More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Svir_18260 on replicon NC_013159
Organism: Saccharomonospora viridis DSM 43017



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013159  Svir_18260  arabinose efflux permease family protein  100 
 
 		 438 aa  856    Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.897354  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1913  General substrate transporter  59.45 
 
 		 463 aa  493  9.999999999999999e-139  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.168957  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2302  General substrate transporter  55.48 
 
 		 444 aa  484  1e-135  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000263865 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0015  major facilitator superfamily MFS_1  56.46 
 
 		 456 aa  473  1e-132  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.170297  normal  0.0989418 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2568  general substrate transporter  54.11 
 
 		 444 aa  472  1e-132  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_20210  arabinose efflux permease family protein  54 
 
 		 452 aa  446  1.0000000000000001e-124  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.272116  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_33020  arabinose efflux permease family protein  42.55 
 
 		 446 aa  317  2e-85  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.471979  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2955  major facilitator superfamily MFS_1  42.27 
 
 		 431 aa  308  1.0000000000000001e-82  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3998  General substrate transporter  44.42 
 
 		 430 aa  301  1e-80  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3577  major facilitator superfamily metabolite/H(+) symporter  38.46 
 
 		 437 aa  295  1e-78  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2798  metabolite/H+ symporter, major facilitator superfamily (MFS)  41.85 
 
 		 437 aa  294  2e-78  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.606232  normal  0.0553764 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_38440  Major Facilitator Superfamily transporter  38.58 
 
 		 442 aa  293  3e-78  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0243  major facilitator superfamily transporter metabolite/H(+) symporter  40.69 
 
 		 437 aa  293  3e-78  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.292556  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2499  major facilitator superfamily MFS_1  41.14 
 
 		 454 aa  293  5e-78  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7815  major facilitator superfamily MFS_1  39.76 
 
 		 442 aa  293  5e-78  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4541  major facilitator transporter  40.26 
 
 		 439 aa  291  1e-77  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.474963  normal  0.714624 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1490  major facilitator superfamily MFS_1  40.14 
 
 		 432 aa  291  2e-77  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.81003  normal  0.0711824 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1708  General substrate transporter  39.4 
 
 		 430 aa  290  4e-77  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5329  major facilitator superfamily MFS_1  41.63 
 
 		 440 aa  289  7e-77  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2383  major facilitator transporter  42 
 
 		 441 aa  287  2.9999999999999996e-76  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3906  major facilitator superfamily transporter  43.03 
 
 		 432 aa  286  7e-76  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.162053  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3818  major facilitator transporter  43.03 
 
 		 432 aa  286  7e-76  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.227675 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3832  major facilitator transporter  43.03 
 
 		 432 aa  286  7e-76  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.143168  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2032  major facilitator transporter  40 
 
 		 439 aa  285  1.0000000000000001e-75  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.450728  normal  0.16892 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3443  major facilitator transporter  37.56 
 
 		 439 aa  285  1.0000000000000001e-75  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.0269111 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4318  major facilitator transporter  39.95 
 
 		 439 aa  283  3.0000000000000004e-75  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3477  major facilitator transporter  39.95 
 
 		 439 aa  283  3.0000000000000004e-75  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0160202 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4048  major facilitator transporter  39.95 
 
 		 439 aa  283  3.0000000000000004e-75  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0869813  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3950  major facilitator transporter  39.3 
 
 		 439 aa  283  5.000000000000001e-75  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.728189 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1278  citrate-proton symport  42.14 
 
 		 456 aa  280  4e-74  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.258621  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2344  major facilitator transporter  40.95 
 
 		 461 aa  276  5e-73  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1794  major facilitator family transporter  37.23 
 
 		 433 aa  275  1.0000000000000001e-72  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0265236  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1587  major facilitator transporter  39.29 
 
 		 450 aa  275  1.0000000000000001e-72  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.891359  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1865  General substrate transporter  38.18 
 
 		 463 aa  273  4.0000000000000004e-72  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1469  major facilitator family transporter  41.72 
 
 		 438 aa  273  4.0000000000000004e-72  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0457955  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1015  general substrate transporter  40.32 
 
 		 438 aa  271  1e-71  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.383043 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_10040  nitrate/nitrite transporter  41.65 
 
 		 439 aa  271  1e-71  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2127  ABC transporter membrane spanning protein (sugar)  38.24 
 
 		 441 aa  271  2e-71  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2307  major facilitator superfamily transporter metabolite/H(+) symporter  38.73 
 
 		 452 aa  269  5.9999999999999995e-71  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4524  major facilitator transporter  39.25 
 
 		 439 aa  270  5.9999999999999995e-71  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.063118  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3902  major facilitator transporter  36.94 
 
 		 441 aa  269  7e-71  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0925  major facilitator transporter  36.21 
 
 		 439 aa  269  8e-71  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.291991  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5496  major facilitator transporter  35.92 
 
 		 435 aa  268  2e-70  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.499469  normal  0.463125 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4694  major facilitator transporter  36.47 
 
 		 439 aa  268  2e-70  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4788  general substrate transporter  37.56 
 
 		 461 aa  268  2e-70  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3580  major facilitator transporter  35.92 
 
 		 435 aa  268  2e-70  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4702  general substrate transporter  37.56 
 
 		 461 aa  268  2e-70  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.57172  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0374  major facilitator transporter  38.59 
 
 		 433 aa  267  2e-70  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5087  general substrate transporter  37.56 
 
 		 461 aa  268  2e-70  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.829473 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4787  major facilitator transporter  35.92 
 
 		 435 aa  268  2e-70  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.991397  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6110  major facilitator superfamily MFS_1  37.75 
 
 		 452 aa  267  2.9999999999999995e-70  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.92916 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4431  putative transmembrane transport protein (general substrate transporter)  36.51 
 
 		 468 aa  266  4e-70  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.90441  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1832  general substrate transporter  35.95 
 
 		 463 aa  266  4e-70  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.326977  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4172  major facilitator transporter  36.47 
 
 		 439 aa  266  4e-70  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.756648  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1848  major facilitator transporter  34.86 
 
 		 447 aa  266  4e-70  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.0276958 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1813  general substrate transporter  35.95 
 
 		 463 aa  266  4e-70  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0995372  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1879  general substrate transporter  35.95 
 
 		 463 aa  266  4e-70  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1269  multi-sensor signal transduction histidine kinase  40.91 
 
 		 839 aa  265  2e-69  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.834147 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1328  putative permease  34.56 
 
 		 436 aa  264  3e-69  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3334  major facilitator superfamily protein  39.12 
 
 		 439 aa  263  4e-69  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.998489 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5098  putative MFS superfamily transport protein  34.95 
 
 		 459 aa  263  4e-69  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.393625 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_17780  major facilitator transporter  37.77 
 
 		 469 aa  263  4.999999999999999e-69  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4531  general substrate transporter  37.56 
 
 		 456 aa  263  6e-69  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0663  general substrate transporter  38.75 
 
 		 435 aa  263  6.999999999999999e-69  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0269429  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7098  major facilitator transporter  38.28 
 
 		 456 aa  262  8e-69  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2608  major facilitator superfamily protein  37.83 
 
 		 441 aa  262  8e-69  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.495276 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2487  major facilitator transporter  38.82 
 
 		 445 aa  262  8.999999999999999e-69  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.911409  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1063  major facilitator superfamily metabolite/H(+) symporter  40.55 
 
 		 432 aa  261  1e-68  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_15920  major facilitator transporter  42.27 
 
 		 437 aa  262  1e-68  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.246808 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_19080  arabinose efflux permease family protein  38.59 
 
 		 443 aa  261  2e-68  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.297545  normal  0.79631 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4735  major facilitator transporter  38.35 
 
 		 445 aa  261  2e-68  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.110403  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3892  major facilitator transporter  38.35 
 
 		 445 aa  261  2e-68  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.50239  normal  0.071614 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3628  major facilitator transporter  38.35 
 
 		 445 aa  261  2e-68  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.804515 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2586  major facilitator superfamily MFS_1  37.5 
 
 		 435 aa  260  4e-68  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.900551  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2103  major facilitator superfamily metabolite/H(+) symporter  36.71 
 
 		 438 aa  260  4e-68  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_05660  metabolite-proton symporter  36.9 
 
 		 482 aa  259  5.0000000000000005e-68  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.232091  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3901  general substrate transporter  35.87 
 
 		 433 aa  259  6e-68  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0991  general substrate transporter  39.02 
 
 		 436 aa  259  6e-68  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0201608  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0863  general substrate transporter  39.29 
 
 		 437 aa  259  6e-68  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.139167  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0512  general substrate transporter  39.02 
 
 		 483 aa  259  7e-68  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.509539  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0851  general substrate transporter  39.53 
 
 		 437 aa  259  7e-68  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.80283  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0338  major facilitator family transporter  38.77 
 
 		 433 aa  259  9e-68  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0662361  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0951  general substrate transporter  39.02 
 
 		 436 aa  259  9e-68  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1437  major facilitator superfamily MFS_1  35.27 
 
 		 437 aa  258  1e-67  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3534  major facilitator transporter  38.12 
 
 		 460 aa  258  1e-67  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.554978  normal  0.678492 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5364  major facilitator transporter  38.12 
 
 		 460 aa  258  1e-67  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.556999 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1458  metabolite-proton symporter  40.78 
 
 		 432 aa  258  2e-67  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.202966  normal  0.170493 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2868  major facilitator transporter  38.14 
 
 		 444 aa  258  2e-67  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.590203  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2106  metabolite:proton symporter family protein  40 
 
 		 437 aa  258  2e-67  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.22377  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0376  major facilitator family transporter  38.14 
 
 		 444 aa  258  2e-67  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.538502  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2985  major facilitator family transporter  38.14 
 
 		 444 aa  258  2e-67  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.464085  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1226  major facilitator family transporter  38.14 
 
 		 444 aa  258  2e-67  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.278518  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3026  MFS transporter, metabolite:H+ symporter (MHS) family protein  39.76 
 
 		 437 aa  257  2e-67  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.531832  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4094  major facilitator transporter  38.3 
 
 		 436 aa  258  2e-67  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.237593  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4263  general substrate transporter  40.96 
 
 		 433 aa  258  2e-67  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2736  metabolite/H+ symporter, major facilitator superfamily (MFS)  38.71 
 
 		 438 aa  258  2e-67  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2159  major facilitator superfamily MFS_1  36.56 
 
 		 438 aa  258  2e-67  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1753  major facilitator family transporter  38.14 
 
 		 444 aa  258  2e-67  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1566  major facilitator family transporter  38.14 
 
 		 444 aa  258  2e-67  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2638  metabolite:proton symporter family protein  40 
 
 		 437 aa  258  2e-67  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>