More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Strop_1197 on replicon NC_009380
Organism: Salinispora tropica CNB-440



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009380  Strop_1197  response regulator receiver  100 
 
 		 230 aa  454  1e-127  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1090  two component transcriptional regulator  93.91 
 
 		 230 aa  413  1e-114  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0839689 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0721  two component transcriptional regulator, winged helix family  63.52 
 
 		 233 aa  276  2e-73  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.811558  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0132  response regulator receiver protein  63.16 
 
 		 231 aa  275  3e-73  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0978  two component transcriptional regulator  64.91 
 
 		 321 aa  274  1.0000000000000001e-72  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.323902  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1441  two component transcriptional regulator  56.33 
 
 		 247 aa  250  1e-65  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.167327  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8286  two component transcriptional regulator, winged helix family  61.88 
 
 		 266 aa  236  2e-61  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.691187  normal  0.348936 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1193  two component transcriptional regulator, winged helix family  56.48 
 
 		 240 aa  232  4.0000000000000004e-60  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3086  two component transcriptional regulator, winged helix family  55.95 
 
 		 233 aa  225  4e-58  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.151774  normal  0.916258 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1554  two component transcriptional regulator, winged helix family  45.81 
 
 		 229 aa  216  2e-55  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00709514 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1897  two component transcriptional regulator, winged helix family  50.44 
 
 		 229 aa  215  5e-55  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0070  two component transcriptional regulator  47.98 
 
 		 229 aa  212  4.9999999999999996e-54  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.834843 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4663  two component transcriptional regulator  52.23 
 
 		 232 aa  211  1e-53  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1028  two component transcriptional regulator, winged helix family  51.79 
 
 		 237 aa  208  7e-53  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2675  two component transcriptional regulator, winged helix family  46.32 
 
 		 234 aa  207  1e-52  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.661044  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0940  two component transcriptional regulator, winged helix family  51.56 
 
 		 237 aa  207  1e-52  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.324642  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1728  two component transcriptional regulator, winged helix family  48.25 
 
 		 233 aa  206  2e-52  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1903  two component transcriptional regulator  43.97 
 
 		 230 aa  206  3e-52  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_03750  PhoP-like protein  44.44 
 
 		 226 aa  205  5e-52  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.181369  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2333  two component transcriptional regulator  44.1 
 
 		 232 aa  205  5e-52  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6145  two component transcriptional regulator  48 
 
 		 228 aa  204  7e-52  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.788201 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1077  two component transcriptional regulator, winged helix family  46.32 
 
 		 235 aa  204  7e-52  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0630  two component transcriptional regulator  44.2 
 
 		 232 aa  204  7e-52  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0785  two component transcriptional regulator, winged helix family  47.6 
 
 		 235 aa  204  8e-52  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1892  two component transcriptional regulator, winged helix family  45.54 
 
 		 228 aa  204  1e-51  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0000392  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1100  two component transcriptional regulator, winged helix family  52.44 
 
 		 236 aa  204  1e-51  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000000182155 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0961  response regulator receiver protein  46.7 
 
 		 229 aa  204  1e-51  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2983  two component transcriptional regulator  47.32 
 
 		 228 aa  203  2e-51  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0019  two component transcriptional regulator  48.03 
 
 		 235 aa  203  2e-51  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0080  two component transcriptional regulator, winged helix family  44.89 
 
 		 230 aa  202  3e-51  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0831  two component transcriptional regulator  47.39 
 
 		 228 aa  202  3e-51  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.310785  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4484  DNA-binding response regulator PhoP  43.04 
 
 		 239 aa  202  4e-51  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4319  alkaline phosphatase synthesis response regulator  43.04 
 
 		 239 aa  202  4e-51  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4330  alkaline phosphatase synthesis response regulator  43.04 
 
 		 239 aa  202  4e-51  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2910  response regulator receiver  47.56 
 
 		 230 aa  202  4e-51  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4833  DNA-binding response regulator PhoP  43.04 
 
 		 239 aa  202  4e-51  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0982965  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4704  DNA-binding response regulator PhoP  43.04 
 
 		 239 aa  202  4e-51  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000673192 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4714  DNA-binding response regulator PhoP  43.04 
 
 		 239 aa  202  4e-51  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0580  two component transcriptional regulator, winged helix family  46.43 
 
 		 226 aa  202  4e-51  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0804  two component transcriptional regulator  50.89 
 
 		 236 aa  202  5e-51  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.324741  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10499  two component system sensor transduction protein regX3  46.88 
 
 		 227 aa  202  5e-51  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  decreased coverage  2.46064e-66  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2709  two component transcriptional regulator, winged helix family  47.86 
 
 		 236 aa  202  5e-51  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  decreased coverage  0.0011921  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0997  response regulator receiver  44.89 
 
 		 228 aa  202  5e-51  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0470  two component transcriptional regulator, winged helix family  47.37 
 
 		 239 aa  202  5e-51  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0260801  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4046  response regulator receiver  46.88 
 
 		 225 aa  202  5e-51  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0588  two component transcriptional regulator  44.69 
 
 		 227 aa  202  5e-51  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.000000000451147  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4720  DNA-binding response regulator PhoP  43.04 
 
 		 239 aa  201  6e-51  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0661  two component transcriptional regulator  47.11 
 
 		 228 aa  201  7e-51  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0674  two component transcriptional regulator  47.11 
 
 		 228 aa  201  7e-51  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.850641 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0654  two component transcriptional regulator  47.11 
 
 		 228 aa  201  7e-51  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.682961 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3394  two component transcriptional regulator, winged helix family  44.3 
 
 		 230 aa  201  8e-51  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.103692  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0499  winged helix family two component transcriptional regulator  45.61 
 
 		 229 aa  201  8e-51  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2570  two component transcriptional regulator, winged helix family  49.15 
 
 		 239 aa  201  8e-51  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0287  two component transcriptional regulator, winged helix family  43.42 
 
 		 229 aa  200  9.999999999999999e-51  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00220806  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1944  two component transcriptional regulator  45.69 
 
 		 238 aa  200  9.999999999999999e-51  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4322  two component transcriptional regulator, winged helix family  48 
 
 		 231 aa  200  9.999999999999999e-51  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1750  two component transcriptional regulator  45.41 
 
 		 234 aa  200  1.9999999999999998e-50  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0987  two component transcriptional regulator, winged helix family  48.48 
 
 		 233 aa  199  1.9999999999999998e-50  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.195539  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0439  two component transcriptional regulator  44.14 
 
 		 225 aa  200  1.9999999999999998e-50  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.000000000223011  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0471  two component transcriptional regulator  49.78 
 
 		 226 aa  199  1.9999999999999998e-50  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.734397 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1784  alkaline phosphatase synthesis transcriptional regulatory protein  45.41 
 
 		 234 aa  200  1.9999999999999998e-50  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.561076  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0724  two component transcriptional regulator  45.33 
 
 		 226 aa  200  1.9999999999999998e-50  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2981  two component transcriptional regulator  47.32 
 
 		 229 aa  200  1.9999999999999998e-50  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.0000000201285  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0654  two component transcriptional regulator, winged helix family  47.19 
 
 		 229 aa  199  3e-50  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.200991  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0700  two component transcriptional regulator, winged helix family  46.67 
 
 		 226 aa  199  3e-50  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.768939  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1673  two component transcriptional regulator, winged helix family  45.41 
 
 		 233 aa  199  3e-50  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0707  two component transcriptional regulator  44.83 
 
 		 232 aa  199  3e-50  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4699  DNA-binding response regulator PhoP  44.54 
 
 		 239 aa  199  3.9999999999999996e-50  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0539  DNA-binding response regulator PhoP  44.54 
 
 		 239 aa  199  3.9999999999999996e-50  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000130788 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5259  two component transcriptional regulator  46.26 
 
 		 235 aa  199  3.9999999999999996e-50  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000559572  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0264  two component transcriptional regulator  40.09 
 
 		 238 aa  198  5e-50  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.392693  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1012  two component transcriptional regulator  47.64 
 
 		 257 aa  198  5e-50  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.658807  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3818  two component transcriptional regulator  51.33 
 
 		 230 aa  198  5e-50  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.386967  normal  0.165932 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0766  two component transcriptional regulator  43.17 
 
 		 231 aa  198  5e-50  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.585906  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0850  two component transcriptional regulator, winged helix family  45.33 
 
 		 226 aa  198  5e-50  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1456  two component transcriptional regulator, winged helix family  44.44 
 
 		 223 aa  198  7e-50  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.000183373  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3815  two component transcriptional regulator, winged helix family  50 
 
 		 225 aa  198  7e-50  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0278114  normal  0.0118387 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5346  DNA-binding response regulator YycF  46.26 
 
 		 235 aa  198  7e-50  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000000234523  hitchhiker  0.00000000000323141 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5615  DNA-binding response regulator YycF  46.26 
 
 		 235 aa  197  7.999999999999999e-50  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5319  DNA-binding response regulator YycF  46.26 
 
 		 235 aa  197  7.999999999999999e-50  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.169223  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5147  response regulator  46.26 
 
 		 235 aa  197  7.999999999999999e-50  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00168683  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5163  response regulator  46.26 
 
 		 235 aa  197  7.999999999999999e-50  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00196509  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5715  DNA-binding response regulator YycF  46.26 
 
 		 235 aa  197  7.999999999999999e-50  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.656882  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0082  two component transcriptional regulator  46.96 
 
 		 228 aa  197  7.999999999999999e-50  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5572  DNA-binding response regulator YycF  46.26 
 
 		 235 aa  197  7.999999999999999e-50  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.81316e-29 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_09290  response regulator with CheY-like receiver domain and winged-helix DNA-binding domain  47.81 
 
 		 229 aa  197  7.999999999999999e-50  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5650  DNA-binding response regulator YycF  46.26 
 
 		 235 aa  197  7.999999999999999e-50  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00563499  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3274  two component transcriptional regulator  43.64 
 
 		 238 aa  197  9e-50  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1256  alkaline phosphatase synthesis transcriptional regulatory protein PhoP  43.97 
 
 		 236 aa  197  1.0000000000000001e-49  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.577358  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1155  two component transcriptional regulator  43.17 
 
 		 231 aa  197  1.0000000000000001e-49  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.000000430064  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6749  two component transcriptional regulator, winged helix family  45.54 
 
 		 226 aa  197  1.0000000000000001e-49  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.290774  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0510  two component transcriptional regulator  44.54 
 
 		 234 aa  197  1.0000000000000001e-49  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2988  two component transcriptional regulator, winged helix family  46.75 
 
 		 242 aa  197  1.0000000000000001e-49  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.410423  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4419  two component transcriptional regulator  42.92 
 
 		 239 aa  197  1.0000000000000001e-49  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0088  two component transcriptional regulator  46.29 
 
 		 228 aa  197  1.0000000000000001e-49  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_4006  two component transcriptional regulator  46.26 
 
 		 235 aa  197  1.0000000000000001e-49  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.010356  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5589  DNA-binding response regulator YycF  46.26 
 
 		 235 aa  197  1.0000000000000001e-49  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0469644  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1288  two component transcriptional regulator  42.41 
 
 		 228 aa  197  1.0000000000000001e-49  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.00000000128008  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1349  two component transcriptional regulator, winged helix family  47.35 
 
 		 237 aa  196  2.0000000000000003e-49  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  0.421984 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2259  osmolarity response regulator  46.35 
 
 		 257 aa  196  2.0000000000000003e-49  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0634187  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>