More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Vapar_4270 on replicon NC_012791
Organism: Variovorax paradoxus S110



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012791  Vapar_4270  Methyltransferase type 11  100 
 
 		 299 aa  613  1e-175  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0859626  n/a   
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5795  Methyltransferase type 11  54.23 
 
 		 293 aa  306  2.0000000000000002e-82  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4266  methyltransferase type 11  40.78 
 
 		 256 aa  69.7  0.00000000005  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.985163  normal  0.26538 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4696  methyltransferase type 11  43.01 
 
 		 256 aa  65.9  0.0000000008  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.219462 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_20390  2-polyprenyl-3-methyl-5-hydroxy-6-metoxy-1, 4-benzoquinol methylase  37.84 
 
 		 245 aa  65.1  0.000000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0797828  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3006  methyltransferase type 11  30.06 
 
 		 305 aa  62.8  0.000000008  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0356  ArsR family transcriptional regulator  37.62 
 
 		 304 aa  62.4  0.000000009  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.208931  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2579  transcriptional regulator, ArsR family  33.61 
 
 		 312 aa  58.9  0.0000001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1327  methyltransferase  29.51 
 
 		 258 aa  57.8  0.0000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0582471  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4083  methyltransferase type 11  36.28 
 
 		 257 aa  57.8  0.0000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.189475  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1742  Methyltransferase type 11  31.5 
 
 		 247 aa  58.2  0.0000002  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.455146  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_10980  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase  34.17 
 
 		 296 aa  57  0.0000004  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2348  methyltransferase type 11  34.21 
 
 		 307 aa  56.6  0.0000004  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0100199  normal  0.0140968 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0808  methyltransferase type 11  40.82 
 
 		 182 aa  56.6  0.0000005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0203629 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2400  methyltransferase type 11  32.69 
 
 		 330 aa  56.6  0.0000005  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00744372 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6064  Methyltransferase type 11  29.63 
 
 		 331 aa  56.2  0.0000007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0147  Methyltransferase type 11  36.84 
 
 		 240 aa  55.8  0.0000007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.610455 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0039  ArsR family transcriptional regulator  32.32 
 
 		 309 aa  55.8  0.0000008  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2300  methyltransferase type 11  35.04 
 
 		 260 aa  55.1  0.000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2302  transcriptional regulator, ArsR family  35.05 
 
 		 309 aa  55.5  0.000001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3135  ArsR family transcriptional regulator  33.67 
 
 		 348 aa  55.1  0.000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3265  methyltransferase type 11  32.87 
 
 		 241 aa  55.1  0.000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1168  Methyltransferase type 11  31.82 
 
 		 267 aa  55.1  0.000001  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5124  methyltransferase type 11  32.87 
 
 		 241 aa  55.1  0.000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.306844 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1781  methyltransferase type 11  37.76 
 
 		 285 aa  55.1  0.000002  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.33334  hitchhiker  0.000337573 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0607  methyltransferase type 11  37.76 
 
 		 285 aa  55.1  0.000002  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.21069  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1957  methyltransferase type 11  36.7 
 
 		 236 aa  55.1  0.000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.476882  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0632  biotin synthesis protein BioC  36.26 
 
 		 312 aa  54.7  0.000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000104697  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1705  Methyltransferase type 11  34.09 
 
 		 234 aa  53.9  0.000003  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2367  Methyltransferase type 11  31.88 
 
 		 270 aa  54.3  0.000003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2101  ArsR family transcriptional regulator  34.48 
 
 		 317 aa  54.3  0.000003  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4269  methyltransferase type 11  32.5 
 
 		 332 aa  53.5  0.000004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.589079  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3047  Methyltransferase type 11  33.88 
 
 		 244 aa  53.5  0.000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0374295  normal  0.16298 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1721  methyltransferase type 11  35.63 
 
 		 309 aa  53.9  0.000004  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0157757  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2090  methyltransferase type 11  32.5 
 
 		 341 aa  53.5  0.000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0798  UbiE/COQ5 methyltransferase  29.19 
 
 		 259 aa  52.8  0.000007  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.350389 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1164  methyltransferase type 11  35.71 
 
 		 267 aa  52.4  0.000008  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.1312  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3137  UDP-N-acetylglucosamine 1-carboxyvinyltransferase  26.51 
 
 		 558 aa  52.4  0.000009  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.785759  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0880  amidohydrolase  35 
 
 		 629 aa  52  0.00001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1868  methyltransferase type 11  34.44 
 
 		 263 aa  52  0.00001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00760268  decreased coverage  0.000000322294 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1859  methyltransferase type 11  32.2 
 
 		 328 aa  51.6  0.00001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.48002  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2935  Methyltransferase type 11  30.94 
 
 		 320 aa  52  0.00001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1840  methyltransferase type 11  32.2 
 
 		 328 aa  51.6  0.00001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1906  methyltransferase type 11  32.2 
 
 		 328 aa  51.6  0.00001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1843  Methyltransferase type 11  31.4 
 
 		 209 aa  52  0.00001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4822  Methyltransferase type 11  36.73 
 
 		 233 aa  51.2  0.00002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3603  Methyltransferase type 11  32.73 
 
 		 269 aa  51.6  0.00002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000473766 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13054  hypothetical protein  27.81 
 
 		 327 aa  51.2  0.00002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.100828 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3338  Methyltransferase type 11  34.26 
 
 		 210 aa  51.2  0.00002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2619  transcriptional regulator, ArsR family  35.71 
 
 		 341 aa  51.6  0.00002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.38929  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1880  transcriptional regulator, ArsR family  32.67 
 
 		 354 aa  51.2  0.00002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.265795 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1599  methyltransferase type 11  32.67 
 
 		 349 aa  51.6  0.00002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.318356  normal  0.150084 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3576  Methyltransferase type 11  35.96 
 
 		 457 aa  50.8  0.00003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0427  hypothetical protein  35.35 
 
 		 241 aa  50.4  0.00003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.142898  normal  0.178021 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0358  methyltransferase type 11  30.58 
 
 		 362 aa  50.8  0.00003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3477  Methyltransferase type 11  38.14 
 
 		 187 aa  50.8  0.00003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.124831  normal  0.285215 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3143  hypothetical protein  28.72 
 
 		 216 aa  50.4  0.00003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0708214  normal  0.0392147 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3308  demethylmenaquinone methyltransferase  33.04 
 
 		 256 aa  50.8  0.00003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.717606 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2088  methyltransferase type 11  32.99 
 
 		 258 aa  50.8  0.00003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2404  Methyltransferase type 11  31.09 
 
 		 226 aa  50.4  0.00003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1451  ArsR family transcriptional regulator  28.24 
 
 		 341 aa  50.1  0.00004  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.166117  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1330  Methyltransferase type 11  26.96 
 
 		 252 aa  50.1  0.00004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1407  ArsR family transcriptional regulator  28.24 
 
 		 341 aa  50.1  0.00004  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.440659  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1462  methyltransferase type 11  34.69 
 
 		 285 aa  50.1  0.00005  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.032097 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0214  UbiE/COQ5 family methlytransferase  28.12 
 
 		 256 aa  50.1  0.00005  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00594444  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2029  ArsR family transcriptional regulator  31.15 
 
 		 337 aa  50.1  0.00005  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.308683  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1458  methyltransferase type 11  32.71 
 
 		 265 aa  50.1  0.00005  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0215  UbiE/COQ5 family methlytransferase  28.12 
 
 		 256 aa  49.7  0.00006  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.383656  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2879  transcriptional regulator, ArsR family  28.74 
 
 		 341 aa  49.7  0.00006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.22791  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6684  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  32.17 
 
 		 230 aa  49.7  0.00006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.00241192  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1224  methyltransferase type 11  31.86 
 
 		 206 aa  49.7  0.00006  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0222  methyltransferase, UbiE/COQ5 family  29.52 
 
 		 256 aa  49.7  0.00007  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.188409  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2783  Methyltransferase type 11  37.36 
 
 		 190 aa  49.3  0.00007  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1805  Methyltransferase type 11  35.29 
 
 		 264 aa  49.3  0.00007  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.440612  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0355  methyltransferase type 11  28.21 
 
 		 299 aa  49.3  0.00007  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.970356 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4779  Methyltransferase type 11  30.08 
 
 		 264 aa  49.3  0.00008  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00766265 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0312  Methyltransferase type 11  33.98 
 
 		 232 aa  49.3  0.00008  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4364  ArsR family transcriptional regulator  36.89 
 
 		 327 aa  48.9  0.00009  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0368446  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0211  methyltransferase type 11  28.47 
 
 		 266 aa  49.3  0.00009  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0237  methyltransferase type 11  29.86 
 
 		 259 aa  48.9  0.00009  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.635147  decreased coverage  0.000545483 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3459  diguanylate cyclase with PAS/PAC sensor  33.71 
 
 		 503 aa  48.9  0.00009  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1264  type 11 methyltransferase  32.69 
 
 		 262 aa  48.9  0.0001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.086933  normal  0.147611 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1558  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  26.09 
 
 		 241 aa  48.9  0.0001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1722  methyltransferase type 11  28.98 
 
 		 341 aa  48.5  0.0001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0427  hypothetical protein  30.63 
 
 		 244 aa  48.9  0.0001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1760  methyltransferase type 11  28.77 
 
 		 320 aa  48.5  0.0001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1528  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  26.09 
 
 		 241 aa  48.9  0.0001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.828667  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2096  type 11 methyltransferase  28.36 
 
 		 207 aa  48.5  0.0001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.423415  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0047  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  32.17 
 
 		 223 aa  48.9  0.0001  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.601084 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4023  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  23.6 
 
 		 240 aa  48.5  0.0001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.712508 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0944  hypothetical protein  30.58 
 
 		 242 aa  48.9  0.0001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.162173  normal  0.410696 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0224  UbiE/COQ5 family methlytransferase  28.12 
 
 		 256 aa  48.5  0.0001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.234424  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0707  methyltransferase type 11  29.6 
 
 		 250 aa  48.5  0.0001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6455  methyltransferase type 11  31.15 
 
 		 316 aa  48.9  0.0001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00745461 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1514  arsenite S-adenosylmethyltransferase  35.05 
 
 		 280 aa  48.9  0.0001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.732855  normal  0.394631 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3430  Methyltransferase type 12  33.66 
 
 		 329 aa  48.5  0.0001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.723258  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4090  methyltransferase type 11  33.33 
 
 		 239 aa  48.5  0.0001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.860776  normal  0.999549 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4848  Methyltransferase type 11  28.4 
 
 		 310 aa  48.5  0.0001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0579  methyltransferase type 11  22.48 
 
 		 339 aa  48.5  0.0001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1640  transcriptional regulator, ArsR family  36.36 
 
 		 342 aa  48.9  0.0001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>