More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Svir_29120 on replicon NC_013159
Organism: Saccharomonospora viridis DSM 43017



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013159  Svir_29120  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase  100 
 
 		 203 aa  400  1e-111  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4348  hypothetical protein  58.25 
 
 		 220 aa  211  7.999999999999999e-54  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.457106  normal  0.449633 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0502  putative methyltransferase  53.92 
 
 		 217 aa  209  3e-53  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.925229  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2456  methyltransferase type 11  54.9 
 
 		 217 aa  201  7e-51  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.161151  normal  0.897652 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3205  Methyltransferase type 11  53.27 
 
 		 210 aa  199  1.9999999999999998e-50  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7096  Methyltransferase type 11  52.75 
 
 		 208 aa  178  4e-44  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.517227  normal  0.260224 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0174  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase-like protein  47.66 
 
 		 217 aa  173  1.9999999999999998e-42  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2296  Methyltransferase type 11  47.03 
 
 		 209 aa  167  9e-41  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.000023308  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1686  Methyltransferase type 11  46.77 
 
 		 212 aa  160  1e-38  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.776814  normal  0.112952 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1528  Methyltransferase type 11  44 
 
 		 209 aa  159  2e-38  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.309563  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4265  Methyltransferase type 11  44.17 
 
 		 215 aa  152  2.9999999999999998e-36  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.00699595  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4619  methyltransferase type 11  49.66 
 
 		 200 aa  143  2e-33  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.194423  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0494  Methyltransferase type 11  42.08 
 
 		 228 aa  139  3e-32  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0277441 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_00760  methyltransferase family protein  42.78 
 
 		 200 aa  137  7.999999999999999e-32  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.226135 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0154  Methyltransferase type 11  44.79 
 
 		 218 aa  136  2e-31  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.733212 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0640  methyltransferase type 11  42.78 
 
 		 197 aa  135  4e-31  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2989  methyltransferase type 11  51.45 
 
 		 232 aa  123  2e-27  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000030187 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1408  Methyltransferase type 11  41.27 
 
 		 222 aa  120  9.999999999999999e-27  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.464916  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_00200  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase  43.66 
 
 		 200 aa  119  1.9999999999999998e-26  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4405  Methyltransferase type 11  37 
 
 		 210 aa  115  5e-25  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.432448  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_02230  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase  37.13 
 
 		 224 aa  101  7e-21  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0915  Methyltransferase type 12  36.31 
 
 		 222 aa  100  2e-20  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2782  hypothetical protein  38.28 
 
 		 400 aa  94.4  1e-18  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0954  methyltransferase type 11  39.58 
 
 		 219 aa  92.8  3e-18  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.579245 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2718  Methyltransferase type 12  35.48 
 
 		 204 aa  85.5  5e-16  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0032  Methyltransferase type 11  35.56 
 
 		 214 aa  72  0.000000000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0757  methyltransferase type 11  36.62 
 
 		 201 aa  70.9  0.00000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.137769  normal  0.156895 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0462  methyltransferase type 11  26.63 
 
 		 215 aa  70.1  0.00000000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0755  Methyltransferase type 12  29.79 
 
 		 264 aa  68.2  0.00000000009  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.0000828856  normal  0.444973 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5869  hypothetical protein  35.92 
 
 		 200 aa  67.4  0.0000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0641287  normal  0.24364 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2543  Methyltransferase type 11  33.58 
 
 		 210 aa  67  0.0000000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7236  Methyltransferase type 12  31.11 
 
 		 234 aa  67.4  0.0000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1751  putative methyltransferase  33.1 
 
 		 222 aa  67.4  0.0000000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1566  Methyltransferase type 11  36.59 
 
 		 226 aa  67.4  0.0000000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2572  methyltransferase type 11  34.67 
 
 		 199 aa  66.6  0.0000000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  hitchhiker  0.00406147  unclonable  0.0000000336172 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1093  methyltransferase  34.69 
 
 		 201 aa  65.5  0.0000000005  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.280373  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0938  SAM-dependent methyltransferases  34.69 
 
 		 201 aa  65.5  0.0000000005  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2139  hypothetical protein  34.69 
 
 		 201 aa  65.5  0.0000000006  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2262  hypothetical protein  34.69 
 
 		 201 aa  65.5  0.0000000006  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.363838  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0942  hypothetical protein  34.69 
 
 		 201 aa  65.5  0.0000000006  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0559  hypothetical protein  34.69 
 
 		 201 aa  65.5  0.0000000006  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2586  methyltransferase type 11  35.21 
 
 		 204 aa  65.5  0.0000000006  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.322136  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0981  Methyltransferase type 11  27.59 
 
 		 221 aa  64.3  0.000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1589  Methyltransferase type 11  35.29 
 
 		 197 aa  64.3  0.000000001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1792  methyltransferase type 11  30.38 
 
 		 202 aa  63.9  0.000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.980769  normal  0.955485 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0750  hypothetical protein  33.33 
 
 		 201 aa  62.4  0.000000005  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0509  methyltransferase type 11  27.78 
 
 		 210 aa  62.4  0.000000005  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2277  methyltransferase type 11  28.48 
 
 		 250 aa  62  0.000000006  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0448979  normal  0.0702037 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2562  methyltransferase type 11  35.21 
 
 		 201 aa  61.6  0.000000007  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.290266  normal  0.0304213 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3306  Methyltransferase type 12  31.43 
 
 		 196 aa  61.6  0.000000007  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.0246311 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2959  Methyltransferase type 12  30.71 
 
 		 196 aa  60.1  0.00000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0135677 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4063  Methyltransferase type 11  34.78 
 
 		 319 aa  59.3  0.00000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.355877 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1926  methyltransferase type 11  34.51 
 
 		 201 aa  59.7  0.00000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.541309  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2538  methyltransferase type 11  34.51 
 
 		 201 aa  59.7  0.00000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0718588  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4293  Methyltransferase type 11  34.78 
 
 		 305 aa  59.7  0.00000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.943104  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2822  hypothetical protein  32.39 
 
 		 200 aa  58.9  0.00000004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.201237  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2348  methyltransferase type 11  31.97 
 
 		 307 aa  58.9  0.00000005  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0100199  normal  0.0140968 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3135  ArsR family transcriptional regulator  28.99 
 
 		 348 aa  58.5  0.00000006  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5571  methyltransferase  37.72 
 
 		 121 aa  58.5  0.00000006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.766224  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0718  glycosyl transferase family protein  32.45 
 
 		 1106 aa  58.5  0.00000007  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.411794  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6054  methyltransferase type 11  27.98 
 
 		 241 aa  58.5  0.00000007  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.202203  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2940  methyltransferase type 11  32.65 
 
 		 224 aa  58.5  0.00000007  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0152  methyltransferase type 11  33.96 
 
 		 296 aa  58.2  0.00000009  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2456  methyltransferase type 11  33.1 
 
 		 204 aa  57.4  0.0000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000386414 
 
 
-
 
NC_006365  plpp0081  hypothetical protein  24.79 
 
 		 390 aa  56.6  0.0000002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  normal  0.113144  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2370  methyltransferase type 11  31.39 
 
 		 219 aa  56.6  0.0000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00258532 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4865  Methyltransferase type 11  26.97 
 
 		 218 aa  56.6  0.0000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.743669  normal  0.127304 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2535  Methyltransferase type 11  31.67 
 
 		 225 aa  57  0.0000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2181  23S rRNA methyltransferase A  32.69 
 
 		 269 aa  56.2  0.0000003  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4023  methyltransferase type 11  33.33 
 
 		 246 aa  56.6  0.0000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.837136  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1744  Methyltransferase type 11  28.57 
 
 		 208 aa  56.2  0.0000003  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.370117 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4343  methyltransferase type 11  33.33 
 
 		 246 aa  56.2  0.0000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1676  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase-like protein  27.4 
 
 		 243 aa  55.8  0.0000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.257047  normal  0.49664 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1762  Methyltransferase type 11  28.7 
 
 		 201 aa  55.5  0.0000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3370  methyltransferase type 12  45 
 
 		 200 aa  55.1  0.0000006  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.211091  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc3026  hypothetical protein  30 
 
 		 196 aa  55.1  0.0000007  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  hitchhiker  0.000455995  normal  0.015635 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3630  Methyltransferase type 11  35.29 
 
 		 291 aa  55.1  0.0000007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3491  methyltransferase type 11  29.91 
 
 		 364 aa  54.7  0.0000008  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2404  Methyltransferase type 11  30.96 
 
 		 226 aa  54.7  0.0000008  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3261  Methyltransferase type 11  31.16 
 
 		 264 aa  54.7  0.0000008  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0888  methyltransferase type 12  30.9 
 
 		 208 aa  54.7  0.0000009  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.526384  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1335  Methyltransferase type 11  33.04 
 
 		 208 aa  54.3  0.000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0357  transcriptional regulator, ArsR family  34.53 
 
 		 310 aa  54.3  0.000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.366158  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1090  hypothetical protein  32.41 
 
 		 201 aa  54.3  0.000001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1232  methyltransferase type 11  29.08 
 
 		 238 aa  54.3  0.000001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.976917  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2173  Methyltransferase type 11  32.04 
 
 		 252 aa  54.7  0.000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2489  methyltransferase type 11  30.34 
 
 		 200 aa  54.3  0.000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.910654  normal  0.230216 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_31490  methyltransferase family protein  46.67 
 
 		 205 aa  54.3  0.000001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009361  OSTLU_87708  predicted protein  35.64 
 
 		 267 aa  54.3  0.000001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1571  23S rRNA methyltransferase A  27.67 
 
 		 271 aa  53.1  0.000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_21650  methyltransferase family protein  28.67 
 
 		 199 aa  53.5  0.000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.920787 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4504  methyltransferase type 12  24.09 
 
 		 198 aa  53.5  0.000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.210014  normal  0.784341 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2478  23S rRNA methyltransferase A  30.77 
 
 		 271 aa  53.9  0.000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.452942  normal  0.114256 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_6010  methyltransferase type 11  31.91 
 
 		 246 aa  53.1  0.000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0230  Methyltransferase type 11  36.89 
 
 		 344 aa  52.4  0.000004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.183914 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2660  23S rRNA methyltransferase A  26.9 
 
 		 271 aa  52.8  0.000004  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000543045  hitchhiker  0.00521689 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1849  methyltransferase type 11  30.22 
 
 		 259 aa  52.4  0.000005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3198  methyltransferase  30.19 
 
 		 226 aa  52  0.000005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2491  Methyltransferase type 11  33.56 
 
 		 195 aa  52  0.000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.13744 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3873  Methyltransferase type 12  32.35 
 
 		 203 aa  52.4  0.000005  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.137783 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>