15 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Coch_1399 on replicon NC_013162
Organism: Capnocytophaga ochracea DSM 7271



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013162  Coch_1399  TM2 domain containing protein  100 
 
 		 113 aa  231  3e-60  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.452664  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0258  hypothetical protein  56.86 
 
 		 110 aa  125  3e-28  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  decreased coverage  0.0000028904  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1541  TM2 domain containing protein  56.67 
 
 		 133 aa  70.9  0.000000000006  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.273114  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_17940  predicted membrane protein  45.31 
 
 		 344 aa  62.8  0.000000001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.300515  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4904  TM2 domain-containing protein  48.21 
 
 		 176 aa  60.1  0.00000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.097022  hitchhiker  0.00581278 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5432  protein of unknown function DUF1707  37.5 
 
 		 194 aa  52  0.000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.00776452  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0822  TM2 domain containing protein  34.85 
 
 		 161 aa  48.9  0.00003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.966716  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3876  TM2 domain containing protein  46.81 
 
 		 78 aa  47  0.0001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET0230  TM2 domain-containing protein  27.52 
 
 		 107 aa  45.1  0.0004  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0254008  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1700  TM2 domain-containing protein  26.92 
 
 		 125 aa  43.9  0.0007  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.0217305  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2756  TM2 domain containing protein  38.1 
 
 		 67 aa  43.5  0.0009  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00000265887  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2238  TM2 domain-containing protein  57.58 
 
 		 101 aa  42.4  0.002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.540179  hitchhiker  0.00143417 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1089  TM2  37.5 
 
 		 117 aa  41.2  0.004  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0041  hypothetical protein  51.16 
 
 		 80 aa  41.2  0.004  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2746  TM2 domain containing protein  41.38 
 
 		 67 aa  41.6  0.004  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000224877  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>