
 		 204 aa  216  2e-55  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.891404  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5481  hypothetical protein  55.85 
 
 		 204 aa  216  2e-55  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.478764  normal  0.488282 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5768  hypothetical protein  55.85 
 
 		 204 aa  216  2e-55  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.802117  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_6057  hypothetical protein  53.72 
 
 		 201 aa  209  1e-53  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.229198  normal  0.563539 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4219  protein of unknown function DUF179  55.14 
 
 		 209 aa  207  8e-53  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.231215  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0850  hypothetical protein  51.89 
 
 		 204 aa  205  3e-52  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.0512572 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5395  hypothetical protein  54.21 
 
 		 190 aa  191  5e-48  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4833  protein of unknown function DUF179  50.27 
 
 		 225 aa  187  8e-47  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0922435  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1704  hypothetical protein  49.48 
 
 		 208 aa  170  1e-41  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.77077  hitchhiker  0.00529814 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_5076  protein of unknown function DUF179  51.85 
 
 		 187 aa  166  2e-40  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2389  hypothetical protein  48.19 
 
 		 198 aa  162  3e-39  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.468382  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0987  hypothetical protein  47.51 
 
 		 196 aa  156  2e-37  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0924  hypothetical protein  46.49 
 
 		 193 aa  155  3e-37  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.127262  normal  0.648252 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3774  hypothetical protein  46.03 
 
 		 198 aa  154  8e-37  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.436862 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0923  hypothetical protein  45.86 
 
 		 196 aa  154  8e-37  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1179  protein of unknown function DUF179  48.07 
 
 		 184 aa  154  1e-36  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0188247  normal  0.235234 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0367  protein of unknown function DUF179  45.99 
 
 		 192 aa  147  7e-35  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.584645  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0723  hypothetical protein  43.3 
 
 		 196 aa  147  1.0000000000000001e-34  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1710  hypothetical protein  46.49 
 
 		 192 aa  147  1.0000000000000001e-34  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.199079 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3882  protein of unknown function DUF179  48.91 
 
 		 191 aa  145  3e-34  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1289  hypothetical protein  46.49 
 
 		 191 aa  136  2e-31  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1471  hypothetical protein  47.85 
 
 		 205 aa  131  6e-30  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0090  protein of unknown function DUF179  39.23 
 
 		 182 aa  127  1.0000000000000001e-28  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.158665  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0197  protein of unknown function DUF179  39.57 
 
 		 183 aa  109  3e-23  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0637  hypothetical protein  32.63 
 
 		 189 aa  100  1e-20  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.500132  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3626  protein of unknown function DUF179  31.49 
 
 		 186 aa  95.9  3e-19  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1601  hypothetical protein  31.02 
 
 		 188 aa  95.5  4e-19  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.0943857  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1432  protein of unknown function DUF179  36.69 
 
 		 188 aa  95.5  4e-19  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.914919  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0776  protein of unknown function DUF179  34.07 
 
 		 187 aa  94.4  1e-18  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4074  protein of unknown function DUF179  31.41 
 
 		 186 aa  93.6  2e-18  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.499752  hitchhiker  0.00807045 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2142  protein of unknown function DUF179  31.91 
 
 		 187 aa  91.3  9e-18  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3631  hypothetical protein  35.16 
 
 		 184 aa  90.5  1e-17  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.66585 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1896  protein of unknown function DUF179  30 
 
 		 187 aa  90.5  1e-17  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.56007  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1688  protein of unknown function DUF179  32.28 
 
 		 187 aa  89.4  3e-17  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000694892 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0885  hypothetical protein  30.69 
 
 		 187 aa  89.4  3e-17  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0777  protein of unknown function DUF179  28.57 
 
 		 187 aa  89.4  4e-17  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0331  protein of unknown function DUF179  33.68 
 
 		 198 aa  89.4  4e-17  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.502019  normal  0.568849 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0019  hypothetical protein  28.49 
 
 		 200 aa  86.7  2e-16  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0938  hypothetical protein  33.15 
 
 		 192 aa  85.1  6e-16  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.147168  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0675  hypothetical protein  30.43 
 
 		 190 aa  85.1  7e-16  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1286  hypothetical protein  26.78 
 
 		 197 aa  82.4  0.000000000000004  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.921549  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1773  transcriptional regulator  25.95 
 
 		 182 aa  82  0.000000000000005  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.728608  normal  0.0503905 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1356  protein of unknown function DUF179  29.05 
 
 		 216 aa  81.6  0.000000000000006  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03293  Transcription regulator  28.89 
 
 		 208 aa  81.6  0.000000000000007  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.856515  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0705  hypothetical protein  31.02 
 
 		 200 aa  80.9  0.00000000000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0539  hypothetical protein  31.33 
 
 		 188 aa  80.5  0.00000000000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A2219  hypothetical protein  29.27 
 
 		 181 aa  80.5  0.00000000000002  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.0000000277771  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5037  hypothetical protein  28.65 
 
 		 190 aa  80.1  0.00000000000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2193  transcriptional regulator  27.12 
 
 		 194 aa  80.5  0.00000000000002  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.996839  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2327  hypothetical protein  29.73 
 
 		 191 aa  80.5  0.00000000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0686759 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3637  argininosuccinate lyase  28.57 
 
 		 203 aa  79.7  0.00000000000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.755097  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3550  hypothetical protein  31.09 
 
 		 216 aa  80.5  0.00000000000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.749853  n/a   
 
 
-
 
NC_002620  TC0483  hypothetical protein  30.37 
 
 		 190 aa  79.3  0.00000000000003  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  0.195339  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3962  hypothetical protein  31.11 
 
 		 192 aa  79.3  0.00000000000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.554384 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0469  hypothetical protein  26.09 
 
 		 189 aa  79.7  0.00000000000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0400  hypothetical protein  30 
 
 		 201 aa  79.7  0.00000000000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1153  hypothetical protein  28.57 
 
 		 198 aa  79  0.00000000000004  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7071  protein of unknown function DUF179  26.49 
 
 		 184 aa  79  0.00000000000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0737  hypothetical protein  31.11 
 
 		 192 aa  79  0.00000000000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.270978  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0754  hypothetical protein  31.11 
 
 		 192 aa  79  0.00000000000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.173115  normal  0.270249 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5311  hypothetical protein  27.57 
 
 		 190 aa  78.6  0.00000000000005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.00562319  normal  0.215998 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_05290  hypothetical protein  28.88 
 
 		 189 aa  79  0.00000000000005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.535405  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0485  hypothetical protein  28.11 
 
 		 190 aa  78.6  0.00000000000006  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.127846  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0835  hypothetical protein  31.11 
 
 		 192 aa  78.2  0.00000000000007  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.186487  hitchhiker  0.000370502 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0382  hypothetical protein  31.11 
 
 		 192 aa  78.2  0.00000000000007  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.653476  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0864  hypothetical protein  31.11 
 
 		 192 aa  78.2  0.00000000000007  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2524  hypothetical protein  31.11 
 
 		 192 aa  78.2  0.00000000000008  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.811534  normal  0.166085 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4027  hypothetical protein  27.72 
 
 		 187 aa  77  0.0000000000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0375113  hitchhiker  0.00119286 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0619  hypothetical protein  28.8 
 
 		 190 aa  77.4  0.0000000000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.976015  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0868  hypothetical protein  29.03 
 
 		 192 aa  77.4  0.0000000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.0761346 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0505  hypothetical protein  28.88 
 
 		 189 aa  77  0.0000000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4995  hypothetical protein  27.44 
 
 		 189 aa  76.6  0.0000000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0140  hypothetical protein  23.35 
 
 		 209 aa  77  0.0000000000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2752  hypothetical protein  31.02 
 
 		 221 aa  77  0.0000000000002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0823934  normal  0.689503 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5045  hypothetical protein  27.44 
 
 		 189 aa  77  0.0000000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1462  hypothetical protein  29.44 
 
 		 207 aa  77  0.0000000000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4491  hypothetical protein  31.77 
 
 		 199 aa  76.6  0.0000000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.154644  normal  0.460951 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3811  hypothetical protein  29.03 
 
 		 221 aa  77  0.0000000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4869  hypothetical protein  27.44 
 
 		 189 aa  76.6  0.0000000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.0147719 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2594  hypothetical protein  33.85 
 
 		 205 aa  77  0.0000000000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1997  hypothetical protein  29.44 
 
 		 192 aa  76.3  0.0000000000003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.938009  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03574  hypothetical protein  26.74 
 
 		 189 aa  76.3  0.0000000000003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3170  hypothetical protein  29.44 
 
 		 192 aa  76.3  0.0000000000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6966  hypothetical protein  29.17 
 
 		 216 aa  76.3  0.0000000000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.146428  normal  1 
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0481  hypothetical protein  31.33 
 
 		 187 aa  76.3  0.0000000000003  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  0.756128  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6933  protein of unknown function DUF179  30.43 
 
 		 210 aa  76.3  0.0000000000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0916  hypothetical protein  29.44 
 
 		 192 aa  76.3  0.0000000000003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2746  hypothetical protein  29.44 
 
 		 192 aa  76.3  0.0000000000003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.770221  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3112  hypothetical protein  29.44 
 
 		 192 aa  76.3  0.0000000000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3148  hypothetical protein  29.44 
 
 		 192 aa  76.3  0.0000000000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.199133  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1859  hypothetical protein  29.44 
 
 		 192 aa  76.3  0.0000000000003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0567  hypothetical protein  28.8 
 
 		 190 aa  76.3  0.0000000000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.7379  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1132  hypothetical protein  28.65 
 
 		 190 aa  75.9  0.0000000000004  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.214662  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0788  hypothetical protein  30.21 
 
 		 213 aa  75.9  0.0000000000004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2659  hypothetical protein  29.57 
 
 		 184 aa  75.9  0.0000000000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.679405 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0226  hypothetical protein  29.03 
 
 		 197 aa  75.5  0.0000000000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0738315  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2478  hypothetical protein  27.78 
 
 		 186 aa  75.5  0.0000000000005  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>