52 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Svir_35570 on replicon NC_013159
Organism: Saccharomonospora viridis DSM 43017



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013159  Svir_35570  predicted membrane protein  100 
 
 		 369 aa  713    Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  hitchhiker  0.00968721  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0323  hypothetical protein  56.28 
 
 		 442 aa  375  1e-103  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.168214  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1996  putative integral membrane protein  40 
 
 		 442 aa  218  1e-55  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3715  hypothetical protein  44.66 
 
 		 369 aa  213  2.9999999999999995e-54  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.376902  normal  0.0526059 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1985  membrane protein  39.56 
 
 		 470 aa  206  4e-52  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.775986  normal  0.0143914 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0276  membrane protein-like protein  41.4 
 
 		 502 aa  205  9e-52  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.0292908 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2972  putative integral membrane protein  41.78 
 
 		 428 aa  203  4e-51  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0319  membrane protein-like protein  41.14 
 
 		 502 aa  200  3.9999999999999996e-50  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0495235  hitchhiker  0.000246371 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1365  putative integral membrane protein  44.48 
 
 		 377 aa  197  2.0000000000000003e-49  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3033  membrane protein  40.73 
 
 		 388 aa  195  8.000000000000001e-49  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5989  membrane protein-like protein  40.29 
 
 		 445 aa  193  4e-48  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.112909 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3562  hypothetical protein  38.71 
 
 		 399 aa  188  1e-46  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.118202  normal  0.328074 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3357  hypothetical protein  37.6 
 
 		 399 aa  186  8e-46  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.410286 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3055  hypothetical protein  37.42 
 
 		 392 aa  185  1.0000000000000001e-45  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3009  hypothetical protein  37.42 
 
 		 392 aa  185  1.0000000000000001e-45  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.477214  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3024  hypothetical protein  37.42 
 
 		 392 aa  184  2.0000000000000003e-45  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  decreased coverage  0.00601193  normal  0.11527 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6011  membrane protein-like protein  36.52 
 
 		 406 aa  184  2.0000000000000003e-45  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0111505  normal  0.791396 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_08850  predicted membrane protein  40.48 
 
 		 390 aa  181  1e-44  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0749641  normal  0.0331265 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2268  hypothetical protein  37.77 
 
 		 366 aa  169  7e-41  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.37562  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_13920  predicted membrane protein  37.76 
 
 		 437 aa  167  4e-40  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0156682  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2005  putative integral membrane protein  35.69 
 
 		 425 aa  161  1e-38  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000213441 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2216  membrane protein-like protein  41.55 
 
 		 397 aa  156  6e-37  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.0000105763  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2583  putative integral membrane protein  32.05 
 
 		 327 aa  140  3e-32  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.003396 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_12520  predicted membrane protein  31.69 
 
 		 468 aa  132  1.0000000000000001e-29  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.360296  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1978  hypothetical protein  34.94 
 
 		 492 aa  117  3e-25  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3589  hypothetical protein  31.1 
 
 		 313 aa  105  2e-21  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4278  membrane protein-like protein  28.37 
 
 		 404 aa  98.6  2e-19  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.277261  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1254  hypothetical protein  30.97 
 
 		 347 aa  96.3  8e-19  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2739  membrane protein-like protein  31.94 
 
 		 408 aa  76.3  0.0000000000009  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1820  membrane protein-like protein  31.08 
 
 		 411 aa  71.2  0.00000000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.335053  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1066  hypothetical protein  28.38 
 
 		 234 aa  67.4  0.0000000004  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00537874  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0448  hypothetical protein  29.63 
 
 		 252 aa  67  0.0000000005  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3987  membrane protein-like protein  26.82 
 
 		 397 aa  64.7  0.000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.203091  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1522  membrane protein-like protein  29.6 
 
 		 374 aa  63.5  0.000000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.179045  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0746  membrane protein  30.48 
 
 		 389 aa  61.2  0.00000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_02140  predicted membrane protein  26.88 
 
 		 205 aa  58.9  0.0000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3275  hypothetical protein  32.23 
 
 		 332 aa  57.8  0.0000003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.880784  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_05830  predicted membrane protein  26.45 
 
 		 226 aa  54.3  0.000003  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.42901  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1250  hypothetical protein  32.14 
 
 		 228 aa  51.6  0.00002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.361549  normal  0.274152 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0500  hypothetical protein  30.54 
 
 		 219 aa  50.8  0.00004  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0552  hypothetical protein  29.22 
 
 		 339 aa  50.8  0.00004  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0829  FHA domain containing protein  31.62 
 
 		 439 aa  48.9  0.0001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.00203514 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0448  hypothetical protein  27.71 
 
 		 225 aa  48.1  0.0002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2611  TPR repeat-containing protein  29.82 
 
 		 915 aa  48.1  0.0002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3270  membrane protein-like protein  28.22 
 
 		 337 aa  48.1  0.0002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1689  YpdC  25.84 
 
 		 224 aa  48.1  0.0002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0328  membrane protein-like protein  32.14 
 
 		 216 aa  47.8  0.0003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  hitchhiker  0.00221731  hitchhiker  0.00778453 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_3157  hypothetical protein  26.24 
 
 		 329 aa  46.6  0.0007  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0042  hypothetical protein  28.38 
 
 		 336 aa  46.2  0.0009  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.0273863 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1405  hypothetical protein  28.06 
 
 		 338 aa  45.8  0.001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.52985  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0976  hypothetical protein  28.29 
 
 		 229 aa  45.8  0.001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0255663  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0633  hypothetical protein  24.51 
 
 		 267 aa  42.7  0.01  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  0.000000160183  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>