28 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hoch_4937 on replicon NC_013440
Organism: Haliangium ochraceum DSM 14365



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013440  Hoch_4937  TM2 domain containing protein  100 
 
 		 194 aa  401  1e-111  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1825  TM2 domain containing protein  46.25 
 
 		 154 aa  144  7.0000000000000006e-34  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4957  TM2  43.48 
 
 		 164 aa  120  9.999999999999999e-27  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2399  TM2 domain-containing protein  33.54 
 
 		 169 aa  107  9.000000000000001e-23  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.324538  normal  0.432831 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5043  hypothetical protein  46.15 
 
 		 184 aa  73.2  0.000000000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.307475  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0480  TM2  46.15 
 
 		 134 aa  71.6  0.000000000006  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.748725  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0479  TM2 domain-containing protein  55.17 
 
 		 114 aa  70.5  0.00000000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4964  TM2 domain-containing protein  47.62 
 
 		 139 aa  70.9  0.00000000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5316  TM2  43.48 
 
 		 144 aa  70.1  0.00000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.368186 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_05210  hypothetical protein  45.07 
 
 		 134 aa  69.7  0.00000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5141  TM2 domain-containing protein  47.62 
 
 		 139 aa  70.5  0.00000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.143411  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0498  hypothetical protein  46.48 
 
 		 134 aa  70.5  0.00000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_03100  TM2 domain-containing hypothetical protein  45.45 
 
 		 133 aa  67.8  0.0000000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.564885  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1993  TM2 domain-containing protein  43.48 
 
 		 135 aa  67.4  0.0000000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0383529  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5091  hypothetical protein  44.44 
 
 		 139 aa  66.6  0.0000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.710135  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0374  TM2 domain-containing protein  44.44 
 
 		 139 aa  66.6  0.0000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2502  TM2  42.42 
 
 		 140 aa  65.9  0.0000000004  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  hitchhiker  0.000265771  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0299  TM2 domain containing protein  40.74 
 
 		 135 aa  65.5  0.0000000005  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.00000251621  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4145  TM2 domain-containing protein  42.42 
 
 		 132 aa  63.2  0.000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1622  hypothetical protein  41.79 
 
 		 132 aa  62.8  0.000000003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0167  TM2 domain-containing protein  43.75 
 
 		 135 aa  61.2  0.000000009  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1932  TM2 domain containing protein  37.5 
 
 		 104 aa  50.4  0.00002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.533409  normal  0.0149218 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1604  TM2 domain containing protein  36.46 
 
 		 104 aa  46.2  0.0003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.10102  normal  0.345673 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1089  TM2  33.98 
 
 		 117 aa  43.9  0.002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2756  TM2 domain containing protein  46.67 
 
 		 67 aa  42.7  0.003  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00000265887  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2397  TM2 domain containing protein  44.12 
 
 		 113 aa  42.4  0.004  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  2.25927e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2746  TM2 domain containing protein  48.89 
 
 		 67 aa  42.4  0.004  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000224877  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1614  hypothetical protein  36.36 
 
 		 104 aa  42.4  0.004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.696869  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>