86 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmcs_0712 on replicon NC_008146
Organism: Mycobacterium sp. MCS



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009077  Mjls_0706  methyltransferase type 12  100 
 
 		 209 aa  407  1e-113  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.0371032 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0726  methyltransferase type 12  100 
 
 		 209 aa  407  1e-113  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.204789  normal  0.0433618 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0712  methyltransferase type 12  100 
 
 		 209 aa  407  1e-113  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.897231  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0888  methyltransferase type 12  72.33 
 
 		 208 aa  290  1e-77  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.526384  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0981  hypothetical protein  46.97 
 
 		 241 aa  134  9e-31  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.316182  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8283  hypothetical protein  51.22 
 
 		 213 aa  132  3.9999999999999996e-30  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.848679  normal  0.948646 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2920  Methyltransferase type 12  40.38 
 
 		 223 aa  125  7e-28  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.79301  hitchhiker  0.00140451 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2753  methyltransferase type 12  45.56 
 
 		 231 aa  122  3e-27  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.126222  hitchhiker  0.00760021 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3091  Methyltransferase type 11  46.67 
 
 		 227 aa  109  3e-23  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.144611  normal  0.974838 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1721  Methyltransferase type 11  40.53 
 
 		 237 aa  106  2e-22  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.204  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0102  Methyltransferase type 11  25.89 
 
 		 232 aa  60.5  0.00000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0888112  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0963  SAM-dependent methyltransferase  23.88 
 
 		 239 aa  53.9  0.000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.679672  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4176  methyltransferase type 11  30.36 
 
 		 256 aa  53.9  0.000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  unclonable  0.00000140176  hitchhiker  0.0000000044225 
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5795  Methyltransferase type 11  30.47 
 
 		 293 aa  53.1  0.000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3335  Methyltransferase type 12  28.7 
 
 		 259 aa  51.6  0.000007  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.15309  unclonable  0.0000000176588 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4348  hypothetical protein  31.79 
 
 		 220 aa  52  0.000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.457106  normal  0.449633 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0823  cyclopropane-fatty-acyl-phospholipid synthase  32.98 
 
 		 260 aa  51.6  0.000008  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.589192 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3934  Methyltransferase type 11  32.59 
 
 		 259 aa  49.7  0.00003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.229133  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0502  putative methyltransferase  33.77 
 
 		 217 aa  49.3  0.00004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.925229  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2456  methyltransferase type 11  35.29 
 
 		 217 aa  49.7  0.00004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.161151  normal  0.897652 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02124  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  25.64 
 
 		 234 aa  48.5  0.00007  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.369264  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2989  methyltransferase type 11  38.78 
 
 		 232 aa  48.1  0.00009  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000030187 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09363  putative methyltransferase  24.21 
 
 		 227 aa  48.1  0.0001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.182013  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7096  Methyltransferase type 11  31.29 
 
 		 208 aa  47.4  0.0001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.517227  normal  0.260224 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2173  Methyltransferase type 11  30.82 
 
 		 252 aa  47  0.0002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1006  Methyltransferase type 11  28.57 
 
 		 244 aa  46.6  0.0002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_29120  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase  31.41 
 
 		 203 aa  47  0.0002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2296  Methyltransferase type 11  33.61 
 
 		 209 aa  47.4  0.0002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.000023308  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0757  methyltransferase type 11  33.33 
 
 		 442 aa  46.6  0.0002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5792  Methyltransferase type 11  31.54 
 
 		 239 aa  47.4  0.0002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0476  putative methyltransferase  30.65 
 
 		 253 aa  47  0.0002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.626019  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0057  putative C-3 methyl transferase  24.58 
 
 		 410 aa  46.2  0.0003  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  hitchhiker  0.00760269  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5197  C-methyltransferase  26.67 
 
 		 415 aa  46.2  0.0003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0174  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase-like protein  46.94 
 
 		 217 aa  45.8  0.0005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3390  C-methyltransferase  26.67 
 
 		 420 aa  45.4  0.0005  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0218606  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0383  Methyltransferase type 11  28.12 
 
 		 277 aa  45.8  0.0005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0772  C-methyltransferase  26.62 
 
 		 409 aa  45.8  0.0005  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.0227083 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2262  hypothetical protein  58.7 
 
 		 201 aa  45.4  0.0006  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.363838  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1093  methyltransferase  58.7 
 
 		 201 aa  45.4  0.0006  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.280373  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2139  hypothetical protein  58.7 
 
 		 201 aa  45.4  0.0006  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0942  hypothetical protein  58.7 
 
 		 201 aa  45.4  0.0006  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0559  hypothetical protein  58.7 
 
 		 201 aa  45.4  0.0006  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0938  SAM-dependent methyltransferases  58.7 
 
 		 201 aa  45.4  0.0006  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2770  methyltransferase type 12  28.85 
 
 		 408 aa  45.1  0.0007  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4752  putative methionine biosynthesis protein MetW  28.32 
 
 		 541 aa  45.1  0.0008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.432574 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1069  Methyltransferase type 12  35.48 
 
 		 248 aa  44.7  0.0009  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4141  methyltransferase type 11  34.55 
 
 		 273 aa  44.3  0.001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.160628 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2782  hypothetical protein  41.18 
 
 		 400 aa  44.7  0.001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0757  methyltransferase type 11  37.97 
 
 		 201 aa  44.3  0.001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.137769  normal  0.156895 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1983  Methyltransferase type 11  27.27 
 
 		 252 aa  44.7  0.001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.600797 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4899  putative SAM-dependent methyltransferase  27.45 
 
 		 541 aa  44.3  0.001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00310573 
 
 
-
 
NC_002620  TC0410  hypothetical protein  30.3 
 
 		 266 aa  44.3  0.001  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  0.404807  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2108  hypothetical protein  38.66 
 
 		 247 aa  44.7  0.001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.162717  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3026  hypothetical protein  31.82 
 
 		 196 aa  43.9  0.002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  hitchhiker  0.000455995  normal  0.015635 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3562  Methyltransferase type 11  44.78 
 
 		 200 aa  43.5  0.002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.50395 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2082  Methyltransferase type 11  34.38 
 
 		 265 aa  43.5  0.002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0250363  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1113  Methyltransferase type 11  23.08 
 
 		 252 aa  43.5  0.002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.022337  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0998  methyltransferase, putative  30.32 
 
 		 258 aa  43.5  0.002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.742454  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2499  methyltransferase type 12  32.04 
 
 		 203 aa  43.5  0.002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.301518 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2784  C-methyltransferase  24.32 
 
 		 413 aa  43.1  0.003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.611308 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4043  Methyltransferase type 11  43.18 
 
 		 248 aa  43.1  0.003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2775  Methyltransferase type 11  24.39 
 
 		 277 aa  43.1  0.003  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8438  SAM-dependent methyltransferase, putative  35.71 
 
 		 258 aa  43.1  0.003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3333  Methyltransferase type 11  35.48 
 
 		 257 aa  43.1  0.003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0736  tellurite resistance protein TehB  25.22 
 
 		 208 aa  43.1  0.003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.304393  normal  0.132387 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_00200  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase  27.06 
 
 		 200 aa  43.5  0.003  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0750  hypothetical protein  42.11 
 
 		 201 aa  43.1  0.003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4001  Methyltransferase type 11  41.67 
 
 		 248 aa  43.1  0.003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3333  C-methyltransferase  24.32 
 
 		 413 aa  42.7  0.003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0639  Methyltransferase type 11  38.95 
 
 		 307 aa  42.7  0.004  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.110248 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4828  methyltransferase domain family  26.47 
 
 		 541 aa  42.7  0.004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4902  putative SAM-dependent methyltransferase  27.27 
 
 		 541 aa  42.7  0.004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4270  Methyltransferase type 11  31.48 
 
 		 299 aa  42.4  0.005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0859626  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1528  Methyltransferase type 11  33.75 
 
 		 209 aa  42.4  0.005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.309563  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3724  methyltransferase type 11  32.35 
 
 		 240 aa  42.4  0.005  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.752355 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0925  Methyltransferase type 11  35.09 
 
 		 222 aa  42.4  0.006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_14051  hypothetical protein  25.33 
 
 		 402 aa  42  0.006  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4364  ArsR family transcriptional regulator  32.77 
 
 		 327 aa  42.4  0.006  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0368446  normal  1 
 
 
-
 
NC_009044  PICST_31474  predicted protein  25.64 
 
 		 449 aa  42  0.006  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.981787  normal  0.166066 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2302  transcriptional regulator, ArsR family  30.67 
 
 		 309 aa  42  0.007  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0348  hypothetical protein  33.61 
 
 		 208 aa  42  0.007  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.11153  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2926  transcriptional regulator ArsR family  30.77 
 
 		 341 aa  42  0.007  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.276584  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2169  hypothetical protein  36.08 
 
 		 223 aa  41.6  0.008  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4217  C-methyltransferase  29.37 
 
 		 411 aa  41.6  0.008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.858444  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1379  Methyltransferase type 11  27.68 
 
 		 251 aa  41.2  0.01  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4053  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase UbiE  32.17 
 
 		 207 aa  41.2  0.01  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>