15 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bmur_2746 on replicon NC_014150
Organism: Brachyspira murdochii DSM 12563



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014150  Bmur_2746  TM2 domain containing protein  100 
 
 
67 aa  132  9.999999999999999e-31  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000224877  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2756  TM2 domain containing protein  86.57 
 
 
67 aa  122  2e-27  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00000265887  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3876  TM2 domain containing protein  51.47 
 
 
78 aa  65.1  0.0000000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2397  TM2 domain containing protein  51.56 
 
 
113 aa  64.7  0.0000000004  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  2.25927e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1541  TM2 domain containing protein  41.54 
 
 
133 aa  61.6  0.000000004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.273114  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_17940  predicted membrane protein  45.76 
 
 
344 aa  57.4  0.00000007  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.300515  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4904  TM2 domain-containing protein  42.42 
 
 
176 aa  52.4  0.000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.097022  hitchhiker  0.00581278 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2238  TM2 domain-containing protein  46.27 
 
 
101 aa  50.8  0.000006  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.540179  hitchhiker  0.00143417 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5432  protein of unknown function DUF1707  36.76 
 
 
194 aa  48.1  0.00004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.00776452  n/a   
 
 
-
 
NC_011879  Achl_4067  TM2 domain containing protein  47.62 
 
 
469 aa  46.6  0.0001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1913  TM2 domain-containing protein  38.36 
 
 
131 aa  43.5  0.0008  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.114845  hitchhiker  0.00105597 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1922  TM2 domain-containing protein  36.62 
 
 
137 aa  42.4  0.002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.134509 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4937  TM2 domain containing protein  48.89 
 
 
194 aa  42.4  0.002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1399  TM2 domain containing protein  41.38 
 
 
113 aa  41.6  0.004  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.452664  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0822  TM2 domain containing protein  38.81 
 
 
161 aa  41.2  0.004  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.966716  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>