68 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ndas_1878 on replicon NC_014210
Organism: Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014210  Ndas_1878  Methyltransferase type 11  100 
 
 		 219 aa  437  9.999999999999999e-123  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1400  methyltransferase type 11  34.74 
 
 		 218 aa  74.7  0.000000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0823  cyclopropane-fatty-acyl-phospholipid synthase  30.97 
 
 		 260 aa  53.1  0.000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.589192 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2173  Methyltransferase type 11  34.04 
 
 		 252 aa  53.1  0.000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4652  Methyltransferase type 11  33.33 
 
 		 254 aa  52  0.000007  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.230067 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2609  Methyltransferase type 11  38.14 
 
 		 259 aa  52  0.000007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.337876 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1983  Methyltransferase type 11  27.54 
 
 		 252 aa  51.6  0.000009  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.600797 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2460  hypothetical protein  31.25 
 
 		 281 aa  51.2  0.00001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.171848  normal  0.0255916 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1144  Methyltransferase type 11  37.89 
 
 		 337 aa  50.8  0.00002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.344527  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4520  methyltransferase domain protein  31.97 
 
 		 783 aa  49.3  0.00005  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2810  Methyltransferase type 11  25.31 
 
 		 246 aa  48.9  0.00005  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.54366  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4865  Methyltransferase type 11  32.9 
 
 		 218 aa  48.5  0.00007  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.743669  normal  0.127304 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3030  type 12 methyltransferase  32.74 
 
 		 258 aa  48.5  0.00008  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.788601  normal  0.081497 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5792  Methyltransferase type 11  37.37 
 
 		 239 aa  48.5  0.00008  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0289  Mg-protoporphyrin IX methyl transferase  34.86 
 
 		 222 aa  47  0.0002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.705778  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1932  Mg-protoporphyrin IX methyl transferase  34.86 
 
 		 222 aa  47  0.0002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2935  methyltransferase type 11  26.17 
 
 		 249 aa  47.4  0.0002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0034  methyltransferase type 12  32.65 
 
 		 267 aa  47  0.0002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1779  Methyltransferase type 11  36.21 
 
 		 212 aa  46.6  0.0003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1995  methyltransferase type 11  34.65 
 
 		 287 aa  46.6  0.0003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.731995  normal  0.0329645 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1804  hypothetical protein  31.63 
 
 		 832 aa  46.6  0.0003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.80698  normal  0.0920937 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0077  trans-aconitate methyltransferase  33.33 
 
 		 258 aa  46.2  0.0004  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8438  SAM-dependent methyltransferase, putative  33.68 
 
 		 258 aa  45.8  0.0005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3917  Methyltransferase type 11  38.57 
 
 		 243 aa  45.1  0.0008  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0024  biotin biosynthesis protein BioC  29.59 
 
 		 283 aa  45.1  0.0008  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00323673  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1264  type 11 methyltransferase  34.19 
 
 		 262 aa  44.7  0.001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.086933  normal  0.147611 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3332  Methyltransferase type 11  30.6 
 
 		 268 aa  44.3  0.001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1234  Methyltransferase type 12  34 
 
 		 277 aa  45.1  0.001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.792867  normal  0.802761 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3179  methyltransferase type 11  25.81 
 
 		 250 aa  44.3  0.001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0194529  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2119  Methyltransferase type 12  38.46 
 
 		 234 aa  44.3  0.001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.54361  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1979  methyltransferase type 11  33.01 
 
 		 240 aa  44.7  0.001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.950841 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1612  Methyltransferase type 11  29.91 
 
 		 255 aa  44.7  0.001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.227144  normal  0.791841 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0144  dethiobiotin synthase  36.11 
 
 		 474 aa  44.3  0.001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.211479  normal  0.0379424 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3259  hypothetical protein  24.14 
 
 		 248 aa  43.9  0.002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.454805 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0890  hypothetical protein  24.09 
 
 		 227 aa  43.9  0.002  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1176  UbiE/COQ5 methyltransferase  31.96 
 
 		 230 aa  43.9  0.002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0192927  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1146  Methyltransferase type 11  30.85 
 
 		 251 aa  43.9  0.002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.114976  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0888  methyltransferase type 12  38.95 
 
 		 208 aa  43.9  0.002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.526384  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1232  methyltransferase type 11  31.18 
 
 		 238 aa  44.3  0.002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.976917  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1742  Methyltransferase type 11  31.37 
 
 		 247 aa  43.9  0.002  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.455146  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5330  trans-aconitate 2-methyltransferase  34.31 
 
 		 260 aa  43.9  0.002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.270812  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3418  methyltransferase type 12  33.64 
 
 		 275 aa  43.5  0.003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.137162  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00659  2-polyprenyl-3-methyl-5-hydroxy-6-metoxy-1,4- benzoquinol methylase  29.14 
 
 		 250 aa  43.1  0.003  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1261  hypothetical protein  34.04 
 
 		 250 aa  43.1  0.003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_01566  conserved hypothetical protein  33.33 
 
 		 279 aa  43.1  0.003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.145995  normal  0.121317 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6705  Methyltransferase type 11  54.29 
 
 		 810 aa  42.7  0.004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006663  SEA0014  UbiE/COQ5 family methlytransferase  24.24 
 
 		 244 aa  42.7  0.004  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4934  Methyltransferase type 11  25 
 
 		 332 aa  43.1  0.004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.310878 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1006  Mg-protoporphyrin IX methyl transferase  31.82 
 
 		 222 aa  42.7  0.004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.788103  normal  0.633954 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1229  Methyltransferase type 12  32.67 
 
 		 309 aa  42.7  0.004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6020  Trans-aconitate 2-methyltransferase  24.38 
 
 		 252 aa  42.4  0.005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3939  trans-aconitate 2-methyltransferase  22.56 
 
 		 255 aa  42.7  0.005  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4566  putative S-adenosyl-L-methionine (SAM)-dependent methyltransferase  34.31 
 
 		 285 aa  42.7  0.005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.343396 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3089  putative methyltransferase  36.08 
 
 		 241 aa  42.4  0.006  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0996  Methyltransferase type 11  28.38 
 
 		 246 aa  42.4  0.006  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0807  Methyltransferase type 11  25 
 
 		 200 aa  42  0.006  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0780  Methyltransferase type 11  25 
 
 		 200 aa  42  0.006  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0395  biotin biosynthesis protein BioC  32.04 
 
 		 272 aa  42  0.007  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0883344  normal  0.752327 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4949  methyltransferase type 11  28.87 
 
 		 256 aa  42  0.007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0973  methyltransferase type 11  28.67 
 
 		 266 aa  42  0.007  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1194  methyltransferase type 11  30.77 
 
 		 256 aa  42  0.007  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10570  benzoquinone methyltransferase  40.3 
 
 		 241 aa  42  0.007  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.175539  normal  0.480356 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2768  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  26.19 
 
 		 247 aa  41.6  0.008  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2568  methyltransferase type 11  33.33 
 
 		 199 aa  42  0.008  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1339  Methyltransferase type 11  27.27 
 
 		 247 aa  42  0.008  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.150557  normal  0.123836 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3362  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase ubie  25 
 
 		 251 aa  42  0.008  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3804  Cyclopropane-fatty-acyl-phospholipid synthase  33.33 
 
 		 456 aa  41.6  0.009  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.119292  normal  0.179835 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2370  methyltransferase type 11  24.61 
 
 		 219 aa  41.6  0.01  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00258532 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>