58 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mvan_0888 on replicon NC_008726
Organism: Mycobacterium vanbaalenii PYR-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008726  Mvan_0888  methyltransferase type 12  100 
 
 
208 aa  403  1e-111  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.526384  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0706  methyltransferase type 12  72.33 
 
 
209 aa  276  1e-73  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.0371032 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0726  methyltransferase type 12  72.33 
 
 
209 aa  276  1e-73  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.204789  normal  0.0433618 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0712  methyltransferase type 12  72.33 
 
 
209 aa  276  1e-73  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.897231  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0981  hypothetical protein  45.96 
 
 
241 aa  127  1.0000000000000001e-28  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.316182  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2753  methyltransferase type 12  43.78 
 
 
231 aa  122  3e-27  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.126222  hitchhiker  0.00760021 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8283  hypothetical protein  44.15 
 
 
213 aa  121  7e-27  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.848679  normal  0.948646 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2920  Methyltransferase type 12  41.8 
 
 
223 aa  118  6e-26  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.79301  hitchhiker  0.00140451 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1721  Methyltransferase type 11  40.32 
 
 
237 aa  104  1e-21  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.204  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3091  Methyltransferase type 11  46.51 
 
 
227 aa  99  5e-20  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.144611  normal  0.974838 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0102  Methyltransferase type 11  24.1 
 
 
232 aa  62.4  0.000000005  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0888112  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_29120  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase  30.9 
 
 
203 aa  54.7  0.0000009  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2989  methyltransferase type 11  44.93 
 
 
232 aa  52  0.000007  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000030187 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0174  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase-like protein  50.98 
 
 
217 aa  50.8  0.00001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0502  putative methyltransferase  33.33 
 
 
217 aa  48.9  0.00005  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.925229  normal 
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5795  Methyltransferase type 11  31.43 
 
 
293 aa  48.5  0.00007  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2173  Methyltransferase type 11  34.34 
 
 
252 aa  48.1  0.00009  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3934  Methyltransferase type 11  31.11 
 
 
259 aa  47.4  0.0001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.229133  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4348  hypothetical protein  29.7 
 
 
220 aa  46.6  0.0003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.457106  normal  0.449633 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0823  cyclopropane-fatty-acyl-phospholipid synthase  30.1 
 
 
260 aa  45.8  0.0004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.589192 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2456  methyltransferase type 11  32.18 
 
 
217 aa  45.8  0.0004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.161151  normal  0.897652 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2782  hypothetical protein  38.16 
 
 
400 aa  46.2  0.0004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4752  putative methionine biosynthesis protein MetW  28.71 
 
 
541 aa  45.1  0.0007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.432574 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3205  Methyltransferase type 11  40.58 
 
 
210 aa  45.1  0.0007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1528  Methyltransferase type 11  29.83 
 
 
209 aa  44.3  0.001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.309563  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4899  putative SAM-dependent methyltransferase  28.71 
 
 
541 aa  44.3  0.001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00310573 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0559  hypothetical protein  58.7 
 
 
201 aa  44.3  0.001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2262  hypothetical protein  58.7 
 
 
201 aa  44.3  0.001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.363838  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1093  methyltransferase  58.7 
 
 
201 aa  44.3  0.001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.280373  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2139  hypothetical protein  58.7 
 
 
201 aa  44.3  0.001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0942  hypothetical protein  58.7 
 
 
201 aa  44.3  0.001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0938  SAM-dependent methyltransferases  58.7 
 
 
201 aa  44.3  0.001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09363  putative methyltransferase  22.64 
 
 
227 aa  43.5  0.002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.182013  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1878  Methyltransferase type 11  38.95 
 
 
219 aa  43.9  0.002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4265  Methyltransferase type 11  37.5 
 
 
215 aa  43.9  0.002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.00699595  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_12280  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase  32.04 
 
 
236 aa  43.5  0.002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4934  Methyltransferase type 11  28.7 
 
 
332 aa  43.9  0.002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.310878 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3335  Methyltransferase type 12  26.27 
 
 
259 aa  43.9  0.002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.15309  unclonable  0.0000000176588 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0750  hypothetical protein  60.87 
 
 
201 aa  43.9  0.002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0757  methyltransferase type 11  31.19 
 
 
442 aa  43.5  0.002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2191  methyltransferase type 11  39.22 
 
 
226 aa  43.9  0.002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2296  Methyltransferase type 11  46.03 
 
 
209 aa  43.5  0.003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.000023308  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4828  methyltransferase domain family  27.72 
 
 
541 aa  43.1  0.003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4902  putative SAM-dependent methyltransferase  27.72 
 
 
541 aa  43.1  0.003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4176  methyltransferase type 11  30.38 
 
 
256 aa  43.1  0.003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  unclonable  0.00000140176  hitchhiker  0.0000000044225 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_00200  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase  31.93 
 
 
200 aa  42.7  0.004  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3418  methyltransferase type 12  27.78 
 
 
275 aa  42.7  0.004  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.137162  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0632  type 11 methyltransferase  33.04 
 
 
204 aa  42.4  0.005  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.186651 
 
 
-
 
NC_002620  TC0410  hypothetical protein  31.37 
 
 
266 aa  42.4  0.006  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  0.404807  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1408  Methyltransferase type 11  40.22 
 
 
222 aa  42  0.006  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.464916  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1113  Methyltransferase type 11  24.04 
 
 
252 aa  42  0.006  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.022337  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0252  Methyltransferase type 12  36.96 
 
 
227 aa  42  0.007  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.965523  hitchhiker  0.00106675 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2488  methyltransferase type 11  40 
 
 
223 aa  41.6  0.009  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.180957 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4852  putative SAM-dependent methyltransferase  26.73 
 
 
541 aa  41.6  0.009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.0491612 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2038  Methyltransferase type 11  33.33 
 
 
197 aa  41.6  0.009  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.678124 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_20390  2-polyprenyl-3-methyl-5-hydroxy-6-metoxy-1, 4-benzoquinol methylase  38.54 
 
 
245 aa  41.6  0.01  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0797828  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4520  methyltransferase domain protein  42.86 
 
 
783 aa  41.6  0.01  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc3026  hypothetical protein  38.38 
 
 
196 aa  41.2  0.01  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  hitchhiker  0.000455995  normal  0.015635 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>