22 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dole_1993 on replicon NC_009943
Organism: Desulfococcus oleovorans Hxd3



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009943  Dole_1993  TM2 domain-containing protein  100 
 
 		 135 aa  271  2.0000000000000002e-72  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0383529  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_05210  hypothetical protein  73.64 
 
 		 134 aa  204  3e-52  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0498  hypothetical protein  73.64 
 
 		 134 aa  203  6e-52  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4964  TM2 domain-containing protein  76 
 
 		 139 aa  203  6e-52  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4145  TM2 domain-containing protein  73.64 
 
 		 132 aa  203  7e-52  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0374  TM2 domain-containing protein  72.44 
 
 		 139 aa  201  2e-51  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5316  TM2  68.46 
 
 		 144 aa  201  2e-51  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.368186 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0167  TM2 domain-containing protein  70.68 
 
 		 135 aa  201  2e-51  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5141  TM2 domain-containing protein  74.4 
 
 		 139 aa  201  3e-51  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.143411  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5043  hypothetical protein  72 
 
 		 184 aa  200  5e-51  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.307475  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5091  hypothetical protein  74.4 
 
 		 139 aa  200  5e-51  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.710135  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0299  TM2 domain containing protein  70.23 
 
 		 135 aa  198  1.9999999999999998e-50  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.00000251621  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0480  TM2  72 
 
 		 134 aa  196  7e-50  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.748725  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1622  hypothetical protein  67.72 
 
 		 132 aa  187  5e-47  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2502  TM2  72.8 
 
 		 140 aa  173  6e-43  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  hitchhiker  0.000265771  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_03100  TM2 domain-containing hypothetical protein  73.6 
 
 		 133 aa  172  9.999999999999999e-43  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.564885  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4937  TM2 domain containing protein  43.48 
 
 		 194 aa  67.4  0.00000000006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2399  TM2 domain-containing protein  49.25 
 
 		 169 aa  60.1  0.000000009  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.324538  normal  0.432831 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1825  TM2 domain containing protein  50 
 
 		 154 aa  55.5  0.0000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0479  TM2 domain-containing protein  40.24 
 
 		 114 aa  51.2  0.000005  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4957  TM2  45.16 
 
 		 164 aa  50.8  0.000006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2261  TM2 domain-containing protein  43.64 
 
 		 103 aa  40.8  0.007  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.46379  normal  0.197019 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>