15 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Achl_4067 on replicon NC_011879
Organism: Arthrobacter chlorophenolicus A6



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011879  Achl_4067  TM2 domain containing protein  100 
 
 
469 aa  927    Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_17940  predicted membrane protein  36.19 
 
 
344 aa  73.9  0.000000000005  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.300515  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2397  TM2 domain containing protein  43.94 
 
 
113 aa  62.4  0.00000002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  2.25927e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1541  TM2 domain containing protein  32.82 
 
 
133 aa  54.3  0.000005  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.273114  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2746  TM2 domain containing protein  42.62 
 
 
67 aa  50.8  0.00005  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000224877  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4904  TM2 domain-containing protein  41.07 
 
 
176 aa  50.4  0.00006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.097022  hitchhiker  0.00581278 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2756  TM2 domain containing protein  37.7 
 
 
67 aa  48.9  0.0002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00000265887  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3876  TM2 domain containing protein  42.86 
 
 
78 aa  48.9  0.0002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5432  protein of unknown function DUF1707  42.59 
 
 
194 aa  47.8  0.0004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.00776452  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1622  hypothetical protein  31.73 
 
 
132 aa  45.4  0.002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0480  TM2  34.09 
 
 
134 aa  45.1  0.003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.748725  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1399  TM2 domain containing protein  43.14 
 
 
113 aa  44.3  0.005  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.452664  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5141  TM2 domain-containing protein  36.23 
 
 
139 aa  43.9  0.006  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.143411  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4937  TM2 domain containing protein  41.82 
 
 
194 aa  43.9  0.006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2238  TM2 domain-containing protein  44.62 
 
 
101 aa  43.5  0.008  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.540179  hitchhiker  0.00143417 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>