More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Suden_0180 on replicon NC_007575
Organism: Sulfurimonas denitrificans DSM 1251



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007575  Suden_0180  transketolase, central region  100 
 
 		 162 aa  334  2.9999999999999997e-91  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5637  transketolase subunit B  37.09 
 
 		 307 aa  113  1.0000000000000001e-24  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3397  Transketolase central region  35.66 
 
 		 298 aa  106  1e-22  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_14551  transketolase C-terminal subunit  34.67 
 
 		 304 aa  95.5  3e-19  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1589  transketolase family protein  32.26 
 
 		 288 aa  92.4  2e-18  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1923  transketolase domain-containing protein  38.71 
 
 		 315 aa  90.1  1e-17  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2287  transketolase central region  32.17 
 
 		 305 aa  86.7  1e-16  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1058  transketolase subunit B  27.85 
 
 		 308 aa  85.9  2e-16  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.847424 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4473  transketolase, central region  30.66 
 
 		 296 aa  80.9  0.000000000000007  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.0113424 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1130  transketolase central region  33.86 
 
 		 336 aa  80.9  0.000000000000008  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3248  putative transketolase, C-terminal subunit  34.88 
 
 		 314 aa  79.3  0.00000000000002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0910  putative transketolase, C-terminal subunit  34.88 
 
 		 310 aa  79.3  0.00000000000002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3382  transketolase domain-containing protein  34.11 
 
 		 314 aa  78.6  0.00000000000003  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0894  transketolase subunit B  31.48 
 
 		 314 aa  79  0.00000000000003  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5715  Transketolase central region  29.8 
 
 		 296 aa  78.2  0.00000000000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4986  transketolase central region  31.71 
 
 		 296 aa  78.2  0.00000000000004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.545662  hitchhiker  0.000179953 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0438  transketolase central region  33.77 
 
 		 312 aa  77.4  0.00000000000007  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.0397028  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0796  Transketolase central region  30.2 
 
 		 316 aa  77.4  0.00000000000008  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2110  transketolase, central region  30.91 
 
 		 314 aa  77.4  0.00000000000008  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.44874  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1286  transketolase-like  32.3 
 
 		 327 aa  76.6  0.0000000000001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.290354  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0237  transketolase subunit B  28.4 
 
 		 311 aa  76.3  0.0000000000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2646  Transketolase domain protein  31.29 
 
 		 314 aa  75.1  0.0000000000003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0477221  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2402  transketolase, C-terminal subunit  31.78 
 
 		 310 aa  75.5  0.0000000000003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.730568  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1273  transketolase central region  27.66 
 
 		 303 aa  75.1  0.0000000000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.257757  hitchhiker  0.0057855 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2059  Transketolase central region  30.86 
 
 		 313 aa  75.5  0.0000000000003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1173  Transketolase central region  31.48 
 
 		 327 aa  74.7  0.0000000000004  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  unclonable  0.000000393635  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1963  transketolase, C-terminal subunit  28.1 
 
 		 302 aa  75.1  0.0000000000004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.686485  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1775  transketolase, central region  30.25 
 
 		 314 aa  74.3  0.0000000000006  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0809  transketolase central region  37.6 
 
 		 592 aa  74.7  0.0000000000006  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.32467  normal  0.55266 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2254  Transketolase domain protein  28.67 
 
 		 318 aa  74.3  0.0000000000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.655402  normal  0.0447096 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4002  Transketolase central region  29.27 
 
 		 299 aa  73.9  0.0000000000008  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.226763  normal  0.146008 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1468  Transketolase central region  33.74 
 
 		 314 aa  73.9  0.0000000000009  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0697  transketoloase, C half  35.05 
 
 		 104 aa  73.9  0.0000000000009  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.837924  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0789  transketolase central region  30.25 
 
 		 314 aa  73.6  0.000000000001  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0874  Transketolase central region  29.19 
 
 		 326 aa  72.4  0.000000000002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3528  Transketolase central region  31.16 
 
 		 306 aa  72.8  0.000000000002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.605284  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2032  Transketolase domain protein  27.97 
 
 		 318 aa  72.8  0.000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.262756  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0881  Transketolase central region  29.81 
 
 		 327 aa  72.4  0.000000000003  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  decreased coverage  0.00000000876605  normal  0.0478781 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0338  Transketolase central region  35.95 
 
 		 319 aa  72  0.000000000003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2444  transketolase subunit B  29.63 
 
 		 313 aa  72  0.000000000003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1628  transketolase, C-terminal subunit  28.1 
 
 		 303 aa  71.6  0.000000000004  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.750747  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2655  transketolase, C-terminal subunit  28.1 
 
 		 303 aa  71.6  0.000000000004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2130  transketolase, C-terminal subunit  28.1 
 
 		 303 aa  71.6  0.000000000004  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.963697  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3184  transketolase, C-terminal subunit  28.1 
 
 		 303 aa  71.6  0.000000000004  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2515  transketolase domain-containing protein  28.1 
 
 		 303 aa  71.6  0.000000000004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2568  transketolase domain-containing protein  28.1 
 
 		 303 aa  71.6  0.000000000004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.974177  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1404  transketolase, C-terminal subunit  28.1 
 
 		 303 aa  71.6  0.000000000004  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.108594  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0407  transketolase central region  28.03 
 
 		 323 aa  71.2  0.000000000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0194561  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5103  Transketolase central region  31.21 
 
 		 306 aa  70.9  0.000000000006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.47717 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3642  Transketolase central region  28.12 
 
 		 307 aa  70.9  0.000000000007  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1178  Transketolase central region  27.95 
 
 		 327 aa  70.5  0.000000000008  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.0058066  normal  0.0131189 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1381  Transketolase central region  30.63 
 
 		 306 aa  70.5  0.00000000001  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5275  transketolase, central region  29.8 
 
 		 335 aa  68.9  0.00000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.181452  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_00875  transketolase, C-terminal subunit  31.25 
 
 		 317 aa  69.3  0.00000000002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1878  transketolase subunit B  29.49 
 
 		 312 aa  69.7  0.00000000002  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3129  transketolase domain-containing protein  28.24 
 
 		 322 aa  69.3  0.00000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2718  transketolase subunit B  32 
 
 		 340 aa  68.9  0.00000000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1717  Transketolase central region  30.14 
 
 		 347 aa  68.9  0.00000000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2506  Transketolase central region  30.14 
 
 		 343 aa  68.6  0.00000000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.165482 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3347  Transketolase central region  29.14 
 
 		 331 aa  68.9  0.00000000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.027962  normal  0.023237 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0711  Transketolase central region  31.13 
 
 		 315 aa  68.9  0.00000000003  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  decreased coverage  0.00000202012  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_05490  transketolase subunit B  36.36 
 
 		 325 aa  68.6  0.00000000004  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  0.948034 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0471  transketolase subunit B  31.69 
 
 		 312 aa  68.6  0.00000000004  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.0285277  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1192  transketolase-like  29.63 
 
 		 327 aa  67.8  0.00000000005  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.101787  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2513  transketolase subunit B  28.86 
 
 		 322 aa  67.8  0.00000000005  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0244  transketolase-like protein  33.87 
 
 		 311 aa  67.8  0.00000000005  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0969  transketolase, central region  28.93 
 
 		 306 aa  67.8  0.00000000006  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.86113  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1527  Transketolase central region  30.07 
 
 		 319 aa  67.4  0.00000000007  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1554  transketolase central region  30.99 
 
 		 312 aa  67.8  0.00000000007  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.0600642  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3878  transketolase, central region  32 
 
 		 342 aa  67.4  0.00000000008  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.733485  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0261  Transketolase central region  30.82 
 
 		 339 aa  67  0.0000000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.885505 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_09040  transketolase subunit B  37.69 
 
 		 315 aa  67  0.0000000001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.28283  normal  0.0525296 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1505  transketolase central region  29.86 
 
 		 314 aa  65.9  0.0000000002  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.0385912  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0293  putative transketolase, C-terminal subunit  28.12 
 
 		 314 aa  66.2  0.0000000002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0288  transketolase  28.12 
 
 		 314 aa  66.2  0.0000000002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.000211069  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6362  Transketolase central region  29.17 
 
 		 307 aa  66.2  0.0000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.465513  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0614  transketolase, central region  29.86 
 
 		 310 aa  66.2  0.0000000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.593318 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1170  transketolase subunit B  29.81 
 
 		 326 aa  65.9  0.0000000002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.000103125  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2604  deoxyxylulose-5-phosphate synthase  29.61 
 
 		 618 aa  65.1  0.0000000004  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0280  Transketolase central region  27.5 
 
 		 310 aa  65.1  0.0000000004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.741894  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0365  transketolase central region  30.28 
 
 		 312 aa  65.1  0.0000000004  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.556876  normal  0.0129681 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2367  Transketolase central region  29.86 
 
 		 339 aa  64.7  0.0000000005  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.438048  normal  0.0327946 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0492  transketolase, central region  28.22 
 
 		 312 aa  64.7  0.0000000005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2092  transketolase central region  29.86 
 
 		 339 aa  64.7  0.0000000005  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.147262 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1792  transketolase subunit B  27.61 
 
 		 310 aa  64.7  0.0000000006  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0510195  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1895  transketolase, C-terminal subunit  30.52 
 
 		 318 aa  63.9  0.0000000008  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00759771 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0265  Transketolase central region  26.88 
 
 		 310 aa  63.5  0.000000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00214892 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1078  deoxyxylulose-5-phosphate synthase  31.17 
 
 		 635 aa  63.5  0.000000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0303047  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4663  transketolase central region  27.78 
 
 		 328 aa  62.8  0.000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1539  transketolase central region  27.15 
 
 		 348 aa  62.4  0.000000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.844968  normal  0.490255 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0049  transketolase, central region  28.47 
 
 		 317 aa  62.8  0.000000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0727  transketolase central region  30.4 
 
 		 335 aa  62.4  0.000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0406  Transketolase central region  29.45 
 
 		 343 aa  62.4  0.000000003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2041  transketolase central region  26.85 
 
 		 330 aa  62  0.000000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.522483 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4383  Transketolase central region  29.66 
 
 		 342 aa  61.6  0.000000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0967269  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2126  Transketolase domain protein  27.52 
 
 		 320 aa  61.6  0.000000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.764032  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2699  transketolase subunit B  29.79 
 
 		 288 aa  61.6  0.000000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2744  transketolase central region  29.66 
 
 		 342 aa  62  0.000000004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0728122  normal  0.0592981 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3958  transketolase subunit B  29.45 
 
 		 340 aa  62  0.000000004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.158278  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1145  deoxyxylulose-5-phosphate synthase  31.01 
 
 		 625 aa  61.2  0.000000005  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.820706  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>