More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CCV52592_0136 on replicon NC_009715
Organism: Campylobacter curvus 525.92



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009715  CCV52592_0136  transcriptional activator protein CopR  100 
 
 		 220 aa  446  1e-125  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0840  transcriptional activator protein CopR  59.28 
 
 		 222 aa  258  6e-68  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.048163  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0528  transcriptional activator protein CopR  58.64 
 
 		 220 aa  234  9e-61  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1324  extracellular solute-binding protein  50.45 
 
 		 220 aa  221  4.9999999999999996e-57  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.273971  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1280  DNA-binding response regulator  49.09 
 
 		 220 aa  215  5e-55  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.0000547046  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1358  DNA-binding response regulator  51.71 
 
 		 221 aa  202  4e-51  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.0519481  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1236  DNA-binding response regulator  51.71 
 
 		 221 aa  202  4e-51  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  hitchhiker  0.000000188808  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0128  two-component response regulator  49.77 
 
 		 228 aa  199  3e-50  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.4797  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1103  two-component response regulator  52.29 
 
 		 221 aa  197  7e-50  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0504  DNA-binding response regulator  50.73 
 
 		 221 aa  197  1.0000000000000001e-49  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  hitchhiker  0.000376141  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0097  response regulator receiver  41.55 
 
 		 222 aa  175  5e-43  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1365  two component transcriptional regulator  45.37 
 
 		 219 aa  164  9e-40  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  decreased coverage  0.00130586  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0120  response regulator receiver  40.18 
 
 		 221 aa  158  8e-38  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0884  two component transcriptional regulator  38.25 
 
 		 218 aa  144  8.000000000000001e-34  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.68851  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1330  response regulator receiver  32.57 
 
 		 219 aa  128  8.000000000000001e-29  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0386  two component transcriptional regulator  30.56 
 
 		 222 aa  125  4.0000000000000003e-28  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2440  two component transcriptional regulator  31.67 
 
 		 222 aa  124  8.000000000000001e-28  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0936231  normal  1 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1806  two-component response regulator  34.26 
 
 		 220 aa  124  9e-28  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0311  two component transcriptional regulator  31.22 
 
 		 232 aa  121  8e-27  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.280613 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4657  two component transcriptional regulator, winged helix family  32.67 
 
 		 240 aa  121  9e-27  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_04130  response regulator with CheY-like receiver domain and winged-helix DNA-binding domain  32.43 
 
 		 236 aa  120  1.9999999999999998e-26  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.118973  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0258  two component transcriptional regulator  32.56 
 
 		 217 aa  119  3e-26  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.0200742  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1773  two component transcriptional regulator  33.8 
 
 		 217 aa  119  3e-26  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1566  two component transcriptional regulator, winged helix family  31.82 
 
 		 228 aa  119  3e-26  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00435599 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3061  two component transcriptional regulator  30.26 
 
 		 229 aa  118  6e-26  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.296421  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0257  response regulator receiver  31.02 
 
 		 219 aa  117  1.9999999999999998e-25  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4258  response regulator receiver  27.52 
 
 		 220 aa  117  1.9999999999999998e-25  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0567705  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4793  two component transcriptional regulator, winged helix family  30.18 
 
 		 219 aa  117  1.9999999999999998e-25  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.732153 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3235  DNA-binding response regulator  32 
 
 		 224 aa  116  3e-25  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0521  two component transcriptional regulator  30.45 
 
 		 223 aa  115  5e-25  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.720367  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_31270  response regulator with CheY-like receiver domain protein and winged-helix DNA-binding domain protein  29.82 
 
 		 221 aa  115  5e-25  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.014564  normal  0.249814 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3221  DNA-binding response regulator  31.5 
 
 		 224 aa  114  8.999999999999998e-25  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2944  two component transcriptional regulator  32 
 
 		 224 aa  114  8.999999999999998e-25  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0958095  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1625  DNA-binding response regulator CsrR  33.18 
 
 		 229 aa  114  1.0000000000000001e-24  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.137799  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1458  two component transcriptional regulator  30.23 
 
 		 218 aa  114  1.0000000000000001e-24  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4970  two component transcriptional regulator  32.29 
 
 		 228 aa  114  1.0000000000000001e-24  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.375881  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2033  DNA-binding response regulator  31.5 
 
 		 224 aa  114  1.0000000000000001e-24  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.725953  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2999  DNA-binding response regulator  31.5 
 
 		 224 aa  113  2.0000000000000002e-24  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.227145  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3229  DNA-binding response regulator  31.5 
 
 		 224 aa  113  2.0000000000000002e-24  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0535  two component transcriptional regulator  30.65 
 
 		 223 aa  113  2.0000000000000002e-24  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.660155  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1213  two component transcriptional regulator, winged helix family  30.73 
 
 		 223 aa  113  3e-24  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0625  two component transcriptional regulator  30.4 
 
 		 217 aa  112  4.0000000000000004e-24  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5387  two component transcriptional regulator, winged helix family  35.71 
 
 		 236 aa  112  4.0000000000000004e-24  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1579  response regulator receiver  32.41 
 
 		 225 aa  112  5e-24  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.410227  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3651  two component transcriptional regulator, winged helix family  33.65 
 
 		 228 aa  112  6e-24  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.0435949 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2453  winged helix family two component transcriptional regulator  29.86 
 
 		 236 aa  112  6e-24  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.147888  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2765  two component transcriptional regulator, winged helix family  31.88 
 
 		 225 aa  110  1.0000000000000001e-23  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.497538  normal  0.0218205 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4628  two component transcriptional regulator, winged helix family  34.48 
 
 		 224 aa  110  1.0000000000000001e-23  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000289587 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4374  DNA-binding response regulator ColR  31.84 
 
 		 227 aa  110  1.0000000000000001e-23  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4070  response regulator receiver:transcriptional regulatory protein, C-terminal  31.84 
 
 		 227 aa  110  1.0000000000000001e-23  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0290724  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4693  two component transcriptional regulator, winged helix family  28.9 
 
 		 220 aa  110  1.0000000000000001e-23  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3383  two component transcriptional regulator  31.71 
 
 		 224 aa  110  1.0000000000000001e-23  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0737  two component transcriptional regulator, winged helix family  33.18 
 
 		 224 aa  111  1.0000000000000001e-23  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3352  two component transcriptional regulator, winged helix family  31.88 
 
 		 225 aa  110  1.0000000000000001e-23  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3620  two component transcriptional regulator, winged helix family  30.45 
 
 		 239 aa  110  2.0000000000000002e-23  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0253056  normal  0.477246 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0308  two component transcriptional regulator  30.04 
 
 		 239 aa  110  2.0000000000000002e-23  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2673  DNA-binding response regulator  32.67 
 
 		 224 aa  110  2.0000000000000002e-23  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0354  DNA-binding response regulator  30.18 
 
 		 229 aa  110  2.0000000000000002e-23  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  unclonable  0.00000041064  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0312  two component transcriptional regulator  29.49 
 
 		 221 aa  109  2.0000000000000002e-23  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0209  two component transcriptional regulator, winged helix family  34.27 
 
 		 251 aa  110  2.0000000000000002e-23  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3276  winged helix family two component transcriptional regulator  29.52 
 
 		 234 aa  110  2.0000000000000002e-23  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.208422  normal  0.192837 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4477  response regulator receiver  29.95 
 
 		 228 aa  110  2.0000000000000002e-23  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.0220713 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0583  two component transcriptional regulator  30.09 
 
 		 224 aa  110  2.0000000000000002e-23  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0841609  normal  0.467543 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1581  two component transcriptional regulator  31.36 
 
 		 238 aa  110  2.0000000000000002e-23  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0901  winged helix family two component transcriptional regulator  33.49 
 
 		 227 aa  109  3e-23  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0969  two component transcriptional regulator  33.49 
 
 		 227 aa  109  3e-23  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.0722332 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4486  two component transcriptional regulator  33.49 
 
 		 227 aa  109  3e-23  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.643247  normal  0.864162 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0840  two component transcriptional regulator, winged helix family  30 
 
 		 241 aa  109  3e-23  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.214337  normal  0.533835 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_56950  putative two-component response regulator  32.68 
 
 		 227 aa  109  3e-23  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4952  putative two-component response regulator  32.68 
 
 		 227 aa  109  3e-23  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0784  two component transcriptional regulator  30.8 
 
 		 239 aa  109  3e-23  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0940  two component transcriptional regulator  33.49 
 
 		 227 aa  109  3e-23  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0203  response regulator receiver  33.92 
 
 		 231 aa  109  4.0000000000000004e-23  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.359659 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6507  two component transcriptional regulator  28.7 
 
 		 270 aa  109  4.0000000000000004e-23  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0763131  normal  0.20607 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1034  two component transcriptional regulator, winged helix family  34.25 
 
 		 219 aa  109  4.0000000000000004e-23  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.171933  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6588  two component transcriptional regulator  29 
 
 		 229 aa  108  4.0000000000000004e-23  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.13217  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2762  two component transcriptional regulator, winged helix family  32.2 
 
 		 225 aa  108  4.0000000000000004e-23  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3511  two component transcriptional regulator  29.17 
 
 		 224 aa  108  5e-23  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.0000000699106  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1969  response regulator receiver domain-containing protein  32.72 
 
 		 219 aa  108  5e-23  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.478098  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2076  two component transcriptional regulator  31.86 
 
 		 223 aa  108  5e-23  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0826632  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3998  two component transcriptional regulator  28.83 
 
 		 220 aa  108  7.000000000000001e-23  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.278973  normal  0.137181 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00347  DNA-binding response regulator in two-component regulatory system with PhoR (or CreC)  28.76 
 
 		 229 aa  108  9.000000000000001e-23  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3210  two component transcriptional regulator PhoB, winged helix family  28.76 
 
 		 229 aa  108  9.000000000000001e-23  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.146413  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6259  two component response regulator  28.44 
 
 		 220 aa  108  9.000000000000001e-23  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.1188  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0318  transcriptional regulator PhoB  28.76 
 
 		 229 aa  108  9.000000000000001e-23  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6397  response regulator receiver protein  30.9 
 
 		 237 aa  108  9.000000000000001e-23  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.680662  normal  0.0804167 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3234  transcriptional regulator PhoB  28.76 
 
 		 229 aa  108  9.000000000000001e-23  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.456974  unclonable  0.00000000819474 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1404  two component transcriptional regulator  29.06 
 
 		 229 aa  108  9.000000000000001e-23  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.153238  normal  1 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2431  response regulator receiver  30.1 
 
 		 224 aa  108  9.000000000000001e-23  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.721266  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0429  transcriptional regulator PhoB  28.76 
 
 		 229 aa  108  9.000000000000001e-23  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.283039  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2385  two component transcriptional regulator  30.1 
 
 		 224 aa  108  9.000000000000001e-23  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3674  two component transcriptional regulator  31.05 
 
 		 263 aa  108  9.000000000000001e-23  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.400914  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0427  transcriptional regulator PhoB  28.76 
 
 		 229 aa  108  9.000000000000001e-23  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0467  transcriptional regulator PhoB  28.76 
 
 		 229 aa  108  9.000000000000001e-23  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1449  two component transcriptional regulator  31.4 
 
 		 246 aa  108  9.000000000000001e-23  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.566781  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_07910  response regulator with CheY-like receiver domain and winged-helix DNA-binding domain  29.09 
 
 		 239 aa  108  9.000000000000001e-23  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00351  hypothetical protein  28.76 
 
 		 229 aa  108  9.000000000000001e-23  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0475  transcriptional regulator PhoB  28.76 
 
 		 229 aa  108  9.000000000000001e-23  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3686  response regulator receiver  30.5 
 
 		 233 aa  108  9.000000000000001e-23  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3875  two component transcriptional regulator  29.36 
 
 		 224 aa  107  1e-22  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.0000000754116  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>