More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Suden_0884 on replicon NC_007575
Organism: Sulfurimonas denitrificans DSM 1251



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007575  Suden_0884  two component transcriptional regulator  100 
 
 		 218 aa  436  1e-121  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.68851  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0097  response regulator receiver  42.92 
 
 		 222 aa  171  9e-42  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1365  two component transcriptional regulator  41.94 
 
 		 219 aa  162  3e-39  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  decreased coverage  0.00130586  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1324  extracellular solute-binding protein  39.73 
 
 		 220 aa  151  8e-36  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.273971  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1280  DNA-binding response regulator  37.96 
 
 		 220 aa  148  5e-35  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.0000547046  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1773  two component transcriptional regulator  36.53 
 
 		 217 aa  147  2.0000000000000003e-34  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0128  two-component response regulator  40.27 
 
 		 228 aa  146  2.0000000000000003e-34  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.4797  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0840  transcriptional activator protein CopR  36.36 
 
 		 222 aa  142  3e-33  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.048163  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0521  two component transcriptional regulator  33.79 
 
 		 223 aa  142  5e-33  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.720367  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4261  two component transcriptional regulator, winged helix family  34.68 
 
 		 224 aa  140  9.999999999999999e-33  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.906422  normal  0.0109867 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4228  winged helix family two component transcriptional regulator  36.04 
 
 		 509 aa  139  3e-32  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.290807  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5018  two component transcriptional regulator, winged helix family  35.14 
 
 		 226 aa  139  3e-32  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4222  two component transcriptional regulator, winged helix family  34.23 
 
 		 224 aa  138  6e-32  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2941  multi-component transcriptional regulator, winged helix family  32.58 
 
 		 652 aa  137  1e-31  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0136  transcriptional activator protein CopR  38.25 
 
 		 220 aa  137  2e-31  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1480  two component transcriptional regulator, winged helix family  36.24 
 
 		 219 aa  137  2e-31  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000681553  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_31270  response regulator with CheY-like receiver domain protein and winged-helix DNA-binding domain protein  33.02 
 
 		 221 aa  135  4e-31  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.014564  normal  0.249814 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3354  two component transcriptional regulator  34.72 
 
 		 220 aa  135  4e-31  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.44436  normal  1 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1806  two-component response regulator  34.72 
 
 		 220 aa  135  6.0000000000000005e-31  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1445  two component transcriptional regulator, winged helix family  34.23 
 
 		 225 aa  134  7.000000000000001e-31  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1416  two component transcriptional regulator, winged helix family  34.23 
 
 		 225 aa  134  7.000000000000001e-31  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1579  response regulator receiver  35.48 
 
 		 225 aa  134  8e-31  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.410227  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0535  two component transcriptional regulator  32.88 
 
 		 223 aa  133  1.9999999999999998e-30  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.660155  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4085  two component transcriptional regulator  34.68 
 
 		 225 aa  133  3e-30  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.320847 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2062  two component transcriptional regulator  36.32 
 
 		 228 aa  132  3e-30  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0133309  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0120  response regulator receiver  35.35 
 
 		 221 aa  131  6e-30  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1233  DNA-binding response regulator  34.84 
 
 		 222 aa  131  6.999999999999999e-30  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0842153  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0851  two component transcriptional regulator  33.33 
 
 		 222 aa  131  7.999999999999999e-30  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1162  putative two component system regulatory protein  33.94 
 
 		 233 aa  130  1.0000000000000001e-29  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0238  multi-component transcriptional regulator  33.48 
 
 		 1629 aa  130  2.0000000000000002e-29  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4693  two component transcriptional regulator, winged helix family  30.23 
 
 		 220 aa  129  2.0000000000000002e-29  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1244  DNA-binding response regulator  31.8 
 
 		 219 aa  129  3e-29  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000551267  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1478  two component transcriptional regulator  30.73 
 
 		 240 aa  129  3e-29  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000111909  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0644  two component transcriptional regulator  33.18 
 
 		 222 aa  129  3e-29  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.553024  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1294  two component transcriptional regulator, winged helix family  30.88 
 
 		 218 aa  129  3e-29  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0476117  hitchhiker  0.00354598 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2104  two component transcriptional regulator, winged helix family  31.82 
 
 		 225 aa  129  4.0000000000000003e-29  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.302064  normal  0.805943 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4628  two component transcriptional regulator, winged helix family  33.18 
 
 		 224 aa  129  4.0000000000000003e-29  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000289587 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2927  two component transcriptional regulator, winged helix family  31.98 
 
 		 224 aa  129  4.0000000000000003e-29  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0919  two component transcriptional regulator, winged helix family  30.28 
 
 		 223 aa  129  5.0000000000000004e-29  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.682864 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1477  response regulator receiver  32.37 
 
 		 222 aa  128  6e-29  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.932866  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1969  response regulator receiver domain-containing protein  33.33 
 
 		 219 aa  128  7.000000000000001e-29  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.478098  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0257  response regulator receiver  33.49 
 
 		 219 aa  128  7.000000000000001e-29  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0717  two component transcriptional regulator, winged helix family  30.32 
 
 		 226 aa  127  9.000000000000001e-29  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.000154116  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_01690  response regulator with CheY-like receiver domain and winged-helix DNA-binding domain  29.49 
 
 		 217 aa  127  1.0000000000000001e-28  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.459553  normal  0.405302 
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5471  two component transcriptional regulator  34.1 
 
 		 221 aa  127  1.0000000000000001e-28  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00800002  hitchhiker  0.0013378 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003784  two-component system response regulator QseB  31.34 
 
 		 219 aa  127  2.0000000000000002e-28  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000147394  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0604  two component transcriptional regulator  31.42 
 
 		 227 aa  126  2.0000000000000002e-28  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.00704602  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0429  response regulator receiver:transcriptional regulatory protein, C-terminal  32.41 
 
 		 223 aa  126  2.0000000000000002e-28  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.199286  decreased coverage  0.000258733 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0258  two component transcriptional regulator  33.02 
 
 		 217 aa  127  2.0000000000000002e-28  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.0200742  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0699  two component transcriptional regulator  31.48 
 
 		 220 aa  127  2.0000000000000002e-28  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0632  two component transcriptional regulator  31.42 
 
 		 227 aa  126  2.0000000000000002e-28  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.157641  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2762  two component transcriptional regulator, winged helix family  34.55 
 
 		 225 aa  125  3e-28  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1458  two component transcriptional regulator  30.88 
 
 		 218 aa  126  3e-28  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1723  multi-component transcriptional regulator, winged helix family  31.84 
 
 		 597 aa  126  3e-28  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000000776738 
 
 
-
 
NC_003296  RS02110  two-component response regulator transcription regulator protein  31.39 
 
 		 246 aa  125  4.0000000000000003e-28  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2474  heavy metal response regulator  31.56 
 
 		 223 aa  125  4.0000000000000003e-28  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3286  two component transcriptional regulator, winged helix family  33.03 
 
 		 228 aa  125  4.0000000000000003e-28  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.167791  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1103  two-component response regulator  36.28 
 
 		 221 aa  125  6e-28  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1917  DNA-binding response regulator  33.48 
 
 		 222 aa  125  6e-28  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3267  two component transcriptional regulator, winged helix family  31.02 
 
 		 220 aa  124  8.000000000000001e-28  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.387524  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2552  two component transcriptional regulator, winged helix family  30.49 
 
 		 230 aa  124  8.000000000000001e-28  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.0000276879  normal  0.180215 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02658  hypothetical protein  29.95 
 
 		 219 aa  124  1e-27  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2066  two component transcriptional regulator  32.57 
 
 		 225 aa  124  1e-27  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0102  two component heavy metal response transcriptional regulator  33.94 
 
 		 223 aa  124  1e-27  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.753235  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3235  DNA-binding response regulator  31.19 
 
 		 224 aa  124  1e-27  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2752  multi-component transcriptional regulator, winged helix family  32.88 
 
 		 799 aa  123  2e-27  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0801  two component transcriptional regulator  33.03 
 
 		 221 aa  123  2e-27  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.0203691 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0274  two component transcriptional regulator, winged helix family  29.28 
 
 		 232 aa  124  2e-27  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.701823  normal  0.83989 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1449  two component transcriptional regulator  29.86 
 
 		 246 aa  124  2e-27  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.566781  normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1792  DNA-binding response regulator  33.49 
 
 		 224 aa  122  3e-27  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0238902  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2815  response regulator receiver:transcriptional regulatory protein, C-terminal  30.56 
 
 		 218 aa  122  3e-27  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.877458  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1629  multi-component transcriptional regulator  35.37 
 
 		 613 aa  122  3e-27  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.703021  normal  0.230726 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3617  DNA-binding transcriptional regulator BasR  31.94 
 
 		 220 aa  123  3e-27  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.0000270917  normal  0.430126 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3674  two component transcriptional regulator  27.85 
 
 		 263 aa  122  3e-27  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.400914  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0802  two component transcriptional regulator  31.7 
 
 		 220 aa  122  3e-27  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2743  two component transcriptional regulator, winged helix family  32.58 
 
 		 228 aa  123  3e-27  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4163  two component transcriptional regulator  31.94 
 
 		 223 aa  122  4e-27  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3607  DNA-binding transcriptional regulator BasR  31.48 
 
 		 220 aa  122  4e-27  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000000202279  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3980  DNA-binding transcriptional regulator BasR  31.48 
 
 		 220 aa  122  4e-27  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00000564215  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3221  DNA-binding response regulator  30.73 
 
 		 224 aa  122  4e-27  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3444  two component transcriptional regulator  32.57 
 
 		 220 aa  122  4e-27  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.112849  normal  0.384843 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_63150  two-component response regulator  29.49 
 
 		 221 aa  122  4e-27  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.388672  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3741  DNA-binding transcriptional regulator BasR  31.48 
 
 		 220 aa  122  4e-27  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2033  DNA-binding response regulator  30.73 
 
 		 224 aa  122  5e-27  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.725953  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1034  two component transcriptional regulator, winged helix family  32.42 
 
 		 219 aa  122  5e-27  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.171933  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4064  two component transcriptional regulator  32.57 
 
 		 233 aa  121  6e-27  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.98903  normal  0.0666639 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0311  two component transcriptional regulator  29.82 
 
 		 232 aa  122  6e-27  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.280613 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1802  two component transcriptional regulator  31.67 
 
 		 227 aa  121  7e-27  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5497  DNA-binding response regulator  29.49 
 
 		 221 aa  121  7e-27  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.553345  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5311  two component transcriptional regulator  30.93 
 
 		 246 aa  121  8e-27  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.554395  normal  0.310406 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0558  two component transcriptional regulator, winged helix family  28.77 
 
 		 237 aa  121  8e-27  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0210  DNA-binding response regulator  30.28 
 
 		 225 aa  121  9e-27  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2619  two component transcriptional regulator, winged helix family  33.18 
 
 		 224 aa  121  9e-27  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.189992  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3686  response regulator receiver  33.03 
 
 		 233 aa  121  9e-27  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4347  two component transcriptional regulator  31.84 
 
 		 236 aa  121  9e-27  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4258  response regulator receiver  28.64 
 
 		 220 aa  121  9e-27  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0567705  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2944  two component transcriptional regulator  30.73 
 
 		 224 aa  121  9e-27  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0958095  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0389  winged helix family two component transcriptional regulator  32.72 
 
 		 224 aa  121  9e-27  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.667669  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0951  response regulator receiver protein  31.28 
 
 		 239 aa  121  9e-27  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.0000000111905  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1404  two component transcriptional regulator  30.63 
 
 		 229 aa  120  9.999999999999999e-27  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.153238  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>