45 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Strop_1922 on replicon NC_009380
Organism: Salinispora tropica CNB-440



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009380  Strop_1922  TM2 domain-containing protein  100 
 
 		 137 aa  272  9e-73  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.134509 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1913  TM2 domain-containing protein  76.64 
 
 		 131 aa  165  1e-40  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.114845  hitchhiker  0.00105597 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1899  TM2 domain-containing protein  64.79 
 
 		 155 aa  92.8  1e-18  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.47053  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_25400  protein of unknown function (DUF1707)  59.46 
 
 		 166 aa  88.6  2e-17  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.7287 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5432  protein of unknown function DUF1707  56.16 
 
 		 194 aa  83.6  9e-16  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.00776452  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_15340  TM2 domain-containing protein  47.14 
 
 		 253 aa  74.3  0.0000000000005  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4904  TM2 domain-containing protein  51.43 
 
 		 176 aa  69.7  0.00000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.097022  hitchhiker  0.00581278 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0837  TM2 domain-containing protein  56.9 
 
 		 92 aa  69.3  0.00000000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2315  hypothetical protein  43.48 
 
 		 146 aa  68.2  0.00000000003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0230  TM2 domain-containing protein  36.79 
 
 		 107 aa  67  0.00000000008  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0254008  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0125  TM2 domain-containing protein  39.05 
 
 		 107 aa  67  0.00000000008  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_204  hypothetical protein  37.14 
 
 		 107 aa  66.6  0.0000000001  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3595  TM2 domain-containing protein  45.68 
 
 		 161 aa  62.8  0.000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.687188  normal  0.546417 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_35490  predicted membrane protein  40.45 
 
 		 212 aa  60.8  0.000000006  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2820  TM2 domain-containing protein  60 
 
 		 143 aa  60.1  0.00000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.256448  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11631  hypothetical protein  53.42 
 
 		 146 aa  58.9  0.00000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.0708972 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_23650  predicted membrane protein  43.21 
 
 		 336 aa  59.3  0.00000002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.360975 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3666  TM2 domain containing protein  37.35 
 
 		 160 aa  58.9  0.00000003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3062  TM2 domain-containing protein  48.19 
 
 		 127 aa  57.8  0.00000005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0882033  normal  0.218482 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3105  TM2 domain-containing protein  48.19 
 
 		 127 aa  57.8  0.00000005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3046  TM2 domain-containing protein  48.19 
 
 		 127 aa  57.8  0.00000005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0602  TM2 domain protein  45.16 
 
 		 109 aa  55.8  0.0000002  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0822  TM2 domain containing protein  35.29 
 
 		 161 aa  55.1  0.0000003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.966716  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1541  TM2 domain containing protein  35.58 
 
 		 133 aa  54.7  0.0000004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.273114  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0382  hypothetical protein  46 
 
 		 88 aa  53.1  0.000001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3876  TM2 domain containing protein  42.86 
 
 		 78 aa  52.4  0.000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0604  TM2 domain protein  40.98 
 
 		 190 aa  52  0.000003  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0591  TM2 domain containing protein  42.62 
 
 		 133 aa  51.2  0.000004  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00000337836  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_17940  predicted membrane protein  37.68 
 
 		 344 aa  50.4  0.000007  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.300515  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0836  TM2 domain-containing protein  52.5 
 
 		 79 aa  48.5  0.00003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_01500  predicted membrane protein  38.36 
 
 		 265 aa  48.9  0.00003  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.138392  normal  0.440212 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_53630  hypothetical protein  35.9 
 
 		 111 aa  47.4  0.00007  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0142273  hitchhiker  0.000532666 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4699  hypothetical protein  35.9 
 
 		 111 aa  47.4  0.00008  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2984  TM2 domain containing protein  33.78 
 
 		 305 aa  45.4  0.0002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.39909  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_03530  predicted membrane protein  33.72 
 
 		 159 aa  44.3  0.0006  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  0.0851449 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2756  TM2 domain containing protein  38.03 
 
 		 67 aa  43.1  0.001  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00000265887  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0353  hypothetical protein  30.33 
 
 		 181 aa  43.1  0.001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00000372967  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1506  TM2 domain containing protein  51.06 
 
 		 87 aa  43.5  0.001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2746  TM2 domain containing protein  36.62 
 
 		 67 aa  42.4  0.002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000224877  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2995  TM2 domain-containing protein  39.29 
 
 		 116 aa  42  0.003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0888  TM2 domain-containing protein  28.71 
 
 		 154 aa  42  0.003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.155279 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1837  TM2  32.56 
 
 		 148 aa  41.6  0.004  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.535212  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2397  TM2 domain containing protein  28.33 
 
 		 113 aa  41.2  0.005  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  2.25927e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_27311  hypothetical protein  40.28 
 
 		 92 aa  40.8  0.006  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.848779 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2064  hypothetical protein  70.83 
 
 		 364 aa  40.4  0.008  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00393707  normal  0.614114 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>