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for query gene Svir_19560 on replicon NC_013159
Organism: Saccharomonospora viridis DSM 43017



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Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013159  Svir_19560  arabinose efflux permease family protein  100 
 
 		 552 aa  1080    Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.301888  normal  0.424094 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4396  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  55.13 
 
 		 526 aa  520  1e-146  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_23370  arabinose efflux permease family protein  51.52 
 
 		 535 aa  487  1e-136  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.517259  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0970  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  50.69 
 
 		 737 aa  483  1e-135  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1011  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  49.59 
 
 		 522 aa  481  1e-134  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0466  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  52.02 
 
 		 575 aa  479  1e-134  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.614591  normal  0.0769795 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2369  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  48.85 
 
 		 555 aa  479  1e-134  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.528601  normal  0.618021 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4795  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  52.16 
 
 		 534 aa  476  1e-133  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.29039  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4620  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  52.25 
 
 		 566 aa  476  1e-133  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.226241  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0331  EmrB/QacA subfamily drug resistance transporter  46.94 
 
 		 571 aa  476  1e-133  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2523  major facilitator superfamily MFS_1  51.19 
 
 		 551 aa  476  1e-133  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.76417  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0854  EmrB/QacA family drug resistance transporter  51.12 
 
 		 711 aa  467  9.999999999999999e-131  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5055  EmrB/QacA family drug resistance transporter  48.06 
 
 		 522 aa  447  1.0000000000000001e-124  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.663135  normal  0.937687 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0773  major facilitator transporter  49.51 
 
 		 518 aa  443  1e-123  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3948  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  50.1 
 
 		 524 aa  439  9.999999999999999e-123  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.448257  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3513  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  45.83 
 
 		 850 aa  435  1e-121  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0296  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  49.38 
 
 		 531 aa  434  1e-120  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5709  major facilitator transporter  48.82 
 
 		 578 aa  419  1e-116  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.494905  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6564  EmrB/QacA family drug resistance transporter  45.99 
 
 		 526 aa  417  9.999999999999999e-116  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.569718  normal  0.0165949 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4865  major facilitator superfamily MFS_1  49.09 
 
 		 477 aa  416  9.999999999999999e-116  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_33640  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  47.12 
 
 		 575 aa  409  1e-113  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.179116  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2821  major facilitator superfamily MFS_1  47.24 
 
 		 544 aa  399  9.999999999999999e-111  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00501587 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2169  EmrB/QacA family drug resistance transporter  45.23 
 
 		 554 aa  382  1e-105  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_01490  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  44.47 
 
 		 624 aa  380  1e-104  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1314  EmrB/QacA subfamily drug resistance transporter  39.55 
 
 		 535 aa  342  1e-92  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  decreased coverage  0.00952843  normal  0.308238 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_08840  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  36.07 
 
 		 592 aa  334  3e-90  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4394  major facilitator superfamily MFS_1  41.1 
 
 		 538 aa  332  9e-90  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.497016  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5486  major facilitator superfamily MFS_1  39.25 
 
 		 584 aa  322  8e-87  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0573143  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6232  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  40.12 
 
 		 535 aa  322  9.999999999999999e-87  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3709  EmrB/QacA family drug resistance transporter  39.07 
 
 		 522 aa  314  2.9999999999999996e-84  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.486595  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3291  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  38.93 
 
 		 666 aa  312  1e-83  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.47407  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8653  Arabinose efflux permease-like protein  39.54 
 
 		 666 aa  307  3e-82  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5185  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  37.62 
 
 		 525 aa  306  6e-82  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.804488  normal  0.490544 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0550  tRNA-guanine transglycosylase, various specificities  36.76 
 
 		 1062 aa  304  3.0000000000000004e-81  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4090  EmrB/QacA family drug resistance transporter  38.46 
 
 		 523 aa  303  4.0000000000000003e-81  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.588022  normal  0.0353646 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8279  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  38.09 
 
 		 680 aa  303  7.000000000000001e-81  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.270413  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0391  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  36.07 
 
 		 530 aa  302  1e-80  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.979828  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1890  EmrB/QacA family drug resistance transporter  39.86 
 
 		 569 aa  302  1e-80  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2786  EmrB/QacA family drug resistance transporter  36.33 
 
 		 682 aa  301  2e-80  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3321  EmrB/QacA family drug resistance transporter  40.38 
 
 		 650 aa  300  3e-80  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.157992  normal  0.0742968 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2318  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  37.09 
 
 		 678 aa  298  1e-79  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2756  EmrB/QacA family drug resistance transporter  37.86 
 
 		 682 aa  299  1e-79  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2800  EmrB/QacA family drug resistance transporter  37.86 
 
 		 682 aa  299  1e-79  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.375758  normal  0.713659 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4864  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  36.38 
 
 		 685 aa  297  4e-79  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1036  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  37.2 
 
 		 672 aa  295  1e-78  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2480  EmrB/QacA family drug resistance transporter  36.17 
 
 		 504 aa  295  2e-78  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0662  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  36.28 
 
 		 525 aa  293  6e-78  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0717  EmrB/QacA family drug resistance transporter  38.76 
 
 		 558 aa  292  1e-77  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.770491 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0763  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  34.41 
 
 		 641 aa  291  2e-77  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0275  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  35.19 
 
 		 539 aa  290  4e-77  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.269312  normal  0.0148555 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4672  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  37.4 
 
 		 593 aa  290  6e-77  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.349364  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2050  EmrB/QacA family drug resistance transporter  39 
 
 		 516 aa  289  7e-77  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.851205  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3042  EmrB/QacA family drug resistance transporter  35.74 
 
 		 685 aa  289  8e-77  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.141693  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4163  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  38.02 
 
 		 676 aa  288  1e-76  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_14720  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  38.99 
 
 		 524 aa  287  4e-76  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.584953  normal  0.369508 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4890  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  37.5 
 
 		 513 aa  286  7e-76  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0326454  normal  0.212856 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3817  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  37.94 
 
 		 697 aa  285  1.0000000000000001e-75  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.00137036  normal  0.060926 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2988  EmrB/QacA family drug resistance transporter  38.66 
 
 		 514 aa  285  1.0000000000000001e-75  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1779  major facilitator superfamily multidrug efflux transporter  37.29 
 
 		 520 aa  285  1.0000000000000001e-75  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.38448  unclonable  0.00000000116602 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0614  EmrB/QacA family drug resistance transporter  33.79 
 
 		 607 aa  285  1.0000000000000001e-75  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.222069  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1465  EmrB/QacA family drug resistance transporter  38.48 
 
 		 504 aa  283  5.000000000000001e-75  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1299  EmrB/QacA family drug resistance transporter  38.48 
 
 		 504 aa  283  8.000000000000001e-75  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.144452  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0279  EmrB/QacA family drug resistance transporter  38.48 
 
 		 504 aa  283  8.000000000000001e-75  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.2584  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2111  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  37.53 
 
 		 528 aa  282  1e-74  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.534364  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2533  EmrB/QacA family drug resistance transporter  38.27 
 
 		 519 aa  281  3e-74  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_05770  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  37.73 
 
 		 528 aa  280  4e-74  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.148276  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1356  EmrB/QacA family drug resistance transporter  38.27 
 
 		 504 aa  280  4e-74  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.991135  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1016  EmrB/QacA family drug resistance transporter  38.27 
 
 		 504 aa  280  4e-74  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.80336  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0550  EmrB/QacA family drug resistance transporter  38.27 
 
 		 504 aa  280  4e-74  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.976745  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3285  EmrB/QacA family drug resistance transporter  38.66 
 
 		 501 aa  278  3e-73  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.791434 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4024  EmrB/QacA family drug resistance transporter  38.87 
 
 		 509 aa  277  4e-73  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.179138  normal  0.623334 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3357  EmrB/QacA family drug resistance transporter  37.47 
 
 		 505 aa  276  6e-73  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000299723 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1278  EmrB/QacA family drug resistance transporter  37.84 
 
 		 504 aa  275  1.0000000000000001e-72  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3702  EmrB/QacA family drug resistance transporter  38.88 
 
 		 509 aa  275  2.0000000000000002e-72  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4666  EmrB/QacA family drug resistance transporter  38.88 
 
 		 509 aa  275  2.0000000000000002e-72  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.481677  normal  0.435005 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3945  EmrB/QacA family drug resistance transporter  36.58 
 
 		 528 aa  273  4.0000000000000004e-72  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  hitchhiker  0.00181565  hitchhiker  0.00620132 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1157  EmrB/QacA family drug resistance transporter  37.42 
 
 		 504 aa  273  4.0000000000000004e-72  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.153598  normal  0.545064 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0241  EmrB/QacA family drug resistance transporter  35.59 
 
 		 523 aa  272  1e-71  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.232516  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4056  EmrB/QacA family drug resistance transporter  37.76 
 
 		 509 aa  272  1e-71  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.010273  normal  0.647251 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4024  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  34.55 
 
 		 562 aa  271  2e-71  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.736768  n/a   
 
 
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NC_010515  Bcenmc03_5634  EmrB/QacA family drug resistance transporter  37.21 
 
 		 504 aa  271  2e-71  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.327669 
 
 
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NC_013093  Amir_0306  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  36.61 
 
 		 555 aa  269  8e-71  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.509937  n/a   
 
 
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NC_013526  Tter_2612  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  32.02 
 
 		 565 aa  268  2e-70  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  unclonable  0.000000000331464  n/a   
 
 
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NC_013204  Elen_0210  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  38.15 
 
 		 592 aa  265  1e-69  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.852197 
 
 
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NC_010552  BamMC406_4512  EmrB/QacA family drug resistance transporter  37.34 
 
 		 504 aa  265  1e-69  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2560  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  35.15 
 
 		 557 aa  265  2e-69  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.577395  normal  0.137403 
 
 
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NC_009436  Ent638_0043  EmrB/QacA family drug resistance transporter  35.71 
 
 		 504 aa  263  4.999999999999999e-69  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.258133  normal  0.869121 
 
 
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NC_013521  Sked_23860  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  35.21 
 
 		 572 aa  263  8.999999999999999e-69  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0809765  normal  1 
 
 
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NC_009664  Krad_4278  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  34.72 
 
 		 685 aa  261  2e-68  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  decreased coverage  0.00129972  normal  0.114111 
 
 
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NC_008541  Arth_1179  EmrB/QacA family drug resistance transporter  34.69 
 
 		 538 aa  260  5.0000000000000005e-68  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  decreased coverage  0.00903391  n/a   
 
 
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NC_013552  DhcVS_1424  major facilitator family transporter  32.88 
 
 		 537 aa  257  4e-67  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.0000410629  n/a   
 
 
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NC_008463  PA14_03040  putative MFS transporter  35.86 
 
 		 501 aa  257  4e-67  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.479989  hitchhiker  0.0000743098 
 
 
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NC_009656  PSPA7_0331  MFS family transporter  35.45 
 
 		 515 aa  257  5e-67  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_007973  Rmet_0017  EmrB/QacA family drug resistance transporter  35.88 
 
 		 528 aa  256  7e-67  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_011886  Achl_1250  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  34.08 
 
 		 567 aa  252  1e-65  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000544425 
 
 
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NC_009664  Krad_2535  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  34.9 
 
 		 575 aa  251  2e-65  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_013757  Gobs_2339  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  39.24 
 
 		 918 aa  250  5e-65  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  decreased coverage  0.00297311  n/a   
 
 
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NC_013595  Sros_1258  EmrB/QacA family drug resistance transporter  38.14 
 
 		 485 aa  248  1e-64  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.645684 
 
 
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NC_010184  BcerKBAB4_0577  EmrB/QacA family drug resistance transporter  31.12 
 
 		 537 aa  247  4e-64  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_009674  Bcer98_0558  EmrB/QacA family drug resistance transporter  32.09 
 
 		 538 aa  247  4.9999999999999997e-64  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.00000222683  n/a   
 
 
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