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for query gene Amir_4865 on replicon NC_013093
Organism: Actinosynnema mirum DSM 43827



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Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013093  Amir_4865  major facilitator superfamily MFS_1  100 
 
 
477 aa  915    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4396  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  60.64 
 
 
526 aa  589  1e-167  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_23370  arabinose efflux permease family protein  60.79 
 
 
535 aa  584  1.0000000000000001e-165  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.517259  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2523  major facilitator superfamily MFS_1  62.78 
 
 
551 aa  570  1e-161  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.76417  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2369  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  55.22 
 
 
555 aa  513  1e-144  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.528601  normal  0.618021 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4795  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  56.39 
 
 
534 aa  506  9.999999999999999e-143  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.29039  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0466  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  50.7 
 
 
575 aa  481  1e-134  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.614591  normal  0.0769795 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5055  EmrB/QacA family drug resistance transporter  50.1 
 
 
522 aa  463  1e-129  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.663135  normal  0.937687 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0331  EmrB/QacA subfamily drug resistance transporter  49.21 
 
 
571 aa  462  1e-129  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3948  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  54.76 
 
 
524 aa  454  1.0000000000000001e-126  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.448257  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4620  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  50.51 
 
 
566 aa  450  1e-125  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.226241  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1011  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  50.4 
 
 
522 aa  451  1e-125  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0773  major facilitator transporter  56.74 
 
 
518 aa  446  1.0000000000000001e-124  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0970  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  51.49 
 
 
737 aa  443  1e-123  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5709  major facilitator transporter  55.56 
 
 
578 aa  432  1e-120  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.494905  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_19560  arabinose efflux permease family protein  49.19 
 
 
552 aa  429  1e-119  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.301888  normal  0.424094 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0296  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  47.04 
 
 
531 aa  425  1e-118  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0854  EmrB/QacA family drug resistance transporter  50.7 
 
 
711 aa  425  1e-117  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3513  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  46.99 
 
 
850 aa  419  1e-116  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_33640  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  46.41 
 
 
575 aa  413  1e-114  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.179116  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2821  major facilitator superfamily MFS_1  52.03 
 
 
544 aa  413  1e-114  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00501587 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_01490  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  51.33 
 
 
624 aa  391  1e-107  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6564  EmrB/QacA family drug resistance transporter  41.73 
 
 
526 aa  360  2e-98  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.569718  normal  0.0165949 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2169  EmrB/QacA family drug resistance transporter  47 
 
 
554 aa  344  2e-93  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1890  EmrB/QacA family drug resistance transporter  44.02 
 
 
569 aa  332  1e-89  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1314  EmrB/QacA subfamily drug resistance transporter  39.55 
 
 
535 aa  321  1.9999999999999998e-86  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  decreased coverage  0.00952843  normal  0.308238 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5486  major facilitator superfamily MFS_1  44.58 
 
 
584 aa  320  3.9999999999999996e-86  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0573143  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4394  major facilitator superfamily MFS_1  41.97 
 
 
538 aa  317  3e-85  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.497016  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5185  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  39.45 
 
 
525 aa  311  2e-83  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.804488  normal  0.490544 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6232  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  43.57 
 
 
535 aa  307  2.0000000000000002e-82  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3709  EmrB/QacA family drug resistance transporter  40.71 
 
 
522 aa  298  2e-79  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.486595  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8279  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  39.22 
 
 
680 aa  291  2e-77  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.270413  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4090  EmrB/QacA family drug resistance transporter  40.71 
 
 
523 aa  289  9e-77  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.588022  normal  0.0353646 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0550  tRNA-guanine transglycosylase, various specificities  39.07 
 
 
1062 aa  288  1e-76  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3291  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  37.42 
 
 
666 aa  285  2.0000000000000002e-75  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.47407  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8653  Arabinose efflux permease-like protein  39.08 
 
 
666 aa  283  4.0000000000000003e-75  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1465  EmrB/QacA family drug resistance transporter  42.08 
 
 
504 aa  282  8.000000000000001e-75  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1299  EmrB/QacA family drug resistance transporter  42.08 
 
 
504 aa  282  1e-74  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.144452  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2050  EmrB/QacA family drug resistance transporter  37.3 
 
 
516 aa  281  1e-74  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.851205  normal 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0279  EmrB/QacA family drug resistance transporter  42.08 
 
 
504 aa  282  1e-74  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.2584  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1356  EmrB/QacA family drug resistance transporter  42.08 
 
 
504 aa  281  2e-74  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.991135  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2533  EmrB/QacA family drug resistance transporter  41.83 
 
 
519 aa  280  4e-74  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2756  EmrB/QacA family drug resistance transporter  38.3 
 
 
682 aa  280  4e-74  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2800  EmrB/QacA family drug resistance transporter  38.3 
 
 
682 aa  280  4e-74  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.375758  normal  0.713659 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2786  EmrB/QacA family drug resistance transporter  38.3 
 
 
682 aa  280  4e-74  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1016  EmrB/QacA family drug resistance transporter  41.83 
 
 
504 aa  280  5e-74  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.80336  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0550  EmrB/QacA family drug resistance transporter  41.83 
 
 
504 aa  280  5e-74  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.976745  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2480  EmrB/QacA family drug resistance transporter  35.74 
 
 
504 aa  279  6e-74  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4864  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  37.24 
 
 
685 aa  279  7e-74  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1278  EmrB/QacA family drug resistance transporter  41.83 
 
 
504 aa  278  1e-73  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1779  major facilitator superfamily multidrug efflux transporter  40.66 
 
 
520 aa  278  2e-73  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.38448  unclonable  0.00000000116602 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0662  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  40.44 
 
 
525 aa  277  2e-73  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_08840  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  34.58 
 
 
592 aa  277  3e-73  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4890  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  40.43 
 
 
513 aa  277  3e-73  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0326454  normal  0.212856 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0614  EmrB/QacA family drug resistance transporter  38.28 
 
 
607 aa  277  4e-73  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.222069  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0717  EmrB/QacA family drug resistance transporter  42.18 
 
 
558 aa  276  6e-73  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.770491 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0763  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  37.67 
 
 
641 aa  276  6e-73  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4056  EmrB/QacA family drug resistance transporter  38.97 
 
 
509 aa  276  7e-73  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.010273  normal  0.647251 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4512  EmrB/QacA family drug resistance transporter  40 
 
 
504 aa  276  8e-73  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3702  EmrB/QacA family drug resistance transporter  38.26 
 
 
509 aa  275  1.0000000000000001e-72  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4163  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  38.71 
 
 
676 aa  275  1.0000000000000001e-72  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4666  EmrB/QacA family drug resistance transporter  38.26 
 
 
509 aa  275  1.0000000000000001e-72  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.481677  normal  0.435005 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5634  EmrB/QacA family drug resistance transporter  38.03 
 
 
504 aa  272  1e-71  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.327669 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4024  EmrB/QacA family drug resistance transporter  39.32 
 
 
509 aa  271  2e-71  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.179138  normal  0.623334 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0241  EmrB/QacA family drug resistance transporter  38.62 
 
 
523 aa  270  2.9999999999999997e-71  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.232516  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1157  EmrB/QacA family drug resistance transporter  39.75 
 
 
504 aa  270  2.9999999999999997e-71  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.153598  normal  0.545064 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2318  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  35.01 
 
 
678 aa  270  4e-71  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3042  EmrB/QacA family drug resistance transporter  37.5 
 
 
685 aa  270  4e-71  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.141693  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0391  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  37.18 
 
 
530 aa  270  5e-71  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.979828  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0275  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  38.26 
 
 
539 aa  269  5.9999999999999995e-71  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.269312  normal  0.0148555 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3945  EmrB/QacA family drug resistance transporter  39.44 
 
 
528 aa  269  1e-70  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  hitchhiker  0.00181565  hitchhiker  0.00620132 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3321  EmrB/QacA family drug resistance transporter  37.68 
 
 
650 aa  269  1e-70  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.157992  normal  0.0742968 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3285  EmrB/QacA family drug resistance transporter  38.05 
 
 
501 aa  268  2e-70  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.791434 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4024  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  38.14 
 
 
562 aa  266  5e-70  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.736768  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3817  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  36.36 
 
 
697 aa  266  5.999999999999999e-70  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.00137036  normal  0.060926 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3357  EmrB/QacA family drug resistance transporter  38.53 
 
 
505 aa  264  3e-69  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000299723 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1036  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  38.26 
 
 
672 aa  263  4.999999999999999e-69  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4672  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  39.43 
 
 
593 aa  263  4.999999999999999e-69  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.349364  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_05770  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  37.74 
 
 
528 aa  262  8e-69  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.148276  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0210  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  35.4 
 
 
592 aa  260  4e-68  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.852197 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2612  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  36.81 
 
 
565 aa  257  3e-67  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  unclonable  0.000000000331464  n/a   
 
 
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NC_013411  GYMC61_3298  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  35.66 
 
 
538 aa  256  6e-67  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
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NC_013093  Amir_0306  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  36.74 
 
 
555 aa  254  3e-66  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.509937  n/a   
 
 
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NC_013169  Ksed_14720  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  39.49 
 
 
524 aa  249  5e-65  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.584953  normal  0.369508 
 
 
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NC_013552  DhcVS_1424  major facilitator family transporter  35.61 
 
 
537 aa  249  6e-65  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.0000410629  n/a   
 
 
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NC_013595  Sros_4211  EmrB/QacA family drug resistance transporter  36.24 
 
 
491 aa  249  6e-65  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.539583  hitchhiker  0.00153857 
 
 
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NC_013595  Sros_1258  EmrB/QacA family drug resistance transporter  38.52 
 
 
485 aa  249  8e-65  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.645684 
 
 
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NC_007333  Tfu_2988  EmrB/QacA family drug resistance transporter  39.75 
 
 
514 aa  248  1e-64  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
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NC_009436  Ent638_0043  EmrB/QacA family drug resistance transporter  37.81 
 
 
504 aa  249  1e-64  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.258133  normal  0.869121 
 
 
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NC_008541  Arth_1179  EmrB/QacA family drug resistance transporter  35.37 
 
 
538 aa  245  9.999999999999999e-64  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  decreased coverage  0.00903391  n/a   
 
 
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NC_013946  Mrub_0144  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  38.81 
 
 
890 aa  244  3e-63  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.00000517573  normal 
 
 
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NC_013510  Tcur_0224  major facilitator superfamily MFS_1  35.9 
 
 
489 aa  243  5e-63  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
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NC_009484  Acry_2437  major facilitator transporter  34.85 
 
 
494 aa  242  9e-63  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.516021  n/a   
 
 
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NC_009664  Krad_4278  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  37.67 
 
 
685 aa  241  2e-62  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  decreased coverage  0.00129972  normal  0.114111 
 
 
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NC_007650  BTH_II0295  EmrB/QacA family drug resistance transporter  35.98 
 
 
565 aa  241  2e-62  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
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NC_011369  Rleg2_3811  major facilitator superfamily MFS_1  34.86 
 
 
512 aa  241  2.9999999999999997e-62  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
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NC_009767  Rcas_2747  EmrB/QacA family drug resistance transporter  37.83 
 
 
500 aa  240  2.9999999999999997e-62  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
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NC_011886  Achl_1250  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  35.89 
 
 
567 aa  239  6.999999999999999e-62  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000544425 
 
 
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NC_013521  Sked_23860  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  35.71 
 
 
572 aa  239  1e-61  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0809765  normal 
 
 
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NC_009664  Krad_2535  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  35.83 
 
 
575 aa  237  3e-61  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
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