22 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Coch_0660 on replicon NC_013162
Organism: Capnocytophaga ochracea DSM 7271



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013162  Coch_0660  Methyltransferase type 11  100 
 
 
234 aa  484  1e-136  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0485  methyltransferase type 11  61.8 
 
 
235 aa  305  3e-82  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09363  putative methyltransferase  47.64 
 
 
227 aa  214  9.999999999999999e-55  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.182013  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0963  SAM-dependent methyltransferase  37.18 
 
 
239 aa  156  3e-37  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.679672  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0102  Methyltransferase type 11  36.02 
 
 
232 aa  144  8.000000000000001e-34  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0888112  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4493  hypothetical protein  26.15 
 
 
235 aa  66.2  0.0000000004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.809793  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3934  Methyltransferase type 11  33.08 
 
 
259 aa  62.8  0.000000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.229133  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1767  hypothetical protein  21.54 
 
 
239 aa  62.8  0.000000005  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  decreased coverage  0.00475072 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2092  hypothetical protein  22.66 
 
 
240 aa  47.8  0.0002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.516307 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2504  hypothetical protein  33.65 
 
 
236 aa  43.1  0.003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1440  methyltransferase type 11  27.1 
 
 
248 aa  42.7  0.005  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2579  hypothetical protein  44.68 
 
 
236 aa  42.7  0.005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000213687  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2483  hypothetical protein  44.68 
 
 
236 aa  42.7  0.005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00000000363722  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2230  methyltransferase  44.68 
 
 
236 aa  42.7  0.005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000000502541  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2308  hypothetical protein  44.68 
 
 
236 aa  42.7  0.005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.000000011894  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2514  hypothetical protein  45.65 
 
 
222 aa  42.4  0.006  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00000000941617  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0255  methyltransferase type 12  29.51 
 
 
211 aa  42.4  0.006  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.0188144 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1880  methionine biosynthesis protein MetW  33.33 
 
 
242 aa  42.4  0.007  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.0239131 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2289  methyltransferase type 11  38.1 
 
 
236 aa  42  0.008  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00000192074  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0403  Methyltransferase type 12  25.29 
 
 
252 aa  42  0.008  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1394  methyltransferase type 11  26.17 
 
 
248 aa  42  0.009  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2276  methyltransferase  42.55 
 
 
236 aa  41.6  0.01  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  4.19659e-16  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>