58 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Francci3_0981 on replicon NC_007777
Organism: Frankia sp. CcI3



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007777  Francci3_0981  hypothetical protein  100 
 
 		 241 aa  459  9.999999999999999e-129  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.316182  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2920  Methyltransferase type 12  42.6 
 
 		 223 aa  147  1.0000000000000001e-34  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.79301  hitchhiker  0.00140451 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0888  methyltransferase type 12  45.96 
 
 		 208 aa  142  4e-33  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.526384  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0712  methyltransferase type 12  47.83 
 
 		 209 aa  140  1.9999999999999998e-32  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.897231  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0706  methyltransferase type 12  47.83 
 
 		 209 aa  140  1.9999999999999998e-32  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.0371032 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0726  methyltransferase type 12  47.83 
 
 		 209 aa  140  1.9999999999999998e-32  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.204789  normal  0.0433618 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8283  hypothetical protein  48.5 
 
 		 213 aa  136  2e-31  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.848679  normal  0.948646 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2753  methyltransferase type 12  43.69 
 
 		 231 aa  137  2e-31  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.126222  hitchhiker  0.00760021 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3091  Methyltransferase type 11  49.72 
 
 		 227 aa  132  3e-30  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.144611  normal  0.974838 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1721  Methyltransferase type 11  38.64 
 
 		 237 aa  116  3e-25  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.204  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0174  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase-like protein  34.84 
 
 		 217 aa  62  0.000000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09363  putative methyltransferase  27.37 
 
 		 227 aa  52.4  0.000006  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.182013  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4902  putative SAM-dependent methyltransferase  26.67 
 
 		 541 aa  52.4  0.000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4828  methyltransferase domain family  26.67 
 
 		 541 aa  52.4  0.000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4899  putative SAM-dependent methyltransferase  26.67 
 
 		 541 aa  51.6  0.00001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00310573 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0102  Methyltransferase type 11  27.27 
 
 		 232 aa  51.2  0.00001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0888112  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4752  putative methionine biosynthesis protein MetW  26.67 
 
 		 541 aa  51.6  0.00001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.432574 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4852  putative SAM-dependent methyltransferase  26.67 
 
 		 541 aa  50.4  0.00002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.0491612 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4547  methyltransferase type 11  35 
 
 		 254 aa  51.2  0.00002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.577153  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2989  methyltransferase type 11  44.29 
 
 		 232 aa  49.7  0.00004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000030187 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7096  Methyltransferase type 11  29.55 
 
 		 208 aa  49.3  0.00005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.517227  normal  0.260224 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0494  Methyltransferase type 11  34.13 
 
 		 228 aa  47.4  0.0002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0277441 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1794  methyltransferase type 12  27.1 
 
 		 336 aa  47.4  0.0002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3934  Methyltransferase type 11  28.35 
 
 		 259 aa  47.4  0.0002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.229133  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4493  hypothetical protein  29.67 
 
 		 235 aa  46.6  0.0004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.809793  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1528  Methyltransferase type 11  34.16 
 
 		 209 aa  46.6  0.0004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.309563  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4934  Methyltransferase type 11  30.43 
 
 		 332 aa  46.2  0.0005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.310878 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0485  methyltransferase type 11  25.13 
 
 		 235 aa  46.2  0.0005  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_00200  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase  39.45 
 
 		 200 aa  45.8  0.0006  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4176  methyltransferase type 11  25 
 
 		 256 aa  45.8  0.0007  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  unclonable  0.00000140176  hitchhiker  0.0000000044225 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1544  Methyltransferase type 11  31.76 
 
 		 200 aa  45.4  0.0008  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.580406  normal  1 
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5795  Methyltransferase type 11  28.43 
 
 		 293 aa  44.7  0.001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0289  Mg-protoporphyrin IX methyl transferase  35.9 
 
 		 222 aa  45.1  0.001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.705778  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1932  Mg-protoporphyrin IX methyl transferase  35.9 
 
 		 222 aa  45.1  0.001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3938  methyltransferase type 12  30.88 
 
 		 444 aa  44.3  0.002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.16065  normal  0.145676 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4270  Methyltransferase type 11  26.26 
 
 		 299 aa  44.3  0.002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0859626  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1458  methyltransferase type 11  31 
 
 		 265 aa  44.7  0.002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2782  hypothetical protein  53.66 
 
 		 400 aa  43.9  0.002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0211  methyltransferase type 11  35.94 
 
 		 266 aa  43.5  0.003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0907  Methyltransferase type 11  29.77 
 
 		 220 aa  43.9  0.003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0476  putative methyltransferase  38.46 
 
 		 253 aa  43.1  0.004  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.626019  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0503  methyltransferase type 11  32 
 
 		 197 aa  43.1  0.004  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1842  methyltransferase type 11  38 
 
 		 244 aa  43.1  0.004  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1006  Mg-protoporphyrin IX methyl transferase  35.9 
 
 		 222 aa  43.1  0.004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.788103  normal  0.633954 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3090  methyltransferase type 11  50 
 
 		 195 aa  43.1  0.004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.533993  normal  0.421813 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0925  Methyltransferase type 11  40 
 
 		 222 aa  42.7  0.005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_09370  dimethyladenosine transferase (rRNA methylation)  32.79 
 
 		 256 aa  42.7  0.005  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.258715  normal  0.963324 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0279  putative methylase  25 
 
 		 185 aa  42.7  0.005  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2499  methyltransferase type 12  32.8 
 
 		 203 aa  42.4  0.006  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.301518 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_29120  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase  31.53 
 
 		 203 aa  42.4  0.006  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2168  Methyltransferase type 11  45 
 
 		 250 aa  42.4  0.007  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000153459 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3355  Methyltransferase type 11  25 
 
 		 285 aa  42.4  0.007  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.109468  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2559  rRNA (guanine-N(2)-)-methyltransferase  34.88 
 
 		 333 aa  42.4  0.007  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1379  Methyltransferase type 11  27.35 
 
 		 251 aa  42  0.008  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2000  hypothetical protein  47.5 
 
 		 207 aa  42  0.008  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0173133  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0632  type 11 methyltransferase  34.02 
 
 		 204 aa  42  0.009  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.186651 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2707  Methyltransferase type 12  34.55 
 
 		 201 aa  41.6  0.01  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.821475 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0348  hypothetical protein  32.76 
 
 		 208 aa  41.6  0.01  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.11153  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>