61 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Svir_39020 on replicon NC_013159
Organism: Saccharomonospora viridis DSM 43017



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013159  Svir_39020  predicted membrane protein  100 
 
 		 238 aa  473  1e-133  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.584509 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0449  DoxX family protein  42.62 
 
 		 182 aa  134  9.999999999999999e-31  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2855  DoxX family protein  44.22 
 
 		 379 aa  134  9.999999999999999e-31  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  decreased coverage  0.00921996  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1701  DoxX family protein  41.24 
 
 		 174 aa  132  3e-30  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  hitchhiker  0.00286745  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3130  DoxX family protein  38.51 
 
 		 315 aa  119  3.9999999999999996e-26  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.470972  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_18970  predicted membrane protein  36.5 
 
 		 236 aa  118  9.999999999999999e-26  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.129095  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2554  DoxX family protein  38.56 
 
 		 321 aa  117  1.9999999999999998e-25  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.225464  normal  0.850178 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2562  DoxX family protein  38.56 
 
 		 321 aa  117  1.9999999999999998e-25  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2517  DoxX  38.56 
 
 		 321 aa  117  1.9999999999999998e-25  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.114204  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3403  DoxX family protein  39.24 
 
 		 276 aa  115  7.999999999999999e-25  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.351564  normal  0.43311 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_18830  predicted membrane protein  35.03 
 
 		 226 aa  103  2e-21  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0296  DoxX family protein  36.49 
 
 		 271 aa  93.6  3e-18  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1264  DoxX family protein  39.35 
 
 		 223 aa  88.6  8e-17  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.157094  normal  0.163775 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2087  DoxX  40 
 
 		 119 aa  82  0.000000000000008  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2652  DoxX family protein  33.75 
 
 		 182 aa  79  0.00000000000006  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  hitchhiker  0.000120854  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2385  DoxX family protein  30.96 
 
 		 182 aa  76.3  0.0000000000004  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000239673 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_5054  DoxX family protein  37.16 
 
 		 181 aa  73.6  0.000000000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0149064 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4544  DoxX family protein  35.23 
 
 		 181 aa  73.6  0.000000000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.573172 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1210  DoxX family protein  34.64 
 
 		 176 aa  72.8  0.000000000005  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0688869 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1208  DoxX family protein  29.94 
 
 		 182 aa  70.1  0.00000000003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_19460  hypothetical protein  29.28 
 
 		 188 aa  61.2  0.00000002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.635094  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1811  hypothetical protein  27.85 
 
 		 161 aa  58.9  0.00000006  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_09480  hypothetical protein  31.87 
 
 		 192 aa  58.9  0.00000006  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.322851  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0868  DoxX family protein  37.5 
 
 		 130 aa  58.5  0.0000001  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.879404  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2493  DoxX family protein  32.03 
 
 		 158 aa  57.4  0.0000002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.3994  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3712  DoxX family protein  38.26 
 
 		 190 aa  55.8  0.0000006  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.803576  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0630  DoxX family protein  33.03 
 
 		 140 aa  54.7  0.000001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.470761  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0867  membrane protein yphA  30.22 
 
 		 152 aa  53.5  0.000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.271535 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4661  DoxX family protein  32 
 
 		 145 aa  53.5  0.000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.526141  normal  0.512029 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4554  DoxX family protein  28.06 
 
 		 143 aa  52  0.000009  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0302  DoxX family protein  37.5 
 
 		 136 aa  51.2  0.00001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.0320339 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4671  DoxX family protein  33.33 
 
 		 145 aa  50.1  0.00003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.547503 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1386  DoxX family protein  29.5 
 
 		 137 aa  50.1  0.00003  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.42391  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5199  DoxX family protein  33.33 
 
 		 145 aa  50.1  0.00003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.342492  normal  0.27185 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5841  DoxX  40.74 
 
 		 134 aa  49.7  0.00004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2877  DoxX family protein  29.86 
 
 		 136 aa  48.5  0.0001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3412  DoxX family protein  31.94 
 
 		 145 aa  47  0.0002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.401045  normal  0.464952 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2498  DoxX  32.37 
 
 		 149 aa  47  0.0002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3973  DoxX family protein  36.14 
 
 		 135 aa  46.2  0.0004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.72349 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0860  DoxX  30.28 
 
 		 136 aa  46.2  0.0004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.2035  normal  0.169459 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0545  hypothetical protein  30.84 
 
 		 175 aa  46.6  0.0004  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1200  DoxX  30.6 
 
 		 139 aa  46.2  0.0005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2341  DoxX  33.55 
 
 		 152 aa  46.2  0.0005  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.201028  normal  0.120907 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2074  DoxD-like family protein  29.89 
 
 		 145 aa  44.7  0.001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.480184  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1365  DoxX family protein  35.14 
 
 		 139 aa  45.1  0.001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0662293  normal  0.0953632 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2385  DoxX family protein  29.29 
 
 		 131 aa  44.7  0.001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0905931  normal  0.641291 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3348  DoxX  38.74 
 
 		 146 aa  44.3  0.002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0716703  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4094  hypothetical protein  35.92 
 
 		 140 aa  43.9  0.002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.887917  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5222  DoxX family protein  27.97 
 
 		 144 aa  43.9  0.002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0336  DoxX family membrane protein  33.33 
 
 		 145 aa  43.1  0.003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1934  DoxX family protein  34.67 
 
 		 155 aa  43.1  0.003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.467271  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3552  DoxX family protein  34.67 
 
 		 137 aa  43.9  0.003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.583897  normal  0.164311 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4096  DoxX family protein  30.23 
 
 		 174 aa  42.7  0.005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0554855  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3122  DoxX family protein  30 
 
 		 139 aa  42.7  0.005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.461418  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3976  DoxX family protein  30.23 
 
 		 174 aa  42.4  0.006  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.603426  decreased coverage  0.00896237 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1107  DoxX family protein  36.84 
 
 		 168 aa  42.4  0.006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.298421  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5311  DoxX family protein  32.65 
 
 		 145 aa  42  0.007  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.482098 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3056  DoxX  32.65 
 
 		 145 aa  42  0.007  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4958  DoxX family protein  32.65 
 
 		 145 aa  42  0.007  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00723227 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1413  DoxD-like family protein  32.63 
 
 		 182 aa  42  0.008  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.197847  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5400  DoxX family protein  29.59 
 
 		 137 aa  42  0.009  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0358694  normal  0.0708806 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>