137 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Strop_1575 on replicon NC_009380
Organism: Salinispora tropica CNB-440



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009380  Strop_1575  NAD-dependent epimerase/dehydratase  100 
 
 		 330 aa  633  1e-180  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.684899 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1526  NAD-dependent epimerase/dehydratase  94.24 
 
 		 330 aa  597  1e-169  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.672845  hitchhiker  0.00016367 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8770  NAD dependent epimerase/dehydratase family  54.38 
 
 		 331 aa  302  4.0000000000000003e-81  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5466  NAD-dependent epimerase/dehydratase  58.66 
 
 		 328 aa  300  3e-80  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.386009  normal  0.364855 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6794  NAD dependent epimerase/dehydratase family  44.78 
 
 		 331 aa  240  2.9999999999999997e-62  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4700  NAD dependent epimerase/dehydratase family  46.06 
 
 		 334 aa  238  2e-61  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.268858  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2035  NAD-dependent epimerase/dehydratase  47.52 
 
 		 352 aa  234  1.0000000000000001e-60  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0499801  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2308  NAD-dependent epimerase/dehydratase  43.75 
 
 		 337 aa  226  5.0000000000000005e-58  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.472972 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3930  NAD-dependent epimerase/dehydratase  43.73 
 
 		 341 aa  217  2e-55  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0390546  normal  0.187548 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6243  NAD-dependent epimerase/dehydratase  41.76 
 
 		 335 aa  216  5e-55  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2039  NAD-dependent epimerase/dehydratase  33.84 
 
 		 346 aa  189  5.999999999999999e-47  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2833  NAD-dependent epimerase/dehydratase  32.08 
 
 		 345 aa  182  8.000000000000001e-45  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0117402  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2466  NAD-dependent epimerase/dehydratase  41 
 
 		 344 aa  182  9.000000000000001e-45  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3080  hypothetical protein  32.32 
 
 		 340 aa  179  4e-44  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.666002  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3063  hypothetical protein  32.52 
 
 		 340 aa  176  6e-43  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2836  hypothetical protein  32.22 
 
 		 340 aa  173  3.9999999999999995e-42  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.00215985  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2810  isoflavone reductase  32.22 
 
 		 341 aa  173  3.9999999999999995e-42  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00175876  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3051  hypothetical protein  32.22 
 
 		 340 aa  173  3.9999999999999995e-42  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3050  isoflavone reductase  32.37 
 
 		 345 aa  172  5.999999999999999e-42  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2200  isoflavone reductase  31.79 
 
 		 345 aa  172  9e-42  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.799899  hitchhiker  0.000000000145539 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1271  NAD-dependent epimerase/dehydratase  43.41 
 
 		 327 aa  172  1e-41  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2770  isoflavone reductase  31.61 
 
 		 341 aa  169  4e-41  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2459  NAD-dependent epimerase/dehydratase  33.8 
 
 		 342 aa  149  7e-35  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00045189 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2968  NAD-dependent epimerase/dehydratase  33.73 
 
 		 333 aa  148  1.0000000000000001e-34  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.186902  normal  0.164864 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6880  NAD-dependent epimerase/dehydratase  36.5 
 
 		 324 aa  143  5e-33  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3358  NmrA family protein  38.91 
 
 		 330 aa  139  7e-32  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.0117254 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4756  NAD-dependent epimerase/dehydratase  36.05 
 
 		 320 aa  135  9.999999999999999e-31  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4501  NAD-dependent epimerase/dehydratase  36.28 
 
 		 330 aa  129  6e-29  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.609099  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2166  NAD-dependent epimerase/dehydratase  34.64 
 
 		 338 aa  129  8.000000000000001e-29  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000118533 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_19280  nucleoside-diphosphate-sugar epimerase  35.33 
 
 		 330 aa  127  3e-28  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.666821 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4508  NAD-dependent epimerase/dehydratase  35.22 
 
 		 316 aa  122  6e-27  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.137578 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8736  hypothetical protein  32.59 
 
 		 324 aa  118  9.999999999999999e-26  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2412  NAD-dependent epimerase/dehydratase  34.44 
 
 		 327 aa  107  3e-22  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0305483  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1826  mRNA-binding protein  33.2 
 
 		 313 aa  86.7  6e-16  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.334449 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3192  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.07 
 
 		 329 aa  85.9  9e-16  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_07841  putative mRNA binding protein  25.83 
 
 		 306 aa  82  0.00000000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2758  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.36 
 
 		 311 aa  80.1  0.00000000000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_17471  putative mRNA binding protein  33.2 
 
 		 341 aa  79.7  0.00000000000005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2534  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.57 
 
 		 328 aa  79.3  0.00000000000008  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1877  nucleotide sugar epimerase  33.68 
 
 		 301 aa  78.6  0.0000000000001  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.964376  normal  1 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0805  putative mRNA binding protein  25.31 
 
 		 306 aa  79  0.0000000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.788288  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0403  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.19 
 
 		 342 aa  78.2  0.0000000000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.532871  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0776  nucleotide sugar epimerase  29.84 
 
 		 306 aa  75.5  0.000000000001  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.347752  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4630  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.46 
 
 		 310 aa  75.1  0.000000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.01826  normal  1 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_08581  putative mRNA binding protein  24.27 
 
 		 306 aa  75.5  0.000000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_08611  putative mRNA binding protein  25.11 
 
 		 306 aa  75.1  0.000000000002  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.330884  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2001  NAD-dependent epimerase/dehydratase  25.88 
 
 		 309 aa  75.1  0.000000000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2026  NAD-dependent epimerase/dehydratase  25.88 
 
 		 309 aa  75.1  0.000000000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.81324 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0205  putative mRNA binding protein  27.56 
 
 		 307 aa  72.8  0.000000000007  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_09641  putative mRNA binding protein  26 
 
 		 323 aa  72.8  0.000000000007  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.513424  hitchhiker  0.0042312 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_08371  putative mRNA binding protein  26.95 
 
 		 307 aa  72.4  0.000000000009  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.499278  normal  0.0509544 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_27320  nucleoside-diphosphate-sugar epimerase  28.19 
 
 		 329 aa  72.4  0.00000000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.572933 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0789  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.74 
 
 		 330 aa  71.2  0.00000000002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5542  hypothetical protein  30.35 
 
 		 292 aa  70.1  0.00000000005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.449911 
 
 
-
 
NC_005945  BAS5301  hypothetical protein  30.35 
 
 		 290 aa  68.6  0.0000000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5697  hypothetical protein  30.35 
 
 		 292 aa  68.9  0.0000000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2691  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.74 
 
 		 310 aa  68.6  0.0000000001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1329  NAD-dependent epimerase/dehydratase  33.18 
 
 		 300 aa  67.8  0.0000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0398599  normal  0.110586 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4240  NAD-dependent epimerase/dehydratase  31.41 
 
 		 327 aa  67.4  0.0000000003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.596937  normal  0.966404 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_3136  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.64 
 
 		 328 aa  66.6  0.0000000006  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.30935  normal  0.512704 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5580  hypothetical protein  30.69 
 
 		 293 aa  66.2  0.0000000007  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5143  hypothetical protein  30.05 
 
 		 293 aa  65.9  0.000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.673361  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1785  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.49 
 
 		 336 aa  65.1  0.000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.250908  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0710  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.39 
 
 		 339 aa  65.1  0.000000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0984  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.32 
 
 		 339 aa  64.3  0.000000003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.550308  hitchhiker  0.00907782 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5628  hypothetical protein  28.86 
 
 		 290 aa  63.5  0.000000005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5572  hypothetical protein  28.71 
 
 		 295 aa  63.5  0.000000005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2101  3-beta hydroxysteroid dehydrogenase/isomerase  26.25 
 
 		 313 aa  62.4  0.000000009  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00798646 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5128  hypothetical protein  28.08 
 
 		 293 aa  60.5  0.00000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0673  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.39 
 
 		 335 aa  60.8  0.00000003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.293726  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1427  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.78 
 
 		 353 aa  60.5  0.00000004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5377  hypothetical protein  26.73 
 
 		 295 aa  59.7  0.00000006  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  0.00568321  normal  0.0173928 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5240  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.57 
 
 		 346 aa  59.3  0.00000009  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2585  NAD-dependent epimerase/dehydratase  32.69 
 
 		 326 aa  58.9  0.0000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.982727  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6286  Isoflavone_redu, isoflavone reductase  30.91 
 
 		 304 aa  58.5  0.0000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.416579  normal  0.15306 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1066  NAD-dependent epimerase/dehydratase  31.12 
 
 		 321 aa  57.4  0.0000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1883  NAD-dependent epimerase/dehydratase  32.5 
 
 		 342 aa  57.4  0.0000004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.832817 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2374  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.77 
 
 		 326 aa  57  0.0000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.79798  normal  0.123393 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2106  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.47 
 
 		 336 aa  55.1  0.000002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0557769  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0171  3-beta hydroxysteroid dehydrogenase/isomerase  31.52 
 
 		 330 aa  55.1  0.000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1490  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.95 
 
 		 336 aa  53.5  0.000004  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1570  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.47 
 
 		 331 aa  53.5  0.000005  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0260  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  26.02 
 
 		 327 aa  53.1  0.000006  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1168  NAD-dependent epimerase/dehydratase  33.49 
 
 		 320 aa  52.8  0.000008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2145  NAD-dependent epimerase/dehydratase  24.7 
 
 		 304 aa  52.8  0.000009  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.365657  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0517  UDP-glucose 4-epimerase  28.03 
 
 		 325 aa  50.8  0.00003  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.171515  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0365  NAD-dependent epimerase/dehydratase  31.36 
 
 		 333 aa  50.4  0.00004  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2545  putative mRNA-binding protein  31.93 
 
 		 327 aa  50.1  0.00005  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0962067  hitchhiker  0.000986877 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3691  UDP-glucose 4-epimerase  26.98 
 
 		 319 aa  49.7  0.00007  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0494  NAD-dependent epimerase/dehydratase  23.98 
 
 		 296 aa  49.7  0.00007  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.417633  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0263  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.33 
 
 		 338 aa  48.9  0.0001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1227  NAD-dependent epimerase/dehydratase  32.11 
 
 		 320 aa  48.9  0.0001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2854  NAD-dependent epimerase/dehydratase  40.95 
 
 		 349 aa  48.5  0.0001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.618946 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0956  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  25.1 
 
 		 344 aa  47.8  0.0003  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.417373  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_14581  hypothetical protein  21.88 
 
 		 278 aa  47.8  0.0003  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2099  3-beta hydroxysteroid dehydrogenase/isomerase  32.96 
 
 		 330 aa  47.4  0.0003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0931539  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1329  NAD-dependent epimerase/dehydratase  31.65 
 
 		 327 aa  47.8  0.0003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1815  NAD-dependent epimerase/dehydratase  21.37 
 
 		 349 aa  47.4  0.0003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5301  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.31 
 
 		 321 aa  47.4  0.0004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011691  PHATRDRAFT_30466  predicted protein  27.73 
 
 		 361 aa  47  0.0004  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>