25 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ndas_1721 on replicon NC_014210
Organism: Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014210  Ndas_1721  Methyltransferase type 11  100 
 
 
237 aa  458  9.999999999999999e-129  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.204  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2920  Methyltransferase type 12  54.19 
 
 
223 aa  194  1e-48  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.79301  hitchhiker  0.00140451 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8283  hypothetical protein  46.8 
 
 
213 aa  149  4e-35  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.848679  normal  0.948646 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3091  Methyltransferase type 11  44.44 
 
 
227 aa  115  6e-25  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.144611  normal  0.974838 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2753  methyltransferase type 12  39.3 
 
 
231 aa  110  3e-23  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.126222  hitchhiker  0.00760021 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0712  methyltransferase type 12  41.57 
 
 
209 aa  105  5e-22  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.897231  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0726  methyltransferase type 12  41.57 
 
 
209 aa  105  5e-22  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.204789  normal  0.0433618 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0706  methyltransferase type 12  41.57 
 
 
209 aa  105  5e-22  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.0371032 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0888  methyltransferase type 12  40.32 
 
 
208 aa  104  1e-21  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.526384  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0981  hypothetical protein  38.64 
 
 
241 aa  99.4  4e-20  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.316182  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2169  hypothetical protein  28.02 
 
 
223 aa  49.3  0.00005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2281  Methyltransferase type 11  31.58 
 
 
237 aa  47.4  0.0002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.316994  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2098  hypothetical protein  33.33 
 
 
194 aa  47  0.0003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.379159  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0197  Methyltransferase type 11  56.41 
 
 
197 aa  46.2  0.0004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.746837  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0102  Methyltransferase type 11  23.73 
 
 
232 aa  46.6  0.0004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0888112  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1006  Methyltransferase type 11  34.46 
 
 
244 aa  46.2  0.0004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0186  Methyltransferase type 11  53.85 
 
 
197 aa  45.8  0.0006  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_02230  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase  40 
 
 
224 aa  45.4  0.0008  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1428  Methyltransferase type 11  38.61 
 
 
233 aa  45.4  0.0009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.258196 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3934  Methyltransferase type 11  34.52 
 
 
259 aa  43.9  0.002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.229133  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3160  methyltransferase type 12  32.08 
 
 
222 aa  43.5  0.003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.657234  normal  0.0993246 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1005  Methyltransferase type 11  31 
 
 
249 aa  43.1  0.004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2707  Methyltransferase type 12  60 
 
 
201 aa  42.7  0.005  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.821475 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10570  benzoquinone methyltransferase  40 
 
 
241 aa  42.7  0.005  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.175539  normal  0.480356 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_01310  methyltransferase family protein  55.56 
 
 
201 aa  41.6  0.01  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>