28 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CHU_0963 on replicon NC_008255
Organism: Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008255  CHU_0963  SAM-dependent methyltransferase  100 
 
 
239 aa  493  9.999999999999999e-139  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.679672  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0485  methyltransferase type 11  41.38 
 
 
235 aa  166  4e-40  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09363  putative methyltransferase  40.34 
 
 
227 aa  165  6.9999999999999995e-40  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.182013  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0660  Methyltransferase type 11  37.18 
 
 
234 aa  156  3e-37  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0102  Methyltransferase type 11  34.76 
 
 
232 aa  143  2e-33  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0888112  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3934  Methyltransferase type 11  26.19 
 
 
259 aa  75.5  0.0000000000008  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.229133  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4493  hypothetical protein  25 
 
 
235 aa  73.9  0.000000000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.809793  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2546  Methyltransferase type 11  25 
 
 
244 aa  49.7  0.00004  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.0272722 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1767  hypothetical protein  29.63 
 
 
239 aa  50.1  0.00004  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  decreased coverage  0.00475072 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2092  hypothetical protein  26.71 
 
 
240 aa  49.3  0.00005  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.516307 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0628  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  27.48 
 
 
230 aa  46.6  0.0004  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  0.308347  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1722  methyltransferase type 12  32.69 
 
 
575 aa  45.8  0.0006  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal  0.0792321 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4852  putative SAM-dependent methyltransferase  27.12 
 
 
541 aa  45.1  0.0009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.0491612 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4752  putative methionine biosynthesis protein MetW  26.27 
 
 
541 aa  45.1  0.001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.432574 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4902  putative SAM-dependent methyltransferase  26.09 
 
 
541 aa  45.1  0.001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0706  methyltransferase type 12  22.83 
 
 
209 aa  44.3  0.002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.0371032 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0712  methyltransferase type 12  22.83 
 
 
209 aa  44.3  0.002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.897231  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_03040  methyltransferase family protein  38.1 
 
 
202 aa  44.3  0.002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0726  methyltransferase type 12  22.83 
 
 
209 aa  44.3  0.002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.204789  normal  0.0433618 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4899  putative SAM-dependent methyltransferase  26.09 
 
 
541 aa  44.3  0.002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00310573 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4828  methyltransferase domain family  25.66 
 
 
541 aa  44.3  0.002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2920  Methyltransferase type 12  21.89 
 
 
223 aa  43.5  0.003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.79301  hitchhiker  0.00140451 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1849  Methyltransferase type 11  29.13 
 
 
255 aa  42.7  0.005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.391703  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2699  methyltransferase type 12  43.48 
 
 
231 aa  42.4  0.006  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3114  Methyltransferase type 12  24.58 
 
 
247 aa  42.4  0.007  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2206  Methyltransferase type 11  25.74 
 
 
269 aa  42.4  0.007  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000097592  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0836  Methyltransferase type 12  30 
 
 
310 aa  42  0.008  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0463  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  26.74 
 
 
250 aa  42  0.009  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>