24 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PP_5091 on replicon NC_002947
Organism: Pseudomonas putida KT2440



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002947  PP_5091  hypothetical protein  100 
 
 		 139 aa  278  2e-74  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.710135  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4964  TM2 domain-containing protein  98.56 
 
 		 139 aa  275  1e-73  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5141  TM2 domain-containing protein  97.12 
 
 		 139 aa  273  4e-73  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.143411  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0374  TM2 domain-containing protein  93.48 
 
 		 139 aa  263  5.999999999999999e-70  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4145  TM2 domain-containing protein  83.72 
 
 		 132 aa  222  1e-57  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5316  TM2  77.3 
 
 		 144 aa  221  2e-57  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.368186 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5043  hypothetical protein  74.82 
 
 		 184 aa  218  1.9999999999999999e-56  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.307475  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_05210  hypothetical protein  84.13 
 
 		 134 aa  218  1.9999999999999999e-56  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0480  TM2  74.1 
 
 		 134 aa  217  3.9999999999999997e-56  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.748725  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0498  hypothetical protein  82.54 
 
 		 134 aa  216  7.999999999999999e-56  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0167  TM2 domain-containing protein  81.45 
 
 		 135 aa  212  9.999999999999999e-55  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1993  TM2 domain-containing protein  74.4 
 
 		 135 aa  200  5e-51  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0383529  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_03100  TM2 domain-containing hypothetical protein  81.4 
 
 		 133 aa  197  3.9999999999999996e-50  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.564885  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0299  TM2 domain containing protein  70.31 
 
 		 135 aa  193  5.000000000000001e-49  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.00000251621  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1622  hypothetical protein  68.8 
 
 		 132 aa  187  5e-47  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2502  TM2  75.76 
 
 		 140 aa  186  1e-46  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  hitchhiker  0.000265771  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4937  TM2 domain containing protein  44.44 
 
 		 194 aa  66.6  0.0000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2399  TM2 domain-containing protein  52.46 
 
 		 169 aa  60.8  0.000000006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.324538  normal  0.432831 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1825  TM2 domain containing protein  45.16 
 
 		 154 aa  56.6  0.0000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4957  TM2  48.21 
 
 		 164 aa  53.5  0.000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0479  TM2 domain-containing protein  41.46 
 
 		 114 aa  52  0.000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2397  TM2 domain containing protein  53.49 
 
 		 113 aa  44.3  0.0006  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  2.25927e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1089  TM2  36.59 
 
 		 117 aa  42  0.002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1614  hypothetical protein  34.07 
 
 		 104 aa  40.8  0.006  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.696869  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>