23 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mext_0479 on replicon NC_010172
Organism: Methylobacterium extorquens PA1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010172  Mext_0479  TM2 domain-containing protein  100 
 
 		 114 aa  231  3e-60  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2399  TM2 domain-containing protein  53.45 
 
 		 169 aa  71.2  0.000000000005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.324538  normal  0.432831 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4937  TM2 domain containing protein  55.17 
 
 		 194 aa  70.5  0.000000000007  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_03100  TM2 domain-containing hypothetical protein  45.35 
 
 		 133 aa  60.1  0.00000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.564885  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5043  hypothetical protein  42.35 
 
 		 184 aa  58.2  0.00000004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.307475  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0480  TM2  43.02 
 
 		 134 aa  57.8  0.00000004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.748725  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1825  TM2 domain containing protein  50 
 
 		 154 aa  57.8  0.00000005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4957  TM2  38.71 
 
 		 164 aa  55.5  0.0000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4145  TM2 domain-containing protein  40.7 
 
 		 132 aa  53.5  0.000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0374  TM2 domain-containing protein  40.7 
 
 		 139 aa  53.5  0.000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5091  hypothetical protein  41.46 
 
 		 139 aa  52  0.000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.710135  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5316  TM2  45.07 
 
 		 144 aa  52.8  0.000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.368186 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2502  TM2  44.44 
 
 		 140 aa  52  0.000003  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  hitchhiker  0.000265771  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5141  TM2 domain-containing protein  41.46 
 
 		 139 aa  52  0.000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.143411  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4964  TM2 domain-containing protein  46.27 
 
 		 139 aa  52  0.000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1993  TM2 domain-containing protein  40.24 
 
 		 135 aa  51.2  0.000005  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0383529  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_05210  hypothetical protein  46.43 
 
 		 134 aa  48.9  0.00003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0498  hypothetical protein  44.64 
 
 		 134 aa  48.1  0.00004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0167  TM2 domain-containing protein  45 
 
 		 135 aa  47.8  0.00005  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1791  TM2  29.7 
 
 		 124 aa  47  0.00009  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.0956269  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0299  TM2 domain containing protein  44.07 
 
 		 135 aa  46.6  0.0001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.00000251621  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1622  hypothetical protein  39.34 
 
 		 132 aa  45.4  0.0002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3198  TM2 domain-containing protein  43.4 
 
 		 161 aa  41.6  0.003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.827821  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>