114 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Phep_0102 on replicon NC_013061
Organism: Pedobacter heparinus DSM 2366



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013061  Phep_0102  Methyltransferase type 11  100 
 
 
232 aa  479  1e-134  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0888112  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09363  putative methyltransferase  40 
 
 
227 aa  174  8e-43  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.182013  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0485  methyltransferase type 11  38.24 
 
 
235 aa  162  3e-39  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0660  Methyltransferase type 11  36.02 
 
 
234 aa  144  8.000000000000001e-34  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0963  SAM-dependent methyltransferase  34.76 
 
 
239 aa  143  2e-33  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.679672  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3934  Methyltransferase type 11  27.32 
 
 
259 aa  79  0.00000000000006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.229133  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4493  hypothetical protein  26.73 
 
 
235 aa  76.6  0.0000000000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.809793  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1767  hypothetical protein  26.99 
 
 
239 aa  65.5  0.0000000007  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  decreased coverage  0.00475072 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2092  hypothetical protein  30.91 
 
 
240 aa  65.5  0.0000000007  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.516307 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0888  methyltransferase type 12  24.1 
 
 
208 aa  62.4  0.000000006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.526384  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2920  Methyltransferase type 12  30.67 
 
 
223 aa  60.1  0.00000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.79301  hitchhiker  0.00140451 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3732  Methyltransferase type 11  25.12 
 
 
274 aa  59.7  0.00000004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0712  methyltransferase type 12  25.54 
 
 
209 aa  57  0.0000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.897231  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0726  methyltransferase type 12  25.54 
 
 
209 aa  57  0.0000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.204789  normal  0.0433618 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0706  methyltransferase type 12  25.54 
 
 
209 aa  57  0.0000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.0371032 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0655  D-alanine--D-alanine ligase  34.82 
 
 
663 aa  56.6  0.0000003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.24382  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1565  methyltransferase type 11  29.63 
 
 
247 aa  53.9  0.000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.132389  hitchhiker  0.000000000856384 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0896  methyltransferase, putative  25.14 
 
 
262 aa  52.8  0.000004  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3917  Methyltransferase type 11  32.99 
 
 
243 aa  53.1  0.000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1459  Methyltransferase type 11  31.63 
 
 
250 aa  52  0.000008  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2753  methyltransferase type 12  22.49 
 
 
231 aa  50.8  0.00002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.126222  hitchhiker  0.00760021 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8283  hypothetical protein  24.66 
 
 
213 aa  50.4  0.00002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.848679  normal  0.948646 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1966  methyltransferase type 11  26.32 
 
 
215 aa  49.7  0.00004  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000000755977  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2436  Methyltransferase type 11  28.33 
 
 
268 aa  49.3  0.00005  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1452  Methyltransferase type 11  28.93 
 
 
202 aa  48.9  0.00006  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1158  hypothetical protein  27.27 
 
 
239 aa  48.9  0.00007  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_31310  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase  26.23 
 
 
232 aa  48.5  0.00009  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.060018  normal  0.471088 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2138  Methyltransferase type 11  24.18 
 
 
260 aa  48.1  0.0001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2453  MCP methyltransferase, CheR-type  25.49 
 
 
247 aa  48.1  0.0001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000000207695  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0587  Methyltransferase type 11  27 
 
 
220 aa  48.1  0.0001  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011025  MARTH_orf339  predicted O-methyltransferase  26.36 
 
 
242 aa  47.4  0.0002  Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  hitchhiker  0.00322712  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2579  hypothetical protein  29.55 
 
 
236 aa  47.8  0.0002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000213687  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2899  hypothetical protein  29.55 
 
 
236 aa  47.8  0.0002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000000010502  normal  0.0506013 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1305  Methyltransferase type 11  29.52 
 
 
235 aa  47.4  0.0002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0712  Methyltransferase type 11  27.27 
 
 
246 aa  47.4  0.0002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4343  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase-like protein  26.5 
 
 
259 aa  47.4  0.0002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.90716 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1006  Methyltransferase type 11  25.34 
 
 
244 aa  47.4  0.0002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4227  hypothetical protein  23.36 
 
 
249 aa  47  0.0003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.0061415  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2276  methyltransferase  28.41 
 
 
236 aa  47  0.0003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  4.19659e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4065  methyltransferase  23.36 
 
 
249 aa  47  0.0003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000000132189  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4075  methyltransferase  23.36 
 
 
249 aa  47  0.0003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.0000412904  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4555  hypothetical protein  23.36 
 
 
249 aa  47  0.0003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00000250123  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1194  methyltransferase type 11  28.81 
 
 
256 aa  47  0.0003  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1001  methyltransferase type 11  33 
 
 
282 aa  47  0.0003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1394  methyltransferase type 11  26.53 
 
 
248 aa  47  0.0003  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2590  Methyltransferase type 11  29.53 
 
 
253 aa  46.6  0.0003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1440  methyltransferase type 11  26.53 
 
 
248 aa  47  0.0003  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1113  Methyltransferase type 11  29.03 
 
 
252 aa  47  0.0003  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.022337  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2872  hypothetical protein  27.68 
 
 
253 aa  47  0.0003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4351  hypothetical protein  23.36 
 
 
249 aa  47  0.0003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000420898 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003268  methyltransferase  33.78 
 
 
210 aa  47  0.0003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2308  hypothetical protein  28.41 
 
 
236 aa  46.2  0.0004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.000000011894  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2483  hypothetical protein  28.41 
 
 
236 aa  46.2  0.0004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00000000363722  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1721  Methyltransferase type 11  23.73 
 
 
237 aa  46.6  0.0004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.204  normal 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1580  hypothetical protein  28.04 
 
 
269 aa  46.2  0.0004  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.0517207  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4886  methyltransferase type 12  27.01 
 
 
259 aa  46.2  0.0004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0358  methyltransferase type 11  28.57 
 
 
637 aa  45.8  0.0005  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000290663  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3271  Methyltransferase type 12  28.46 
 
 
238 aa  46.2  0.0005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.128592 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2907  Methyltransferase type 11  28.17 
 
 
243 aa  45.4  0.0006  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2230  methyltransferase  28.41 
 
 
236 aa  45.8  0.0006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000000502541  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2168  Methyltransferase type 11  30.38 
 
 
250 aa  45.8  0.0006  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000153459 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2775  Methyltransferase type 11  28.3 
 
 
277 aa  45.8  0.0006  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5323  methyltransferase type 11  31.25 
 
 
252 aa  45.8  0.0006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.426827  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1005  Methyltransferase type 11  27.83 
 
 
249 aa  45.4  0.0006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4222  Methyltransferase type 11  32.38 
 
 
286 aa  45.4  0.0008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.743258  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0788  hypothetical protein  22.63 
 
 
249 aa  45.4  0.0008  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000039768  hitchhiker  0.00000215266 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2790  methyltransferase type 11  26.02 
 
 
201 aa  45.1  0.001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.030207  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4462  hypothetical protein  23.36 
 
 
249 aa  44.7  0.001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000536455  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2437  hypothetical protein  28.74 
 
 
236 aa  45.1  0.001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000255199  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1849  Methyltransferase type 11  25 
 
 
255 aa  44.7  0.001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.391703  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2514  hypothetical protein  29.35 
 
 
222 aa  43.9  0.002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00000000941617  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4410  hypothetical protein  23.36 
 
 
249 aa  44.3  0.002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.422473  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1888  methyltransferase type 11  31.82 
 
 
209 aa  43.9  0.002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10570  benzoquinone methyltransferase  32.18 
 
 
241 aa  43.9  0.002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.175539  normal  0.480356 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2289  methyltransferase type 11  26.14 
 
 
236 aa  43.9  0.002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00000192074  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0251  methyltransferase type 11  29.91 
 
 
165 aa  43.9  0.002  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal  0.999818 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4449  hypothetical protein  22.63 
 
 
249 aa  44.3  0.002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0469644  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2749  Methyltransferase type 11  24.41 
 
 
252 aa  43.5  0.002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1149  Methyltransferase type 11  28.16 
 
 
241 aa  43.9  0.002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00000285461  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003869  biotin synthesis protein BioC  26.47 
 
 
268 aa  44.3  0.002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.19334  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1330  Methyltransferase type 11  25.16 
 
 
252 aa  43.5  0.003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3055  methyltransferase type 11  22.58 
 
 
249 aa  43.1  0.003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0287567  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01809  methyltransferase  27.92 
 
 
268 aa  43.5  0.003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2546  Methyltransferase type 11  24.51 
 
 
244 aa  43.5  0.003  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.0272722 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2504  hypothetical protein  27.59 
 
 
236 aa  43.1  0.003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0656  Methyltransferase type 11  25.98 
 
 
199 aa  43.1  0.003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00098603 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1069  Methyltransferase type 12  23.15 
 
 
248 aa  43.5  0.003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1186  methyltransferase type 11  21.3 
 
 
262 aa  43.1  0.004  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.315285  normal 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5488  Methyltransferase type 12  35.56 
 
 
218 aa  43.1  0.004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.254106  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3953  Methyltransferase type 12  28.57 
 
 
249 aa  43.1  0.004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.988562  normal  0.116443 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1394  methyltransferase type 12  38.71 
 
 
177 aa  42.7  0.005  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0374  methyltransferase  21.28 
 
 
245 aa  42.4  0.005  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1855  methyltransferase type 11  26.67 
 
 
232 aa  42.7  0.005  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00000126246  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1254  methyltransferase type 11  28.83 
 
 
244 aa  42.7  0.005  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2863  hypothetical protein  29.06 
 
 
254 aa  42.7  0.005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00276445 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0817  methyltransferase  32 
 
 
253 aa  42.7  0.005  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0471  Methyltransferase type 11  27.41 
 
 
202 aa  42.7  0.005  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11406  transferase  38.3 
 
 
212 aa  42.4  0.006  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.000309281  normal  0.307952 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1722  methyltransferase type 12  28.57 
 
 
575 aa  42  0.007  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal  0.0792321 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0685  cyclopropane-fatty-acyl-phospholipid synthase  29.09 
 
 
418 aa  42.4  0.007  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.132671  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>