65 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Strop_0799 on replicon NC_009380
Organism: Salinispora tropica CNB-440



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009380  Strop_0799  ribonuclease BN  100 
 
 		 367 aa  705    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0743  ribonuclease BN  84.64 
 
 		 307 aa  422  1e-117  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.183226  hitchhiker  0.000468275 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0898  ribonuclease BN  37.83 
 
 		 307 aa  149  7e-35  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0551761 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5550  membrane protein-like protein  41.03 
 
 		 302 aa  138  2e-31  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.989573  normal  0.0897553 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4202  ribonuclease BN  31.97 
 
 		 341 aa  118  9.999999999999999e-26  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0950  ribonuclease  29.41 
 
 		 332 aa  110  6e-23  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5966  ribonuclease BN  30.28 
 
 		 390 aa  102  1e-20  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.172061 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0663  ribonuclease BN  29.96 
 
 		 411 aa  99.4  9e-20  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.362248  normal  0.0877902 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1769  ribonuclease BN  27.07 
 
 		 377 aa  95.1  2e-18  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3957  ribonuclease BN  31.64 
 
 		 374 aa  91.7  2e-17  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.707734  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1264  membrane protein-like protein  29.54 
 
 		 311 aa  90.9  3e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1295  ribonuclease  29.19 
 
 		 361 aa  90.5  4e-17  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  0.381565 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1230  putative ribonuclease  26.35 
 
 		 339 aa  90.1  5e-17  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1213  hypothetical protein  26.35 
 
 		 339 aa  90.1  5e-17  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.158916  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4744  putative ribonuclease  23.36 
 
 		 339 aa  89.4  9e-17  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3886  ribonuclease  24.7 
 
 		 332 aa  89  1e-16  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4870  putative ribonuclease  28.22 
 
 		 346 aa  88.2  2e-16  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0433032  normal  0.0967189 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4885  putative ribonuclease  23.66 
 
 		 337 aa  88.2  2e-16  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3927  putative ribonuclease  23.66 
 
 		 337 aa  88.2  2e-16  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4010  putative ribonuclease  23.66 
 
 		 337 aa  88.2  2e-16  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3826  putative ribonuclease  23.66 
 
 		 337 aa  87.8  3e-16  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.135959 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03323  hypothetical protein  23.67 
 
 		 337 aa  87  4e-16  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.1002  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0191  ribonuclease  23.67 
 
 		 337 aa  87  4e-16  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.365161  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0195  ribonuclease  23.67 
 
 		 337 aa  87  4e-16  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.119003  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3725  putative ribonuclease  23.67 
 
 		 337 aa  87  4e-16  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03370  conserved inner membrane protein  23.67 
 
 		 337 aa  87  4e-16  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0762767  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4056  ribonuclease BN-like family protein  25.77 
 
 		 361 aa  87  4e-16  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0106  ribonuclease  25.43 
 
 		 366 aa  87  5e-16  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0083  ribonuclease  23.1 
 
 		 338 aa  86.7  6e-16  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4075  hypothetical protein  25.72 
 
 		 357 aa  86.3  8e-16  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.90745  normal  0.0226711 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1240  putative ribonuclease  26.69 
 
 		 343 aa  84.7  0.000000000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.35918 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0087  ribonuclease  23.28 
 
 		 338 aa  84  0.000000000000004  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3919  putative ribonuclease  22.42 
 
 		 341 aa  83.6  0.000000000000005  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.431008  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1561  putative ribonuclease  25.24 
 
 		 347 aa  83.2  0.000000000000006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.285533 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4073  ribonuclease  27.27 
 
 		 328 aa  78.2  0.0000000000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13368  integral membrane protein  28.57 
 
 		 289 aa  77  0.0000000000005  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_05300  ribonuclease, putative  28.77 
 
 		 366 aa  76.3  0.0000000000007  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3802  putative ribonuclease  23.61 
 
 		 342 aa  75.5  0.000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3815  putative ribonuclease  23.61 
 
 		 342 aa  75.5  0.000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3983  putative ribonuclease  23.61 
 
 		 342 aa  75.5  0.000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.344715 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3924  putative ribonuclease  23.61 
 
 		 342 aa  75.5  0.000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3880  putative ribonuclease  23.61 
 
 		 342 aa  75.5  0.000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6469  ribonuclease  27.44 
 
 		 339 aa  75.1  0.000000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0143  hypothetical protein  29.96 
 
 		 266 aa  72  0.00000000002  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.23892  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0671  ribonuclease BN  33.33 
 
 		 315 aa  68.2  0.0000000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.157242 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3967  ribonuclease BN  32.91 
 
 		 357 aa  60.8  0.00000004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.565971 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1012  ribonuclease BN  29.79 
 
 		 344 aa  60.1  0.00000006  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2530  ribonuclease BN  27.9 
 
 		 337 aa  58.2  0.0000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1124  ribonuclease BN  28.27 
 
 		 329 aa  57.8  0.0000003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4548  ribonuclease BN  25.77 
 
 		 349 aa  57  0.0000005  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.79228  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4405  ribonuclease BN  25.81 
 
 		 343 aa  54.3  0.000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_25840  predicted membrane protein  23.93 
 
 		 375 aa  52  0.00001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.200788  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1198  ribonuclease BN  26.18 
 
 		 324 aa  51.2  0.00003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000216425 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2955  ribonuclease BN  27.07 
 
 		 389 aa  50.8  0.00004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  hitchhiker  0.00451533  decreased coverage  0.000148448 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2523  ribonuclease BN  24.52 
 
 		 349 aa  50.4  0.00005  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.861907  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0653  ribonuclease BN  24.48 
 
 		 294 aa  45.8  0.001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0697  ribonuclease BN, putative  24.84 
 
 		 429 aa  45.8  0.001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.47498  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0733  ribonuclease BN  24.84 
 
 		 439 aa  45.8  0.001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0824671  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0986  ribonuclease BN  29.37 
 
 		 288 aa  45.4  0.001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0732  ribonuclease BN  24.84 
 
 		 439 aa  45.1  0.002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5245  ribonuclease BN  27.09 
 
 		 331 aa  45.4  0.002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.33321  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3407  ribonuclease BN  23.42 
 
 		 322 aa  44.3  0.003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.57313  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2696  ribonuclease BN  23.42 
 
 		 322 aa  44.3  0.003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0425  putative ribonuclease BN  27.11 
 
 		 300 aa  43.9  0.004  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.250516  normal  0.726297 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4678  ribonuclease BN  23.55 
 
 		 347 aa  43.1  0.009  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0366951  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>