More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Suden_0441 on replicon NC_007575
Organism: Sulfurimonas denitrificans DSM 1251



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007575  Suden_0441  SsrA-binding protein  100 
 
 		 150 aa  304  3e-82  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.634743  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1060  SsrA-binding protein  58.67 
 
 		 152 aa  187  4e-47  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0617  SsrA-binding protein  59.59 
 
 		 150 aa  183  9e-46  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.412585  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1248  SsrA-binding protein  59.59 
 
 		 150 aa  182  1.0000000000000001e-45  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.383971  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1629  SsrA-binding protein  57.33 
 
 		 154 aa  182  1.0000000000000001e-45  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.765691  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1123  SsrA-binding protein  59.59 
 
 		 150 aa  182  1.0000000000000001e-45  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0712  SsrA-binding protein  54 
 
 		 151 aa  173  8e-43  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0695  SsrA-binding protein  54.73 
 
 		 150 aa  172  1.9999999999999998e-42  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1111  SsrA-binding protein  55.48 
 
 		 153 aa  170  6.999999999999999e-42  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0060  SsrA-binding protein  54.67 
 
 		 151 aa  157  4e-38  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0189  SsrA-binding protein  47.59 
 
 		 158 aa  156  1e-37  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.000399646  normal  0.0189188 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3672  SsrA-binding protein  51.35 
 
 		 155 aa  152  2e-36  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.35402  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0775  SsrA-binding protein  50.34 
 
 		 148 aa  152  2e-36  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000000199999  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2083  SsrA-binding protein  53.1 
 
 		 151 aa  152  2e-36  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4350  SsrA-binding protein  46.21 
 
 		 158 aa  150  5e-36  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.08512  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5231  SsrA-binding protein  51.35 
 
 		 155 aa  149  1e-35  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1864  SsrA-binding protein  45.52 
 
 		 160 aa  149  1e-35  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5242  SsrA-binding protein  51.35 
 
 		 155 aa  149  1e-35  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.275752  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2045  SsrA-binding protein  48.63 
 
 		 155 aa  149  1e-35  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.524843 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5277  SsrA-binding protein  51.35 
 
 		 155 aa  149  1e-35  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000417052  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4955  SsrA-binding protein  50.68 
 
 		 155 aa  149  2e-35  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.0000000570818  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4806  SsrA-binding protein  50.68 
 
 		 155 aa  149  2e-35  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000144098  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4817  SsrA-binding protein  50.68 
 
 		 155 aa  149  2e-35  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000561916  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5332  SsrA-binding protein  50.68 
 
 		 155 aa  149  2e-35  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000000321328  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5212  SsrA-binding protein  50.68 
 
 		 155 aa  149  2e-35  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0002  SsrA-binding protein  51.35 
 
 		 155 aa  148  3e-35  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.185549  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1314  SsrA-binding protein  51.01 
 
 		 152 aa  148  3e-35  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00672101  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3124  SsrA-binding protein  49.32 
 
 		 155 aa  147  4e-35  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2342  SsrA-binding protein  50.68 
 
 		 149 aa  147  6e-35  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.994349  normal  0.13276 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1393  SsrA-binding protein  48.98 
 
 		 159 aa  145  1.0000000000000001e-34  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  hitchhiker  0.00517715  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2627  SsrA-binding protein  50.34 
 
 		 148 aa  146  1.0000000000000001e-34  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4865  SsrA-binding protein  48.97 
 
 		 157 aa  146  1.0000000000000001e-34  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0694  SsrA-binding protein  47.95 
 
 		 150 aa  145  2.0000000000000003e-34  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  unclonable  0.000000543524  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0670  SsrA-binding protein  47.95 
 
 		 150 aa  145  2.0000000000000003e-34  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  unclonable  0.0000000000585556  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1455  SsrA-binding protein  48.98 
 
 		 159 aa  145  2.0000000000000003e-34  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.0000318181  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2325  SsrA-binding protein  47.26 
 
 		 155 aa  144  3e-34  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.595693  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2342  SsrA-binding protein  47.26 
 
 		 156 aa  144  4.0000000000000006e-34  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.0903697 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2954  SsrA-binding protein  47.97 
 
 		 155 aa  144  5e-34  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000000670079  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1354  SsrA-binding protein  48.97 
 
 		 156 aa  144  6e-34  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.000258997  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1485  SsrA-binding protein  50.68 
 
 		 165 aa  143  8.000000000000001e-34  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.352503  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0962  SsrA-binding protein  50 
 
 		 157 aa  143  9e-34  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4920  SsrA-binding protein  49.32 
 
 		 155 aa  142  1e-33  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00075072  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2169  SsrA-binding protein  44.52 
 
 		 155 aa  141  2e-33  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2231  SsrA-binding protein  44.52 
 
 		 155 aa  141  2e-33  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.589723  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2005  SsrA-binding protein  47.95 
 
 		 158 aa  141  4e-33  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.141035 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0655  SsrA-binding protein  45.83 
 
 		 158 aa  141  4e-33  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00271498 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0820  SsrA-binding protein  45.21 
 
 		 155 aa  140  5e-33  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.533301  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2620  SsrA-binding protein  45.52 
 
 		 157 aa  140  6e-33  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2631  SsrA-binding protein  47.92 
 
 		 157 aa  140  6e-33  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0750238  normal  0.108359 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1092  SsrA-binding protein  49.31 
 
 		 152 aa  140  8e-33  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0691  SsrA-binding protein  46.9 
 
 		 161 aa  140  8e-33  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1424  SsrA-binding protein  47.26 
 
 		 148 aa  139  9e-33  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0442544  hitchhiker  0.00854817 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2865  SsrA-binding protein  47.22 
 
 		 154 aa  139  9.999999999999999e-33  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000473081  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0277  SsrA-binding protein  45.27 
 
 		 153 aa  139  9.999999999999999e-33  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0454  SsrA-binding protein  45.27 
 
 		 153 aa  139  9.999999999999999e-33  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00020171 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1145  SsrA-binding protein  47.62 
 
 		 154 aa  139  9.999999999999999e-33  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.533821  normal  0.478578 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1646  SsrA-binding protein  46.67 
 
 		 172 aa  138  1.9999999999999998e-32  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.281559  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01177  SsrA-binding protein  49.66 
 
 		 167 aa  138  1.9999999999999998e-32  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.130797  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3903  SsrA-binding protein  46.9 
 
 		 157 aa  138  3e-32  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.0606215 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0724  SsrA-binding protein  45.21 
 
 		 160 aa  137  3.9999999999999997e-32  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0275  SsrA-binding protein  41.38 
 
 		 155 aa  137  3.9999999999999997e-32  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000343962  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0748  SsrA-binding protein  46.53 
 
 		 157 aa  137  3.9999999999999997e-32  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.107528  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0942  SsrA-binding protein  45.89 
 
 		 155 aa  137  4.999999999999999e-32  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0373189  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1709  SsrA-binding protein  46.67 
 
 		 153 aa  137  6e-32  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0149731  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0463  SsrA-binding protein  47.26 
 
 		 158 aa  137  6e-32  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.00000000143287  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4712  SsrA-binding protein  45.52 
 
 		 156 aa  137  7e-32  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000106723  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1861  SsrA-binding protein  48.28 
 
 		 150 aa  136  7.999999999999999e-32  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.706787  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1198  SsrA-binding protein  48.61 
 
 		 189 aa  136  7.999999999999999e-32  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.11518  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_15720  SsrA-binding protein  46.21 
 
 		 155 aa  136  7.999999999999999e-32  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000205152  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1409  SsrA-binding protein  48.28 
 
 		 158 aa  136  8.999999999999999e-32  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3721  SsrA-binding protein  45.83 
 
 		 154 aa  136  8.999999999999999e-32  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.516097  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2984  SsrA-binding protein  42.47 
 
 		 161 aa  136  8.999999999999999e-32  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000114855  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0771  SsrA-binding protein  48.63 
 
 		 147 aa  136  8.999999999999999e-32  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.401658  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0819  SsrA-binding protein  45.52 
 
 		 154 aa  136  8.999999999999999e-32  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.796399  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4733  SsrA-binding protein  45.58 
 
 		 160 aa  136  1e-31  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.348384  hitchhiker  0.00889462 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0358  SsrA-binding protein  46.53 
 
 		 158 aa  136  1e-31  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.133211 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4599  SsrA-binding protein  45.58 
 
 		 160 aa  136  1e-31  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.432881  normal  0.0841371 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1994  SsrA-binding protein  44.14 
 
 		 154 aa  135  2e-31  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.000000000521346  normal  0.65027 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1443  SsrA-binding protein  43.54 
 
 		 158 aa  135  2e-31  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.0000666048  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1268  SsrA-binding protein  44.83 
 
 		 163 aa  135  2e-31  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.745549  normal  0.12571 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0698  SsrA-binding protein  46.26 
 
 		 160 aa  135  2e-31  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.105025  hitchhiker  0.0000324101 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2898  SsrA-binding protein  48.63 
 
 		 156 aa  135  2e-31  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2751  SsrA-binding protein  48.63 
 
 		 156 aa  135  2e-31  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0325  SsrA-binding protein  46.53 
 
 		 158 aa  135  2e-31  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.678014 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1590  SsrA-binding protein  46.58 
 
 		 167 aa  135  2e-31  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3008  SsrA-binding protein  47.37 
 
 		 159 aa  135  2e-31  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0959  SsrA-binding protein  45.21 
 
 		 160 aa  135  2e-31  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3085  SsrA-binding protein  46.31 
 
 		 152 aa  135  2e-31  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0708876  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3832  SsrA-binding protein  46.53 
 
 		 158 aa  135  3.0000000000000003e-31  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0883  SsrA-binding protein  43.06 
 
 		 157 aa  134  3.0000000000000003e-31  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01809  SsrA-binding protein  49.32 
 
 		 159 aa  135  3.0000000000000003e-31  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.00252244  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2543  SsrA-binding protein  43.06 
 
 		 157 aa  134  3.0000000000000003e-31  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.829865  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4734  SsrA-binding protein  45.58 
 
 		 160 aa  135  3.0000000000000003e-31  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.683241  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET1506  SsrA-binding protein  40.69 
 
 		 172 aa  134  4e-31  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.000124278  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1824  SsrA-binding protein  46.9 
 
 		 150 aa  134  4e-31  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  decreased coverage  0.00000000470623  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2863  SsrA-binding protein  46.58 
 
 		 165 aa  134  4e-31  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.643018  normal  0.0844663 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1296  SsrA-binding protein  40.69 
 
 		 182 aa  134  5e-31  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  unclonable  0.000000000870079  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2552  SsrA-binding protein  47.22 
 
 		 157 aa  134  6.0000000000000005e-31  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00446859 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1256  SsrA-binding protein  47.22 
 
 		 157 aa  134  6.0000000000000005e-31  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0547561  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1280  ssrA binding protein (smpB)  41.38 
 
 		 154 aa  134  6.0000000000000005e-31  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000661775  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>