More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Strop_2477 on replicon NC_009380
Organism: Salinispora tropica CNB-440



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009380  Strop_2477  aminotransferase, class I and II  100 
 
 		 439 aa  877    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.055447  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2660  GntR family transcriptional regulator  86.05 
 
 		 439 aa  722    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.220468  hitchhiker  0.000201414 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4591  putative transcriptional regulator, GntR family  61.45 
 
 		 431 aa  508  1e-143  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.374822  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1742  putative transcriptional regulator, GntR family  53.99 
 
 		 430 aa  462  1e-129  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.554811 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3266  putative transcriptional regulator, GntR family  53.08 
 
 		 426 aa  424  1e-117  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2452  aminotransferase, class I and II  49.88 
 
 		 441 aa  367  1e-100  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.410489  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3064  putative transcriptional regulator, GntR family  42.79 
 
 		 449 aa  311  2e-83  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.725277  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_39710  transcriptional regulator with HTH domain protein and aminotransferase domain protein  33.58 
 
 		 446 aa  176  9.999999999999999e-43  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5940  putative transcriptional regulator, GntR family  33.42 
 
 		 463 aa  172  7.999999999999999e-42  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2152  aminotransferase, class I and II  33.58 
 
 		 416 aa  169  1e-40  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1964  GntR family transcriptional regulator  32.37 
 
 		 409 aa  168  2e-40  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2120  GntR family transcriptional regulator  30.03 
 
 		 401 aa  166  8e-40  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.265686 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5405  putative transcriptional regulator, GntR family  31.93 
 
 		 446 aa  164  3e-39  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3812  putative transcriptional regulator, GntR family  31.5 
 
 		 435 aa  161  2e-38  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9379  putative transcriptional regulator, GntR family  32.19 
 
 		 441 aa  160  3e-38  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.938507  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1434  putative transcriptional regulator, GntR family  28.85 
 
 		 400 aa  160  4e-38  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2328  aminotransferase, class I and II  32.25 
 
 		 433 aa  159  7e-38  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4022  aminotransferase, class I and II  30.2 
 
 		 433 aa  159  8e-38  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2549  putative transcriptional regulator, GntR family  31.25 
 
 		 436 aa  159  9e-38  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.49034  normal  0.185545 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_7090  putative transcriptional regulator, GntR family  31.19 
 
 		 438 aa  159  1e-37  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.635615  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4690  aminotransferase, class I and II  31.6 
 
 		 439 aa  159  1e-37  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1080  putative transcriptional regulator, GntR family  27.11 
 
 		 401 aa  158  2e-37  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0093  putative transcriptional regulator, GntR family  31.17 
 
 		 425 aa  157  5.0000000000000005e-37  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3370  putative transcriptional regulator, GntR family  33.08 
 
 		 611 aa  157  5.0000000000000005e-37  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0532019  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_9047  putative transcriptional regulator, GntR family  31.27 
 
 		 437 aa  155  1e-36  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.779817  normal  0.283217 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_37960  transcriptional regulator with HTH domain and aminotransferase domain  32.17 
 
 		 436 aa  154  2.9999999999999998e-36  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5545  putative transcriptional regulator, GntR family  33.43 
 
 		 367 aa  151  2e-35  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.97296  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4975  putative transcriptional regulator, GntR family  31.19 
 
 		 430 aa  150  3e-35  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1902  aromatic amino acid aminotransferase / 2-aminoadipate aminotransferase  28.32 
 
 		 397 aa  150  4e-35  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2237  putative transcriptional regulator, GntR family  31.6 
 
 		 440 aa  150  4e-35  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0384062  normal  0.194146 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1466  GntR family transcriptional regulator  29.46 
 
 		 386 aa  150  5e-35  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.677019  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1659  2-aminoadipate aminotransferase  31.34 
 
 		 399 aa  150  6e-35  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.0665896 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_10910  putative transcriptional regulator, GntR family  27.52 
 
 		 394 aa  150  6e-35  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0310  GntR family transcriptional regulator  27.79 
 
 		 397 aa  149  1.0000000000000001e-34  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.0000000000040274  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0985  aminotransferase protein  30.5 
 
 		 406 aa  148  2.0000000000000003e-34  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0572002  normal  0.184063 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1532  GntR family transcriptional regulator  31.27 
 
 		 399 aa  148  2.0000000000000003e-34  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.192742  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0421  GntR family transcriptional regulator  27.78 
 
 		 403 aa  147  3e-34  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.493071  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1469  GntR family transcriptional regulator  27.85 
 
 		 413 aa  147  4.0000000000000006e-34  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1028  GntR family transcriptional regulator  29.51 
 
 		 399 aa  147  4.0000000000000006e-34  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00000000000000302984 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_5087  putative transcriptional regulator, GntR family  32.08 
 
 		 454 aa  146  6e-34  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0846  putative transcriptional regulator, GntR family  31.25 
 
 		 396 aa  146  8.000000000000001e-34  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0129506  normal  0.750819 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0915  putative transcriptional regulator, GntR family  31.25 
 
 		 396 aa  146  8.000000000000001e-34  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.262681  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4214  putative transcriptional regulator, GntR family  32.48 
 
 		 438 aa  145  1e-33  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_5101  GntR family transcriptional regulator  31.51 
 
 		 437 aa  145  1e-33  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000000307944 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4583  aminotransferase, class I and II  31.36 
 
 		 437 aa  145  2e-33  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000597747 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1108  GntR family transcriptional regulator  25 
 
 		 395 aa  143  5e-33  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0593  GntR family transcriptional regulator  31.39 
 
 		 450 aa  143  6e-33  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2905  GntR family transcriptional regulator  29.97 
 
 		 340 aa  143  6e-33  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1641  valine-pyruvate aminotransferase  30.12 
 
 		 440 aa  141  1.9999999999999998e-32  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.320192  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6427  putative transcriptional regulator, GntR family  29.04 
 
 		 414 aa  139  7e-32  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.93178 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0318  putative transcriptional regulator, GntR family  28.61 
 
 		 432 aa  139  7.999999999999999e-32  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.024163  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1580  GntR family transcriptional regulator  25.37 
 
 		 395 aa  139  1e-31  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.136638  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3867  putative transcriptional regulator, GntR family  28.79 
 
 		 394 aa  139  1e-31  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4054  putative transcriptional regulator, GntR family  28.28 
 
 		 394 aa  139  1e-31  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0110  GntR family transcriptional regulator  25.12 
 
 		 411 aa  138  2e-31  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4485  aminotransferase, class I and II  34.06 
 
 		 364 aa  138  2e-31  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.0118141 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2117  GntR family transcriptional regulator  28.98 
 
 		 398 aa  138  2e-31  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.483945  normal  0.104969 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3729  aminotransferase, class I and II  31.45 
 
 		 420 aa  137  3.0000000000000003e-31  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0865  putative transcriptional regulator, GntR family  26.45 
 
 		 404 aa  137  5e-31  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.000909191  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1887  GntR family transcriptional regulator  29.18 
 
 		 402 aa  137  5e-31  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3369  putative transcriptional regulator, GntR family  33 
 
 		 402 aa  136  8e-31  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0184281  normal  0.0139033 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0064  aminotransferase, class I  27.82 
 
 		 397 aa  136  9e-31  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0105  GntR family transcriptional regulator  26.07 
 
 		 411 aa  135  9.999999999999999e-31  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4999  GntR family transcriptional regulator  34.06 
 
 		 364 aa  135  9.999999999999999e-31  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000160838 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0115  putative transcriptional regulator, GntR family  26.02 
 
 		 396 aa  134  1.9999999999999998e-30  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1213  putative transcriptional regulator, GntR family  29.89 
 
 		 398 aa  134  1.9999999999999998e-30  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1955  GntR family transcriptional regulator  29.26 
 
 		 408 aa  134  3e-30  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.479896  normal  0.0640255 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6710  GntR family transcriptional regulator  31.6 
 
 		 416 aa  134  3e-30  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.614277  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0766  GntR family transcriptional regulator  29.11 
 
 		 383 aa  134  3e-30  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.195582 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2387  aminotransferase, class I and II  29.55 
 
 		 393 aa  134  3e-30  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.462658  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2269  GntR family transcriptional regulator  29.55 
 
 		 393 aa  134  3e-30  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2616  putative transcriptional regulator, GntR family  25.65 
 
 		 395 aa  133  5e-30  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.791152  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2350  aminotransferase, class I and II  28.32 
 
 		 394 aa  133  6e-30  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0592  putative transcriptional regulator, GntR family  27.25 
 
 		 411 aa  133  6.999999999999999e-30  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3332  putative aminotransferase  29.55 
 
 		 398 aa  133  6.999999999999999e-30  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.381382 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0851  GntR family transcriptional regulator  25.18 
 
 		 395 aa  133  6.999999999999999e-30  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.0242467  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1095  GntR family transcriptional regulator  24.57 
 
 		 395 aa  132  1.0000000000000001e-29  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.435284  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2372  GntR family transcriptional regulator  29.55 
 
 		 393 aa  132  1.0000000000000001e-29  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1670  GntR family transcriptional regulator  30.13 
 
 		 395 aa  132  1.0000000000000001e-29  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.868104 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1739  aminotransferase, class I and II  29.55 
 
 		 393 aa  132  1.0000000000000001e-29  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2351  aminotransferase, class I and II  29.55 
 
 		 393 aa  132  1.0000000000000001e-29  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.654815  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0233  GntR family transcriptional regulator  25.13 
 
 		 395 aa  132  1.0000000000000001e-29  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.511167 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00093  valine-pyruvate aminotransferase  30.23 
 
 		 417 aa  132  2.0000000000000002e-29  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.947467  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0928  GntR family transcriptional regulator  29.77 
 
 		 393 aa  132  2.0000000000000002e-29  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.511381  normal  0.662482 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1154  aminotransferase, class I/II  29.77 
 
 		 393 aa  132  2.0000000000000002e-29  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3581  putative GntR family transcriptional regulator  29.31 
 
 		 441 aa  131  3e-29  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.411706  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2513  aminotransferase  26.41 
 
 		 404 aa  130  3e-29  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.111112  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1725  GntR family transcriptional regulator  31.28 
 
 		 483 aa  130  4.0000000000000003e-29  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.809338  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1337  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  32.73 
 
 		 487 aa  130  4.0000000000000003e-29  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0411  aminotransferase  25.2 
 
 		 405 aa  130  4.0000000000000003e-29  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.894171  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0081  putative transcriptional regulator, GntR family  30.35 
 
 		 402 aa  130  5.0000000000000004e-29  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.48267 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0315  putative transcriptional regulator, GntR family  28.64 
 
 		 403 aa  130  6e-29  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.665801  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0073  putative transcriptional regulator, GntR family  30.35 
 
 		 402 aa  130  6e-29  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1584  GntR family transcriptional regulator  25.8 
 
 		 393 aa  129  7.000000000000001e-29  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3288  putative transcriptional regulator, GntR family  29.94 
 
 		 386 aa  130  7.000000000000001e-29  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000848876  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1762  GntR family transcriptional regulator  30 
 
 		 396 aa  129  1.0000000000000001e-28  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2741  putative transcriptional regulator, GntR family  26.83 
 
 		 405 aa  129  1.0000000000000001e-28  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.343456 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0439  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain protein  29.84 
 
 		 517 aa  129  1.0000000000000001e-28  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0951  aminotransferase family protein  29.77 
 
 		 393 aa  129  1.0000000000000001e-28  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.797197  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4240  aminotransferase, class I and II  31.03 
 
 		 406 aa  129  1.0000000000000001e-28  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>